Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2VRD0

Protein Details
Accession A0A0A2VRD0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
400-426KTSPEAPKVLTRKKKPVNVFMKRPVRRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
411-426RKKKPVNVFMKRPVRR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPVKSLYEMATAVAVKNIESIVSVGYLSYSSVRHILLKVDNARQLRQIELNCPQLHGETGELWLRLIEKDFPLEFKAKAYMPKSQDKWFKVWEKYKVDHDRSIRESEEQLRAALMGLRQDKEKNTSKIVEGRFLPSDAIRPKKRNGPKDHTTGVLTFGGGSRTRTLTGAGVMRKARREAREVRNIQGALSRSVVAPIRLLEKQHLKAPPPAMVRERRIAAQPAFRTPETEEREQRLQELEKKRAAALEEHSQRAAYITDSEEDSDMDQEPTYKPPKQRATPVSATVAGPSSSSTPVKPTVPGRKVIGSRGSMFQRKFGAGKSVKSPTKPVRVTTTTTTTTASRDMSPTAKKRTTSSAKLDEPAAGPSKRPATEPAQVSPNRVLPRQPSPPEDIARSMSLKTSPEAPKVLTRKKKPVNVFMKRPVRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.12
3 0.13
4 0.12
5 0.09
6 0.09
7 0.09
8 0.08
9 0.08
10 0.08
11 0.07
12 0.07
13 0.07
14 0.08
15 0.09
16 0.09
17 0.1
18 0.13
19 0.14
20 0.16
21 0.17
22 0.22
23 0.24
24 0.32
25 0.36
26 0.39
27 0.45
28 0.45
29 0.46
30 0.46
31 0.43
32 0.39
33 0.4
34 0.36
35 0.37
36 0.4
37 0.46
38 0.41
39 0.4
40 0.37
41 0.32
42 0.3
43 0.25
44 0.2
45 0.12
46 0.15
47 0.16
48 0.15
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.13
53 0.15
54 0.15
55 0.13
56 0.18
57 0.19
58 0.2
59 0.22
60 0.24
61 0.23
62 0.21
63 0.24
64 0.22
65 0.28
66 0.29
67 0.34
68 0.37
69 0.46
70 0.48
71 0.53
72 0.59
73 0.56
74 0.59
75 0.59
76 0.61
77 0.62
78 0.66
79 0.66
80 0.65
81 0.65
82 0.7
83 0.72
84 0.69
85 0.67
86 0.63
87 0.62
88 0.58
89 0.59
90 0.5
91 0.42
92 0.4
93 0.38
94 0.39
95 0.32
96 0.28
97 0.24
98 0.22
99 0.2
100 0.18
101 0.14
102 0.14
103 0.17
104 0.17
105 0.2
106 0.22
107 0.24
108 0.29
109 0.37
110 0.35
111 0.36
112 0.38
113 0.39
114 0.44
115 0.43
116 0.41
117 0.34
118 0.34
119 0.31
120 0.29
121 0.26
122 0.19
123 0.24
124 0.25
125 0.33
126 0.36
127 0.39
128 0.42
129 0.51
130 0.6
131 0.63
132 0.67
133 0.67
134 0.67
135 0.7
136 0.68
137 0.6
138 0.53
139 0.43
140 0.36
141 0.27
142 0.2
143 0.14
144 0.12
145 0.12
146 0.11
147 0.12
148 0.11
149 0.12
150 0.12
151 0.13
152 0.13
153 0.11
154 0.13
155 0.16
156 0.15
157 0.18
158 0.2
159 0.22
160 0.23
161 0.26
162 0.3
163 0.28
164 0.34
165 0.4
166 0.46
167 0.54
168 0.54
169 0.53
170 0.52
171 0.49
172 0.43
173 0.37
174 0.29
175 0.2
176 0.19
177 0.17
178 0.12
179 0.13
180 0.14
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.11
185 0.12
186 0.12
187 0.15
188 0.2
189 0.21
190 0.26
191 0.27
192 0.26
193 0.3
194 0.31
195 0.33
196 0.29
197 0.3
198 0.3
199 0.33
200 0.34
201 0.32
202 0.32
203 0.27
204 0.27
205 0.29
206 0.26
207 0.26
208 0.25
209 0.26
210 0.28
211 0.27
212 0.26
213 0.24
214 0.31
215 0.3
216 0.34
217 0.34
218 0.35
219 0.38
220 0.36
221 0.35
222 0.29
223 0.27
224 0.3
225 0.34
226 0.35
227 0.34
228 0.35
229 0.34
230 0.32
231 0.3
232 0.25
233 0.22
234 0.26
235 0.27
236 0.27
237 0.27
238 0.25
239 0.24
240 0.22
241 0.18
242 0.1
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.09
256 0.09
257 0.14
258 0.18
259 0.22
260 0.25
261 0.34
262 0.43
263 0.46
264 0.55
265 0.56
266 0.59
267 0.58
268 0.57
269 0.51
270 0.44
271 0.39
272 0.3
273 0.25
274 0.17
275 0.13
276 0.11
277 0.1
278 0.11
279 0.12
280 0.12
281 0.14
282 0.17
283 0.18
284 0.21
285 0.27
286 0.35
287 0.37
288 0.4
289 0.4
290 0.44
291 0.44
292 0.45
293 0.43
294 0.36
295 0.35
296 0.36
297 0.4
298 0.4
299 0.39
300 0.38
301 0.35
302 0.34
303 0.33
304 0.29
305 0.33
306 0.3
307 0.32
308 0.35
309 0.41
310 0.42
311 0.43
312 0.5
313 0.48
314 0.55
315 0.55
316 0.52
317 0.52
318 0.53
319 0.55
320 0.52
321 0.5
322 0.42
323 0.41
324 0.39
325 0.31
326 0.29
327 0.27
328 0.24
329 0.19
330 0.18
331 0.2
332 0.24
333 0.32
334 0.37
335 0.43
336 0.46
337 0.46
338 0.48
339 0.55
340 0.58
341 0.58
342 0.59
343 0.59
344 0.58
345 0.58
346 0.56
347 0.48
348 0.4
349 0.37
350 0.34
351 0.26
352 0.23
353 0.27
354 0.32
355 0.3
356 0.31
357 0.32
358 0.33
359 0.4
360 0.43
361 0.42
362 0.44
363 0.44
364 0.47
365 0.46
366 0.46
367 0.42
368 0.4
369 0.41
370 0.38
371 0.45
372 0.51
373 0.53
374 0.51
375 0.54
376 0.59
377 0.59
378 0.56
379 0.51
380 0.45
381 0.43
382 0.4
383 0.33
384 0.29
385 0.27
386 0.26
387 0.24
388 0.29
389 0.31
390 0.34
391 0.36
392 0.36
393 0.42
394 0.5
395 0.59
396 0.61
397 0.65
398 0.71
399 0.78
400 0.84
401 0.84
402 0.85
403 0.86
404 0.86
405 0.86
406 0.86