Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2VCP0

Protein Details
Accession A0A0A2VCP0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
829-848AISGHRKKRAKVKSTSSLETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
834-839RKKRAK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 10, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011006  CheY-like_superfamily  
IPR000305  GIY-YIG_endonuc  
IPR035901  GIY-YIG_endonuc_sf  
IPR047296  GIY-YIG_UvrC_Cho  
IPR003583  Hlx-hairpin-Hlx_DNA-bd_motif  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR016032  Sig_transdc_resp-reg_C-effctor  
IPR001789  Sig_transdc_resp-reg_receiver  
IPR005143  TF_LuxR_autoind-bd_dom  
IPR036693  TF_LuxR_autoind-bd_dom_sf  
IPR000792  Tscrpt_reg_LuxR_C  
IPR001943  UVR_dom  
IPR036876  UVR_dom_sf  
IPR004791  UvrC  
IPR001162  UvrC_RNase_H_dom  
IPR038476  UvrC_RNase_H_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0009380  C:excinuclease repair complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0009381  F:excinuclease ABC activity  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0000160  P:phosphorelay signal transduction system  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF03472  Autoind_bind  
PF00196  GerE  
PF01541  GIY-YIG  
PF14520  HHH_5  
PF00072  Response_reg  
PF02151  UVR  
PF08459  UvrC_RNaseH_dom  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50164  GIY_YIG  
PS00622  HTH_LUXR_1  
PS50043  HTH_LUXR_2  
PS50110  RESPONSE_REGULATORY  
PS50151  UVR  
PS50165  UVRC  
CDD cd10434  GIY-YIG_UvrC_Cho  
cd06170  LuxR_C_like  
cd17535  REC_NarL-like  
Amino Acid Sequences MVRVSNFMRGEIIWSDALFAESRELWDAARDHGLASGRTHCVMAPNRTAGFLSVSRSNVRTEILSEDELGLRLSYLAELSMATLNRLEDPSVEMLDMKLSKREREILQWTGEGIRRILEEIKGIKVSGEVNCGEDAIKWCRSNPVDVVLMDMNMPGIGGLEATRKIARYSSDIKVIMLTIHTENPLPAKVMQAGAAGYLSKGAAPQDVVNAIRSVNAGQRYIASDIAQQMALSQIAPEAESPFASLSERELQIMLMITKGQKVNEISEQLNLSPKTVNSYRYRMFSKLNISGDVELTHLAIRHGQPGVYRMYDAGGTVIYVGKAKDLKKRLSSYFRTNLASRKTEALVALIQHIDVTVTHTETEALLLEHNYIKLYQPRYNVLLRDDKSYPFIFLSADSHPRLAMHRGAKHAKGEYFGPFPNGYAVRETLALLQKVFPVRQCENSVYRNRSRPCLQYQIGRCLGPCVSGLVTEEDYARQVDYVRLFLAGKDDQVLTQLISRMEVASKNLEFEEAARIRDQIQAVRRITEKQFVSNSGDDLDVIGVSFDAGLACMHVLFIRQGKVLGSRSYFPKVPAGTELSEVVETFVGQFYLQGSQMRTLPSEILLDFALADKSLLADSLSELAGRKVNVQTKPRGDRARYLKLARTNAATALVTKLSQQSTIQQRLKALAEVLKLPEVKRMECFDISHTMGEQTVASCVVFDSNGPLRAEYRRYNITGITPGDDYAAMNQVLRRRYGKAIEESKIPDVILIDGGKGQLGQAKAVFAELDVPWDKHHPLLLGVAKGSDRKAGLETLFFEPEGEGFSLPPDSPALHVIQHIRDDSHDHAISGHRKKRAKVKSTSSLETIEGIGPKRRQMLLKYMGGLQPLINASIEEIAKVPGISQALAEKIYYSLKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.15
4 0.16
5 0.13
6 0.12
7 0.12
8 0.12
9 0.13
10 0.15
11 0.15
12 0.14
13 0.19
14 0.2
15 0.2
16 0.23
17 0.21
18 0.19
19 0.22
20 0.25
21 0.21
22 0.23
23 0.25
24 0.24
25 0.25
26 0.25
27 0.22
28 0.28
29 0.33
30 0.37
31 0.38
32 0.4
33 0.4
34 0.41
35 0.41
36 0.33
37 0.3
38 0.25
39 0.24
40 0.23
41 0.26
42 0.28
43 0.29
44 0.3
45 0.27
46 0.26
47 0.23
48 0.21
49 0.22
50 0.23
51 0.23
52 0.21
53 0.21
54 0.2
55 0.2
56 0.18
57 0.14
58 0.1
59 0.09
60 0.08
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.07
67 0.11
68 0.1
69 0.11
70 0.12
71 0.13
72 0.15
73 0.16
74 0.15
75 0.12
76 0.15
77 0.16
78 0.16
79 0.15
80 0.13
81 0.13
82 0.17
83 0.19
84 0.16
85 0.21
86 0.23
87 0.26
88 0.3
89 0.36
90 0.35
91 0.41
92 0.47
93 0.45
94 0.45
95 0.43
96 0.4
97 0.38
98 0.38
99 0.31
100 0.24
101 0.21
102 0.18
103 0.2
104 0.21
105 0.17
106 0.2
107 0.2
108 0.23
109 0.23
110 0.22
111 0.2
112 0.19
113 0.21
114 0.18
115 0.19
116 0.16
117 0.17
118 0.17
119 0.17
120 0.16
121 0.15
122 0.18
123 0.19
124 0.25
125 0.24
126 0.25
127 0.32
128 0.34
129 0.36
130 0.33
131 0.33
132 0.31
133 0.3
134 0.33
135 0.25
136 0.23
137 0.19
138 0.17
139 0.12
140 0.08
141 0.08
142 0.04
143 0.04
144 0.03
145 0.04
146 0.04
147 0.07
148 0.08
149 0.1
150 0.12
151 0.12
152 0.13
153 0.15
154 0.17
155 0.21
156 0.27
157 0.28
158 0.34
159 0.33
160 0.33
161 0.31
162 0.29
163 0.23
164 0.18
165 0.17
166 0.11
167 0.12
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.15
172 0.15
173 0.14
174 0.13
175 0.14
176 0.15
177 0.15
178 0.15
179 0.14
180 0.13
181 0.11
182 0.11
183 0.09
184 0.07
185 0.07
186 0.06
187 0.05
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.1
194 0.12
195 0.13
196 0.13
197 0.13
198 0.12
199 0.12
200 0.12
201 0.11
202 0.14
203 0.15
204 0.15
205 0.15
206 0.16
207 0.18
208 0.19
209 0.18
210 0.14
211 0.14
212 0.15
213 0.16
214 0.14
215 0.11
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.07
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.08
233 0.1
234 0.15
235 0.15
236 0.15
237 0.15
238 0.14
239 0.14
240 0.15
241 0.12
242 0.07
243 0.08
244 0.08
245 0.11
246 0.13
247 0.12
248 0.15
249 0.17
250 0.2
251 0.22
252 0.25
253 0.22
254 0.23
255 0.24
256 0.21
257 0.25
258 0.22
259 0.19
260 0.17
261 0.17
262 0.2
263 0.22
264 0.28
265 0.27
266 0.34
267 0.35
268 0.39
269 0.42
270 0.39
271 0.39
272 0.38
273 0.39
274 0.39
275 0.38
276 0.35
277 0.33
278 0.31
279 0.28
280 0.23
281 0.17
282 0.11
283 0.1
284 0.09
285 0.07
286 0.07
287 0.1
288 0.1
289 0.12
290 0.12
291 0.13
292 0.13
293 0.15
294 0.17
295 0.14
296 0.14
297 0.11
298 0.12
299 0.11
300 0.1
301 0.08
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.06
308 0.06
309 0.07
310 0.12
311 0.15
312 0.22
313 0.28
314 0.33
315 0.39
316 0.45
317 0.49
318 0.54
319 0.57
320 0.58
321 0.59
322 0.57
323 0.53
324 0.5
325 0.49
326 0.45
327 0.42
328 0.35
329 0.31
330 0.28
331 0.26
332 0.24
333 0.19
334 0.15
335 0.13
336 0.13
337 0.1
338 0.09
339 0.07
340 0.07
341 0.06
342 0.05
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.08
351 0.06
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.09
361 0.14
362 0.18
363 0.2
364 0.22
365 0.25
366 0.28
367 0.3
368 0.3
369 0.28
370 0.32
371 0.29
372 0.31
373 0.3
374 0.27
375 0.28
376 0.27
377 0.24
378 0.16
379 0.16
380 0.12
381 0.11
382 0.13
383 0.12
384 0.15
385 0.15
386 0.15
387 0.14
388 0.14
389 0.15
390 0.15
391 0.18
392 0.2
393 0.22
394 0.28
395 0.32
396 0.33
397 0.34
398 0.34
399 0.29
400 0.25
401 0.24
402 0.2
403 0.2
404 0.18
405 0.18
406 0.15
407 0.15
408 0.16
409 0.15
410 0.13
411 0.12
412 0.12
413 0.1
414 0.11
415 0.11
416 0.12
417 0.14
418 0.13
419 0.12
420 0.12
421 0.14
422 0.14
423 0.15
424 0.13
425 0.16
426 0.18
427 0.21
428 0.23
429 0.25
430 0.27
431 0.33
432 0.38
433 0.38
434 0.41
435 0.45
436 0.44
437 0.46
438 0.46
439 0.44
440 0.43
441 0.45
442 0.42
443 0.41
444 0.43
445 0.45
446 0.43
447 0.38
448 0.33
449 0.26
450 0.25
451 0.18
452 0.15
453 0.09
454 0.07
455 0.08
456 0.08
457 0.08
458 0.09
459 0.08
460 0.08
461 0.07
462 0.08
463 0.08
464 0.07
465 0.06
466 0.06
467 0.08
468 0.08
469 0.09
470 0.08
471 0.09
472 0.09
473 0.09
474 0.12
475 0.1
476 0.09
477 0.1
478 0.1
479 0.09
480 0.1
481 0.1
482 0.07
483 0.08
484 0.1
485 0.08
486 0.09
487 0.09
488 0.08
489 0.09
490 0.09
491 0.1
492 0.11
493 0.11
494 0.11
495 0.11
496 0.11
497 0.1
498 0.1
499 0.16
500 0.14
501 0.15
502 0.15
503 0.15
504 0.16
505 0.19
506 0.19
507 0.16
508 0.19
509 0.26
510 0.26
511 0.28
512 0.28
513 0.29
514 0.3
515 0.32
516 0.28
517 0.25
518 0.26
519 0.26
520 0.3
521 0.26
522 0.25
523 0.19
524 0.18
525 0.14
526 0.12
527 0.1
528 0.05
529 0.05
530 0.04
531 0.03
532 0.03
533 0.03
534 0.02
535 0.02
536 0.03
537 0.03
538 0.03
539 0.03
540 0.03
541 0.03
542 0.03
543 0.04
544 0.05
545 0.08
546 0.09
547 0.09
548 0.1
549 0.1
550 0.14
551 0.16
552 0.18
553 0.17
554 0.19
555 0.22
556 0.25
557 0.26
558 0.23
559 0.26
560 0.24
561 0.23
562 0.23
563 0.23
564 0.2
565 0.2
566 0.19
567 0.15
568 0.14
569 0.13
570 0.11
571 0.07
572 0.06
573 0.06
574 0.05
575 0.05
576 0.04
577 0.05
578 0.05
579 0.07
580 0.08
581 0.09
582 0.1
583 0.12
584 0.14
585 0.14
586 0.14
587 0.14
588 0.13
589 0.12
590 0.13
591 0.11
592 0.1
593 0.09
594 0.08
595 0.07
596 0.08
597 0.07
598 0.05
599 0.05
600 0.04
601 0.04
602 0.04
603 0.04
604 0.04
605 0.04
606 0.05
607 0.06
608 0.06
609 0.06
610 0.07
611 0.08
612 0.1
613 0.1
614 0.12
615 0.16
616 0.23
617 0.29
618 0.34
619 0.41
620 0.47
621 0.53
622 0.59
623 0.61
624 0.57
625 0.6
626 0.63
627 0.65
628 0.62
629 0.6
630 0.58
631 0.57
632 0.59
633 0.52
634 0.46
635 0.38
636 0.32
637 0.3
638 0.25
639 0.18
640 0.16
641 0.15
642 0.11
643 0.12
644 0.15
645 0.13
646 0.14
647 0.14
648 0.2
649 0.28
650 0.38
651 0.4
652 0.39
653 0.39
654 0.41
655 0.42
656 0.35
657 0.28
658 0.22
659 0.2
660 0.2
661 0.2
662 0.2
663 0.21
664 0.2
665 0.24
666 0.23
667 0.23
668 0.25
669 0.27
670 0.28
671 0.28
672 0.29
673 0.26
674 0.29
675 0.29
676 0.26
677 0.22
678 0.18
679 0.17
680 0.16
681 0.13
682 0.08
683 0.08
684 0.07
685 0.07
686 0.06
687 0.06
688 0.06
689 0.06
690 0.06
691 0.1
692 0.13
693 0.18
694 0.19
695 0.19
696 0.21
697 0.26
698 0.31
699 0.31
700 0.33
701 0.33
702 0.35
703 0.35
704 0.35
705 0.33
706 0.33
707 0.29
708 0.26
709 0.22
710 0.2
711 0.19
712 0.18
713 0.15
714 0.11
715 0.13
716 0.11
717 0.11
718 0.13
719 0.17
720 0.19
721 0.23
722 0.24
723 0.25
724 0.3
725 0.35
726 0.39
727 0.44
728 0.49
729 0.48
730 0.5
731 0.5
732 0.46
733 0.41
734 0.34
735 0.26
736 0.19
737 0.18
738 0.15
739 0.12
740 0.1
741 0.1
742 0.1
743 0.1
744 0.09
745 0.08
746 0.1
747 0.1
748 0.11
749 0.11
750 0.12
751 0.12
752 0.12
753 0.12
754 0.08
755 0.11
756 0.09
757 0.14
758 0.15
759 0.16
760 0.17
761 0.21
762 0.22
763 0.2
764 0.22
765 0.18
766 0.17
767 0.23
768 0.25
769 0.23
770 0.22
771 0.22
772 0.22
773 0.23
774 0.23
775 0.2
776 0.16
777 0.16
778 0.18
779 0.2
780 0.2
781 0.21
782 0.23
783 0.24
784 0.24
785 0.22
786 0.21
787 0.17
788 0.16
789 0.17
790 0.14
791 0.1
792 0.09
793 0.1
794 0.12
795 0.11
796 0.12
797 0.11
798 0.1
799 0.12
800 0.14
801 0.15
802 0.14
803 0.17
804 0.21
805 0.23
806 0.26
807 0.26
808 0.24
809 0.24
810 0.28
811 0.28
812 0.32
813 0.29
814 0.25
815 0.26
816 0.32
817 0.41
818 0.46
819 0.49
820 0.49
821 0.54
822 0.61
823 0.69
824 0.73
825 0.73
826 0.73
827 0.77
828 0.79
829 0.81
830 0.79
831 0.71
832 0.63
833 0.54
834 0.45
835 0.37
836 0.29
837 0.25
838 0.23
839 0.28
840 0.28
841 0.31
842 0.35
843 0.37
844 0.4
845 0.41
846 0.49
847 0.49
848 0.52
849 0.5
850 0.49
851 0.47
852 0.43
853 0.38
854 0.28
855 0.24
856 0.2
857 0.19
858 0.14
859 0.13
860 0.12
861 0.16
862 0.16
863 0.12
864 0.12
865 0.12
866 0.13
867 0.13
868 0.12
869 0.11
870 0.13
871 0.12
872 0.13
873 0.15
874 0.16
875 0.17
876 0.16
877 0.13
878 0.14