Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A086TH62

Protein Details
Accession A0A086TH62    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
432-455EREWEEARLRKRQKRKDGVTDVGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
440-446LRKRQKR
Subcellular Location(s) mito 9, cyto_nucl 8.5, nucl 7, cyto 6, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAQPQRQDSQPAFSPPPQHSPSPAASQSAFAPPPTKRPQSRPDSPYANSPYAMSPATGATPPGSTGSPANAQSPAPPGQQTPYTNGVATPILSLPETRPSSTPPVQTPNTPTASTPQYTTAMMAPIGVIPPTQGPGTMGPPQRPAERPTKDYEYDVTDSLAGTGIDLRAEEQYMADMYSTYFDPEARTGFPQHPPGSKSSLYGAGPANQHAQTISEQDQKKYAAQAAQKAWTESSMRLGASRTQEINDPFLLVALLHQRADKIAREHHLELNLELKNNTQTAGKLKHPDQFAEPTVVVNTKPVGPNQALVQTTGSFIPHDAYLVDQLALMSIATKARVQELVADAHIIASHRQKTSHGDVPEDWEPAAAPLNIQKPEVMEVDGLAADGTPAPGASPPKRPADAVDAAVAPPRKHTKIGPYVTTTLRDLAKQEREWEEARLRKRQKRKDGVTDVGATTSRAGSVAPGTPSSVAPDGEKPPTKKESKKAQAAKTAEANNHANQNLTSSMFAGLGGKSGLFGKKKTGKTYDWMNVGRSGSGTSTPTRAAPGVSKGGPGGPGGGGGPNPMALTTEGRNRLGTWREDKEKGKNIQLRDWVSALEKDGRDVRALQKALIYLDASNPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.48
3 0.55
4 0.52
5 0.49
6 0.47
7 0.47
8 0.47
9 0.48
10 0.45
11 0.4
12 0.36
13 0.35
14 0.33
15 0.34
16 0.31
17 0.24
18 0.28
19 0.26
20 0.35
21 0.42
22 0.49
23 0.5
24 0.58
25 0.67
26 0.71
27 0.8
28 0.77
29 0.76
30 0.74
31 0.68
32 0.69
33 0.66
34 0.59
35 0.49
36 0.44
37 0.37
38 0.33
39 0.31
40 0.22
41 0.16
42 0.14
43 0.16
44 0.15
45 0.14
46 0.12
47 0.12
48 0.12
49 0.14
50 0.13
51 0.12
52 0.13
53 0.16
54 0.19
55 0.2
56 0.22
57 0.21
58 0.21
59 0.22
60 0.25
61 0.25
62 0.23
63 0.23
64 0.23
65 0.25
66 0.31
67 0.31
68 0.32
69 0.33
70 0.32
71 0.31
72 0.29
73 0.28
74 0.22
75 0.2
76 0.16
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.12
81 0.12
82 0.2
83 0.22
84 0.22
85 0.23
86 0.27
87 0.35
88 0.39
89 0.43
90 0.39
91 0.44
92 0.44
93 0.47
94 0.48
95 0.46
96 0.45
97 0.4
98 0.36
99 0.33
100 0.36
101 0.33
102 0.29
103 0.25
104 0.24
105 0.23
106 0.24
107 0.2
108 0.16
109 0.15
110 0.13
111 0.1
112 0.09
113 0.09
114 0.08
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.08
119 0.08
120 0.07
121 0.09
122 0.11
123 0.15
124 0.21
125 0.24
126 0.25
127 0.3
128 0.33
129 0.36
130 0.37
131 0.38
132 0.41
133 0.43
134 0.45
135 0.47
136 0.51
137 0.47
138 0.46
139 0.44
140 0.4
141 0.36
142 0.33
143 0.26
144 0.2
145 0.18
146 0.16
147 0.14
148 0.08
149 0.06
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.09
171 0.1
172 0.12
173 0.12
174 0.14
175 0.17
176 0.2
177 0.24
178 0.29
179 0.31
180 0.33
181 0.34
182 0.35
183 0.37
184 0.34
185 0.31
186 0.26
187 0.27
188 0.23
189 0.24
190 0.22
191 0.21
192 0.21
193 0.21
194 0.23
195 0.18
196 0.18
197 0.15
198 0.16
199 0.12
200 0.15
201 0.18
202 0.22
203 0.23
204 0.24
205 0.27
206 0.27
207 0.27
208 0.25
209 0.24
210 0.22
211 0.23
212 0.29
213 0.29
214 0.32
215 0.32
216 0.3
217 0.28
218 0.24
219 0.23
220 0.17
221 0.18
222 0.15
223 0.14
224 0.14
225 0.15
226 0.17
227 0.19
228 0.21
229 0.18
230 0.17
231 0.21
232 0.22
233 0.23
234 0.19
235 0.16
236 0.13
237 0.12
238 0.11
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.13
248 0.14
249 0.14
250 0.17
251 0.2
252 0.25
253 0.27
254 0.28
255 0.29
256 0.27
257 0.24
258 0.25
259 0.23
260 0.19
261 0.16
262 0.15
263 0.14
264 0.13
265 0.14
266 0.09
267 0.1
268 0.14
269 0.18
270 0.21
271 0.24
272 0.26
273 0.3
274 0.31
275 0.31
276 0.28
277 0.28
278 0.26
279 0.23
280 0.21
281 0.16
282 0.16
283 0.15
284 0.12
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.12
291 0.12
292 0.13
293 0.13
294 0.16
295 0.14
296 0.14
297 0.14
298 0.11
299 0.12
300 0.11
301 0.1
302 0.06
303 0.06
304 0.07
305 0.06
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.04
316 0.04
317 0.03
318 0.04
319 0.04
320 0.05
321 0.05
322 0.06
323 0.07
324 0.08
325 0.07
326 0.09
327 0.11
328 0.11
329 0.1
330 0.1
331 0.09
332 0.09
333 0.09
334 0.07
335 0.07
336 0.11
337 0.15
338 0.15
339 0.16
340 0.17
341 0.22
342 0.28
343 0.32
344 0.29
345 0.28
346 0.27
347 0.32
348 0.32
349 0.27
350 0.21
351 0.15
352 0.14
353 0.12
354 0.13
355 0.08
356 0.06
357 0.1
358 0.14
359 0.15
360 0.15
361 0.15
362 0.14
363 0.16
364 0.17
365 0.13
366 0.09
367 0.08
368 0.09
369 0.08
370 0.08
371 0.05
372 0.04
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.05
380 0.1
381 0.13
382 0.2
383 0.24
384 0.28
385 0.3
386 0.3
387 0.3
388 0.33
389 0.32
390 0.26
391 0.24
392 0.2
393 0.19
394 0.22
395 0.22
396 0.15
397 0.17
398 0.21
399 0.22
400 0.23
401 0.26
402 0.32
403 0.4
404 0.45
405 0.44
406 0.43
407 0.44
408 0.44
409 0.43
410 0.35
411 0.28
412 0.24
413 0.21
414 0.2
415 0.23
416 0.28
417 0.27
418 0.32
419 0.32
420 0.35
421 0.35
422 0.38
423 0.38
424 0.38
425 0.42
426 0.47
427 0.54
428 0.59
429 0.68
430 0.74
431 0.77
432 0.81
433 0.85
434 0.86
435 0.85
436 0.8
437 0.74
438 0.66
439 0.55
440 0.46
441 0.37
442 0.27
443 0.19
444 0.14
445 0.1
446 0.07
447 0.07
448 0.06
449 0.08
450 0.11
451 0.11
452 0.12
453 0.12
454 0.13
455 0.14
456 0.16
457 0.15
458 0.13
459 0.13
460 0.17
461 0.2
462 0.26
463 0.32
464 0.31
465 0.36
466 0.43
467 0.5
468 0.53
469 0.59
470 0.64
471 0.67
472 0.75
473 0.78
474 0.77
475 0.78
476 0.74
477 0.69
478 0.64
479 0.59
480 0.51
481 0.47
482 0.43
483 0.37
484 0.38
485 0.34
486 0.28
487 0.23
488 0.24
489 0.21
490 0.18
491 0.16
492 0.12
493 0.13
494 0.11
495 0.12
496 0.1
497 0.09
498 0.08
499 0.08
500 0.07
501 0.07
502 0.1
503 0.15
504 0.16
505 0.17
506 0.26
507 0.35
508 0.4
509 0.47
510 0.51
511 0.49
512 0.53
513 0.61
514 0.59
515 0.58
516 0.55
517 0.5
518 0.48
519 0.45
520 0.39
521 0.31
522 0.25
523 0.18
524 0.18
525 0.18
526 0.16
527 0.18
528 0.19
529 0.19
530 0.2
531 0.19
532 0.19
533 0.2
534 0.23
535 0.26
536 0.25
537 0.25
538 0.23
539 0.24
540 0.23
541 0.2
542 0.16
543 0.1
544 0.1
545 0.1
546 0.11
547 0.09
548 0.09
549 0.09
550 0.08
551 0.08
552 0.08
553 0.09
554 0.09
555 0.13
556 0.15
557 0.23
558 0.27
559 0.28
560 0.29
561 0.29
562 0.35
563 0.37
564 0.41
565 0.41
566 0.46
567 0.51
568 0.58
569 0.62
570 0.65
571 0.69
572 0.68
573 0.7
574 0.68
575 0.65
576 0.66
577 0.69
578 0.63
579 0.57
580 0.52
581 0.43
582 0.41
583 0.38
584 0.33
585 0.32
586 0.28
587 0.28
588 0.33
589 0.32
590 0.31
591 0.34
592 0.36
593 0.38
594 0.38
595 0.35
596 0.33
597 0.33
598 0.32
599 0.3
600 0.25
601 0.17