Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2VXE0

Protein Details
Accession A0A0A2VXE0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-48QQNSAPQGKKPAKARRKSREEIDQEARERKRQKKHRGHAAGSRANGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-70GKKPAKARRKSREEIDQEARERKRQKKHRGHAAGSRANGENQAKGGKSSGQAKDPRIGSKK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004558  Coprogen_oxidase_HemN  
IPR034505  Coproporphyrinogen-III_oxidase  
IPR006638  Elp3/MiaA/NifB-like_rSAM  
IPR010723  HemN_C  
IPR007197  rSAM  
IPR007336  YihI  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0051989  F:coproporphyrinogen dehydrogenase activity  
GO:0004109  F:coproporphyrinogen oxidase activity  
GO:0005096  F:GTPase activator activity  
GO:0051536  F:iron-sulfur cluster binding  
GO:0006782  P:protoporphyrinogen IX biosynthetic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF06969  HemN_C  
PF04055  Radical_SAM  
PF04220  YihI  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51918  RADICAL_SAM  
CDD cd01335  Radical_SAM  
Amino Acid Sequences MKQQNSAPQGKKPAKARRKSREEIDQEARERKRQKKHRGHAAGSRANGENQAKGGKSSGQAKDPRIGSKKPIQLGVTDAAPVAKQHKPKSEKPMLTPQAELDMLENDERLDGLLERLEAGETLSKEEQSWVDAKLDRIDALMEQLGIAWEDDEEEEEEKADDLMRLLKGEFAAAKGYGSRNEWASFAPSASATTPQGVSMSEQLIDWDLALIQKYNYSGPRYTSYPTALEFSEAFGEPTFLQAVARYPERPLSLYVHIPFCHKLCYFCGCNKIVTRQQHKADQYLDALEQEIIHRAPLFAGRLVSQMHWGGGTPTYLSKAQISRLMALLRGNFHFNDDAELSIEVDPREIELDVLDHLRQEGFTRLSMGVQDFNKEVQRLVNREQDEEFIFALIERARALGFTSTNIDLIYGLPKQTPESFAFTLKRVAELSPHRLSVFNYAHLPTLFAAQRKIKDADLPSAQQKLDILQETIASLTGSGYQFIGMDHFARPDDELAIAQREGKLHRNFQGYTTQGDTDLLGLGVSAISMIGDCYAQNQKEPKRYYQQVDEQGNALWRGLALTRDDCIRRDVIKALICNFQLNFADIEQAWSLTFADYFAEDMGLLAPLAKDGLVEISGQGIQVTGKGRLLIRNICMCFDAYLRQKARLQQFSRVI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.8
3 0.84
4 0.84
5 0.87
6 0.88
7 0.87
8 0.86
9 0.83
10 0.81
11 0.8
12 0.76
13 0.73
14 0.74
15 0.7
16 0.68
17 0.7
18 0.7
19 0.72
20 0.75
21 0.8
22 0.82
23 0.88
24 0.91
25 0.92
26 0.9
27 0.88
28 0.87
29 0.83
30 0.73
31 0.67
32 0.58
33 0.48
34 0.48
35 0.41
36 0.32
37 0.28
38 0.3
39 0.26
40 0.25
41 0.26
42 0.23
43 0.26
44 0.33
45 0.35
46 0.39
47 0.45
48 0.47
49 0.52
50 0.52
51 0.56
52 0.54
53 0.53
54 0.52
55 0.55
56 0.59
57 0.55
58 0.57
59 0.49
60 0.44
61 0.45
62 0.4
63 0.31
64 0.24
65 0.2
66 0.15
67 0.15
68 0.15
69 0.15
70 0.18
71 0.25
72 0.31
73 0.41
74 0.48
75 0.56
76 0.65
77 0.71
78 0.71
79 0.71
80 0.75
81 0.72
82 0.67
83 0.6
84 0.5
85 0.44
86 0.38
87 0.32
88 0.21
89 0.16
90 0.15
91 0.15
92 0.14
93 0.1
94 0.09
95 0.09
96 0.08
97 0.07
98 0.06
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.09
105 0.07
106 0.08
107 0.11
108 0.1
109 0.15
110 0.16
111 0.16
112 0.16
113 0.18
114 0.17
115 0.16
116 0.17
117 0.14
118 0.17
119 0.19
120 0.2
121 0.21
122 0.22
123 0.19
124 0.18
125 0.17
126 0.13
127 0.13
128 0.12
129 0.09
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.05
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.06
150 0.1
151 0.1
152 0.11
153 0.1
154 0.11
155 0.11
156 0.12
157 0.12
158 0.09
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.12
164 0.13
165 0.15
166 0.16
167 0.17
168 0.18
169 0.19
170 0.17
171 0.19
172 0.17
173 0.15
174 0.13
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.13
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.11
186 0.1
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.09
193 0.08
194 0.06
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.07
201 0.08
202 0.11
203 0.14
204 0.17
205 0.18
206 0.2
207 0.24
208 0.25
209 0.26
210 0.26
211 0.25
212 0.23
213 0.22
214 0.21
215 0.17
216 0.17
217 0.15
218 0.13
219 0.12
220 0.11
221 0.11
222 0.09
223 0.1
224 0.08
225 0.09
226 0.09
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.08
231 0.1
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.15
236 0.16
237 0.17
238 0.17
239 0.19
240 0.2
241 0.23
242 0.24
243 0.24
244 0.23
245 0.24
246 0.24
247 0.2
248 0.22
249 0.19
250 0.18
251 0.18
252 0.23
253 0.24
254 0.25
255 0.3
256 0.27
257 0.3
258 0.3
259 0.34
260 0.35
261 0.41
262 0.45
263 0.47
264 0.49
265 0.53
266 0.53
267 0.5
268 0.45
269 0.37
270 0.31
271 0.25
272 0.21
273 0.15
274 0.14
275 0.1
276 0.08
277 0.07
278 0.08
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.08
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.09
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.1
306 0.11
307 0.12
308 0.16
309 0.16
310 0.15
311 0.16
312 0.16
313 0.14
314 0.14
315 0.14
316 0.12
317 0.12
318 0.12
319 0.11
320 0.12
321 0.12
322 0.1
323 0.12
324 0.1
325 0.1
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.08
330 0.09
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.06
335 0.07
336 0.06
337 0.05
338 0.04
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.06
348 0.09
349 0.09
350 0.09
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.12
355 0.12
356 0.13
357 0.12
358 0.13
359 0.12
360 0.13
361 0.15
362 0.14
363 0.14
364 0.14
365 0.18
366 0.21
367 0.25
368 0.3
369 0.29
370 0.3
371 0.31
372 0.28
373 0.25
374 0.22
375 0.18
376 0.11
377 0.1
378 0.08
379 0.09
380 0.07
381 0.07
382 0.05
383 0.06
384 0.05
385 0.06
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.08
390 0.1
391 0.1
392 0.11
393 0.11
394 0.1
395 0.08
396 0.08
397 0.1
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.09
402 0.11
403 0.12
404 0.15
405 0.15
406 0.2
407 0.21
408 0.24
409 0.26
410 0.25
411 0.29
412 0.25
413 0.24
414 0.19
415 0.18
416 0.21
417 0.24
418 0.3
419 0.27
420 0.28
421 0.28
422 0.28
423 0.28
424 0.31
425 0.28
426 0.23
427 0.23
428 0.23
429 0.24
430 0.22
431 0.22
432 0.14
433 0.17
434 0.17
435 0.16
436 0.19
437 0.22
438 0.24
439 0.28
440 0.29
441 0.25
442 0.29
443 0.3
444 0.31
445 0.31
446 0.32
447 0.3
448 0.32
449 0.31
450 0.26
451 0.24
452 0.19
453 0.19
454 0.18
455 0.15
456 0.12
457 0.13
458 0.12
459 0.12
460 0.11
461 0.07
462 0.05
463 0.05
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.08
470 0.08
471 0.09
472 0.07
473 0.08
474 0.08
475 0.09
476 0.09
477 0.1
478 0.11
479 0.1
480 0.1
481 0.1
482 0.1
483 0.1
484 0.12
485 0.12
486 0.12
487 0.13
488 0.14
489 0.17
490 0.25
491 0.28
492 0.32
493 0.37
494 0.42
495 0.41
496 0.41
497 0.46
498 0.39
499 0.37
500 0.34
501 0.29
502 0.23
503 0.23
504 0.21
505 0.13
506 0.12
507 0.09
508 0.06
509 0.05
510 0.05
511 0.04
512 0.04
513 0.03
514 0.02
515 0.02
516 0.02
517 0.03
518 0.03
519 0.04
520 0.04
521 0.08
522 0.14
523 0.15
524 0.2
525 0.28
526 0.35
527 0.44
528 0.49
529 0.53
530 0.57
531 0.64
532 0.66
533 0.67
534 0.69
535 0.69
536 0.68
537 0.61
538 0.52
539 0.46
540 0.43
541 0.34
542 0.25
543 0.15
544 0.11
545 0.11
546 0.11
547 0.12
548 0.12
549 0.13
550 0.15
551 0.2
552 0.22
553 0.22
554 0.24
555 0.27
556 0.25
557 0.26
558 0.28
559 0.29
560 0.32
561 0.34
562 0.34
563 0.36
564 0.35
565 0.35
566 0.31
567 0.3
568 0.26
569 0.24
570 0.22
571 0.17
572 0.19
573 0.16
574 0.19
575 0.15
576 0.14
577 0.13
578 0.12
579 0.12
580 0.1
581 0.1
582 0.07
583 0.08
584 0.07
585 0.08
586 0.08
587 0.07
588 0.06
589 0.07
590 0.07
591 0.06
592 0.06
593 0.06
594 0.06
595 0.05
596 0.06
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.07
601 0.07
602 0.07
603 0.07
604 0.09
605 0.09
606 0.09
607 0.08
608 0.07
609 0.07
610 0.1
611 0.13
612 0.13
613 0.14
614 0.17
615 0.19
616 0.24
617 0.3
618 0.32
619 0.36
620 0.42
621 0.42
622 0.41
623 0.4
624 0.36
625 0.31
626 0.28
627 0.3
628 0.29
629 0.37
630 0.38
631 0.43
632 0.47
633 0.53
634 0.62
635 0.64
636 0.61