Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2W4T3

Protein Details
Accession A0A0A2W4T3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-121EDLYLPYKPKRRTRGQIAIEAHydrophilic
736-755SNAPREQKGRPAAQQKPRGRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
740-753REQKGRPAAQQKPR
Subcellular Location(s) cyto 17, mito 6, nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041692  HHH_9  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR022967  S1_dom  
IPR003029  S1_domain  
IPR044146  S1_Tex  
IPR023323  Tex-like_dom_sf  
IPR023319  Tex-like_HTH_dom_sf  
IPR018974  Tex-like_N  
IPR032639  Tex_YqgF  
IPR006641  YqgF/RNaseH-like_dom  
IPR037027  YqgF/RNaseH-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000791  C:euchromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005721  C:pericentric heterochromatin  
GO:0042393  F:histone binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0031491  F:nucleosome binding  
GO:0001073  F:transcription antitermination factor activity, DNA binding  
GO:0000433  P:carbon catabolite repression of transcription from RNA polymerase II promoter by glucose  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006334  P:nucleosome assembly  
GO:0016973  P:poly(A)+ mRNA export from nucleus  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0071931  P:positive regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle  
GO:0031440  P:regulation of mRNA 3'-end processing  
GO:0001178  P:regulation of transcriptional start site selection at RNA polymerase II promoter  
GO:0140673  P:transcription elongation-coupled chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF12836  HHH_3  
PF17674  HHH_9  
PF00575  S1  
PF09371  Tex_N  
PF16921  Tex_YqgF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50126  S1  
CDD cd05685  S1_Tex  
Amino Acid Sequences MMNDSLCRIIAGELQARNEQVEAAVRLLDEGNTVPFIARYRKEVTGGLDDTQLRQLETRLSYLRELEERRQAILKSISEQGKLSDELAGAINGTLSKTELEDLYLPYKPKRRTRGQIAIEAGLEPLADLLWNEPSHDPEQEAARFVDADKGVADTKAALDGARYILMERFAEDAVLLAKVRDYLWKNAHLVSAVVSGKEEEGAKFRDYFTHHEAIATVPSHRALAMFRGRNEGILQLSLNADPQFDEPPRESYCEQLIMNHLDLRLNNAPADSWRKAVVSWTWRIKVLMHLETELMGTVRERAEDEAINVFARNLHDLLMAAPAGLRATMGLDPGLRTGVKVAVVDATGKLVATDTIYPHTGQAAKAAVAVAALCEKHNVELVAIGNGTASRETERFFLDVQKQFPKVTAQKVIVSEAGASVYSASELAALEFPDLDVSIRGAVSIARRLQDPLAELVKIDPKSIGVGQYQHDVSQTQLAKKLDAVVEDCVNAVGVDLNTASVPLLTRVAGLTRMMAQNIVTWRDENGRFQNRQQLLKVSRLGPKAFEQCAGFLRINHGDNPLDASTVHPEAYPVVERILAATQQALQDLMGNSSELRDLKASQFTDERFGVPTVTDIIKELEKPGRDPRPEFKTAQFAEGVETMNDLTPGMVLEGAVTNVTNFGAFVDIGVHQDGLVHISSLSDKFIDDPHKVVKAGDIVKVKVLEVDLQRKRIALTMRLDEQPGEGGSRRGNGSNAPREQKGRPAAQQKPRGRENAGGGNSAMMDALAAAMGKKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.3
3 0.29
4 0.29
5 0.25
6 0.21
7 0.16
8 0.18
9 0.17
10 0.15
11 0.15
12 0.14
13 0.15
14 0.15
15 0.14
16 0.11
17 0.1
18 0.11
19 0.11
20 0.11
21 0.1
22 0.11
23 0.15
24 0.21
25 0.23
26 0.26
27 0.31
28 0.34
29 0.37
30 0.38
31 0.39
32 0.39
33 0.39
34 0.35
35 0.35
36 0.33
37 0.32
38 0.34
39 0.29
40 0.22
41 0.21
42 0.21
43 0.22
44 0.24
45 0.27
46 0.26
47 0.28
48 0.29
49 0.3
50 0.33
51 0.34
52 0.37
53 0.38
54 0.44
55 0.42
56 0.43
57 0.45
58 0.41
59 0.41
60 0.42
61 0.37
62 0.32
63 0.38
64 0.38
65 0.36
66 0.36
67 0.31
68 0.29
69 0.28
70 0.25
71 0.19
72 0.16
73 0.16
74 0.16
75 0.14
76 0.1
77 0.09
78 0.09
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.06
83 0.07
84 0.08
85 0.09
86 0.09
87 0.11
88 0.13
89 0.15
90 0.18
91 0.21
92 0.22
93 0.28
94 0.36
95 0.42
96 0.5
97 0.57
98 0.63
99 0.7
100 0.78
101 0.83
102 0.8
103 0.79
104 0.73
105 0.66
106 0.56
107 0.46
108 0.35
109 0.24
110 0.18
111 0.1
112 0.06
113 0.04
114 0.04
115 0.03
116 0.05
117 0.09
118 0.09
119 0.12
120 0.13
121 0.17
122 0.19
123 0.2
124 0.2
125 0.18
126 0.23
127 0.22
128 0.24
129 0.2
130 0.18
131 0.18
132 0.17
133 0.21
134 0.16
135 0.15
136 0.13
137 0.15
138 0.15
139 0.14
140 0.14
141 0.08
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.07
146 0.07
147 0.08
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.12
154 0.11
155 0.11
156 0.12
157 0.11
158 0.11
159 0.1
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.08
168 0.14
169 0.17
170 0.24
171 0.28
172 0.33
173 0.35
174 0.35
175 0.36
176 0.29
177 0.26
178 0.2
179 0.2
180 0.16
181 0.14
182 0.13
183 0.13
184 0.12
185 0.13
186 0.13
187 0.08
188 0.12
189 0.15
190 0.16
191 0.17
192 0.17
193 0.2
194 0.22
195 0.28
196 0.3
197 0.3
198 0.29
199 0.28
200 0.28
201 0.24
202 0.24
203 0.19
204 0.13
205 0.11
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.08
211 0.14
212 0.22
213 0.25
214 0.25
215 0.31
216 0.31
217 0.31
218 0.31
219 0.26
220 0.19
221 0.16
222 0.15
223 0.1
224 0.11
225 0.1
226 0.12
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.13
232 0.13
233 0.15
234 0.15
235 0.19
236 0.21
237 0.24
238 0.23
239 0.22
240 0.24
241 0.24
242 0.23
243 0.2
244 0.22
245 0.2
246 0.2
247 0.19
248 0.17
249 0.15
250 0.15
251 0.2
252 0.19
253 0.18
254 0.17
255 0.15
256 0.15
257 0.17
258 0.24
259 0.19
260 0.17
261 0.18
262 0.18
263 0.18
264 0.2
265 0.23
266 0.22
267 0.27
268 0.32
269 0.32
270 0.33
271 0.33
272 0.31
273 0.31
274 0.31
275 0.27
276 0.22
277 0.22
278 0.21
279 0.2
280 0.2
281 0.14
282 0.08
283 0.06
284 0.05
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.08
290 0.1
291 0.1
292 0.11
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.1
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.09
306 0.08
307 0.07
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.04
312 0.04
313 0.03
314 0.02
315 0.04
316 0.04
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.06
324 0.05
325 0.06
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.06
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.04
339 0.04
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.07
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.1
348 0.1
349 0.09
350 0.11
351 0.1
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.06
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.04
377 0.04
378 0.05
379 0.06
380 0.07
381 0.08
382 0.09
383 0.1
384 0.1
385 0.14
386 0.2
387 0.23
388 0.25
389 0.28
390 0.28
391 0.27
392 0.28
393 0.29
394 0.26
395 0.27
396 0.29
397 0.27
398 0.28
399 0.28
400 0.29
401 0.23
402 0.19
403 0.15
404 0.1
405 0.09
406 0.06
407 0.05
408 0.04
409 0.04
410 0.03
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.03
415 0.04
416 0.04
417 0.05
418 0.05
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.03
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.05
431 0.06
432 0.1
433 0.12
434 0.12
435 0.13
436 0.14
437 0.14
438 0.14
439 0.14
440 0.14
441 0.13
442 0.12
443 0.12
444 0.12
445 0.17
446 0.16
447 0.15
448 0.12
449 0.11
450 0.13
451 0.14
452 0.14
453 0.1
454 0.12
455 0.13
456 0.16
457 0.16
458 0.15
459 0.15
460 0.13
461 0.12
462 0.16
463 0.18
464 0.16
465 0.21
466 0.21
467 0.21
468 0.21
469 0.24
470 0.18
471 0.17
472 0.17
473 0.13
474 0.13
475 0.13
476 0.13
477 0.1
478 0.09
479 0.07
480 0.06
481 0.05
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.05
486 0.04
487 0.05
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.04
492 0.05
493 0.05
494 0.06
495 0.06
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.1
501 0.1
502 0.1
503 0.1
504 0.1
505 0.12
506 0.14
507 0.16
508 0.14
509 0.13
510 0.15
511 0.21
512 0.22
513 0.23
514 0.3
515 0.36
516 0.37
517 0.39
518 0.47
519 0.46
520 0.48
521 0.45
522 0.45
523 0.4
524 0.43
525 0.45
526 0.4
527 0.42
528 0.42
529 0.41
530 0.34
531 0.37
532 0.37
533 0.34
534 0.32
535 0.27
536 0.25
537 0.26
538 0.27
539 0.22
540 0.17
541 0.21
542 0.23
543 0.23
544 0.23
545 0.24
546 0.2
547 0.19
548 0.23
549 0.19
550 0.15
551 0.13
552 0.14
553 0.14
554 0.15
555 0.15
556 0.11
557 0.11
558 0.11
559 0.13
560 0.13
561 0.1
562 0.1
563 0.1
564 0.1
565 0.11
566 0.12
567 0.1
568 0.09
569 0.09
570 0.1
571 0.1
572 0.1
573 0.09
574 0.08
575 0.1
576 0.11
577 0.11
578 0.09
579 0.09
580 0.09
581 0.09
582 0.12
583 0.09
584 0.1
585 0.11
586 0.12
587 0.15
588 0.22
589 0.22
590 0.22
591 0.26
592 0.26
593 0.29
594 0.28
595 0.26
596 0.22
597 0.22
598 0.19
599 0.15
600 0.15
601 0.13
602 0.13
603 0.12
604 0.11
605 0.13
606 0.14
607 0.14
608 0.18
609 0.2
610 0.2
611 0.24
612 0.32
613 0.39
614 0.43
615 0.47
616 0.52
617 0.54
618 0.58
619 0.58
620 0.52
621 0.53
622 0.49
623 0.47
624 0.4
625 0.32
626 0.29
627 0.27
628 0.24
629 0.14
630 0.14
631 0.12
632 0.11
633 0.11
634 0.08
635 0.06
636 0.05
637 0.06
638 0.05
639 0.05
640 0.04
641 0.05
642 0.05
643 0.06
644 0.06
645 0.05
646 0.05
647 0.06
648 0.06
649 0.05
650 0.05
651 0.05
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.07
656 0.07
657 0.09
658 0.1
659 0.09
660 0.08
661 0.09
662 0.09
663 0.09
664 0.08
665 0.07
666 0.07
667 0.07
668 0.1
669 0.1
670 0.11
671 0.09
672 0.09
673 0.1
674 0.16
675 0.2
676 0.2
677 0.23
678 0.27
679 0.3
680 0.31
681 0.3
682 0.28
683 0.3
684 0.31
685 0.34
686 0.33
687 0.31
688 0.34
689 0.34
690 0.31
691 0.25
692 0.23
693 0.23
694 0.25
695 0.35
696 0.36
697 0.4
698 0.4
699 0.39
700 0.39
701 0.38
702 0.37
703 0.34
704 0.35
705 0.38
706 0.42
707 0.43
708 0.43
709 0.38
710 0.34
711 0.29
712 0.23
713 0.2
714 0.17
715 0.17
716 0.18
717 0.22
718 0.23
719 0.23
720 0.24
721 0.28
722 0.36
723 0.43
724 0.49
725 0.51
726 0.53
727 0.57
728 0.58
729 0.6
730 0.59
731 0.57
732 0.57
733 0.62
734 0.67
735 0.73
736 0.8
737 0.79
738 0.8
739 0.8
740 0.77
741 0.71
742 0.68
743 0.65
744 0.64
745 0.58
746 0.5
747 0.43
748 0.38
749 0.33
750 0.27
751 0.19
752 0.09
753 0.06
754 0.04
755 0.04
756 0.04
757 0.04