FuNGI

A0A0A2W4B4

Protein Details

Accession

A0A0A2W4B4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-41	MLRDRQRFSRRLHGAKKIKNADS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 9.5, cyto_nucl 8.5, mito 8, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003593 AAA+_ATPase IPR011709 DEAD-box_helicase_OB_fold IPR007502 Helicase-assoc_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR024590 HrpA_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR010222 RNA_helicase_HrpA
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0071014 C:post-mRNA release spliceosomal complex GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0005684 C:U2-type spliceosomal complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0000466 P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000463 P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000390 P:spliceosomal complex disassembly
Pfam	View protein in Pfam PF11898 DUF3418 PF04408 HA2 PF00271 Helicase_C PF07717 OB_NTP_bind
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd17989 DEXHc_HrpA cd18791 SF2_C_RHA

Amino Acid Sequences

MEMTKPSLSSLLARLDGLMLRDRQRFSRRLHGAKKIKNADSQQALFDTLAAEIDAAAGKVQLREAARPAITYPDNLPVSQKKQDILNAVRDHQVVIVAGETGSGKTTQLPKICMELGRGIKGLIGHTQPRRLAARTVANRIAEELQTEPGGCVGYKVRFSDHVGDNTMVKLMTDGILLAEIQQDRLLMQYDTIIIDEAHERSLNIDFLLGYLRELLPKRPDLKIIITSATIDPERFSRHFNNAPIVEVSGRTFPVEVRYRPMVEDNDDTDRDQLQAIFDAVDELGHESSGDILIFMSGEREIRDTADALTKLNLPHTEILPLYARLSNSEQNRVFQAHVGRRIVLATNVAETSLTVPGIKYVIDPGTARISRYSYRTKVQRLPIEPVSQASANQRKGRCGRVSEGICIRLYSEDDFLSRPEFTDPEILRTNLASVILQMTALGLGDIQAFPFVEAPDKRHIQDGVRLLEELGAITSDEEHSVYKLTPSGRQLSQLPVDPRLAKMVLEAQKFGCVREVMIITSALSIQDPRERPMDRQQASDEKHRRFHDKESDFLAYVNLWNYLGEQQKALSSNQFRRQCKLDFLNYLRVREWQDIYTQLRQVVKELGLPVNSEPGDFRAVHSALLTGLLSHIGQKDTEKQEYTGARNARFSIFPGSGLFKKPPKWTMVAELVETSRLWGRIAARIDPEWIEPLAQHLIKRSYSEPHWEKAQGAVMAQEKVTLYGLPIVAARKVNYSDIDPALCRELFIRHALVEGDWQTRHAFFRDNLKLRAEIEDLEHKSRRRDILVDDETLFEFYDQRIAHDVISARHFDSWWKKTSRETPDLLNFEKNMLIREGAEQVSKLDYPNFWHQGNLKLRLTYQFEPGADADGVTVHIPLPLLNQVEEAGFEWQIPGVRRELIIALIKSLPKPVRRNFVPAPNYAEAFLGRATPLELPLLDSLEREFRRMAGVTIDREDWHWDQVPDHLKMTFRVVDEHNKKLKEGKDLSELKGGLKDKVQQTLSAVADDGIEQSGLHIWSFGSLPESYEQKRGNYRMKAFPALVDEKESVAIKLFDNPLEQQQAMWRGLRRLLLLNIPSPVKYLHEKLPNKAKLGLYFNPYGKVLELIDDCISCGIDKLIAQNGGPVWSEEGFAALHEKVRAELNDTVVEIAKQVEQILTAVFNINKRLKGRVDMTMALGLSDVKAQMSGLVYRGFVTGNGYKRLGDTLRYLQAIEKRLEKMAIDPHRDRAQMLKVESVQQAWQQWLNKLPPASRENEEVQEIRWMIEELRVSYFAQQLGTPYPISDKRILQAMEQVAL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.21
3	0.22
4	0.21
5	0.22
6	0.22
7	0.28
8	0.34
9	0.36
10	0.43
11	0.5
12	0.54
13	0.55
14	0.61
15	0.65
16	0.7
17	0.76
18	0.78
19	0.8
20	0.82
21	0.86
22	0.84
23	0.79
24	0.77
25	0.74
26	0.72
27	0.69
28	0.63
29	0.55
30	0.47
31	0.43
32	0.35
33	0.29
34	0.21
35	0.13
36	0.12
37	0.09
38	0.07
39	0.05
40	0.06
41	0.06
42	0.06
43	0.05
44	0.06
45	0.08
46	0.08
47	0.09
48	0.13
49	0.15
50	0.18
51	0.22
52	0.27
53	0.26
54	0.27
55	0.27
56	0.3
57	0.29
58	0.28
59	0.27
60	0.29
61	0.3
62	0.3
63	0.35
64	0.35
65	0.4
66	0.45
67	0.45
68	0.39
69	0.42
70	0.47
71	0.5
72	0.47
73	0.5
74	0.47
75	0.47
76	0.48
77	0.44
78	0.4
79	0.31
80	0.27
81	0.18
82	0.14
83	0.12
84	0.09
85	0.08
86	0.08
87	0.08
88	0.07
89	0.08
90	0.08
91	0.08
92	0.13
93	0.2
94	0.25
95	0.29
96	0.32
97	0.32
98	0.37
99	0.4
100	0.36
101	0.33
102	0.35
103	0.34
104	0.34
105	0.33
106	0.28
107	0.26
108	0.26
109	0.24
110	0.21
111	0.22
112	0.27
113	0.31
114	0.38
115	0.37
116	0.42
117	0.44
118	0.42
119	0.41
120	0.41
121	0.47
122	0.47
123	0.53
124	0.52
125	0.49
126	0.47
127	0.46
128	0.41
129	0.31
130	0.26
131	0.21
132	0.17
133	0.17
134	0.17
135	0.14
136	0.12
137	0.12
138	0.1
139	0.1
140	0.13
141	0.16
142	0.19
143	0.21
144	0.23
145	0.25
146	0.3
147	0.36
148	0.37
149	0.37
150	0.37
151	0.37
152	0.35
153	0.32
154	0.29
155	0.2
156	0.15
157	0.11
158	0.09
159	0.08
160	0.07
161	0.07
162	0.06
163	0.06
164	0.06
165	0.06
166	0.1
167	0.09
168	0.1
169	0.1
170	0.1
171	0.1
172	0.11
173	0.13
174	0.09
175	0.09
176	0.09
177	0.1
178	0.1
179	0.1
180	0.1
181	0.08
182	0.09
183	0.11
184	0.11
185	0.12
186	0.12
187	0.11
188	0.12
189	0.15
190	0.14
191	0.11
192	0.11
193	0.09
194	0.09
195	0.12
196	0.1
197	0.08
198	0.1
199	0.1
200	0.15
201	0.17
202	0.21
203	0.25
204	0.31
205	0.35
206	0.35
207	0.39
208	0.37
209	0.41
210	0.41
211	0.38
212	0.33
213	0.29
214	0.29
215	0.26
216	0.25
217	0.21
218	0.16
219	0.15
220	0.16
221	0.21
222	0.2
223	0.25
224	0.27
225	0.34
226	0.4
227	0.42
228	0.47
229	0.42
230	0.43
231	0.38
232	0.35
233	0.27
234	0.22
235	0.21
236	0.15
237	0.14
238	0.13
239	0.12
240	0.11
241	0.19
242	0.25
243	0.25
244	0.29
245	0.32
246	0.33
247	0.34
248	0.38
249	0.33
250	0.3
251	0.33
252	0.3
253	0.31
254	0.31
255	0.3
256	0.27
257	0.25
258	0.21
259	0.18
260	0.15
261	0.11
262	0.11
263	0.11
264	0.09
265	0.08
266	0.09
267	0.07
268	0.07
269	0.06
270	0.07
271	0.06
272	0.06
273	0.06
274	0.05
275	0.06
276	0.07
277	0.06
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.05
284	0.05
285	0.06
286	0.06
287	0.08
288	0.08
289	0.1
290	0.11
291	0.11
292	0.12
293	0.17
294	0.17
295	0.16
296	0.17
297	0.18
298	0.17
299	0.2
300	0.19
301	0.16
302	0.18
303	0.18
304	0.19
305	0.17
306	0.18
307	0.17
308	0.17
309	0.17
310	0.17
311	0.16
312	0.17
313	0.21
314	0.24
315	0.25
316	0.33
317	0.33
318	0.32
319	0.35
320	0.33
321	0.3
322	0.27
323	0.32
324	0.3
325	0.35
326	0.35
327	0.33
328	0.31
329	0.32
330	0.29
331	0.22
332	0.18
333	0.12
334	0.12
335	0.11
336	0.11
337	0.1
338	0.09
339	0.1
340	0.08
341	0.08
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.08
346	0.08
347	0.06
348	0.08
349	0.09
350	0.1
351	0.11
352	0.12
353	0.19
354	0.2
355	0.2
356	0.2
357	0.22
358	0.23
359	0.29
360	0.35
361	0.31
362	0.38
363	0.45
364	0.51
365	0.55
366	0.61
367	0.64
368	0.59
369	0.62
370	0.58
371	0.54
372	0.47
373	0.4
374	0.34
375	0.26
376	0.24
377	0.26
378	0.29
379	0.32
380	0.38
381	0.38
382	0.43
383	0.46
384	0.53
385	0.49
386	0.46
387	0.44
388	0.47
389	0.48
390	0.46
391	0.45
392	0.39
393	0.34
394	0.3
395	0.27
396	0.19
397	0.18
398	0.14
399	0.13
400	0.11
401	0.12
402	0.12
403	0.12
404	0.13
405	0.12
406	0.11
407	0.11
408	0.11
409	0.11
410	0.19
411	0.19
412	0.22
413	0.24
414	0.24
415	0.23
416	0.22
417	0.21
418	0.14
419	0.14
420	0.09
421	0.07
422	0.07
423	0.07
424	0.06
425	0.05
426	0.05
427	0.04
428	0.04
429	0.04
430	0.02
431	0.03
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.05
438	0.06
439	0.06
440	0.1
441	0.11
442	0.15
443	0.21
444	0.23
445	0.23
446	0.25
447	0.27
448	0.23
449	0.29
450	0.31
451	0.27
452	0.26
453	0.25
454	0.22
455	0.21
456	0.19
457	0.13
458	0.07
459	0.05
460	0.04
461	0.04
462	0.04
463	0.04
464	0.05
465	0.05
466	0.05
467	0.05
468	0.07
469	0.07
470	0.07
471	0.1
472	0.11
473	0.14
474	0.17
475	0.21
476	0.21
477	0.24
478	0.25
479	0.25
480	0.26
481	0.28
482	0.26
483	0.24
484	0.26
485	0.24
486	0.23
487	0.21
488	0.2
489	0.14
490	0.13
491	0.19
492	0.22
493	0.22
494	0.22
495	0.2
496	0.25
497	0.25
498	0.24
499	0.19
500	0.14
501	0.13
502	0.15
503	0.15
504	0.1
505	0.11
506	0.11
507	0.08
508	0.08
509	0.08
510	0.06
511	0.05
512	0.05
513	0.06
514	0.12
515	0.13
516	0.15
517	0.2
518	0.21
519	0.24
520	0.34
521	0.42
522	0.38
523	0.39
524	0.41
525	0.43
526	0.45
527	0.52
528	0.5
529	0.44
530	0.5
531	0.5
532	0.54
533	0.49
534	0.54
535	0.54
536	0.48
537	0.47
538	0.44
539	0.43
540	0.37
541	0.34
542	0.26
543	0.16
544	0.14
545	0.12
546	0.08
547	0.06
548	0.06
549	0.07
550	0.11
551	0.13
552	0.12
553	0.12
554	0.12
555	0.13
556	0.15
557	0.15
558	0.16
559	0.19
560	0.26
561	0.35
562	0.42
563	0.42
564	0.44
565	0.48
566	0.45
567	0.45
568	0.43
569	0.39
570	0.37
571	0.39
572	0.46
573	0.43
574	0.43
575	0.37
576	0.35
577	0.33
578	0.29
579	0.28
580	0.18
581	0.18
582	0.21
583	0.24
584	0.24
585	0.22
586	0.22
587	0.22
588	0.22
589	0.22
590	0.19
591	0.16
592	0.15
593	0.15
594	0.14
595	0.12
596	0.13
597	0.12
598	0.13
599	0.12
600	0.11
601	0.09
602	0.09
603	0.11
604	0.11
605	0.11
606	0.12
607	0.13
608	0.13
609	0.13
610	0.11
611	0.09
612	0.09
613	0.08
614	0.04
615	0.04
616	0.04
617	0.04
618	0.05
619	0.06
620	0.06
621	0.06
622	0.07
623	0.14
624	0.17
625	0.19
626	0.19
627	0.19
628	0.23
629	0.26
630	0.27
631	0.26
632	0.26
633	0.25
634	0.25
635	0.25
636	0.22
637	0.19
638	0.18
639	0.17
640	0.14
641	0.13
642	0.13
643	0.15
644	0.15
645	0.17
646	0.18
647	0.17
648	0.22
649	0.25
650	0.27
651	0.27
652	0.29
653	0.28
654	0.3
655	0.33
656	0.29
657	0.26
658	0.23
659	0.21
660	0.18
661	0.17
662	0.13
663	0.08
664	0.07
665	0.07
666	0.08
667	0.09
668	0.14
669	0.15
670	0.16
671	0.16
672	0.16
673	0.17
674	0.16
675	0.15
676	0.12
677	0.1
678	0.09
679	0.07
680	0.09
681	0.11
682	0.11
683	0.11
684	0.12
685	0.15
686	0.15
687	0.17
688	0.17
689	0.18
690	0.18
691	0.28
692	0.28
693	0.27
694	0.3
695	0.28
696	0.27
697	0.25
698	0.26
699	0.17
700	0.14
701	0.15
702	0.14
703	0.13
704	0.13
705	0.12
706	0.09
707	0.09
708	0.1
709	0.07
710	0.05
711	0.07
712	0.07
713	0.07
714	0.08
715	0.08
716	0.09
717	0.1
718	0.11
719	0.1
720	0.11
721	0.12
722	0.12
723	0.13
724	0.14
725	0.14
726	0.15
727	0.13
728	0.13
729	0.14
730	0.13
731	0.11
732	0.09
733	0.1
734	0.11
735	0.12
736	0.12
737	0.1
738	0.11
739	0.11
740	0.1
741	0.11
742	0.11
743	0.12
744	0.11
745	0.12
746	0.12
747	0.13
748	0.14
749	0.13
750	0.14
751	0.14
752	0.24
753	0.31
754	0.35
755	0.36
756	0.37
757	0.37
758	0.34
759	0.35
760	0.26
761	0.18
762	0.16
763	0.21
764	0.22
765	0.25
766	0.28
767	0.27
768	0.29
769	0.33
770	0.32
771	0.27
772	0.27
773	0.26
774	0.33
775	0.34
776	0.33
777	0.29
778	0.28
779	0.26
780	0.24
781	0.2
782	0.1
783	0.08
784	0.06
785	0.11
786	0.1
787	0.11
788	0.14
789	0.14
790	0.14
791	0.16
792	0.18
793	0.14
794	0.17
795	0.17
796	0.14
797	0.14
798	0.14
799	0.17
800	0.25
801	0.27
802	0.32
803	0.33
804	0.34
805	0.4
806	0.49
807	0.51
808	0.48
809	0.46
810	0.45
811	0.49
812	0.52
813	0.47
814	0.4
815	0.32
816	0.27
817	0.28
818	0.22
819	0.17
820	0.13
821	0.12
822	0.1
823	0.12
824	0.14
825	0.12
826	0.12
827	0.11
828	0.11
829	0.12
830	0.12
831	0.11
832	0.1
833	0.1
834	0.14
835	0.22
836	0.25
837	0.23
838	0.25
839	0.26
840	0.34
841	0.39
842	0.41
843	0.35
844	0.32
845	0.33
846	0.35
847	0.4
848	0.32
849	0.3
850	0.27
851	0.25
852	0.27
853	0.26
854	0.23
855	0.17
856	0.15
857	0.11
858	0.08
859	0.09
860	0.07
861	0.07
862	0.04
863	0.05
864	0.05
865	0.05
866	0.06
867	0.09
868	0.09
869	0.09
870	0.1
871	0.1
872	0.1
873	0.1
874	0.09
875	0.08
876	0.07
877	0.07
878	0.07
879	0.07
880	0.1
881	0.11
882	0.11
883	0.11
884	0.12
885	0.12
886	0.13
887	0.13
888	0.13
889	0.16
890	0.14
891	0.14
892	0.16
893	0.17
894	0.16
895	0.22
896	0.23
897	0.27
898	0.35
899	0.39
900	0.47
901	0.48
902	0.56
903	0.55
904	0.6
905	0.57
906	0.51
907	0.53
908	0.45
909	0.43
910	0.36
911	0.31
912	0.21
913	0.18
914	0.16
915	0.09
916	0.07
917	0.07
918	0.08
919	0.07
920	0.08
921	0.08
922	0.08
923	0.09
924	0.09
925	0.11
926	0.1
927	0.1
928	0.1
929	0.17
930	0.18
931	0.17
932	0.17
933	0.16
934	0.19
935	0.19
936	0.19
937	0.17
938	0.21
939	0.21
940	0.23
941	0.23
942	0.21
943	0.21
944	0.26
945	0.2
946	0.21
947	0.22
948	0.2
949	0.2
950	0.26
951	0.31
952	0.27
953	0.27
954	0.25
955	0.23
956	0.24
957	0.28
958	0.24
959	0.19
960	0.21
961	0.24
962	0.33
963	0.37
964	0.44
965	0.46
966	0.44
967	0.44
968	0.47
969	0.48
970	0.47
971	0.47
972	0.42
973	0.45
974	0.49
975	0.5
976	0.49
977	0.46
978	0.37
979	0.38
980	0.35
981	0.27
982	0.25
983	0.29
984	0.26
985	0.33
986	0.33
987	0.28
988	0.29
989	0.33
990	0.31
991	0.25
992	0.22
993	0.15
994	0.15
995	0.14
996	0.12
997	0.06
998	0.06
999	0.05
1000	0.05
1001	0.07
1002	0.08
1003	0.07
1004	0.07
1005	0.07
1006	0.08
1007	0.08
1008	0.08
1009	0.08
1010	0.08
1011	0.1
1012	0.12
1013	0.17
1014	0.18
1015	0.25
1016	0.27
1017	0.29
1018	0.37
1019	0.43
1020	0.49
1021	0.53
1022	0.57
1023	0.58
1024	0.61
1025	0.61
1026	0.53
1027	0.48
1028	0.45
1029	0.41
1030	0.36
1031	0.31
1032	0.27
1033	0.22
1034	0.24
1035	0.23
1036	0.17
1037	0.14
1038	0.15
1039	0.12
1040	0.17
1041	0.18
1042	0.17
1043	0.19
1044	0.2
1045	0.23
1046	0.25
1047	0.24
1048	0.19
1049	0.23
1050	0.27
1051	0.27
1052	0.29
1053	0.27
1054	0.26
1055	0.29
1056	0.31
1057	0.28
1058	0.26
1059	0.27
1060	0.29
1061	0.29
1062	0.28
1063	0.29
1064	0.27
1065	0.25
1066	0.23
1067	0.21
1068	0.19
1069	0.22
1070	0.24
1071	0.29
1072	0.38
1073	0.42
1074	0.48
1075	0.58
1076	0.59
1077	0.57
1078	0.58
1079	0.53
1080	0.49
1081	0.52
1082	0.49
1083	0.43
1084	0.45
1085	0.43
1086	0.4
1087	0.38
1088	0.32
1089	0.26
1090	0.23
1091	0.18
1092	0.16
1093	0.16
1094	0.16
1095	0.16
1096	0.15
1097	0.15
1098	0.14
1099	0.14
1100	0.09
1101	0.09
1102	0.07
1103	0.07
1104	0.08
1105	0.11
1106	0.15
1107	0.16
1108	0.16
1109	0.18
1110	0.18
1111	0.18
1112	0.18
1113	0.16
1114	0.14
1115	0.13
1116	0.14
1117	0.11
1118	0.11
1119	0.09
1120	0.09
1121	0.12
1122	0.1
1123	0.12
1124	0.12
1125	0.13
1126	0.13
1127	0.17
1128	0.18
1129	0.2
1130	0.22
1131	0.23
1132	0.23
1133	0.23
1134	0.23
1135	0.19
1136	0.19
1137	0.14
1138	0.13
1139	0.11
1140	0.09
1141	0.1
1142	0.09
1143	0.09
1144	0.09
1145	0.09
1146	0.09
1147	0.08
1148	0.11
1149	0.12
1150	0.14
1151	0.22
1152	0.25
1153	0.3
1154	0.31
1155	0.37
1156	0.37
1157	0.42
1158	0.44
1159	0.44
1160	0.45
1161	0.41
1162	0.42
1163	0.39
1164	0.35
1165	0.27
1166	0.24
1167	0.16
1168	0.12
1169	0.11
1170	0.09
1171	0.06
1172	0.07
1173	0.07
1174	0.08
1175	0.1
1176	0.11
1177	0.12
1178	0.13
1179	0.13
1180	0.14
1181	0.15
1182	0.13
1183	0.11
1184	0.16
1185	0.2
1186	0.23
1187	0.28
1188	0.28
1189	0.28
1190	0.28
1191	0.33
1192	0.3
1193	0.27
1194	0.28
1195	0.3
1196	0.35
1197	0.35
1198	0.35
1199	0.34
1200	0.39
1201	0.4
1202	0.38
1203	0.36
1204	0.33
1205	0.35
1206	0.36
1207	0.32
1208	0.31
1209	0.35
1210	0.41
1211	0.44
1212	0.44
1213	0.49
1214	0.54
1215	0.54
1216	0.5
1217	0.47
1218	0.46
1219	0.44
1220	0.44
1221	0.43
1222	0.39
1223	0.44
1224	0.44
1225	0.39
1226	0.33
1227	0.31
1228	0.31
1229	0.28
1230	0.32
1231	0.3
1232	0.33
1233	0.38
1234	0.39
1235	0.4
1236	0.42
1237	0.41
1238	0.44
1239	0.45
1240	0.46
1241	0.42
1242	0.44
1243	0.43
1244	0.43
1245	0.45
1246	0.38
1247	0.34
1248	0.36
1249	0.33
1250	0.28
1251	0.25
1252	0.22
1253	0.18
1254	0.21
1255	0.23
1256	0.18
1257	0.21
1258	0.22
1259	0.22
1260	0.24
1261	0.27
1262	0.23
1263	0.22
1264	0.2
1265	0.19
1266	0.22
1267	0.23
1268	0.2
1269	0.18
1270	0.24
1271	0.27
1272	0.32
1273	0.34
1274	0.33
1275	0.34
1276	0.41
1277	0.41
1278	0.36
1279	0.39

A0A0A2W4B4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer