Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2VDZ5

Protein Details
Accession A0A0A2VDZ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-127GSPGQKRKREPDSPSQRHKRMBasic
268-290SDEWHKLRKDNHKEVERRRRETIBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 2, cyto 2, plas 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR047206  bHLHzip_scCBP1-like  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd11398  bHLHzip_scCBP1  
Amino Acid Sequences MKLSTSRRDFDTASARIVAAQSPCDRRHASAQQFPCIISPYFARRRPSRPSRIVLANLCTAMSCVYLLGAAARQLGCSRVHLVKLDFHQEDMSDPLADHPDLTALTGSPGQKRKREPDSPSQRHKRMAAPAAMMAADTAAFIENAIEASTAAAANGVNVADFNALQQATHGDHTDQASNDATTTAQAALGMYPTLHVPPSTEEQFAAQATENEEDQHDAHPFTSEIPQDMMDQVNHQPQNGEQQQQQQQQRHYSASSQGGSAKPPVGSDEWHKLRKDNHKEVERRRRETINEGINELAKIVPGCEKNKGSILQRAVSFISQLKENEQQNIEKWTLEKLLTEQAITELSQSNDKLKQECERLYRELETWKRVAQNAGLEPPQPKEEPSVSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.33
3 0.3
4 0.29
5 0.26
6 0.19
7 0.22
8 0.26
9 0.31
10 0.33
11 0.38
12 0.39
13 0.39
14 0.47
15 0.52
16 0.54
17 0.56
18 0.6
19 0.6
20 0.59
21 0.56
22 0.47
23 0.41
24 0.33
25 0.26
26 0.25
27 0.28
28 0.36
29 0.41
30 0.48
31 0.51
32 0.58
33 0.67
34 0.73
35 0.74
36 0.73
37 0.74
38 0.73
39 0.73
40 0.72
41 0.66
42 0.59
43 0.51
44 0.43
45 0.37
46 0.29
47 0.23
48 0.16
49 0.12
50 0.08
51 0.06
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.1
62 0.12
63 0.12
64 0.14
65 0.18
66 0.19
67 0.21
68 0.23
69 0.24
70 0.27
71 0.3
72 0.35
73 0.31
74 0.29
75 0.27
76 0.24
77 0.24
78 0.21
79 0.18
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.13
84 0.13
85 0.11
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.06
92 0.07
93 0.11
94 0.12
95 0.18
96 0.26
97 0.31
98 0.37
99 0.43
100 0.5
101 0.56
102 0.63
103 0.64
104 0.67
105 0.74
106 0.77
107 0.81
108 0.82
109 0.78
110 0.74
111 0.7
112 0.65
113 0.62
114 0.59
115 0.51
116 0.42
117 0.38
118 0.34
119 0.3
120 0.24
121 0.15
122 0.09
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.03
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.03
142 0.04
143 0.04
144 0.03
145 0.03
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.08
156 0.09
157 0.1
158 0.08
159 0.1
160 0.11
161 0.13
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.11
167 0.09
168 0.08
169 0.06
170 0.07
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.03
179 0.03
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.07
186 0.11
187 0.13
188 0.13
189 0.13
190 0.13
191 0.14
192 0.14
193 0.12
194 0.08
195 0.07
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.11
216 0.12
217 0.12
218 0.09
219 0.1
220 0.12
221 0.18
222 0.17
223 0.17
224 0.16
225 0.16
226 0.25
227 0.26
228 0.27
229 0.23
230 0.3
231 0.38
232 0.46
233 0.51
234 0.47
235 0.49
236 0.52
237 0.52
238 0.46
239 0.4
240 0.34
241 0.32
242 0.32
243 0.28
244 0.23
245 0.23
246 0.22
247 0.22
248 0.22
249 0.19
250 0.14
251 0.14
252 0.16
253 0.13
254 0.15
255 0.18
256 0.26
257 0.31
258 0.36
259 0.37
260 0.38
261 0.45
262 0.54
263 0.6
264 0.6
265 0.63
266 0.67
267 0.76
268 0.83
269 0.86
270 0.85
271 0.8
272 0.75
273 0.72
274 0.66
275 0.64
276 0.61
277 0.58
278 0.5
279 0.45
280 0.41
281 0.36
282 0.32
283 0.26
284 0.17
285 0.1
286 0.08
287 0.08
288 0.13
289 0.17
290 0.19
291 0.25
292 0.27
293 0.28
294 0.33
295 0.37
296 0.35
297 0.38
298 0.4
299 0.37
300 0.37
301 0.36
302 0.33
303 0.29
304 0.27
305 0.22
306 0.2
307 0.19
308 0.19
309 0.21
310 0.27
311 0.29
312 0.33
313 0.33
314 0.34
315 0.33
316 0.37
317 0.34
318 0.28
319 0.27
320 0.24
321 0.24
322 0.22
323 0.21
324 0.18
325 0.24
326 0.24
327 0.23
328 0.2
329 0.18
330 0.18
331 0.17
332 0.17
333 0.13
334 0.13
335 0.18
336 0.18
337 0.22
338 0.26
339 0.29
340 0.3
341 0.31
342 0.38
343 0.42
344 0.48
345 0.51
346 0.52
347 0.53
348 0.54
349 0.53
350 0.48
351 0.51
352 0.5
353 0.49
354 0.46
355 0.47
356 0.47
357 0.46
358 0.47
359 0.41
360 0.42
361 0.41
362 0.44
363 0.41
364 0.39
365 0.38
366 0.38
367 0.39
368 0.32
369 0.28
370 0.29