Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2WDS2

Protein Details
Accession A0A0A2WDS2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
570-594QGDDDPDKRRHRSRPASADEHHRKRBasic
613-634WLLGNCQRRDVWRRKPTKRHRTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
578-583RRHRSR
625-633RRKPTKRHR
Subcellular Location(s) nucl 9cyto_nucl 9, cyto 7, mito 5, plas 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029028  Alpha/beta_knot_MTases  
IPR012338  Beta-lactam/transpept-like  
IPR005311  PBP_dimer  
IPR036138  PBP_dimer_sf  
IPR001460  PCN-bd_Tpept  
IPR017790  Penicillin-binding_protein_2  
IPR003742  RlmH-like  
IPR029026  tRNA_m1G_MTases_N  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0008658  F:penicillin binding  
GO:0009002  F:serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase activity  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF03717  PBP_dimer  
PF02590  SPOUT_MTase  
PF00905  Transpeptidase  
CDD cd18081  RlmH-like  
Amino Acid Sequences MPDWVQTGFTEYLRRFPKDMPFELVEIPAGKRGKNADIKRILEKEGEMMLAAAGKGNRIVTLDIPGQPWDTPQLATQLERWKQDGRDVSLLIGGPEGLAPACKAAAEQSWSLSALTMPHPLNSFRDYTAESALFVRRALVAFIGILLLTGVLIANLYNLQIVRFNDYQTRSNENRIKLVPIPPSRGIIYDRNGTPLALNRTIYQIEMMPEKVDNVQETLEALRPVVDLTDDDIANFKKERARSHRFTSIAVKTNLTEVQVARFAVNQYRFPGVEVKGYKRRFYPYGSALTHVIGYVSKINDKDVERLDKEGKLANYASTHDIGKLGIERYYEDVLHGQTGYEEVEVNNRGRVIRQLKEVPPQAGHDIYLTLDLKLQTYIETLLEGSRAAVVVTDPRTGGILALVSMPSYNPNLFVDGISSKDYSGLLNDPNTPLINRATQGVYPPASTVKPYMAVSALSAGVITRNTSLFDPGWWQLPGSEKRYRDWKKWGHGRLNVTKSLEESADTFFYQVAYDMGIDRIGEWMSKFGYGHLTGIDLSEERAGNMPTRRYHPGRYRPGLLDSHANPDEQGDDDPDKRRHRSRPASADEHHRKRQAGSLAATDRSAGGRYPLWLLGNCQRRDVWRRKPTKRHRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.38
3 0.42
4 0.5
5 0.51
6 0.54
7 0.52
8 0.49
9 0.47
10 0.46
11 0.41
12 0.33
13 0.27
14 0.24
15 0.24
16 0.23
17 0.21
18 0.23
19 0.27
20 0.34
21 0.42
22 0.47
23 0.5
24 0.57
25 0.61
26 0.66
27 0.65
28 0.59
29 0.51
30 0.46
31 0.39
32 0.31
33 0.27
34 0.19
35 0.16
36 0.13
37 0.12
38 0.11
39 0.1
40 0.09
41 0.09
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.12
46 0.13
47 0.12
48 0.17
49 0.2
50 0.21
51 0.22
52 0.22
53 0.22
54 0.21
55 0.21
56 0.2
57 0.18
58 0.17
59 0.17
60 0.21
61 0.21
62 0.22
63 0.26
64 0.32
65 0.35
66 0.37
67 0.39
68 0.39
69 0.39
70 0.46
71 0.47
72 0.43
73 0.43
74 0.41
75 0.38
76 0.35
77 0.34
78 0.26
79 0.19
80 0.13
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.06
89 0.05
90 0.06
91 0.07
92 0.1
93 0.14
94 0.14
95 0.15
96 0.16
97 0.17
98 0.17
99 0.15
100 0.13
101 0.11
102 0.12
103 0.17
104 0.16
105 0.17
106 0.19
107 0.21
108 0.23
109 0.24
110 0.24
111 0.19
112 0.22
113 0.21
114 0.21
115 0.24
116 0.2
117 0.19
118 0.19
119 0.2
120 0.18
121 0.16
122 0.15
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.1
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.06
131 0.05
132 0.04
133 0.04
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.02
138 0.02
139 0.02
140 0.02
141 0.03
142 0.03
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.1
148 0.11
149 0.16
150 0.17
151 0.19
152 0.24
153 0.27
154 0.32
155 0.32
156 0.39
157 0.35
158 0.44
159 0.49
160 0.45
161 0.47
162 0.43
163 0.43
164 0.39
165 0.42
166 0.42
167 0.4
168 0.43
169 0.39
170 0.41
171 0.37
172 0.35
173 0.34
174 0.3
175 0.29
176 0.29
177 0.28
178 0.29
179 0.29
180 0.27
181 0.24
182 0.25
183 0.27
184 0.23
185 0.24
186 0.21
187 0.23
188 0.24
189 0.23
190 0.18
191 0.13
192 0.12
193 0.13
194 0.13
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.12
199 0.11
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.06
214 0.04
215 0.06
216 0.09
217 0.08
218 0.08
219 0.11
220 0.11
221 0.12
222 0.13
223 0.13
224 0.15
225 0.18
226 0.27
227 0.34
228 0.43
229 0.46
230 0.52
231 0.58
232 0.55
233 0.54
234 0.53
235 0.5
236 0.47
237 0.43
238 0.37
239 0.3
240 0.31
241 0.29
242 0.22
243 0.18
244 0.11
245 0.12
246 0.13
247 0.13
248 0.11
249 0.12
250 0.12
251 0.15
252 0.17
253 0.17
254 0.17
255 0.19
256 0.19
257 0.19
258 0.22
259 0.18
260 0.22
261 0.23
262 0.27
263 0.34
264 0.36
265 0.37
266 0.35
267 0.38
268 0.35
269 0.36
270 0.36
271 0.32
272 0.38
273 0.36
274 0.35
275 0.31
276 0.29
277 0.25
278 0.18
279 0.14
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.1
286 0.1
287 0.14
288 0.16
289 0.18
290 0.19
291 0.24
292 0.23
293 0.25
294 0.27
295 0.24
296 0.23
297 0.23
298 0.2
299 0.17
300 0.17
301 0.15
302 0.14
303 0.14
304 0.15
305 0.12
306 0.12
307 0.1
308 0.1
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.11
317 0.12
318 0.11
319 0.1
320 0.11
321 0.1
322 0.1
323 0.09
324 0.07
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.04
331 0.07
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.11
336 0.1
337 0.11
338 0.18
339 0.2
340 0.21
341 0.26
342 0.31
343 0.33
344 0.4
345 0.42
346 0.37
347 0.33
348 0.32
349 0.28
350 0.23
351 0.2
352 0.14
353 0.11
354 0.1
355 0.12
356 0.1
357 0.08
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.1
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.05
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.07
379 0.09
380 0.1
381 0.09
382 0.1
383 0.1
384 0.1
385 0.1
386 0.06
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.04
392 0.04
393 0.05
394 0.06
395 0.07
396 0.07
397 0.08
398 0.09
399 0.1
400 0.11
401 0.11
402 0.11
403 0.1
404 0.12
405 0.12
406 0.12
407 0.1
408 0.11
409 0.11
410 0.09
411 0.1
412 0.11
413 0.11
414 0.12
415 0.14
416 0.14
417 0.15
418 0.15
419 0.14
420 0.14
421 0.14
422 0.14
423 0.13
424 0.14
425 0.15
426 0.15
427 0.16
428 0.18
429 0.17
430 0.15
431 0.16
432 0.16
433 0.15
434 0.15
435 0.15
436 0.12
437 0.14
438 0.14
439 0.15
440 0.13
441 0.13
442 0.12
443 0.12
444 0.11
445 0.08
446 0.07
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.09
454 0.09
455 0.12
456 0.11
457 0.12
458 0.15
459 0.15
460 0.18
461 0.16
462 0.16
463 0.15
464 0.23
465 0.28
466 0.3
467 0.36
468 0.34
469 0.38
470 0.49
471 0.53
472 0.52
473 0.57
474 0.6
475 0.64
476 0.72
477 0.78
478 0.76
479 0.77
480 0.79
481 0.78
482 0.75
483 0.68
484 0.61
485 0.52
486 0.44
487 0.39
488 0.3
489 0.22
490 0.18
491 0.16
492 0.15
493 0.15
494 0.14
495 0.11
496 0.11
497 0.11
498 0.1
499 0.07
500 0.06
501 0.06
502 0.07
503 0.07
504 0.07
505 0.07
506 0.07
507 0.08
508 0.08
509 0.08
510 0.08
511 0.09
512 0.1
513 0.11
514 0.11
515 0.11
516 0.16
517 0.16
518 0.16
519 0.14
520 0.15
521 0.13
522 0.14
523 0.14
524 0.09
525 0.09
526 0.11
527 0.11
528 0.11
529 0.13
530 0.14
531 0.18
532 0.23
533 0.27
534 0.28
535 0.34
536 0.41
537 0.44
538 0.53
539 0.58
540 0.64
541 0.69
542 0.71
543 0.72
544 0.67
545 0.68
546 0.61
547 0.53
548 0.51
549 0.42
550 0.44
551 0.38
552 0.35
553 0.29
554 0.27
555 0.26
556 0.19
557 0.19
558 0.15
559 0.19
560 0.23
561 0.31
562 0.38
563 0.44
564 0.5
565 0.57
566 0.62
567 0.69
568 0.76
569 0.79
570 0.81
571 0.83
572 0.83
573 0.79
574 0.81
575 0.81
576 0.79
577 0.77
578 0.72
579 0.66
580 0.6
581 0.63
582 0.59
583 0.55
584 0.49
585 0.49
586 0.48
587 0.47
588 0.44
589 0.37
590 0.3
591 0.25
592 0.23
593 0.15
594 0.14
595 0.14
596 0.16
597 0.19
598 0.2
599 0.22
600 0.22
601 0.27
602 0.32
603 0.4
604 0.4
605 0.4
606 0.4
607 0.45
608 0.54
609 0.59
610 0.62
611 0.63
612 0.73
613 0.8
614 0.89