Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7ECD8

Protein Details
Accession A7ECD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
94-117QRAAKRDKSPTPPPKKKEPTPDLTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-110RERRGGEREWDRDRGAARRDARRDDDERPPRRDNRDLFDDRRGGGGGGGRRGGERGDRGDRRDRGDRGDDGGFAAQRAAKRDKSPTPPPKKK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
IPR006529  U2AF_lg  
Gene Ontology GO:0000243  C:commitment complex  
GO:0016607  C:nuclear speck  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0089701  C:U2AF complex  
GO:0008187  F:poly-pyrimidine tract binding  
GO:0030628  F:pre-mRNA 3'-splice site binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
GO:0000245  P:spliceosomal complex assembly  
KEGG ssl:SS1G_02977  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12231  RRM2_U2AF65  
cd12232  RRM3_U2AF65  
Amino Acid Sequences MAHLEIIIEREREDRYSGRERRGGEREWDRDRGAARRDARRDDDERPPRRDNRDLFDDRRGGGGGGGRRGGERGDRGDRRDRGDRGDDGGFAAQRAAKRDKSPTPPPKKKEPTPDLTDIVPILERKRRLTQWDIKPPGYENVTAEQAKLSGMFPLPGAPRQQPMDPSKLQAFMAQPSGSVTNAALKPSNSRQSKRLLVHNIPADTKEETLVGFFNLQLNGLNVIEGSDPCISAQVSKDGSFALLEFKTQSDATVALALDGITMENNDHMVTGNGSADTQGLSIRRPKDYIVPAVTDETPFEPGVVSNIVPDTQNKISVANIPHYLNDEQVTELLVSFGELKAFVLVKDSNTDESRGIAFCEYVDPAATDIAVEGLNGMELGDKHLKVQRASIGNTQVSGLEMSVNAMSMLAGTTSQDLENGRVLQLLNMVTPEELIDNEDYEEICEDVKEECEKYGKVLEMKVPRPTGGSRQSTGVGKIFVKFDTPDSAGKALKALAGRKFADRTVVTTYFPEDDDDY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.3
3 0.4
4 0.46
5 0.51
6 0.54
7 0.56
8 0.61
9 0.64
10 0.61
11 0.6
12 0.62
13 0.63
14 0.64
15 0.65
16 0.57
17 0.54
18 0.54
19 0.52
20 0.48
21 0.48
22 0.5
23 0.55
24 0.6
25 0.64
26 0.66
27 0.66
28 0.66
29 0.63
30 0.67
31 0.68
32 0.69
33 0.69
34 0.71
35 0.72
36 0.74
37 0.77
38 0.72
39 0.7
40 0.71
41 0.72
42 0.68
43 0.68
44 0.64
45 0.55
46 0.5
47 0.43
48 0.33
49 0.26
50 0.27
51 0.22
52 0.22
53 0.22
54 0.21
55 0.21
56 0.21
57 0.21
58 0.21
59 0.22
60 0.26
61 0.34
62 0.39
63 0.44
64 0.53
65 0.56
66 0.58
67 0.62
68 0.58
69 0.55
70 0.56
71 0.52
72 0.47
73 0.44
74 0.37
75 0.3
76 0.3
77 0.23
78 0.17
79 0.17
80 0.14
81 0.15
82 0.21
83 0.25
84 0.26
85 0.31
86 0.39
87 0.46
88 0.52
89 0.61
90 0.66
91 0.72
92 0.78
93 0.79
94 0.83
95 0.84
96 0.84
97 0.84
98 0.82
99 0.79
100 0.76
101 0.75
102 0.66
103 0.57
104 0.5
105 0.39
106 0.3
107 0.24
108 0.18
109 0.17
110 0.2
111 0.23
112 0.26
113 0.34
114 0.37
115 0.42
116 0.5
117 0.56
118 0.61
119 0.69
120 0.7
121 0.64
122 0.61
123 0.57
124 0.52
125 0.44
126 0.35
127 0.26
128 0.23
129 0.26
130 0.25
131 0.23
132 0.18
133 0.16
134 0.14
135 0.13
136 0.11
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.12
142 0.13
143 0.15
144 0.18
145 0.18
146 0.21
147 0.23
148 0.25
149 0.27
150 0.3
151 0.34
152 0.32
153 0.34
154 0.33
155 0.32
156 0.3
157 0.27
158 0.24
159 0.19
160 0.21
161 0.18
162 0.15
163 0.15
164 0.16
165 0.13
166 0.12
167 0.1
168 0.13
169 0.14
170 0.15
171 0.15
172 0.14
173 0.19
174 0.24
175 0.34
176 0.33
177 0.35
178 0.38
179 0.43
180 0.51
181 0.5
182 0.52
183 0.51
184 0.48
185 0.51
186 0.52
187 0.46
188 0.39
189 0.36
190 0.3
191 0.23
192 0.2
193 0.15
194 0.11
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.07
219 0.08
220 0.09
221 0.1
222 0.11
223 0.12
224 0.12
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.04
248 0.02
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.04
266 0.05
267 0.06
268 0.07
269 0.13
270 0.15
271 0.16
272 0.17
273 0.17
274 0.23
275 0.26
276 0.3
277 0.26
278 0.25
279 0.25
280 0.26
281 0.25
282 0.19
283 0.16
284 0.12
285 0.12
286 0.1
287 0.1
288 0.07
289 0.07
290 0.08
291 0.08
292 0.07
293 0.06
294 0.06
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.12
299 0.11
300 0.13
301 0.13
302 0.13
303 0.14
304 0.18
305 0.19
306 0.17
307 0.19
308 0.18
309 0.18
310 0.21
311 0.21
312 0.17
313 0.16
314 0.14
315 0.11
316 0.11
317 0.11
318 0.08
319 0.07
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.09
332 0.09
333 0.1
334 0.12
335 0.14
336 0.16
337 0.17
338 0.18
339 0.15
340 0.16
341 0.17
342 0.15
343 0.14
344 0.11
345 0.1
346 0.09
347 0.1
348 0.09
349 0.08
350 0.08
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.05
356 0.04
357 0.05
358 0.05
359 0.04
360 0.04
361 0.03
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.09
368 0.12
369 0.13
370 0.15
371 0.2
372 0.23
373 0.23
374 0.26
375 0.28
376 0.29
377 0.33
378 0.35
379 0.38
380 0.34
381 0.34
382 0.31
383 0.24
384 0.2
385 0.17
386 0.12
387 0.07
388 0.06
389 0.07
390 0.07
391 0.06
392 0.06
393 0.05
394 0.05
395 0.04
396 0.04
397 0.03
398 0.04
399 0.04
400 0.05
401 0.06
402 0.06
403 0.08
404 0.09
405 0.11
406 0.14
407 0.14
408 0.13
409 0.14
410 0.14
411 0.13
412 0.15
413 0.14
414 0.11
415 0.11
416 0.11
417 0.09
418 0.09
419 0.09
420 0.07
421 0.07
422 0.08
423 0.09
424 0.09
425 0.1
426 0.1
427 0.1
428 0.1
429 0.1
430 0.08
431 0.08
432 0.07
433 0.07
434 0.08
435 0.11
436 0.13
437 0.14
438 0.16
439 0.2
440 0.2
441 0.22
442 0.26
443 0.28
444 0.28
445 0.3
446 0.36
447 0.4
448 0.44
449 0.49
450 0.46
451 0.42
452 0.42
453 0.43
454 0.44
455 0.45
456 0.46
457 0.41
458 0.42
459 0.45
460 0.44
461 0.44
462 0.37
463 0.32
464 0.27
465 0.28
466 0.27
467 0.24
468 0.24
469 0.22
470 0.22
471 0.24
472 0.25
473 0.25
474 0.27
475 0.31
476 0.29
477 0.28
478 0.27
479 0.21
480 0.22
481 0.24
482 0.26
483 0.28
484 0.33
485 0.35
486 0.38
487 0.41
488 0.38
489 0.42
490 0.37
491 0.35
492 0.37
493 0.37
494 0.33
495 0.32
496 0.34
497 0.28
498 0.27