FuNGI

A0A0A2VYL6

Protein Details

Accession

A0A0A2VYL6

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-28	APTGQTSSSKRKRSAPAEKITKRQRAA	Hydrophilic
246-266	HKPEKKSHYLRQPNQHKKQGQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
12-20	RKRSAPAEK

Subcellular Location(s)

nucl 14, mito 6, plas 3, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005612 CCAAT-binding_factor IPR027193 Noc4
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0030692 C:Noc4p-Nop14p complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000447 P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF03914 CBF

Amino Acid Sequences

MAPTGQTSSSKRKRSAPAEKITKRQRAASSEDEEDPNAEILLLEQGILESKKNYNNIAVLLRKAADFTPGNPEAMLSTVALCRIFMRLLAQGSLVSKKSLSEKEQVVVGWLRDQFGQFKNVLLDLLGEDDVAITALTLCMRTLKAEGEFLRDESVYAFPRDFLGKVVKNIIASENDEVRKMYIEEFAEQYDDIRYYTFASVASVIKDFADDQHKLKSRLFESAFALLSVLDGVPSSADELEDFYVHKPEKKSHYLRQPNQHKKQGQEAWLALMNIVETNDQRKRLLALIADVIAPWFATPEMLSDFLTSCYDASGSIALLALSGVFFLIRERNLDYPSFYTKLYSLLNSQILHSKYRARFFRLLDTFLGSTHLPAALVASFLKRLARLSLNAPPSAAAFVVPWIYNMLKKHPLCTFMLHRETKDEEVKKELREHGMEDPFLADESDPMKTQAIDSSFWELVQLQSHYHPNVATIAKIVAEQFTKHSYNMEDFLDHSYASLLDAEMDKDVKKAPVVEFHIPKRVFLPQDDAAGTPDSLLVKLWDFQTVEA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.76
2	0.81
3	0.8
4	0.81
5	0.84
6	0.86
7	0.87
8	0.87
9	0.85
10	0.78
11	0.76
12	0.72
13	0.66
14	0.66
15	0.64
16	0.6
17	0.55
18	0.55
19	0.49
20	0.42
21	0.37
22	0.31
23	0.24
24	0.18
25	0.13
26	0.09
27	0.08
28	0.09
29	0.08
30	0.07
31	0.06
32	0.06
33	0.09
34	0.1
35	0.11
36	0.12
37	0.17
38	0.23
39	0.26
40	0.28
41	0.28
42	0.3
43	0.32
44	0.36
45	0.35
46	0.31
47	0.3
48	0.29
49	0.25
50	0.24
51	0.21
52	0.21
53	0.19
54	0.19
55	0.26
56	0.26
57	0.26
58	0.25
59	0.24
60	0.19
61	0.19
62	0.18
63	0.09
64	0.09
65	0.09
66	0.11
67	0.11
68	0.1
69	0.1
70	0.11
71	0.11
72	0.1
73	0.12
74	0.14
75	0.15
76	0.16
77	0.16
78	0.15
79	0.17
80	0.2
81	0.19
82	0.16
83	0.14
84	0.16
85	0.22
86	0.27
87	0.29
88	0.32
89	0.34
90	0.35
91	0.36
92	0.34
93	0.31
94	0.27
95	0.23
96	0.21
97	0.19
98	0.19
99	0.18
100	0.19
101	0.21
102	0.21
103	0.24
104	0.19
105	0.2
106	0.2
107	0.2
108	0.18
109	0.13
110	0.12
111	0.08
112	0.1
113	0.08
114	0.07
115	0.06
116	0.06
117	0.06
118	0.05
119	0.05
120	0.03
121	0.03
122	0.04
123	0.04
124	0.04
125	0.04
126	0.06
127	0.07
128	0.08
129	0.09
130	0.11
131	0.12
132	0.17
133	0.18
134	0.22
135	0.22
136	0.22
137	0.22
138	0.19
139	0.18
140	0.15
141	0.17
142	0.14
143	0.14
144	0.14
145	0.12
146	0.14
147	0.15
148	0.14
149	0.13
150	0.19
151	0.2
152	0.22
153	0.25
154	0.25
155	0.24
156	0.24
157	0.24
158	0.18
159	0.18
160	0.18
161	0.2
162	0.19
163	0.2
164	0.19
165	0.17
166	0.17
167	0.15
168	0.14
169	0.13
170	0.13
171	0.14
172	0.15
173	0.15
174	0.15
175	0.14
176	0.13
177	0.1
178	0.09
179	0.08
180	0.07
181	0.07
182	0.09
183	0.09
184	0.09
185	0.08
186	0.08
187	0.1
188	0.1
189	0.11
190	0.09
191	0.09
192	0.08
193	0.09
194	0.08
195	0.09
196	0.14
197	0.15
198	0.16
199	0.24
200	0.28
201	0.3
202	0.32
203	0.35
204	0.31
205	0.37
206	0.37
207	0.32
208	0.29
209	0.3
210	0.28
211	0.22
212	0.2
213	0.12
214	0.11
215	0.08
216	0.06
217	0.03
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.04
223	0.03
224	0.03
225	0.04
226	0.05
227	0.05
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.11
232	0.11
233	0.15
234	0.16
235	0.21
236	0.27
237	0.36
238	0.42
239	0.46
240	0.56
241	0.63
242	0.68
243	0.73
244	0.78
245	0.79
246	0.81
247	0.82
248	0.74
249	0.66
250	0.68
251	0.63
252	0.55
253	0.48
254	0.4
255	0.33
256	0.31
257	0.28
258	0.19
259	0.14
260	0.1
261	0.06
262	0.06
263	0.05
264	0.04
265	0.1
266	0.12
267	0.13
268	0.13
269	0.14
270	0.15
271	0.16
272	0.17
273	0.13
274	0.12
275	0.11
276	0.11
277	0.11
278	0.09
279	0.08
280	0.06
281	0.05
282	0.04
283	0.03
284	0.03
285	0.03
286	0.03
287	0.04
288	0.05
289	0.07
290	0.07
291	0.07
292	0.08
293	0.09
294	0.09
295	0.08
296	0.07
297	0.06
298	0.06
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.04
303	0.04
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.03
309	0.02
310	0.02
311	0.02
312	0.02
313	0.02
314	0.03
315	0.05
316	0.06
317	0.08
318	0.1
319	0.12
320	0.14
321	0.15
322	0.16
323	0.17
324	0.21
325	0.2
326	0.18
327	0.17
328	0.16
329	0.18
330	0.17
331	0.16
332	0.14
333	0.16
334	0.19
335	0.18
336	0.19
337	0.22
338	0.22
339	0.23
340	0.22
341	0.27
342	0.28
343	0.36
344	0.39
345	0.39
346	0.44
347	0.44
348	0.53
349	0.47
350	0.45
351	0.38
352	0.37
353	0.31
354	0.25
355	0.25
356	0.15
357	0.13
358	0.11
359	0.1
360	0.07
361	0.07
362	0.07
363	0.05
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.07
368	0.07
369	0.09
370	0.08
371	0.09
372	0.12
373	0.15
374	0.16
375	0.2
376	0.26
377	0.28
378	0.28
379	0.27
380	0.23
381	0.21
382	0.2
383	0.16
384	0.09
385	0.06
386	0.07
387	0.08
388	0.08
389	0.08
390	0.09
391	0.1
392	0.13
393	0.14
394	0.19
395	0.27
396	0.27
397	0.31
398	0.32
399	0.35
400	0.33
401	0.38
402	0.4
403	0.39
404	0.47
405	0.45
406	0.43
407	0.44
408	0.45
409	0.44
410	0.46
411	0.42
412	0.36
413	0.42
414	0.45
415	0.44
416	0.47
417	0.46
418	0.43
419	0.4
420	0.41
421	0.4
422	0.4
423	0.37
424	0.31
425	0.27
426	0.22
427	0.2
428	0.18
429	0.1
430	0.08
431	0.1
432	0.11
433	0.11
434	0.12
435	0.12
436	0.12
437	0.13
438	0.16
439	0.16
440	0.16
441	0.18
442	0.23
443	0.22
444	0.21
445	0.21
446	0.17
447	0.16
448	0.19
449	0.18
450	0.13
451	0.17
452	0.22
453	0.22
454	0.23
455	0.22
456	0.19
457	0.23
458	0.22
459	0.19
460	0.15
461	0.15
462	0.14
463	0.15
464	0.14
465	0.12
466	0.13
467	0.13
468	0.15
469	0.21
470	0.22
471	0.22
472	0.24
473	0.24
474	0.26
475	0.28
476	0.26
477	0.21
478	0.21
479	0.24
480	0.23
481	0.19
482	0.16
483	0.14
484	0.12
485	0.12
486	0.11
487	0.07
488	0.08
489	0.09
490	0.09
491	0.1
492	0.12
493	0.12
494	0.13
495	0.15
496	0.16
497	0.17
498	0.21
499	0.22
500	0.29
501	0.36
502	0.43
503	0.48
504	0.51
505	0.58
506	0.54
507	0.52
508	0.47
509	0.48
510	0.42
511	0.37
512	0.4
513	0.33
514	0.38
515	0.38
516	0.35
517	0.3
518	0.29
519	0.25
520	0.18
521	0.17
522	0.14
523	0.13
524	0.13
525	0.12
526	0.12
527	0.15
528	0.16
529	0.18

A0A0A2VYL6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer