FuNGI

A0A0A2VU08

Protein Details

Accession

A0A0A2VU08

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
11-35	LGTVLDKRGKRANRFHKWRPTVGLC	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto_mito 9, mito 8.5, cyto 8.5, nucl 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003593 AAA+_ATPase IPR027417 P-loop_NTPase IPR009715 RtcR IPR017183 Sigma54_dep_tscrpt_act_RtcR IPR002078 Sigma_54_int
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0003700 F:DNA-binding transcription factor activity
Pfam	View protein in Pfam PF06956 RtcR PF00158 Sigma54_activat
PROSITE	View protein in PROSITE PS50045 SIGMA54_INTERACT_4
CDD	cd00009 AAA

Amino Acid Sequences

MKKRRVVIGVLGTVLDKRGKRANRFHKWRPTVGLCQQPDFPVDRLELLYQPRDSGMTEQLSDDIARVSPDTEVRRHQVTIKDPWDFEEVYAAFLDFATRYDFDTENEEYLVHITTGTHVAQICWFLLTEARYLPASLLQTSPAQKGTPEEGSPAGTYSVIDLDLSRYTTLTSRFQREQQRSISFLKAGIDTRNATFNQLIDRIERVALRSAAPMLLTGPTGAGKSFLAKRIYQLKQARHQVGGKFVAVNCATLRGDNAMSTLFGHVKGAFTGALTARTGLLREADGGVLFLDEIAELGLDEQAMLLKAIEEKTFFPFGSDKEVQSDFQLIAGTHRDMRQWVAAGRFREDLYARINMWSFALPGLAQRREDIAPNVEYELQRFSTEAQTQIRFDKEARDHYLNFACSAQAQWRGNFRELSSSVSRMATLSEQGRIALDTVQEEISQLKESWQIASPETTLNPDIDLFDRRQLETVLEVCRRTQSLSEAGRELFAVSRLKKANPNDADRLRKYLARFNLSWESVHDG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.25
3	0.18
4	0.21
5	0.29
6	0.38
7	0.47
8	0.57
9	0.66
10	0.71
11	0.81
12	0.86
13	0.89
14	0.87
15	0.84
16	0.82
17	0.78
18	0.76
19	0.74
20	0.74
21	0.65
22	0.61
23	0.57
24	0.49
25	0.45
26	0.39
27	0.33
28	0.26
29	0.24
30	0.23
31	0.22
32	0.23
33	0.24
34	0.25
35	0.28
36	0.26
37	0.25
38	0.24
39	0.23
40	0.23
41	0.22
42	0.23
43	0.21
44	0.21
45	0.21
46	0.21
47	0.21
48	0.19
49	0.16
50	0.12
51	0.09
52	0.09
53	0.09
54	0.1
55	0.1
56	0.16
57	0.2
58	0.23
59	0.28
60	0.32
61	0.35
62	0.36
63	0.39
64	0.4
65	0.43
66	0.48
67	0.48
68	0.48
69	0.45
70	0.46
71	0.45
72	0.38
73	0.32
74	0.29
75	0.24
76	0.21
77	0.2
78	0.17
79	0.13
80	0.13
81	0.13
82	0.06
83	0.07
84	0.09
85	0.1
86	0.11
87	0.14
88	0.15
89	0.15
90	0.2
91	0.21
92	0.19
93	0.19
94	0.17
95	0.14
96	0.14
97	0.14
98	0.09
99	0.07
100	0.06
101	0.08
102	0.1
103	0.1
104	0.11
105	0.11
106	0.11
107	0.12
108	0.13
109	0.12
110	0.1
111	0.1
112	0.08
113	0.1
114	0.11
115	0.11
116	0.1
117	0.12
118	0.11
119	0.12
120	0.12
121	0.12
122	0.13
123	0.12
124	0.12
125	0.13
126	0.16
127	0.19
128	0.2
129	0.18
130	0.17
131	0.16
132	0.19
133	0.21
134	0.21
135	0.19
136	0.19
137	0.18
138	0.2
139	0.19
140	0.17
141	0.13
142	0.1
143	0.09
144	0.08
145	0.08
146	0.06
147	0.06
148	0.06
149	0.07
150	0.08
151	0.09
152	0.08
153	0.08
154	0.09
155	0.11
156	0.14
157	0.2
158	0.24
159	0.3
160	0.32
161	0.39
162	0.48
163	0.52
164	0.55
165	0.54
166	0.53
167	0.5
168	0.51
169	0.46
170	0.36
171	0.32
172	0.27
173	0.22
174	0.2
175	0.18
176	0.17
177	0.16
178	0.17
179	0.19
180	0.18
181	0.18
182	0.17
183	0.16
184	0.16
185	0.17
186	0.16
187	0.14
188	0.15
189	0.13
190	0.14
191	0.14
192	0.12
193	0.13
194	0.14
195	0.13
196	0.13
197	0.12
198	0.11
199	0.11
200	0.09
201	0.07
202	0.07
203	0.06
204	0.05
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.06
210	0.05
211	0.08
212	0.11
213	0.15
214	0.18
215	0.18
216	0.22
217	0.3
218	0.32
219	0.38
220	0.42
221	0.43
222	0.49
223	0.56
224	0.54
225	0.48
226	0.5
227	0.43
228	0.41
229	0.37
230	0.29
231	0.23
232	0.2
233	0.21
234	0.18
235	0.17
236	0.12
237	0.13
238	0.12
239	0.11
240	0.11
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.07
249	0.06
250	0.06
251	0.07
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.07
256	0.05
257	0.05
258	0.06
259	0.06
260	0.07
261	0.06
262	0.07
263	0.07
264	0.07
265	0.07
266	0.06
267	0.06
268	0.05
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.05
274	0.05
275	0.04
276	0.04
277	0.03
278	0.03
279	0.02
280	0.02
281	0.02
282	0.02
283	0.02
284	0.02
285	0.03
286	0.02
287	0.02
288	0.02
289	0.03
290	0.03
291	0.03
292	0.03
293	0.03
294	0.05
295	0.06
296	0.07
297	0.08
298	0.09
299	0.12
300	0.14
301	0.13
302	0.13
303	0.14
304	0.14
305	0.22
306	0.22
307	0.19
308	0.21
309	0.22
310	0.21
311	0.2
312	0.21
313	0.13
314	0.12
315	0.12
316	0.09
317	0.09
318	0.11
319	0.11
320	0.12
321	0.13
322	0.13
323	0.13
324	0.15
325	0.15
326	0.15
327	0.16
328	0.19
329	0.23
330	0.24
331	0.25
332	0.25
333	0.23
334	0.24
335	0.23
336	0.19
337	0.18
338	0.2
339	0.17
340	0.18
341	0.18
342	0.15
343	0.16
344	0.14
345	0.11
346	0.08
347	0.08
348	0.07
349	0.1
350	0.16
351	0.17
352	0.17
353	0.17
354	0.2
355	0.21
356	0.23
357	0.22
358	0.2
359	0.19
360	0.19
361	0.2
362	0.2
363	0.19
364	0.18
365	0.18
366	0.15
367	0.15
368	0.14
369	0.15
370	0.18
371	0.19
372	0.23
373	0.24
374	0.26
375	0.27
376	0.3
377	0.3
378	0.25
379	0.24
380	0.29
381	0.29
382	0.34
383	0.39
384	0.41
385	0.4
386	0.43
387	0.48
388	0.4
389	0.36
390	0.29
391	0.23
392	0.18
393	0.19
394	0.18
395	0.21
396	0.23
397	0.24
398	0.31
399	0.36
400	0.38
401	0.39
402	0.35
403	0.35
404	0.33
405	0.37
406	0.32
407	0.3
408	0.29
409	0.27
410	0.27
411	0.19
412	0.2
413	0.15
414	0.16
415	0.16
416	0.16
417	0.16
418	0.16
419	0.17
420	0.15
421	0.15
422	0.12
423	0.11
424	0.1
425	0.11
426	0.11
427	0.11
428	0.11
429	0.11
430	0.11
431	0.12
432	0.11
433	0.12
434	0.16
435	0.17
436	0.19
437	0.22
438	0.22
439	0.22
440	0.24
441	0.23
442	0.21
443	0.21
444	0.22
445	0.19
446	0.17
447	0.17
448	0.15
449	0.15
450	0.16
451	0.19
452	0.17
453	0.22
454	0.25
455	0.25
456	0.26
457	0.25
458	0.24
459	0.24
460	0.26
461	0.26
462	0.27
463	0.28
464	0.27
465	0.3
466	0.3
467	0.28
468	0.27
469	0.25
470	0.31
471	0.35
472	0.37
473	0.36
474	0.35
475	0.34
476	0.31
477	0.27
478	0.2
479	0.19
480	0.22
481	0.21
482	0.28
483	0.31
484	0.36
485	0.42
486	0.47
487	0.53
488	0.55
489	0.61
490	0.63
491	0.68
492	0.73
493	0.69
494	0.69
495	0.62
496	0.58
497	0.55
498	0.54
499	0.54
500	0.52
501	0.5
502	0.5
503	0.56
504	0.53
505	0.5

A0A0A2VU08

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer