Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7EYT4

Protein Details
Accession A7EYT4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
142-162DKERRALDSKKDKSRLKKLAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
151-157KKDKSRL
Subcellular Location(s) cyto 11, cyto_nucl 9, cysk 7, nucl 5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034104  Lsm1  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR044642  PTHR15588  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:1990726  C:Lsm1-7-Pat1 complex  
GO:0000932  C:P-body  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0000339  F:RNA cap binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
GO:0006397  P:mRNA processing  
KEGG ssl:SS1G_10500  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
CDD cd01728  LSm1  
Amino Acid Sequences MEHQPTYQGPEGGAEMPALGAGIPPPNQQLPAQMFTTAAQLLDLTDKKLMISLRDGRKLIGILRSWDQFVLQSTVERIFVAPPSPSTPGAVTQPGLYADVPRGLFLVRGENVLLLGEIDLDKDDDAPPGYEKADAELVHKLDKERRALDSKKDKSRLKKLAELGFEGENSGEAIFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.1
3 0.09
4 0.08
5 0.07
6 0.05
7 0.04
8 0.04
9 0.07
10 0.09
11 0.1
12 0.13
13 0.14
14 0.16
15 0.17
16 0.22
17 0.24
18 0.26
19 0.26
20 0.23
21 0.23
22 0.21
23 0.23
24 0.17
25 0.12
26 0.09
27 0.08
28 0.08
29 0.12
30 0.12
31 0.11
32 0.12
33 0.12
34 0.11
35 0.14
36 0.15
37 0.12
38 0.18
39 0.25
40 0.3
41 0.35
42 0.36
43 0.33
44 0.34
45 0.33
46 0.29
47 0.25
48 0.2
49 0.18
50 0.2
51 0.21
52 0.2
53 0.19
54 0.17
55 0.13
56 0.13
57 0.12
58 0.1
59 0.09
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.1
64 0.09
65 0.07
66 0.08
67 0.08
68 0.07
69 0.07
70 0.1
71 0.12
72 0.12
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.13
77 0.13
78 0.11
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.09
92 0.09
93 0.12
94 0.09
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.08
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.03
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.08
114 0.09
115 0.1
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.12
120 0.15
121 0.14
122 0.15
123 0.18
124 0.19
125 0.2
126 0.21
127 0.22
128 0.25
129 0.3
130 0.34
131 0.32
132 0.37
133 0.43
134 0.47
135 0.54
136 0.59
137 0.63
138 0.67
139 0.74
140 0.76
141 0.77
142 0.84
143 0.83
144 0.79
145 0.78
146 0.76
147 0.74
148 0.7
149 0.62
150 0.54
151 0.46
152 0.39
153 0.31
154 0.23
155 0.16
156 0.13