Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2VY86

Protein Details
Accession A0A0A2VY86    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
443-465GAAKPAGDNARRRRPPRKPAAAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
426-463AGERNNAPRRSGKPQGEGAAKPAGDNARRRRPPRKPAA
Subcellular Location(s) nucl 13cyto_nucl 13, cyto 9, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR028622  DEAD_helicase_RhlE  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0010494  C:cytoplasmic stress granule  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0031370  F:eukaryotic initiation factor 4G binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0033592  F:RNA strand annealing activity  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0002183  P:cytoplasmic translational initiation  
GO:1990625  P:negative regulation of cytoplasmic translational initiation in response to stress  
GO:1901195  P:positive regulation of formation of translation preinitiation complex  
GO:0042255  P:ribosome assembly  
GO:0031047  P:RNA-mediated gene silencing  
GO:0000390  P:spliceosomal complex disassembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd00268  DEADc  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MSFDSLGLNADILRAVEEQGYREPTPIQRQAIPVVLSGRDLMASAQTGTGKTAGFTLPLLQRLTDSAPHQKGRRPVRALILTPTRELAAQIGENVRDYSKYLNIRSLVVFGGVSINPQMMKLRGGVDVLVATPGRLLDLEHQNAVKLDQIEILVLDEADRMLDMGFIHDIRRVLAKLPARRQNLLFSATFSDDIKALAEKLLHNPEEVEVARRNTASEQVTQHVHFVDKKRKRELLSQMIGEGNWQQVLVFTRTKHGANHLAEQLQKDGITAAAIHGNKSQGARTRALADFKSGGIRVLVATDIAARGLDIEELPHVVNYELPNVPEDYVHRIGRTGRAAATGEALSLVCVDEHKLLRDIERLLKREIPRIALPGFDVDPSIPAEPIVNGRQQRGGGGRGGQGGRGGQSQGQGQRRGGNGGNANAAGERNNAPRRSGKPQGEGAAKPAGDNARRRRPPRKPAAAQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.12
4 0.14
5 0.16
6 0.21
7 0.26
8 0.25
9 0.26
10 0.29
11 0.32
12 0.41
13 0.45
14 0.45
15 0.43
16 0.45
17 0.47
18 0.48
19 0.42
20 0.35
21 0.31
22 0.27
23 0.24
24 0.21
25 0.18
26 0.13
27 0.12
28 0.1
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.11
33 0.11
34 0.12
35 0.13
36 0.14
37 0.12
38 0.11
39 0.13
40 0.12
41 0.11
42 0.11
43 0.16
44 0.17
45 0.21
46 0.22
47 0.2
48 0.2
49 0.21
50 0.24
51 0.23
52 0.24
53 0.3
54 0.36
55 0.42
56 0.45
57 0.48
58 0.54
59 0.6
60 0.65
61 0.61
62 0.59
63 0.62
64 0.65
65 0.62
66 0.6
67 0.59
68 0.51
69 0.46
70 0.42
71 0.33
72 0.27
73 0.25
74 0.19
75 0.13
76 0.11
77 0.13
78 0.14
79 0.14
80 0.15
81 0.16
82 0.15
83 0.13
84 0.14
85 0.14
86 0.19
87 0.24
88 0.25
89 0.29
90 0.3
91 0.31
92 0.31
93 0.29
94 0.23
95 0.18
96 0.15
97 0.1
98 0.12
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.09
103 0.08
104 0.09
105 0.11
106 0.09
107 0.1
108 0.11
109 0.12
110 0.12
111 0.13
112 0.12
113 0.11
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.07
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.06
124 0.11
125 0.18
126 0.2
127 0.21
128 0.21
129 0.22
130 0.22
131 0.21
132 0.18
133 0.12
134 0.11
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.07
141 0.06
142 0.05
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.03
148 0.03
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.17
162 0.22
163 0.28
164 0.36
165 0.44
166 0.45
167 0.47
168 0.47
169 0.46
170 0.43
171 0.39
172 0.31
173 0.24
174 0.22
175 0.21
176 0.2
177 0.16
178 0.14
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.12
188 0.16
189 0.16
190 0.16
191 0.16
192 0.15
193 0.17
194 0.16
195 0.15
196 0.13
197 0.14
198 0.15
199 0.15
200 0.15
201 0.13
202 0.17
203 0.16
204 0.17
205 0.17
206 0.18
207 0.2
208 0.2
209 0.2
210 0.16
211 0.16
212 0.16
213 0.21
214 0.29
215 0.34
216 0.39
217 0.45
218 0.49
219 0.5
220 0.55
221 0.58
222 0.57
223 0.53
224 0.48
225 0.43
226 0.38
227 0.35
228 0.27
229 0.19
230 0.1
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.06
235 0.08
236 0.1
237 0.12
238 0.12
239 0.14
240 0.17
241 0.18
242 0.17
243 0.19
244 0.25
245 0.24
246 0.28
247 0.27
248 0.27
249 0.28
250 0.28
251 0.24
252 0.17
253 0.15
254 0.11
255 0.09
256 0.07
257 0.06
258 0.05
259 0.05
260 0.09
261 0.09
262 0.1
263 0.11
264 0.12
265 0.13
266 0.13
267 0.16
268 0.17
269 0.21
270 0.22
271 0.22
272 0.26
273 0.27
274 0.3
275 0.27
276 0.23
277 0.2
278 0.19
279 0.2
280 0.16
281 0.14
282 0.11
283 0.1
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.04
292 0.04
293 0.03
294 0.04
295 0.04
296 0.05
297 0.04
298 0.04
299 0.05
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.08
306 0.08
307 0.12
308 0.12
309 0.12
310 0.13
311 0.14
312 0.14
313 0.13
314 0.14
315 0.17
316 0.21
317 0.21
318 0.2
319 0.21
320 0.23
321 0.27
322 0.28
323 0.23
324 0.19
325 0.21
326 0.21
327 0.2
328 0.21
329 0.15
330 0.12
331 0.11
332 0.1
333 0.08
334 0.07
335 0.06
336 0.04
337 0.05
338 0.06
339 0.1
340 0.12
341 0.14
342 0.16
343 0.17
344 0.19
345 0.22
346 0.24
347 0.29
348 0.35
349 0.36
350 0.36
351 0.43
352 0.43
353 0.47
354 0.47
355 0.42
356 0.38
357 0.39
358 0.36
359 0.3
360 0.28
361 0.24
362 0.22
363 0.17
364 0.15
365 0.11
366 0.11
367 0.13
368 0.13
369 0.1
370 0.09
371 0.1
372 0.1
373 0.14
374 0.16
375 0.2
376 0.22
377 0.24
378 0.27
379 0.27
380 0.29
381 0.28
382 0.28
383 0.25
384 0.25
385 0.26
386 0.28
387 0.28
388 0.25
389 0.23
390 0.21
391 0.2
392 0.19
393 0.18
394 0.14
395 0.16
396 0.21
397 0.28
398 0.34
399 0.36
400 0.36
401 0.4
402 0.4
403 0.43
404 0.39
405 0.38
406 0.36
407 0.34
408 0.35
409 0.29
410 0.28
411 0.24
412 0.23
413 0.17
414 0.15
415 0.17
416 0.23
417 0.31
418 0.32
419 0.35
420 0.43
421 0.48
422 0.54
423 0.6
424 0.59
425 0.58
426 0.63
427 0.66
428 0.65
429 0.59
430 0.54
431 0.51
432 0.43
433 0.36
434 0.35
435 0.35
436 0.35
437 0.43
438 0.5
439 0.54
440 0.64
441 0.72
442 0.78
443 0.82
444 0.87
445 0.88