Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7EL00

Protein Details
Accession A7EL00    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-39RQRSNSPPPHQLSKRDKRRSMLQDKLAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
235-237RKR
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0070822  C:Sin3-type complex  
GO:0042826  F:histone deacetylase binding  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG ssl:SS1G_05997  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MSPTTFGNKAERQRSNSPPPHQLSKRDKRRSMLQDKLAEMTVNFASNRDHYYRDQLKGLQIDMNLIQEADVHGKFPLPDGNEVEALVVDGIKKVKGIAGHHPSAAGKEYESFAREINNAMEERDVALTTHMRDYEVRANEIESAHAYRMRLADLEYQALKTTLRDRLINKVISKKAHLSKDKESIEIGENNALLLHPSQFGLANPASPGGMHSKRATRHRREAEELPNMFDGSKRKRKGIDGDESPAPSRQRMDNGGSTPLWSSERNISASAQIDASAYSIEKLFTDKELAMKYNEAAQAAYSYMVRHAPYEDENSPQNGRSDSSPDTDKMNATSGDVENDDPDSPPSAPTMERQPSHQTRSTRGGALANFNTGTGIDIISDLAYPGNMAAITKQIPKLPPLLASNMQKGYVKGDAANQPQGLAPDEVNAELEIIRRGRTYNDERGYGKNLELENGGRSLLEAVSTPRRAQTYYVRSDNKGSMLSNLREELGAESISKQSSRGGSEVGGTPMSRQNTNEGASRAGRARKNLLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.76
3 0.78
4 0.76
5 0.76
6 0.74
7 0.78
8 0.75
9 0.76
10 0.76
11 0.78
12 0.82
13 0.83
14 0.83
15 0.8
16 0.84
17 0.85
18 0.84
19 0.82
20 0.8
21 0.76
22 0.72
23 0.67
24 0.58
25 0.47
26 0.37
27 0.31
28 0.23
29 0.19
30 0.16
31 0.15
32 0.17
33 0.18
34 0.24
35 0.23
36 0.26
37 0.26
38 0.36
39 0.43
40 0.44
41 0.46
42 0.44
43 0.47
44 0.45
45 0.44
46 0.37
47 0.3
48 0.29
49 0.25
50 0.24
51 0.18
52 0.15
53 0.13
54 0.1
55 0.12
56 0.13
57 0.12
58 0.11
59 0.12
60 0.13
61 0.13
62 0.15
63 0.18
64 0.16
65 0.2
66 0.23
67 0.26
68 0.25
69 0.24
70 0.23
71 0.18
72 0.15
73 0.11
74 0.08
75 0.05
76 0.07
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.1
82 0.14
83 0.17
84 0.25
85 0.32
86 0.34
87 0.34
88 0.35
89 0.33
90 0.31
91 0.3
92 0.2
93 0.14
94 0.13
95 0.15
96 0.15
97 0.17
98 0.16
99 0.14
100 0.16
101 0.15
102 0.16
103 0.15
104 0.17
105 0.15
106 0.15
107 0.15
108 0.13
109 0.14
110 0.13
111 0.11
112 0.08
113 0.1
114 0.11
115 0.13
116 0.15
117 0.14
118 0.14
119 0.15
120 0.19
121 0.25
122 0.26
123 0.26
124 0.23
125 0.24
126 0.25
127 0.24
128 0.2
129 0.14
130 0.14
131 0.13
132 0.15
133 0.14
134 0.15
135 0.16
136 0.15
137 0.14
138 0.14
139 0.18
140 0.18
141 0.21
142 0.19
143 0.18
144 0.18
145 0.18
146 0.16
147 0.12
148 0.16
149 0.19
150 0.2
151 0.24
152 0.26
153 0.34
154 0.4
155 0.43
156 0.42
157 0.44
158 0.46
159 0.44
160 0.46
161 0.45
162 0.46
163 0.5
164 0.54
165 0.51
166 0.53
167 0.6
168 0.58
169 0.51
170 0.45
171 0.38
172 0.34
173 0.3
174 0.25
175 0.17
176 0.15
177 0.14
178 0.14
179 0.11
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.12
197 0.14
198 0.16
199 0.18
200 0.23
201 0.29
202 0.39
203 0.48
204 0.49
205 0.58
206 0.63
207 0.66
208 0.67
209 0.68
210 0.66
211 0.64
212 0.56
213 0.48
214 0.4
215 0.35
216 0.29
217 0.25
218 0.24
219 0.24
220 0.32
221 0.32
222 0.35
223 0.38
224 0.43
225 0.49
226 0.51
227 0.51
228 0.45
229 0.47
230 0.45
231 0.43
232 0.4
233 0.34
234 0.27
235 0.19
236 0.18
237 0.15
238 0.17
239 0.19
240 0.22
241 0.22
242 0.23
243 0.25
244 0.23
245 0.22
246 0.19
247 0.16
248 0.15
249 0.11
250 0.12
251 0.13
252 0.15
253 0.16
254 0.16
255 0.15
256 0.15
257 0.16
258 0.15
259 0.11
260 0.09
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.11
276 0.12
277 0.13
278 0.13
279 0.13
280 0.13
281 0.15
282 0.16
283 0.13
284 0.12
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.06
290 0.05
291 0.06
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.09
296 0.1
297 0.12
298 0.17
299 0.17
300 0.17
301 0.18
302 0.2
303 0.2
304 0.2
305 0.19
306 0.15
307 0.15
308 0.14
309 0.17
310 0.17
311 0.19
312 0.2
313 0.19
314 0.21
315 0.21
316 0.2
317 0.17
318 0.17
319 0.15
320 0.13
321 0.15
322 0.13
323 0.13
324 0.13
325 0.12
326 0.1
327 0.11
328 0.11
329 0.09
330 0.09
331 0.1
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.12
338 0.2
339 0.24
340 0.24
341 0.27
342 0.36
343 0.41
344 0.46
345 0.5
346 0.44
347 0.44
348 0.5
349 0.49
350 0.41
351 0.37
352 0.35
353 0.3
354 0.33
355 0.28
356 0.23
357 0.2
358 0.18
359 0.17
360 0.13
361 0.13
362 0.07
363 0.06
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.03
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.07
379 0.09
380 0.12
381 0.14
382 0.18
383 0.19
384 0.21
385 0.24
386 0.23
387 0.25
388 0.24
389 0.28
390 0.3
391 0.33
392 0.36
393 0.33
394 0.34
395 0.31
396 0.29
397 0.27
398 0.23
399 0.2
400 0.16
401 0.21
402 0.27
403 0.29
404 0.33
405 0.3
406 0.28
407 0.27
408 0.28
409 0.24
410 0.18
411 0.14
412 0.12
413 0.13
414 0.12
415 0.12
416 0.11
417 0.09
418 0.08
419 0.09
420 0.11
421 0.11
422 0.12
423 0.12
424 0.13
425 0.16
426 0.24
427 0.3
428 0.37
429 0.4
430 0.44
431 0.46
432 0.49
433 0.51
434 0.44
435 0.38
436 0.33
437 0.29
438 0.26
439 0.26
440 0.23
441 0.2
442 0.19
443 0.18
444 0.12
445 0.12
446 0.12
447 0.1
448 0.09
449 0.08
450 0.12
451 0.19
452 0.22
453 0.22
454 0.25
455 0.27
456 0.27
457 0.31
458 0.37
459 0.39
460 0.45
461 0.53
462 0.54
463 0.55
464 0.59
465 0.57
466 0.49
467 0.43
468 0.35
469 0.33
470 0.36
471 0.36
472 0.34
473 0.32
474 0.3
475 0.27
476 0.27
477 0.22
478 0.17
479 0.15
480 0.13
481 0.13
482 0.15
483 0.17
484 0.16
485 0.15
486 0.17
487 0.21
488 0.23
489 0.23
490 0.22
491 0.21
492 0.24
493 0.26
494 0.24
495 0.22
496 0.18
497 0.2
498 0.24
499 0.27
500 0.26
501 0.24
502 0.28
503 0.31
504 0.34
505 0.37
506 0.32
507 0.34
508 0.33
509 0.36
510 0.37
511 0.4
512 0.42
513 0.43