Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2VBQ4

Protein Details
Accession A0A0A2VBQ4    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-67LAAPEPPSKRARRAMKKGKSATSKAKKDNDNNDLEHydrophilic
303-341GDEKDKDADKPKKKRSQPQKQQKQFKTRKWYVNRMLGREHydrophilic
349-368DDQSRYRKRFGKDRPANAAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
39-59PSKRARRAMKKGKSATSKAKK
181-203RPKKEPEAKEDGPADRKGGAKKP
312-326KPKKKRSQPQKQQKQ
355-382RKRFGKDRPANAAGQRGPRQDGGDGRRH
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSSDDKEMSPADASPETNPAKRKANVEEIEVDLAAPEPPSKRARRAMKKGKSATSKAKKDNDNNDLEEEETTNKDKKDDKAARSEHGVWIGNLRFTVTPQELRQWLIDNSGGVLTSDMITRVKLPLSKTPGRDKSEPATNKGFAYVDFSDIGGKVAAVALSETEWHGRRLLIKDSTSFEGRPKKEPEAKEDGPADRKGGAKKPAVDPNASRKIFVGNMSFKTTEDDLRRNFEKCGEIEWAKIATFEDTGKCKGYGWVKFKEAEAAAWAVKGFVKIKEAVETEDDFRDDSGGDNDDDDDDGDDGDEKDKDADKPKKKRSQPQKQQKQFKTRKWYVNRMLGRELKLELAEDDQSRYRKRFGKDRPANAAGQRGPRQDGGDGRRHEHKKAETAEDIQTARLMGRVVEHTGSKVTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.27
3 0.3
4 0.33
5 0.38
6 0.39
7 0.45
8 0.48
9 0.52
10 0.52
11 0.58
12 0.55
13 0.55
14 0.53
15 0.47
16 0.44
17 0.37
18 0.3
19 0.19
20 0.17
21 0.13
22 0.1
23 0.11
24 0.11
25 0.16
26 0.25
27 0.3
28 0.38
29 0.47
30 0.57
31 0.66
32 0.75
33 0.81
34 0.83
35 0.88
36 0.88
37 0.87
38 0.85
39 0.82
40 0.82
41 0.82
42 0.81
43 0.8
44 0.8
45 0.8
46 0.81
47 0.83
48 0.8
49 0.75
50 0.68
51 0.62
52 0.54
53 0.46
54 0.37
55 0.28
56 0.22
57 0.19
58 0.19
59 0.21
60 0.21
61 0.24
62 0.29
63 0.31
64 0.41
65 0.47
66 0.49
67 0.55
68 0.58
69 0.57
70 0.58
71 0.56
72 0.48
73 0.43
74 0.39
75 0.29
76 0.31
77 0.29
78 0.24
79 0.21
80 0.2
81 0.16
82 0.15
83 0.21
84 0.18
85 0.21
86 0.21
87 0.27
88 0.27
89 0.28
90 0.29
91 0.26
92 0.23
93 0.22
94 0.21
95 0.16
96 0.15
97 0.13
98 0.12
99 0.09
100 0.08
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.09
109 0.11
110 0.13
111 0.16
112 0.22
113 0.3
114 0.36
115 0.4
116 0.49
117 0.55
118 0.58
119 0.58
120 0.55
121 0.52
122 0.56
123 0.54
124 0.49
125 0.46
126 0.41
127 0.38
128 0.36
129 0.3
130 0.21
131 0.24
132 0.19
133 0.15
134 0.14
135 0.14
136 0.13
137 0.13
138 0.14
139 0.07
140 0.07
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.03
147 0.03
148 0.04
149 0.05
150 0.07
151 0.09
152 0.09
153 0.1
154 0.11
155 0.15
156 0.17
157 0.22
158 0.23
159 0.23
160 0.25
161 0.27
162 0.29
163 0.27
164 0.24
165 0.25
166 0.3
167 0.31
168 0.35
169 0.36
170 0.4
171 0.46
172 0.47
173 0.48
174 0.49
175 0.48
176 0.46
177 0.44
178 0.4
179 0.36
180 0.35
181 0.29
182 0.22
183 0.24
184 0.23
185 0.25
186 0.28
187 0.28
188 0.3
189 0.34
190 0.39
191 0.38
192 0.37
193 0.35
194 0.38
195 0.45
196 0.41
197 0.37
198 0.3
199 0.3
200 0.29
201 0.28
202 0.24
203 0.18
204 0.2
205 0.23
206 0.23
207 0.21
208 0.22
209 0.21
210 0.21
211 0.21
212 0.24
213 0.23
214 0.28
215 0.3
216 0.29
217 0.28
218 0.26
219 0.26
220 0.21
221 0.22
222 0.22
223 0.2
224 0.2
225 0.2
226 0.18
227 0.15
228 0.15
229 0.12
230 0.08
231 0.09
232 0.09
233 0.11
234 0.12
235 0.14
236 0.15
237 0.15
238 0.14
239 0.18
240 0.24
241 0.29
242 0.32
243 0.35
244 0.36
245 0.37
246 0.37
247 0.37
248 0.3
249 0.22
250 0.18
251 0.16
252 0.13
253 0.12
254 0.12
255 0.08
256 0.08
257 0.1
258 0.1
259 0.09
260 0.12
261 0.13
262 0.14
263 0.18
264 0.18
265 0.18
266 0.2
267 0.2
268 0.2
269 0.19
270 0.19
271 0.15
272 0.14
273 0.13
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.09
284 0.08
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.08
291 0.08
292 0.07
293 0.1
294 0.12
295 0.16
296 0.25
297 0.35
298 0.44
299 0.54
300 0.65
301 0.73
302 0.79
303 0.86
304 0.87
305 0.89
306 0.9
307 0.91
308 0.92
309 0.92
310 0.94
311 0.93
312 0.93
313 0.92
314 0.9
315 0.9
316 0.87
317 0.87
318 0.86
319 0.87
320 0.84
321 0.84
322 0.81
323 0.74
324 0.73
325 0.68
326 0.61
327 0.53
328 0.45
329 0.36
330 0.31
331 0.26
332 0.2
333 0.16
334 0.17
335 0.16
336 0.18
337 0.22
338 0.27
339 0.31
340 0.33
341 0.38
342 0.42
343 0.48
344 0.55
345 0.61
346 0.67
347 0.72
348 0.78
349 0.8
350 0.77
351 0.75
352 0.67
353 0.65
354 0.58
355 0.57
356 0.54
357 0.49
358 0.48
359 0.45
360 0.45
361 0.41
362 0.44
363 0.42
364 0.45
365 0.45
366 0.46
367 0.54
368 0.55
369 0.55
370 0.55
371 0.55
372 0.55
373 0.58
374 0.6
375 0.55
376 0.55
377 0.55
378 0.51
379 0.46
380 0.37
381 0.31
382 0.25
383 0.21
384 0.18
385 0.15
386 0.1
387 0.13
388 0.15
389 0.18
390 0.2
391 0.21
392 0.21
393 0.24