Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2VDK3

Protein Details
Accession A0A0A2VDK3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
221-241MEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
222-240EPPKFKHKKIPRGPPSPPP
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 7, cyto 6, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0060090  F:molecular adaptor activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MASIAASLQTSLPKPKYTGEDEEAPSHAKQRGPRIVSAGQIDETQVVLKRSGPPPYGQRSGWRPRSQEDFGDGGAFPEVPVAQYPLDMGRKGSTTSNALAIQVDAEGKVKYDAIARQGHGEGRIIHTSFKDLIPLRQRADAGEIDLSRPDQEAVAATAERTKNALAKLVSGALAAQKPKNVNTGQRSDPTFVRYTPASQMGDNSKKQDRIMKIVEKQRDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEMWRIPPPVSNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDITINDKHAQFAEAVKMAERHAREEVQQRALMQQRPRGAQRRQH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.35
3 0.4
4 0.43
5 0.47
6 0.45
7 0.49
8 0.49
9 0.49
10 0.46
11 0.43
12 0.36
13 0.34
14 0.32
15 0.29
16 0.31
17 0.39
18 0.47
19 0.48
20 0.5
21 0.51
22 0.5
23 0.5
24 0.47
25 0.39
26 0.31
27 0.27
28 0.25
29 0.19
30 0.17
31 0.15
32 0.14
33 0.13
34 0.13
35 0.15
36 0.22
37 0.25
38 0.31
39 0.31
40 0.34
41 0.41
42 0.48
43 0.5
44 0.45
45 0.48
46 0.51
47 0.59
48 0.64
49 0.63
50 0.58
51 0.58
52 0.64
53 0.6
54 0.54
55 0.47
56 0.39
57 0.33
58 0.31
59 0.27
60 0.19
61 0.16
62 0.13
63 0.09
64 0.08
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.12
73 0.14
74 0.14
75 0.15
76 0.14
77 0.15
78 0.17
79 0.18
80 0.17
81 0.17
82 0.18
83 0.2
84 0.19
85 0.18
86 0.17
87 0.15
88 0.12
89 0.1
90 0.09
91 0.06
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.1
99 0.12
100 0.16
101 0.19
102 0.19
103 0.21
104 0.22
105 0.23
106 0.2
107 0.2
108 0.16
109 0.16
110 0.18
111 0.16
112 0.16
113 0.15
114 0.17
115 0.16
116 0.15
117 0.17
118 0.15
119 0.21
120 0.27
121 0.3
122 0.29
123 0.3
124 0.3
125 0.26
126 0.28
127 0.23
128 0.17
129 0.15
130 0.14
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.09
135 0.09
136 0.08
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.12
150 0.12
151 0.16
152 0.12
153 0.12
154 0.13
155 0.12
156 0.12
157 0.09
158 0.09
159 0.07
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.11
164 0.12
165 0.13
166 0.18
167 0.19
168 0.24
169 0.27
170 0.32
171 0.33
172 0.35
173 0.36
174 0.34
175 0.33
176 0.3
177 0.26
178 0.22
179 0.21
180 0.18
181 0.18
182 0.18
183 0.21
184 0.19
185 0.17
186 0.2
187 0.25
188 0.3
189 0.29
190 0.31
191 0.31
192 0.32
193 0.33
194 0.38
195 0.33
196 0.34
197 0.4
198 0.42
199 0.45
200 0.51
201 0.56
202 0.5
203 0.5
204 0.46
205 0.43
206 0.41
207 0.43
208 0.46
209 0.46
210 0.47
211 0.56
212 0.6
213 0.58
214 0.65
215 0.66
216 0.67
217 0.69
218 0.78
219 0.77
220 0.79
221 0.81
222 0.8
223 0.78
224 0.75
225 0.69
226 0.6
227 0.56
228 0.54
229 0.55
230 0.55
231 0.56
232 0.55
233 0.56
234 0.58
235 0.54
236 0.5
237 0.5
238 0.5
239 0.48
240 0.45
241 0.42
242 0.43
243 0.42
244 0.4
245 0.36
246 0.29
247 0.22
248 0.23
249 0.25
250 0.31
251 0.35
252 0.43
253 0.49
254 0.55
255 0.62
256 0.59
257 0.6
258 0.53
259 0.53
260 0.51
261 0.53
262 0.52
263 0.52
264 0.54
265 0.49
266 0.45
267 0.45
268 0.41
269 0.31
270 0.29
271 0.26
272 0.25
273 0.27
274 0.25
275 0.21
276 0.22
277 0.21
278 0.23
279 0.22
280 0.22
281 0.23
282 0.23
283 0.25
284 0.22
285 0.23
286 0.17
287 0.17
288 0.2
289 0.19
290 0.19
291 0.19
292 0.2
293 0.21
294 0.26
295 0.24
296 0.24
297 0.26
298 0.28
299 0.32
300 0.39
301 0.44
302 0.44
303 0.45
304 0.41
305 0.44
306 0.49
307 0.5
308 0.48
309 0.48
310 0.49
311 0.54
312 0.62
313 0.64