Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A086SYC5

Protein Details
Accession A0A086SYC5    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
170-197QEEYKAEKERKDKKKKESKPKTKEVELSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
176-192EKERKDKKKKESKPKTK
Subcellular Location(s) mito 24.5, cyto_mito 14.333, mito_nucl 13.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036788  T_IF-3_C_sf  
IPR001288  Translation_initiation_fac_3  
IPR019815  Translation_initiation_fac_3_C  
Gene Ontology GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00707  IF3_C  
Amino Acid Sequences MRGQTTLRCSRRALSRAFLPAAECRDTARLLTPWMRAQSDSFHQAPTPCRARRHFSSSSPSLARPRPEKPKSLEERAAAIQAEEQLDRRYTLPDYMAKTGRDRLPRDHEITDPHIMVLDGGAVEGPLATRFVMSKLTAGESLRMIQPYKPANHKEGTPAVHALCKIVDIQEEYKAEKERKDKKKKESKPKTKEVELSWGISEHDLVTKTRQIGVFLEKGFKVEVVLGKKKGGRKITETEAQDVLKKVRHEVEARNGMETKPPQGDVGGVLRLMVESKVKP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.52
3 0.55
4 0.54
5 0.48
6 0.41
7 0.4
8 0.39
9 0.36
10 0.29
11 0.25
12 0.26
13 0.26
14 0.25
15 0.24
16 0.21
17 0.23
18 0.28
19 0.29
20 0.32
21 0.35
22 0.35
23 0.32
24 0.32
25 0.32
26 0.33
27 0.35
28 0.3
29 0.27
30 0.28
31 0.3
32 0.33
33 0.36
34 0.4
35 0.39
36 0.46
37 0.5
38 0.56
39 0.6
40 0.64
41 0.61
42 0.58
43 0.62
44 0.58
45 0.58
46 0.53
47 0.49
48 0.48
49 0.46
50 0.47
51 0.44
52 0.48
53 0.53
54 0.55
55 0.59
56 0.59
57 0.64
58 0.66
59 0.69
60 0.66
61 0.56
62 0.56
63 0.49
64 0.45
65 0.34
66 0.26
67 0.19
68 0.15
69 0.15
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.13
75 0.13
76 0.13
77 0.13
78 0.14
79 0.16
80 0.19
81 0.22
82 0.25
83 0.28
84 0.27
85 0.28
86 0.32
87 0.34
88 0.37
89 0.37
90 0.39
91 0.44
92 0.48
93 0.5
94 0.46
95 0.42
96 0.39
97 0.4
98 0.36
99 0.27
100 0.22
101 0.18
102 0.16
103 0.14
104 0.1
105 0.06
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.02
110 0.02
111 0.02
112 0.02
113 0.02
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.04
118 0.05
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.09
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.15
134 0.18
135 0.21
136 0.26
137 0.28
138 0.31
139 0.31
140 0.31
141 0.31
142 0.31
143 0.3
144 0.25
145 0.23
146 0.2
147 0.2
148 0.2
149 0.16
150 0.11
151 0.1
152 0.08
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.1
157 0.13
158 0.14
159 0.15
160 0.18
161 0.22
162 0.23
163 0.26
164 0.34
165 0.4
166 0.51
167 0.61
168 0.67
169 0.74
170 0.83
171 0.88
172 0.9
173 0.91
174 0.92
175 0.9
176 0.91
177 0.88
178 0.83
179 0.78
180 0.69
181 0.67
182 0.57
183 0.49
184 0.39
185 0.33
186 0.27
187 0.21
188 0.19
189 0.1
190 0.11
191 0.1
192 0.11
193 0.13
194 0.16
195 0.17
196 0.2
197 0.2
198 0.2
199 0.21
200 0.25
201 0.27
202 0.24
203 0.27
204 0.23
205 0.23
206 0.22
207 0.19
208 0.15
209 0.13
210 0.18
211 0.21
212 0.28
213 0.28
214 0.32
215 0.36
216 0.41
217 0.45
218 0.48
219 0.46
220 0.46
221 0.51
222 0.54
223 0.58
224 0.55
225 0.51
226 0.47
227 0.42
228 0.39
229 0.36
230 0.32
231 0.29
232 0.27
233 0.28
234 0.3
235 0.35
236 0.37
237 0.41
238 0.48
239 0.53
240 0.52
241 0.52
242 0.48
243 0.43
244 0.45
245 0.41
246 0.36
247 0.3
248 0.3
249 0.27
250 0.26
251 0.26
252 0.22
253 0.23
254 0.19
255 0.16
256 0.15
257 0.14
258 0.14
259 0.14
260 0.12