FuNGI

A0A0A2VU78

Protein Details

Accession

A0A0A2VU78

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
598-625	GSDTQRQDRRNNRRQNNRRDRGERNDRG	Basic
686-717	ADKQQKSRDEQQPRRERNRRRSDEKRQAQQEV	Hydrophilic
734-755	ERTQVMQRRKPRQLSQKVRIES	Hydrophilic
800-834	ETAGMPRRSRRSPRHLRVSGQRRRRYRDERYPAVS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
609-630	NRRQNNRRDRGERNDRGDRNNR
647-661	REAREPREGRDENRR
700-706	RERNRRR
805-824	PRRSRRSPRHLRVSGQRRRR

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 9.499, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012340 NA-bd_OB-fold IPR021968 PNPase_C IPR019307 RNA-bd_AU-1/RNase_E/G IPR028878 RNase_E IPR004659 RNase_E/G IPR022967 S1_dom IPR003029 S1_domain
Gene Ontology	GO:0046872 F:metal ion binding GO:0008995 F:ribonuclease E activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0006396 P:RNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF12111 PNPase_C PF10150 RNase_E_G PF00575 S1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50126 S1
CDD	cd04453 S1_RNase_E

Amino Acid Sequences

MLINATQQEELRVALVDGQRLYDLDIESPGHEQKKANIYKGKITRIEPSLEAAFVDYGAERHGFLPLKEIAREYFPSNYSSHGRPNIKDVLREGQEVIVQIDKEERGNKGAALTTFISLAGSYLVLMPNNPRAGGISRRIEGDDRTELKEALSSLELPDGMGLIVRTAGVGKSAEALQWDLSFRLKHWEAIQKAAENRPAPFLIHQESNVIVRAFRDYLRQDIGEILIDNPKVLELARQHIAALGRPDFSSKIKLYTGEIPLFSHYQIESQIESAFQREVRLPSGGSIVIDTTEALTAIDINSARATRGGDIEETAFNTNLEAADEIARQLRLRDLGGLIVIDFIDMTPVRHQRAVENRLREAVRQDRARIQISHISRFGLLEMSRQRLSPSLGESSHHVCPRCSGTGTIRDNESLSLSILRLIEEEALKENTKEVHAIVPVPIASYLLNEKRDAVSAIEKRQGGVRAIIVPNDQMETPHYSVLRVRKGEETQTLSYMLPKLHEEEMAMPSDEEYTERKRPEQPALATFVMPEVPPAPQETAAEKPAAAAVKPAAQPKADAAEQPGLVSRFFSALKKLFAGDSAAAEVKEVKEEKAAGSDTQRQDRRNNRRQNNRRDRGERNDRGDRNNRDNRENRNNRDDRNNEGREAREPREGRDENRRNRRNGQQQNAEVREARQNVNAVDDADKQQKSRDEQQPRRERNRRRSDEKRQAQQEVKALQQDNVVEQDAEQEERTQVMQRRKPRQLSQKVRIESADASSAVEETQVAQAVTEQAPVALPAVVEAPGNAEQQDENGENRETAGMPRRSRRSPRHLRVSGQRRRRYRDERYPAVSPMPLAAACASPELASGKVFITYPVARPHDQLAQEEAFQAHEEVQHVNVAEAAAVEAVAPEEDVQAIEPVKAVETVIEPAVVETTLPEVIAAPEAEQPQPVAAVDEAPAAETVEHITPAQEETVQPAAETSEPAPVAVEAPAVEEVPVAVVEEVKPVVEAAPVVAAPATQEVNTESSAVAKHATAPMTRAPAPEYTPEAPRHSDWVRPDFTFSGKGSAGGHSASHQATAPATRPQSAE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.17
3	0.19
4	0.19
5	0.19
6	0.19
7	0.18
8	0.2
9	0.17
10	0.16
11	0.14
12	0.16
13	0.16
14	0.16
15	0.2
16	0.24
17	0.23
18	0.26
19	0.26
20	0.31
21	0.41
22	0.46
23	0.51
24	0.53
25	0.54
26	0.61
27	0.67
28	0.68
29	0.64
30	0.61
31	0.6
32	0.56
33	0.57
34	0.48
35	0.44
36	0.37
37	0.31
38	0.28
39	0.22
40	0.18
41	0.14
42	0.13
43	0.09
44	0.07
45	0.09
46	0.1
47	0.09
48	0.1
49	0.15
50	0.17
51	0.16
52	0.22
53	0.25
54	0.28
55	0.28
56	0.3
57	0.26
58	0.29
59	0.31
60	0.29
61	0.29
62	0.27
63	0.29
64	0.27
65	0.3
66	0.3
67	0.31
68	0.36
69	0.4
70	0.45
71	0.43
72	0.49
73	0.54
74	0.52
75	0.52
76	0.48
77	0.48
78	0.45
79	0.45
80	0.39
81	0.31
82	0.3
83	0.27
84	0.25
85	0.19
86	0.16
87	0.15
88	0.17
89	0.17
90	0.19
91	0.22
92	0.22
93	0.22
94	0.23
95	0.23
96	0.22
97	0.25
98	0.22
99	0.23
100	0.22
101	0.19
102	0.18
103	0.18
104	0.15
105	0.11
106	0.11
107	0.07
108	0.06
109	0.05
110	0.06
111	0.08
112	0.08
113	0.09
114	0.12
115	0.18
116	0.19
117	0.19
118	0.17
119	0.19
120	0.23
121	0.29
122	0.34
123	0.33
124	0.33
125	0.35
126	0.37
127	0.36
128	0.34
129	0.33
130	0.33
131	0.31
132	0.34
133	0.34
134	0.32
135	0.3
136	0.3
137	0.25
138	0.18
139	0.17
140	0.14
141	0.13
142	0.14
143	0.13
144	0.11
145	0.11
146	0.08
147	0.07
148	0.07
149	0.06
150	0.05
151	0.05
152	0.05
153	0.05
154	0.05
155	0.06
156	0.07
157	0.07
158	0.07
159	0.09
160	0.1
161	0.1
162	0.11
163	0.12
164	0.11
165	0.12
166	0.13
167	0.12
168	0.15
169	0.15
170	0.14
171	0.22
172	0.22
173	0.24
174	0.29
175	0.37
176	0.36
177	0.42
178	0.45
179	0.41
180	0.44
181	0.46
182	0.46
183	0.39
184	0.38
185	0.36
186	0.33
187	0.29
188	0.27
189	0.27
190	0.25
191	0.25
192	0.25
193	0.22
194	0.22
195	0.22
196	0.23
197	0.18
198	0.14
199	0.13
200	0.16
201	0.16
202	0.16
203	0.21
204	0.2
205	0.24
206	0.27
207	0.26
208	0.24
209	0.23
210	0.23
211	0.18
212	0.16
213	0.13
214	0.14
215	0.13
216	0.13
217	0.11
218	0.11
219	0.1
220	0.09
221	0.13
222	0.11
223	0.16
224	0.19
225	0.19
226	0.19
227	0.21
228	0.22
229	0.2
230	0.22
231	0.18
232	0.17
233	0.17
234	0.19
235	0.19
236	0.2
237	0.24
238	0.2
239	0.23
240	0.23
241	0.24
242	0.25
243	0.3
244	0.33
245	0.29
246	0.28
247	0.26
248	0.27
249	0.27
250	0.23
251	0.18
252	0.13
253	0.12
254	0.13
255	0.14
256	0.12
257	0.12
258	0.12
259	0.11
260	0.12
261	0.12
262	0.12
263	0.1
264	0.12
265	0.14
266	0.16
267	0.17
268	0.18
269	0.17
270	0.16
271	0.18
272	0.16
273	0.13
274	0.11
275	0.09
276	0.08
277	0.08
278	0.07
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.07
287	0.06
288	0.07
289	0.08
290	0.08
291	0.09
292	0.1
293	0.1
294	0.09
295	0.11
296	0.12
297	0.11
298	0.12
299	0.13
300	0.13
301	0.13
302	0.13
303	0.12
304	0.1
305	0.1
306	0.09
307	0.08
308	0.08
309	0.06
310	0.06
311	0.07
312	0.07
313	0.08
314	0.09
315	0.1
316	0.09
317	0.1
318	0.11
319	0.11
320	0.12
321	0.12
322	0.11
323	0.11
324	0.11
325	0.1
326	0.08
327	0.07
328	0.06
329	0.04
330	0.04
331	0.03
332	0.05
333	0.05
334	0.06
335	0.11
336	0.15
337	0.17
338	0.19
339	0.2
340	0.25
341	0.34
342	0.41
343	0.42
344	0.43
345	0.43
346	0.46
347	0.46
348	0.4
349	0.37
350	0.37
351	0.38
352	0.36
353	0.38
354	0.39
355	0.43
356	0.45
357	0.4
358	0.36
359	0.36
360	0.36
361	0.37
362	0.32
363	0.28
364	0.25
365	0.24
366	0.21
367	0.17
368	0.14
369	0.15
370	0.18
371	0.21
372	0.21
373	0.21
374	0.22
375	0.2
376	0.22
377	0.18
378	0.18
379	0.18
380	0.18
381	0.18
382	0.2
383	0.22
384	0.25
385	0.26
386	0.24
387	0.2
388	0.23
389	0.26
390	0.25
391	0.23
392	0.2
393	0.21
394	0.3
395	0.33
396	0.32
397	0.29
398	0.27
399	0.26
400	0.24
401	0.21
402	0.12
403	0.1
404	0.09
405	0.08
406	0.09
407	0.09
408	0.09
409	0.08
410	0.08
411	0.09
412	0.08
413	0.09
414	0.09
415	0.11
416	0.11
417	0.11
418	0.11
419	0.11
420	0.11
421	0.11
422	0.09
423	0.1
424	0.1
425	0.11
426	0.1
427	0.1
428	0.09
429	0.09
430	0.08
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.1
435	0.13
436	0.14
437	0.14
438	0.15
439	0.15
440	0.16
441	0.16
442	0.13
443	0.17
444	0.2
445	0.22
446	0.26
447	0.25
448	0.25
449	0.27
450	0.27
451	0.21
452	0.18
453	0.16
454	0.16
455	0.17
456	0.17
457	0.15
458	0.13
459	0.12
460	0.12
461	0.11
462	0.06
463	0.08
464	0.12
465	0.12
466	0.14
467	0.14
468	0.13
469	0.17
470	0.22
471	0.26
472	0.23
473	0.24
474	0.26
475	0.28
476	0.3
477	0.31
478	0.3
479	0.26
480	0.26
481	0.25
482	0.21
483	0.21
484	0.19
485	0.15
486	0.11
487	0.11
488	0.12
489	0.12
490	0.12
491	0.11
492	0.12
493	0.13
494	0.12
495	0.12
496	0.09
497	0.09
498	0.09
499	0.08
500	0.07
501	0.08
502	0.12
503	0.17
504	0.18
505	0.21
506	0.25
507	0.29
508	0.34
509	0.38
510	0.35
511	0.33
512	0.37
513	0.35
514	0.3
515	0.26
516	0.2
517	0.14
518	0.12
519	0.1
520	0.05
521	0.05
522	0.05
523	0.07
524	0.07
525	0.07
526	0.08
527	0.1
528	0.12
529	0.13
530	0.12
531	0.11
532	0.1
533	0.11
534	0.11
535	0.08
536	0.07
537	0.06
538	0.1
539	0.13
540	0.15
541	0.14
542	0.14
543	0.14
544	0.14
545	0.17
546	0.13
547	0.12
548	0.12
549	0.13
550	0.13
551	0.13
552	0.14
553	0.11
554	0.11
555	0.11
556	0.09
557	0.08
558	0.09
559	0.09
560	0.12
561	0.13
562	0.14
563	0.14
564	0.15
565	0.13
566	0.13
567	0.13
568	0.1
569	0.08
570	0.08
571	0.08
572	0.08
573	0.08
574	0.08
575	0.06
576	0.09
577	0.09
578	0.08
579	0.09
580	0.1
581	0.1
582	0.12
583	0.13
584	0.11
585	0.14
586	0.21
587	0.22
588	0.3
589	0.34
590	0.34
591	0.41
592	0.5
593	0.58
594	0.61
595	0.69
596	0.7
597	0.78
598	0.85
599	0.89
600	0.9
601	0.88
602	0.86
603	0.83
604	0.81
605	0.8
606	0.81
607	0.76
608	0.72
609	0.72
610	0.66
611	0.67
612	0.69
613	0.65
614	0.64
615	0.65
616	0.61
617	0.6
618	0.63
619	0.65
620	0.67
621	0.69
622	0.65
623	0.68
624	0.69
625	0.64
626	0.67
627	0.61
628	0.57
629	0.58
630	0.54
631	0.45
632	0.43
633	0.42
634	0.38
635	0.42
636	0.36
637	0.35
638	0.34
639	0.34
640	0.42
641	0.42
642	0.39
643	0.45
644	0.52
645	0.54
646	0.64
647	0.68
648	0.63
649	0.68
650	0.74
651	0.74
652	0.74
653	0.73
654	0.7
655	0.7
656	0.73
657	0.69
658	0.61
659	0.51
660	0.43
661	0.4
662	0.34
663	0.29
664	0.23
665	0.22
666	0.21
667	0.22
668	0.21
669	0.16
670	0.15
671	0.16
672	0.17
673	0.21
674	0.22
675	0.2
676	0.23
677	0.27
678	0.3
679	0.38
680	0.44
681	0.49
682	0.58
683	0.68
684	0.75
685	0.8
686	0.85
687	0.85
688	0.86
689	0.86
690	0.89
691	0.87
692	0.86
693	0.87
694	0.88
695	0.89
696	0.88
697	0.86
698	0.8
699	0.79
700	0.73
701	0.67
702	0.62
703	0.53
704	0.46
705	0.42
706	0.37
707	0.31
708	0.29
709	0.25
710	0.2
711	0.19
712	0.17
713	0.12
714	0.11
715	0.13
716	0.11
717	0.12
718	0.11
719	0.1
720	0.1
721	0.11
722	0.12
723	0.14
724	0.2
725	0.29
726	0.35
727	0.44
728	0.53
729	0.61
730	0.68
731	0.72
732	0.76
733	0.78
734	0.82
735	0.82
736	0.81
737	0.75
738	0.69
739	0.6
740	0.52
741	0.42
742	0.33
743	0.25
744	0.16
745	0.15
746	0.13
747	0.13
748	0.1
749	0.08
750	0.07
751	0.05
752	0.06
753	0.07
754	0.06
755	0.06
756	0.07
757	0.1
758	0.1
759	0.09
760	0.08
761	0.07
762	0.07
763	0.08
764	0.08
765	0.05
766	0.05
767	0.05
768	0.06
769	0.06
770	0.06
771	0.05
772	0.08
773	0.09
774	0.1
775	0.1
776	0.1
777	0.09
778	0.1
779	0.13
780	0.12
781	0.11
782	0.13
783	0.14
784	0.13
785	0.14
786	0.14
787	0.12
788	0.14
789	0.22
790	0.27
791	0.31
792	0.39
793	0.45
794	0.52
795	0.62
796	0.68
797	0.7
798	0.74
799	0.8
800	0.83
801	0.81
802	0.8
803	0.8
804	0.81
805	0.8
806	0.79
807	0.78
808	0.75
809	0.78
810	0.82
811	0.81
812	0.81
813	0.82
814	0.81
815	0.81
816	0.78
817	0.73
818	0.65
819	0.58
820	0.48
821	0.37
822	0.28
823	0.21
824	0.15
825	0.13
826	0.11
827	0.09
828	0.09
829	0.1
830	0.09
831	0.07
832	0.08
833	0.09
834	0.09
835	0.08
836	0.09
837	0.09
838	0.09
839	0.1
840	0.09
841	0.13
842	0.14
843	0.18
844	0.24
845	0.29
846	0.29
847	0.3
848	0.33
849	0.34
850	0.35
851	0.33
852	0.3
853	0.27
854	0.26
855	0.26
856	0.23
857	0.17
858	0.16
859	0.14
860	0.1
861	0.1
862	0.11
863	0.11
864	0.11
865	0.12
866	0.12
867	0.11
868	0.11
869	0.09
870	0.08
871	0.07
872	0.06
873	0.05
874	0.04
875	0.04
876	0.03
877	0.04
878	0.04
879	0.04
880	0.04
881	0.04
882	0.05
883	0.05
884	0.05
885	0.07
886	0.08
887	0.08
888	0.08
889	0.08
890	0.08
891	0.09
892	0.08
893	0.07
894	0.08
895	0.1
896	0.1
897	0.09
898	0.09
899	0.09
900	0.09
901	0.08
902	0.07
903	0.05
904	0.07
905	0.07
906	0.07
907	0.06
908	0.06
909	0.07
910	0.09
911	0.09
912	0.08
913	0.12
914	0.14
915	0.14
916	0.14
917	0.14
918	0.13
919	0.13
920	0.12
921	0.1
922	0.08
923	0.09
924	0.09
925	0.1
926	0.09
927	0.09
928	0.09
929	0.08
930	0.08
931	0.07
932	0.09
933	0.09
934	0.09
935	0.09
936	0.09
937	0.1
938	0.11
939	0.12
940	0.11
941	0.1
942	0.14
943	0.18
944	0.17
945	0.16
946	0.15
947	0.16
948	0.15
949	0.17
950	0.13
951	0.14
952	0.14
953	0.15
954	0.15
955	0.13
956	0.14
957	0.12
958	0.12
959	0.07
960	0.09
961	0.09
962	0.09
963	0.08
964	0.07
965	0.07
966	0.07
967	0.07
968	0.06
969	0.05
970	0.06
971	0.06
972	0.09
973	0.09
974	0.08
975	0.08
976	0.08
977	0.08
978	0.08
979	0.08
980	0.06
981	0.08
982	0.08
983	0.08
984	0.07
985	0.07
986	0.07
987	0.09
988	0.1
989	0.08
990	0.09
991	0.11
992	0.13
993	0.14
994	0.14
995	0.11
996	0.12
997	0.13
998	0.13
999	0.13
1000	0.11
1001	0.13
1002	0.17
1003	0.19
1004	0.18
1005	0.21
1006	0.25
1007	0.29
1008	0.31
1009	0.29
1010	0.28
1011	0.29
1012	0.31
1013	0.32
1014	0.34
1015	0.31
1016	0.35
1017	0.39
1018	0.41
1019	0.42
1020	0.4
1021	0.43
1022	0.39
1023	0.42
1024	0.43
1025	0.47
1026	0.47
1027	0.44
1028	0.47
1029	0.42
1030	0.43
1031	0.42
1032	0.36
1033	0.33
1034	0.29
1035	0.29
1036	0.26
1037	0.25
1038	0.24
1039	0.19
1040	0.19
1041	0.15
1042	0.19
1043	0.18
1044	0.18
1045	0.17
1046	0.16
1047	0.17
1048	0.2
1049	0.22
1050	0.25
1051	0.27

A0A0A2VU78

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer