Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2VXU2

Protein Details
Accession A0A0A2VXU2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
292-314EDEAKPQAKKVKKEKSTKDSSDSHydrophilic
376-398ITKGKGFTKAKNKMKKGSFRGGVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
384-391KAKNKMKK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13.5, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSAPPAWLFSNNSDAVAAATPTAADPKTTPDRPSTRTMGKKGGSTAVAAPAAPALLVDIVERFLKDHAFTDAHKAFRAQRKEKGLVTKDKDIAVAGPTLVEVFAWWQRAAAKSDEDSADSSDSSESSDSSDDDENDSSDEEEVTKKQEVTKKQEVTKSLKRKAPESDSDSSEEDSDSDLSDSSDDEKEDKEEKPQAKKQKTTITIKLGESDNKMDIDSASDSDSDSSDLDSDSVSDSDSDSDSDSDSDSESDSDSDSSSSEVEKAAAVSLPSSDSSSADSSSDSDLSSSSSEDEAKPQAKKVKKEKSTKDSSDSSVTLDRASPVAEPPLPPAPVAKRKQNEPFSRIPKNIKVDARFASNEWVPMDYSQRAHEDLIITKGKGFTKAKNKMKKGSFRGGVIDITEKKAVYFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.21
3 0.18
4 0.15
5 0.09
6 0.08
7 0.08
8 0.08
9 0.12
10 0.1
11 0.11
12 0.11
13 0.19
14 0.28
15 0.32
16 0.34
17 0.4
18 0.47
19 0.5
20 0.56
21 0.56
22 0.57
23 0.62
24 0.65
25 0.64
26 0.6
27 0.59
28 0.55
29 0.53
30 0.44
31 0.37
32 0.33
33 0.29
34 0.26
35 0.22
36 0.19
37 0.14
38 0.13
39 0.11
40 0.08
41 0.05
42 0.04
43 0.05
44 0.05
45 0.05
46 0.07
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.11
52 0.12
53 0.13
54 0.16
55 0.18
56 0.18
57 0.27
58 0.3
59 0.3
60 0.3
61 0.31
62 0.35
63 0.41
64 0.51
65 0.48
66 0.52
67 0.59
68 0.63
69 0.66
70 0.68
71 0.66
72 0.66
73 0.66
74 0.65
75 0.6
76 0.55
77 0.5
78 0.4
79 0.34
80 0.25
81 0.2
82 0.12
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.06
88 0.04
89 0.06
90 0.08
91 0.1
92 0.1
93 0.11
94 0.14
95 0.17
96 0.19
97 0.19
98 0.19
99 0.18
100 0.22
101 0.22
102 0.21
103 0.19
104 0.18
105 0.16
106 0.14
107 0.13
108 0.1
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.1
117 0.12
118 0.11
119 0.13
120 0.14
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.1
125 0.09
126 0.08
127 0.07
128 0.08
129 0.09
130 0.11
131 0.13
132 0.13
133 0.18
134 0.24
135 0.3
136 0.38
137 0.47
138 0.5
139 0.53
140 0.57
141 0.58
142 0.6
143 0.63
144 0.64
145 0.62
146 0.59
147 0.55
148 0.55
149 0.56
150 0.55
151 0.52
152 0.49
153 0.45
154 0.44
155 0.45
156 0.42
157 0.35
158 0.29
159 0.21
160 0.15
161 0.12
162 0.1
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.11
175 0.14
176 0.14
177 0.16
178 0.22
179 0.27
180 0.35
181 0.41
182 0.49
183 0.53
184 0.57
185 0.58
186 0.6
187 0.63
188 0.61
189 0.6
190 0.56
191 0.53
192 0.49
193 0.46
194 0.38
195 0.33
196 0.28
197 0.23
198 0.18
199 0.15
200 0.14
201 0.12
202 0.1
203 0.1
204 0.09
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.1
263 0.11
264 0.11
265 0.1
266 0.1
267 0.11
268 0.12
269 0.12
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.1
279 0.11
280 0.13
281 0.17
282 0.22
283 0.23
284 0.26
285 0.34
286 0.39
287 0.48
288 0.56
289 0.61
290 0.66
291 0.75
292 0.8
293 0.81
294 0.85
295 0.81
296 0.76
297 0.69
298 0.64
299 0.58
300 0.48
301 0.42
302 0.35
303 0.3
304 0.25
305 0.22
306 0.19
307 0.15
308 0.15
309 0.13
310 0.1
311 0.14
312 0.15
313 0.15
314 0.18
315 0.22
316 0.22
317 0.21
318 0.25
319 0.29
320 0.37
321 0.42
322 0.48
323 0.48
324 0.56
325 0.66
326 0.72
327 0.72
328 0.68
329 0.73
330 0.72
331 0.75
332 0.73
333 0.71
334 0.69
335 0.67
336 0.68
337 0.66
338 0.61
339 0.59
340 0.55
341 0.54
342 0.47
343 0.42
344 0.4
345 0.33
346 0.32
347 0.27
348 0.26
349 0.21
350 0.21
351 0.24
352 0.21
353 0.22
354 0.22
355 0.24
356 0.25
357 0.24
358 0.25
359 0.24
360 0.23
361 0.28
362 0.28
363 0.26
364 0.26
365 0.3
366 0.29
367 0.35
368 0.36
369 0.39
370 0.46
371 0.57
372 0.65
373 0.71
374 0.77
375 0.78
376 0.85
377 0.86
378 0.84
379 0.84
380 0.79
381 0.71
382 0.68
383 0.61
384 0.52
385 0.44
386 0.43
387 0.35
388 0.33
389 0.32
390 0.27
391 0.25