Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A086TGN7

Protein Details
Accession A0A086TGN7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
121-140PAPKSATPPTPRKPNPQPAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-113RKRPAS
119-124GRPAPK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, pero 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16658  RING-Ubox_UBE4B  
Amino Acid Sequences MDSNEQPSWTGGDAPDKEKMAQIRARRLAKLGSSTPKPDENKPPADDAPKASSSSSTPAPQPSKPAQPQPAATSATSSSSNPFAQLGIKKDGSSNEPSSSSGTLRPSRKRPASGADHEGRPAPKSATPPTPRKPNPQPAESDEDYANRVLSHIFRITLNPHNMSTPTGHRLTFLPALNDEMNEEGEPLKLTTSNLDQAIMEAAGLWPHDKPLLDYLLPCWKRAVKAASSSKSSTGPRLEVHEEAKRLALSNCLFSLTLPDLFGRASNPEQDTLVPYILRGPIHENGLDLEFFKEAIKRFEDDDSIPALFTDAMVRISTKLSTMSMQDDYRPYVQALQTFARFPILLANLAKHPTFNMAQSAPGIEKHTLLGPFFRLSPLQAEVIQSYFPGPRTLDKTRIVNAQDSLRMVLRTHQEDLFTITDAFIRAGQETRGRTLDWFAYILNTNHKRRAMQVDPREVASDGFMINATTILDRLCEPFMDNDFSKVDRIDVRYFRQKPRVDINDETKINADQATADEFYSQKEPGEPNFITEVFFLTLAAHHYGSEAANAQLKNLDREIKYLEKHLKAMEEERVKVANIPLQLARFEEALKRVTNVLEKTISLKYAIEGVLLDDRMQSTSLRFMRYVAVWLLRLATGSNYKPGKEEEIHLPLPSEHNAAFACLPEYTVQNIVDNFKFVFRWLPNILRSAVGEELIALCITFLRSSEYIKNPYLKSSLVTLLYSGTVPFMHLKKGVLGDQLVSMKFANDYLLRALMKFYIECELTGAHTQFFDKFNIRYEIFQVIKCVWVNDVYRQELTRESQVNKAFFVQFVNMLLNDATFVLDEAFTKFPKIRSIEKELEDRSLSAETRQKKEEELQSLGNQATSYMQLANESLETMKLFTEALGDAFTMPEIVTRLASMLNYNLETLAGKKAAAELSVSNKDKYQFRPIQLLSDFVEIYLNLGSSKTFIDAVAADGRSYKPEVLERVAYILESRKHMDPADRVRWDKLRTKFVESKQLLDQAELDLGDIPAEYEDPIMGDLMTDPVLLPSGHIVDRSTIAQHLLSDPKDPFTRQPMTVDDAIPQTELKEKIEQWKAERVQAAKDKITGNTMDTSEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.34
3 0.33
4 0.33
5 0.35
6 0.37
7 0.37
8 0.4
9 0.45
10 0.5
11 0.57
12 0.62
13 0.59
14 0.59
15 0.56
16 0.55
17 0.54
18 0.51
19 0.51
20 0.51
21 0.54
22 0.55
23 0.58
24 0.57
25 0.58
26 0.61
27 0.61
28 0.63
29 0.61
30 0.63
31 0.6
32 0.61
33 0.56
34 0.51
35 0.49
36 0.43
37 0.41
38 0.36
39 0.32
40 0.29
41 0.3
42 0.29
43 0.26
44 0.28
45 0.35
46 0.39
47 0.39
48 0.45
49 0.46
50 0.52
51 0.56
52 0.62
53 0.61
54 0.62
55 0.64
56 0.61
57 0.61
58 0.53
59 0.46
60 0.39
61 0.33
62 0.29
63 0.27
64 0.23
65 0.2
66 0.21
67 0.22
68 0.2
69 0.19
70 0.17
71 0.21
72 0.25
73 0.28
74 0.31
75 0.32
76 0.31
77 0.34
78 0.36
79 0.35
80 0.37
81 0.36
82 0.32
83 0.32
84 0.33
85 0.33
86 0.32
87 0.29
88 0.26
89 0.29
90 0.34
91 0.41
92 0.49
93 0.54
94 0.63
95 0.69
96 0.7
97 0.68
98 0.69
99 0.71
100 0.69
101 0.7
102 0.65
103 0.59
104 0.55
105 0.54
106 0.46
107 0.38
108 0.34
109 0.28
110 0.26
111 0.3
112 0.35
113 0.41
114 0.48
115 0.55
116 0.61
117 0.69
118 0.71
119 0.75
120 0.8
121 0.8
122 0.8
123 0.75
124 0.73
125 0.68
126 0.7
127 0.62
128 0.54
129 0.45
130 0.38
131 0.35
132 0.29
133 0.24
134 0.15
135 0.14
136 0.12
137 0.13
138 0.16
139 0.16
140 0.17
141 0.17
142 0.2
143 0.24
144 0.31
145 0.35
146 0.33
147 0.32
148 0.33
149 0.33
150 0.32
151 0.31
152 0.28
153 0.28
154 0.28
155 0.27
156 0.26
157 0.27
158 0.3
159 0.32
160 0.29
161 0.25
162 0.23
163 0.28
164 0.27
165 0.25
166 0.21
167 0.16
168 0.15
169 0.13
170 0.13
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.12
179 0.15
180 0.18
181 0.18
182 0.18
183 0.17
184 0.17
185 0.17
186 0.14
187 0.1
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.07
195 0.09
196 0.09
197 0.11
198 0.14
199 0.18
200 0.18
201 0.18
202 0.21
203 0.3
204 0.3
205 0.29
206 0.29
207 0.28
208 0.29
209 0.35
210 0.38
211 0.31
212 0.41
213 0.49
214 0.5
215 0.52
216 0.52
217 0.47
218 0.46
219 0.44
220 0.4
221 0.34
222 0.33
223 0.3
224 0.33
225 0.35
226 0.33
227 0.35
228 0.35
229 0.32
230 0.3
231 0.3
232 0.25
233 0.23
234 0.21
235 0.23
236 0.18
237 0.2
238 0.19
239 0.19
240 0.18
241 0.17
242 0.2
243 0.16
244 0.16
245 0.14
246 0.14
247 0.13
248 0.13
249 0.13
250 0.1
251 0.12
252 0.12
253 0.17
254 0.18
255 0.18
256 0.19
257 0.19
258 0.21
259 0.19
260 0.19
261 0.14
262 0.12
263 0.14
264 0.16
265 0.15
266 0.13
267 0.16
268 0.17
269 0.2
270 0.2
271 0.17
272 0.16
273 0.18
274 0.16
275 0.13
276 0.11
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.11
281 0.12
282 0.15
283 0.17
284 0.17
285 0.19
286 0.21
287 0.23
288 0.21
289 0.21
290 0.2
291 0.18
292 0.17
293 0.14
294 0.13
295 0.1
296 0.09
297 0.08
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.1
304 0.1
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.11
309 0.12
310 0.14
311 0.16
312 0.17
313 0.18
314 0.19
315 0.21
316 0.21
317 0.21
318 0.18
319 0.19
320 0.2
321 0.2
322 0.21
323 0.21
324 0.21
325 0.21
326 0.2
327 0.18
328 0.16
329 0.14
330 0.15
331 0.14
332 0.15
333 0.15
334 0.16
335 0.17
336 0.19
337 0.19
338 0.13
339 0.13
340 0.14
341 0.15
342 0.14
343 0.16
344 0.14
345 0.15
346 0.15
347 0.16
348 0.13
349 0.13
350 0.14
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.14
355 0.14
356 0.14
357 0.14
358 0.13
359 0.13
360 0.13
361 0.13
362 0.11
363 0.11
364 0.13
365 0.13
366 0.13
367 0.13
368 0.13
369 0.13
370 0.13
371 0.12
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.1
376 0.11
377 0.11
378 0.14
379 0.21
380 0.25
381 0.3
382 0.32
383 0.34
384 0.35
385 0.4
386 0.38
387 0.33
388 0.31
389 0.28
390 0.26
391 0.23
392 0.22
393 0.17
394 0.16
395 0.14
396 0.16
397 0.18
398 0.19
399 0.21
400 0.21
401 0.2
402 0.2
403 0.23
404 0.19
405 0.16
406 0.13
407 0.11
408 0.11
409 0.1
410 0.1
411 0.08
412 0.07
413 0.07
414 0.08
415 0.1
416 0.13
417 0.14
418 0.16
419 0.16
420 0.16
421 0.16
422 0.18
423 0.17
424 0.14
425 0.13
426 0.1
427 0.11
428 0.13
429 0.13
430 0.2
431 0.26
432 0.27
433 0.31
434 0.33
435 0.32
436 0.34
437 0.41
438 0.4
439 0.42
440 0.47
441 0.5
442 0.49
443 0.49
444 0.47
445 0.39
446 0.31
447 0.22
448 0.16
449 0.08
450 0.07
451 0.06
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.05
460 0.05
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.09
466 0.11
467 0.14
468 0.14
469 0.14
470 0.15
471 0.15
472 0.15
473 0.13
474 0.13
475 0.12
476 0.16
477 0.2
478 0.22
479 0.26
480 0.35
481 0.4
482 0.44
483 0.51
484 0.49
485 0.48
486 0.54
487 0.55
488 0.51
489 0.51
490 0.51
491 0.5
492 0.48
493 0.44
494 0.35
495 0.29
496 0.24
497 0.2
498 0.14
499 0.06
500 0.07
501 0.08
502 0.08
503 0.08
504 0.08
505 0.08
506 0.09
507 0.1
508 0.1
509 0.08
510 0.1
511 0.11
512 0.11
513 0.18
514 0.16
515 0.16
516 0.18
517 0.18
518 0.16
519 0.15
520 0.15
521 0.09
522 0.09
523 0.07
524 0.06
525 0.06
526 0.07
527 0.08
528 0.07
529 0.06
530 0.06
531 0.07
532 0.07
533 0.07
534 0.06
535 0.06
536 0.1
537 0.09
538 0.09
539 0.11
540 0.12
541 0.13
542 0.13
543 0.17
544 0.14
545 0.16
546 0.19
547 0.2
548 0.2
549 0.25
550 0.29
551 0.26
552 0.27
553 0.27
554 0.25
555 0.22
556 0.24
557 0.25
558 0.22
559 0.21
560 0.21
561 0.21
562 0.19
563 0.19
564 0.17
565 0.14
566 0.11
567 0.12
568 0.11
569 0.11
570 0.12
571 0.11
572 0.11
573 0.09
574 0.09
575 0.1
576 0.11
577 0.12
578 0.12
579 0.12
580 0.12
581 0.13
582 0.16
583 0.15
584 0.16
585 0.14
586 0.14
587 0.17
588 0.16
589 0.16
590 0.12
591 0.12
592 0.1
593 0.11
594 0.11
595 0.08
596 0.07
597 0.07
598 0.08
599 0.08
600 0.08
601 0.06
602 0.06
603 0.07
604 0.07
605 0.07
606 0.06
607 0.13
608 0.15
609 0.16
610 0.16
611 0.17
612 0.18
613 0.18
614 0.19
615 0.14
616 0.13
617 0.12
618 0.12
619 0.11
620 0.09
621 0.09
622 0.07
623 0.08
624 0.1
625 0.1
626 0.17
627 0.17
628 0.17
629 0.19
630 0.2
631 0.23
632 0.2
633 0.23
634 0.22
635 0.27
636 0.27
637 0.26
638 0.25
639 0.21
640 0.22
641 0.2
642 0.16
643 0.1
644 0.11
645 0.11
646 0.11
647 0.11
648 0.09
649 0.09
650 0.07
651 0.08
652 0.07
653 0.08
654 0.08
655 0.11
656 0.11
657 0.11
658 0.12
659 0.14
660 0.13
661 0.14
662 0.13
663 0.11
664 0.11
665 0.1
666 0.15
667 0.13
668 0.18
669 0.2
670 0.24
671 0.24
672 0.27
673 0.27
674 0.22
675 0.22
676 0.18
677 0.16
678 0.12
679 0.1
680 0.08
681 0.07
682 0.07
683 0.06
684 0.04
685 0.04
686 0.04
687 0.04
688 0.04
689 0.04
690 0.07
691 0.08
692 0.12
693 0.18
694 0.22
695 0.26
696 0.29
697 0.34
698 0.31
699 0.33
700 0.32
701 0.26
702 0.23
703 0.21
704 0.21
705 0.17
706 0.16
707 0.14
708 0.13
709 0.13
710 0.12
711 0.09
712 0.07
713 0.06
714 0.07
715 0.1
716 0.1
717 0.12
718 0.13
719 0.13
720 0.15
721 0.17
722 0.18
723 0.16
724 0.15
725 0.14
726 0.15
727 0.17
728 0.15
729 0.14
730 0.12
731 0.11
732 0.1
733 0.1
734 0.1
735 0.08
736 0.09
737 0.09
738 0.12
739 0.12
740 0.12
741 0.12
742 0.11
743 0.12
744 0.1
745 0.1
746 0.11
747 0.11
748 0.11
749 0.11
750 0.1
751 0.11
752 0.14
753 0.14
754 0.11
755 0.11
756 0.12
757 0.13
758 0.15
759 0.16
760 0.16
761 0.17
762 0.21
763 0.25
764 0.26
765 0.24
766 0.25
767 0.29
768 0.28
769 0.27
770 0.25
771 0.2
772 0.23
773 0.22
774 0.2
775 0.14
776 0.16
777 0.18
778 0.22
779 0.26
780 0.25
781 0.26
782 0.26
783 0.27
784 0.25
785 0.26
786 0.27
787 0.27
788 0.27
789 0.32
790 0.36
791 0.36
792 0.34
793 0.34
794 0.29
795 0.24
796 0.24
797 0.18
798 0.14
799 0.14
800 0.14
801 0.11
802 0.11
803 0.1
804 0.08
805 0.08
806 0.07
807 0.06
808 0.05
809 0.05
810 0.05
811 0.05
812 0.06
813 0.08
814 0.1
815 0.1
816 0.12
817 0.14
818 0.16
819 0.22
820 0.26
821 0.31
822 0.36
823 0.45
824 0.5
825 0.51
826 0.56
827 0.51
828 0.5
829 0.43
830 0.36
831 0.3
832 0.26
833 0.23
834 0.21
835 0.26
836 0.28
837 0.32
838 0.35
839 0.34
840 0.35
841 0.42
842 0.45
843 0.44
844 0.41
845 0.4
846 0.38
847 0.4
848 0.37
849 0.3
850 0.22
851 0.16
852 0.14
853 0.11
854 0.11
855 0.09
856 0.09
857 0.09
858 0.09
859 0.1
860 0.09
861 0.09
862 0.08
863 0.08
864 0.08
865 0.08
866 0.08
867 0.07
868 0.07
869 0.06
870 0.08
871 0.07
872 0.07
873 0.07
874 0.07
875 0.07
876 0.07
877 0.07
878 0.06
879 0.05
880 0.06
881 0.07
882 0.07
883 0.07
884 0.07
885 0.08
886 0.08
887 0.09
888 0.09
889 0.1
890 0.11
891 0.12
892 0.12
893 0.11
894 0.11
895 0.11
896 0.11
897 0.13
898 0.11
899 0.1
900 0.1
901 0.13
902 0.13
903 0.13
904 0.13
905 0.12
906 0.19
907 0.27
908 0.29
909 0.28
910 0.3
911 0.34
912 0.38
913 0.41
914 0.44
915 0.43
916 0.45
917 0.53
918 0.52
919 0.55
920 0.49
921 0.47
922 0.38
923 0.34
924 0.3
925 0.2
926 0.21
927 0.13
928 0.13
929 0.11
930 0.09
931 0.07
932 0.07
933 0.07
934 0.07
935 0.08
936 0.08
937 0.08
938 0.08
939 0.09
940 0.09
941 0.12
942 0.16
943 0.16
944 0.14
945 0.16
946 0.17
947 0.18
948 0.19
949 0.18
950 0.16
951 0.2
952 0.25
953 0.27
954 0.29
955 0.27
956 0.27
957 0.26
958 0.23
959 0.2
960 0.22
961 0.21
962 0.22
963 0.25
964 0.25
965 0.28
966 0.3
967 0.35
968 0.37
969 0.44
970 0.5
971 0.53
972 0.54
973 0.57
974 0.62
975 0.62
976 0.62
977 0.6
978 0.61
979 0.58
980 0.65
981 0.67
982 0.66
983 0.71
984 0.64
985 0.6
986 0.54
987 0.57
988 0.48
989 0.4
990 0.35
991 0.26
992 0.26
993 0.21
994 0.17
995 0.11
996 0.1
997 0.09
998 0.08
999 0.07
1000 0.06
1001 0.07
1002 0.06
1003 0.06
1004 0.06
1005 0.06
1006 0.07
1007 0.07
1008 0.06
1009 0.06
1010 0.06
1011 0.07
1012 0.07
1013 0.07
1014 0.06
1015 0.07
1016 0.08
1017 0.08
1018 0.08
1019 0.09
1020 0.12
1021 0.12
1022 0.13
1023 0.14
1024 0.14
1025 0.17
1026 0.18
1027 0.17
1028 0.15
1029 0.16
1030 0.16
1031 0.17
1032 0.19
1033 0.23
1034 0.23
1035 0.26
1036 0.26
1037 0.3
1038 0.33
1039 0.34
1040 0.35
1041 0.38
1042 0.43
1043 0.4
1044 0.43
1045 0.41
1046 0.44
1047 0.44
1048 0.39
1049 0.34
1050 0.3
1051 0.29
1052 0.26
1053 0.22
1054 0.17
1055 0.2
1056 0.22
1057 0.22
1058 0.26
1059 0.29
1060 0.38
1061 0.46
1062 0.5
1063 0.48
1064 0.57
1065 0.56
1066 0.56
1067 0.59
1068 0.51
1069 0.52
1070 0.55
1071 0.57
1072 0.5
1073 0.51
1074 0.48
1075 0.44
1076 0.46
1077 0.38
1078 0.33
1079 0.31