FuNGI

A0A086SXM2

Protein Details

Accession

A0A086SXM2

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-42	TKSSAKAGNKRRTATKKDPSTNVA	Hydrophilic
466-503	PPTKKEKKKADGKAEKAPKKEKKDTKPKKDSKEAPEPS	Basic
540-562	ESQSAAQKPKKQKTDRKGSPDLG	Hydrophilic
592-621	APEASSTPAKRPRKTKKDKKDKAETAQVEK	Hydrophilic
672-698	AATPQPPKEKKARKPGAPKAGKGKDKE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
468-497	TKKEKKKADGKAEKAPKKEKKDTKPKKDSK
600-613	AKRPRKTKKDKKDK
678-704	PKEKKARKPGAPKAGKGKDKEQTPKRS

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MASRPSYKVHSLKDQIANTKSSAKAGNKRRTATKKDPSTNVAAIFGNNDDDEEDQNTDTDSSDEGGGSEFLRRLAAASATNGASAPKRRSKDDEIADSDDERKSSSAKKASASKAAPAKAEPISTKSDGYSSSEVESDSEHAKPDVSKTNGKATENDEASDSDSSTSSSGSTSDDESDDNESEEDGADVKPAIKTAEKEDPAESDDENSTSSDSESDEDEVEEPAQALPQAQSATKAPPTTETTSDSSDEESESESESDGEENPAVADESIHISDREDGSRQIAVPKTIAPDFMIRRSDQGLNGQDVAQVCNQANLEGKQLWYFTVPSNVPISVVQQLEIPIDQAQQRDPVFSHGGESYGLSFDRMTPKSTIQILIPASDGPSYQSSPRQLDQVMHIKRVSQLGSTSQDSAGPVPKPAARPQPKGLQTRYKPIGVNNPATETPAGPSNVDEDTEMAEAPTLPVVAPPTKKEKKKADGKAEKAPKKEKKDTKPKKDSKEAPEPSTHTTATTTTQPAKAQRKRKLPTSEDDATAAASQLLEESQSAAQKPKKQKTDRKGSPDLGSQPSTTRKETPVPPPPVPAGLPSFDNVSSAPEASSTPAKRPRKTKKDKKDKAETAQVEKQDATNTVPTSSIETQPTGSAVKKTPVPLPKFPGSSQLSAPSPPVASSQTTAATPQPPKEKKARKPGAPKAGKGKDKEQTPKRSNGAAPASKVTPVPVPSVGRASS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.66
2	0.66
3	0.62
4	0.58
5	0.5
6	0.51
7	0.43
8	0.39
9	0.41
10	0.41
11	0.48
12	0.56
13	0.64
14	0.65
15	0.69
16	0.76
17	0.78
18	0.8
19	0.81
20	0.81
21	0.81
22	0.82
23	0.83
24	0.77
25	0.75
26	0.68
27	0.59
28	0.51
29	0.41
30	0.32
31	0.28
32	0.23
33	0.18
34	0.14
35	0.13
36	0.11
37	0.12
38	0.14
39	0.15
40	0.15
41	0.14
42	0.14
43	0.15
44	0.14
45	0.13
46	0.12
47	0.1
48	0.1
49	0.1
50	0.1
51	0.09
52	0.1
53	0.1
54	0.09
55	0.11
56	0.11
57	0.11
58	0.11
59	0.11
60	0.11
61	0.12
62	0.14
63	0.13
64	0.14
65	0.17
66	0.16
67	0.17
68	0.16
69	0.15
70	0.18
71	0.23
72	0.29
73	0.34
74	0.38
75	0.43
76	0.51
77	0.58
78	0.63
79	0.64
80	0.65
81	0.62
82	0.63
83	0.59
84	0.53
85	0.47
86	0.39
87	0.31
88	0.24
89	0.19
90	0.18
91	0.22
92	0.3
93	0.34
94	0.36
95	0.42
96	0.49
97	0.54
98	0.59
99	0.55
100	0.53
101	0.53
102	0.52
103	0.47
104	0.4
105	0.39
106	0.32
107	0.34
108	0.28
109	0.25
110	0.28
111	0.28
112	0.28
113	0.25
114	0.24
115	0.22
116	0.26
117	0.24
118	0.2
119	0.19
120	0.19
121	0.19
122	0.17
123	0.17
124	0.14
125	0.14
126	0.13
127	0.13
128	0.13
129	0.14
130	0.14
131	0.18
132	0.25
133	0.27
134	0.33
135	0.34
136	0.43
137	0.47
138	0.47
139	0.46
140	0.41
141	0.45
142	0.4
143	0.38
144	0.29
145	0.25
146	0.26
147	0.24
148	0.19
149	0.12
150	0.11
151	0.11
152	0.1
153	0.1
154	0.08
155	0.07
156	0.08
157	0.09
158	0.1
159	0.1
160	0.11
161	0.12
162	0.12
163	0.13
164	0.16
165	0.14
166	0.14
167	0.12
168	0.11
169	0.1
170	0.1
171	0.09
172	0.07
173	0.06
174	0.06
175	0.06
176	0.07
177	0.07
178	0.08
179	0.09
180	0.11
181	0.13
182	0.18
183	0.26
184	0.27
185	0.29
186	0.29
187	0.29
188	0.28
189	0.28
190	0.22
191	0.16
192	0.15
193	0.13
194	0.13
195	0.12
196	0.11
197	0.1
198	0.1
199	0.08
200	0.08
201	0.08
202	0.09
203	0.1
204	0.09
205	0.1
206	0.1
207	0.1
208	0.09
209	0.08
210	0.08
211	0.06
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.07
217	0.08
218	0.08
219	0.1
220	0.11
221	0.14
222	0.16
223	0.16
224	0.15
225	0.18
226	0.23
227	0.25
228	0.26
229	0.27
230	0.27
231	0.28
232	0.29
233	0.25
234	0.21
235	0.18
236	0.16
237	0.13
238	0.11
239	0.1
240	0.09
241	0.09
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.08
246	0.07
247	0.08
248	0.07
249	0.06
250	0.06
251	0.06
252	0.06
253	0.05
254	0.05
255	0.04
256	0.07
257	0.07
258	0.08
259	0.08
260	0.08
261	0.11
262	0.12
263	0.13
264	0.12
265	0.12
266	0.13
267	0.14
268	0.14
269	0.16
270	0.16
271	0.15
272	0.15
273	0.16
274	0.16
275	0.16
276	0.16
277	0.12
278	0.16
279	0.17
280	0.21
281	0.22
282	0.19
283	0.2
284	0.23
285	0.24
286	0.19
287	0.24
288	0.22
289	0.21
290	0.21
291	0.2
292	0.18
293	0.17
294	0.17
295	0.12
296	0.11
297	0.1
298	0.11
299	0.11
300	0.1
301	0.11
302	0.11
303	0.13
304	0.12
305	0.12
306	0.11
307	0.12
308	0.11
309	0.1
310	0.11
311	0.09
312	0.13
313	0.13
314	0.14
315	0.15
316	0.14
317	0.14
318	0.13
319	0.14
320	0.13
321	0.12
322	0.11
323	0.1
324	0.11
325	0.11
326	0.1
327	0.09
328	0.06
329	0.08
330	0.09
331	0.09
332	0.09
333	0.13
334	0.13
335	0.13
336	0.13
337	0.15
338	0.15
339	0.14
340	0.15
341	0.11
342	0.12
343	0.11
344	0.11
345	0.08
346	0.07
347	0.07
348	0.06
349	0.06
350	0.07
351	0.13
352	0.14
353	0.15
354	0.16
355	0.17
356	0.2
357	0.21
358	0.2
359	0.14
360	0.17
361	0.15
362	0.14
363	0.14
364	0.11
365	0.1
366	0.09
367	0.09
368	0.07
369	0.08
370	0.09
371	0.1
372	0.13
373	0.16
374	0.19
375	0.19
376	0.2
377	0.19
378	0.19
379	0.23
380	0.29
381	0.27
382	0.27
383	0.26
384	0.25
385	0.26
386	0.27
387	0.23
388	0.14
389	0.13
390	0.15
391	0.18
392	0.18
393	0.18
394	0.15
395	0.16
396	0.15
397	0.15
398	0.15
399	0.12
400	0.11
401	0.12
402	0.14
403	0.16
404	0.21
405	0.3
406	0.34
407	0.38
408	0.42
409	0.49
410	0.54
411	0.58
412	0.58
413	0.58
414	0.53
415	0.57
416	0.56
417	0.51
418	0.45
419	0.41
420	0.46
421	0.41
422	0.42
423	0.34
424	0.34
425	0.31
426	0.31
427	0.28
428	0.19
429	0.15
430	0.14
431	0.14
432	0.11
433	0.11
434	0.12
435	0.12
436	0.12
437	0.11
438	0.08
439	0.08
440	0.09
441	0.08
442	0.06
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.05
447	0.04
448	0.03
449	0.04
450	0.07
451	0.1
452	0.12
453	0.15
454	0.25
455	0.33
456	0.38
457	0.46
458	0.54
459	0.6
460	0.68
461	0.75
462	0.77
463	0.78
464	0.79
465	0.8
466	0.81
467	0.76
468	0.73
469	0.74
470	0.71
471	0.7
472	0.76
473	0.76
474	0.76
475	0.82
476	0.87
477	0.88
478	0.9
479	0.9
480	0.89
481	0.89
482	0.87
483	0.84
484	0.84
485	0.78
486	0.71
487	0.67
488	0.61
489	0.55
490	0.5
491	0.41
492	0.31
493	0.27
494	0.24
495	0.21
496	0.22
497	0.21
498	0.2
499	0.23
500	0.25
501	0.32
502	0.42
503	0.48
504	0.54
505	0.6
506	0.67
507	0.69
508	0.76
509	0.77
510	0.71
511	0.69
512	0.68
513	0.62
514	0.53
515	0.49
516	0.4
517	0.31
518	0.26
519	0.19
520	0.11
521	0.07
522	0.06
523	0.05
524	0.05
525	0.04
526	0.04
527	0.06
528	0.07
529	0.1
530	0.11
531	0.17
532	0.22
533	0.3
534	0.41
535	0.48
536	0.57
537	0.65
538	0.75
539	0.79
540	0.86
541	0.87
542	0.86
543	0.85
544	0.79
545	0.72
546	0.68
547	0.63
548	0.56
549	0.49
550	0.41
551	0.37
552	0.4
553	0.4
554	0.37
555	0.35
556	0.34
557	0.39
558	0.45
559	0.5
560	0.53
561	0.56
562	0.54
563	0.54
564	0.52
565	0.47
566	0.41
567	0.35
568	0.27
569	0.22
570	0.21
571	0.18
572	0.19
573	0.16
574	0.17
575	0.14
576	0.14
577	0.14
578	0.13
579	0.12
580	0.11
581	0.11
582	0.13
583	0.21
584	0.19
585	0.26
586	0.35
587	0.44
588	0.5
589	0.61
590	0.69
591	0.73
592	0.83
593	0.87
594	0.88
595	0.91
596	0.95
597	0.94
598	0.94
599	0.92
600	0.89
601	0.88
602	0.82
603	0.79
604	0.75
605	0.66
606	0.57
607	0.49
608	0.42
609	0.34
610	0.3
611	0.25
612	0.24
613	0.23
614	0.21
615	0.21
616	0.2
617	0.24
618	0.26
619	0.26
620	0.23
621	0.24
622	0.24
623	0.24
624	0.25
625	0.21
626	0.2
627	0.2
628	0.21
629	0.24
630	0.27
631	0.29
632	0.35
633	0.42
634	0.47
635	0.5
636	0.54
637	0.57
638	0.57
639	0.55
640	0.57
641	0.52
642	0.48
643	0.44
644	0.42
645	0.37
646	0.34
647	0.35
648	0.28
649	0.23
650	0.21
651	0.21
652	0.18
653	0.19
654	0.19
655	0.2
656	0.2
657	0.19
658	0.21
659	0.22
660	0.27
661	0.28
662	0.34
663	0.42
664	0.45
665	0.5
666	0.59
667	0.66
668	0.68
669	0.76
670	0.79
671	0.79
672	0.85
673	0.9
674	0.9
675	0.88
676	0.85
677	0.84
678	0.84
679	0.81
680	0.75
681	0.73
682	0.7
683	0.71
684	0.75
685	0.74
686	0.75
687	0.75
688	0.79
689	0.75
690	0.74
691	0.67
692	0.66
693	0.66
694	0.6
695	0.57
696	0.53
697	0.49
698	0.44
699	0.42
700	0.35
701	0.3
702	0.27
703	0.27
704	0.28
705	0.3
706	0.31

A0A086SXM2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer