Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A086TCR8

Protein Details
Accession A0A086TCR8    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
86-116EIAPEPVPKPRKPRTRKPAPGKKTKKGVEDGBasic
125-144DQPWKKYVPSPKAKTGRAKAHydrophilic
291-316SPALDKSPTKKKAPKKKPRTITELATHydrophilic
353-381KGNVKGPGRKKPVKKTKKKPPPPEPVLLSBasic
691-715AQVAASPKRKRGRPRKNSIGIEPQDHydrophilic
723-742MESPMRPRGRPRKDSTSSKGHydrophilic
755-778QALEFPKRPRGRPRKDSTSPSRLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
93-111PKPRKPRTRKPAPGKKTKK
296-309KSPTKKKAPKKKPR
350-374SSAKGNVKGPGRKKPVKKTKKKPPP
697-707PKRKRGRPRKN
727-769MRPRGRPRKDSTSSKGVSSRRTEPPPSGQALEFPKRPRGRPRK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PF09494  Slx4  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MASPDVFQSSPMRPPRRASLLADSSSPLPTVQDLVSQVPRRPPIRSGSRANPIPDGATSTFTSAREHWKSAQAAAANEDTSVSVIEIAPEPVPKPRKPRTRKPAPGKKTKKGVEDGETAELSATDQPWKKYVPSPKAKTGRAKAAQNNAPDKPPEKKDAFQTRKVEKTGTVSEHFPTRNERPVREKSTRPVEDESLYLEPAMSRRVDWTPPPENPKTAVDIGSHGPTQNDINSSATDGDKSGLFKSLLENYGCSEQPSKEAVVISDEDLSFLKKRKRIELLNTNEGSRSVSPALDKSPTKKKAPKKKPRTITELATAAYRPATKISPVPAAEPAVGRLSNGDGGPRSAGSSAKGNVKGPGRKKPVKKTKKKPPPPEPVLLSPGTALKEVSKQDFVFGTSSQLVREQSPSLLREIQSAIGNLTEMDFGNGVTPLNSDMLEPSEQRQKLWDAAARDTDGQLFDAEIIDLVDGSPQCLPADDTDDPFGYFKAEEENVPVVGCPTSPRRDSLEILSDALPPPTKRPESNDRDHSGPRGTYKGPGQCVEGGDGDTFDILPDILPRAVKQPQEIADDDSPFSSSQISVSTDIEKPKATSDLPTQKASAQIPAAVDTQQCRPEEDRTLGKPKRPTFELYTDAQLTKEISSYGFKPVKRRAAMISLLDQCWQSKNSTVAAGTRTITTSAGPSEQPPAIAQVAASPKRKRGRPRKNSIGIEPQDPPPSAQPMESPMRPRGRPRKDSTSSKGVSSRRTEPPPSGQALEFPKRPRGRPRKDSTSPSRLSPVMAATMKHGKASTAEAPPRPSTPTRKPAVPRTIVEIPDSASEAESDMSPSSPFSSPGQTFSPPPAVDLSLSMEEDNELSLTMAPDAKQEALFERITEAVTSAPRSTDPANPSWYEKMLLYDPIVLEGLTAWLNSGQLTRVGYDGEVNPGEVKKWCESKSVCCLWRVNLRGKERKRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.58
3 0.61
4 0.62
5 0.59
6 0.59
7 0.6
8 0.57
9 0.53
10 0.47
11 0.4
12 0.36
13 0.31
14 0.21
15 0.14
16 0.13
17 0.15
18 0.13
19 0.15
20 0.16
21 0.21
22 0.29
23 0.32
24 0.35
25 0.4
26 0.47
27 0.47
28 0.48
29 0.48
30 0.5
31 0.56
32 0.59
33 0.61
34 0.62
35 0.69
36 0.7
37 0.68
38 0.62
39 0.53
40 0.47
41 0.39
42 0.36
43 0.28
44 0.26
45 0.23
46 0.23
47 0.25
48 0.24
49 0.26
50 0.24
51 0.32
52 0.34
53 0.37
54 0.37
55 0.43
56 0.44
57 0.42
58 0.44
59 0.37
60 0.33
61 0.33
62 0.31
63 0.23
64 0.21
65 0.2
66 0.15
67 0.12
68 0.11
69 0.08
70 0.07
71 0.07
72 0.08
73 0.09
74 0.1
75 0.11
76 0.12
77 0.13
78 0.21
79 0.28
80 0.32
81 0.4
82 0.49
83 0.59
84 0.68
85 0.78
86 0.81
87 0.85
88 0.91
89 0.93
90 0.94
91 0.93
92 0.94
93 0.93
94 0.91
95 0.9
96 0.86
97 0.83
98 0.79
99 0.75
100 0.7
101 0.65
102 0.59
103 0.53
104 0.46
105 0.38
106 0.3
107 0.23
108 0.18
109 0.15
110 0.13
111 0.16
112 0.2
113 0.21
114 0.24
115 0.26
116 0.29
117 0.34
118 0.44
119 0.47
120 0.55
121 0.6
122 0.67
123 0.74
124 0.78
125 0.8
126 0.77
127 0.77
128 0.73
129 0.75
130 0.72
131 0.73
132 0.71
133 0.69
134 0.68
135 0.59
136 0.56
137 0.51
138 0.48
139 0.46
140 0.46
141 0.46
142 0.45
143 0.46
144 0.53
145 0.61
146 0.64
147 0.65
148 0.69
149 0.68
150 0.7
151 0.68
152 0.6
153 0.51
154 0.51
155 0.48
156 0.45
157 0.4
158 0.35
159 0.35
160 0.39
161 0.37
162 0.32
163 0.33
164 0.33
165 0.39
166 0.42
167 0.46
168 0.48
169 0.56
170 0.63
171 0.63
172 0.64
173 0.63
174 0.69
175 0.68
176 0.64
177 0.59
178 0.53
179 0.48
180 0.43
181 0.38
182 0.28
183 0.25
184 0.2
185 0.15
186 0.12
187 0.12
188 0.14
189 0.1
190 0.09
191 0.13
192 0.16
193 0.19
194 0.23
195 0.3
196 0.34
197 0.4
198 0.47
199 0.47
200 0.46
201 0.46
202 0.44
203 0.41
204 0.36
205 0.32
206 0.25
207 0.24
208 0.24
209 0.23
210 0.22
211 0.17
212 0.15
213 0.15
214 0.16
215 0.15
216 0.14
217 0.13
218 0.14
219 0.14
220 0.15
221 0.16
222 0.14
223 0.13
224 0.12
225 0.11
226 0.11
227 0.12
228 0.11
229 0.13
230 0.13
231 0.13
232 0.16
233 0.2
234 0.22
235 0.21
236 0.21
237 0.19
238 0.23
239 0.22
240 0.21
241 0.19
242 0.16
243 0.18
244 0.2
245 0.18
246 0.17
247 0.17
248 0.16
249 0.15
250 0.16
251 0.14
252 0.14
253 0.13
254 0.12
255 0.12
256 0.14
257 0.13
258 0.18
259 0.24
260 0.25
261 0.29
262 0.36
263 0.44
264 0.49
265 0.57
266 0.61
267 0.63
268 0.68
269 0.66
270 0.58
271 0.51
272 0.44
273 0.36
274 0.26
275 0.21
276 0.13
277 0.13
278 0.14
279 0.15
280 0.17
281 0.2
282 0.21
283 0.24
284 0.33
285 0.38
286 0.45
287 0.52
288 0.6
289 0.66
290 0.76
291 0.82
292 0.83
293 0.87
294 0.89
295 0.88
296 0.86
297 0.8
298 0.73
299 0.67
300 0.58
301 0.48
302 0.39
303 0.32
304 0.23
305 0.19
306 0.15
307 0.1
308 0.1
309 0.11
310 0.11
311 0.14
312 0.16
313 0.21
314 0.21
315 0.22
316 0.21
317 0.22
318 0.21
319 0.19
320 0.17
321 0.13
322 0.13
323 0.11
324 0.1
325 0.09
326 0.1
327 0.1
328 0.1
329 0.08
330 0.09
331 0.1
332 0.09
333 0.09
334 0.08
335 0.09
336 0.09
337 0.12
338 0.14
339 0.19
340 0.21
341 0.21
342 0.25
343 0.31
344 0.36
345 0.38
346 0.45
347 0.49
348 0.55
349 0.62
350 0.69
351 0.74
352 0.79
353 0.85
354 0.86
355 0.88
356 0.91
357 0.94
358 0.94
359 0.93
360 0.93
361 0.88
362 0.83
363 0.76
364 0.68
365 0.61
366 0.51
367 0.4
368 0.29
369 0.25
370 0.19
371 0.15
372 0.12
373 0.09
374 0.13
375 0.14
376 0.16
377 0.17
378 0.16
379 0.17
380 0.18
381 0.18
382 0.15
383 0.13
384 0.14
385 0.12
386 0.13
387 0.12
388 0.13
389 0.13
390 0.13
391 0.14
392 0.13
393 0.13
394 0.15
395 0.16
396 0.16
397 0.18
398 0.17
399 0.17
400 0.17
401 0.17
402 0.15
403 0.14
404 0.12
405 0.09
406 0.09
407 0.07
408 0.07
409 0.06
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.04
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.06
422 0.05
423 0.05
424 0.07
425 0.08
426 0.09
427 0.1
428 0.17
429 0.17
430 0.17
431 0.19
432 0.18
433 0.19
434 0.21
435 0.22
436 0.17
437 0.19
438 0.2
439 0.19
440 0.18
441 0.16
442 0.14
443 0.11
444 0.09
445 0.08
446 0.06
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.04
451 0.04
452 0.03
453 0.03
454 0.03
455 0.04
456 0.04
457 0.05
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.06
463 0.05
464 0.11
465 0.11
466 0.11
467 0.12
468 0.13
469 0.13
470 0.12
471 0.12
472 0.07
473 0.07
474 0.06
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.1
479 0.11
480 0.1
481 0.1
482 0.1
483 0.08
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.1
488 0.14
489 0.15
490 0.17
491 0.21
492 0.24
493 0.25
494 0.26
495 0.27
496 0.23
497 0.24
498 0.23
499 0.19
500 0.17
501 0.16
502 0.15
503 0.1
504 0.12
505 0.17
506 0.19
507 0.19
508 0.25
509 0.35
510 0.41
511 0.48
512 0.52
513 0.49
514 0.5
515 0.5
516 0.46
517 0.38
518 0.32
519 0.26
520 0.23
521 0.21
522 0.2
523 0.24
524 0.26
525 0.26
526 0.25
527 0.25
528 0.23
529 0.23
530 0.22
531 0.17
532 0.13
533 0.11
534 0.1
535 0.08
536 0.07
537 0.06
538 0.04
539 0.04
540 0.03
541 0.03
542 0.03
543 0.05
544 0.05
545 0.06
546 0.06
547 0.1
548 0.15
549 0.16
550 0.17
551 0.19
552 0.22
553 0.25
554 0.26
555 0.26
556 0.24
557 0.24
558 0.23
559 0.19
560 0.17
561 0.14
562 0.13
563 0.09
564 0.07
565 0.06
566 0.08
567 0.1
568 0.1
569 0.11
570 0.14
571 0.16
572 0.17
573 0.18
574 0.17
575 0.16
576 0.15
577 0.17
578 0.15
579 0.15
580 0.22
581 0.3
582 0.33
583 0.34
584 0.34
585 0.32
586 0.36
587 0.33
588 0.27
589 0.18
590 0.16
591 0.15
592 0.16
593 0.16
594 0.13
595 0.13
596 0.12
597 0.15
598 0.18
599 0.18
600 0.19
601 0.21
602 0.24
603 0.27
604 0.3
605 0.32
606 0.32
607 0.42
608 0.42
609 0.45
610 0.5
611 0.5
612 0.52
613 0.49
614 0.49
615 0.45
616 0.48
617 0.46
618 0.4
619 0.38
620 0.35
621 0.32
622 0.27
623 0.22
624 0.17
625 0.14
626 0.12
627 0.09
628 0.08
629 0.1
630 0.12
631 0.2
632 0.23
633 0.25
634 0.32
635 0.39
636 0.47
637 0.46
638 0.47
639 0.42
640 0.43
641 0.45
642 0.39
643 0.37
644 0.31
645 0.3
646 0.29
647 0.26
648 0.21
649 0.2
650 0.19
651 0.14
652 0.15
653 0.17
654 0.17
655 0.18
656 0.18
657 0.18
658 0.19
659 0.19
660 0.17
661 0.15
662 0.15
663 0.14
664 0.13
665 0.11
666 0.11
667 0.1
668 0.11
669 0.11
670 0.11
671 0.14
672 0.14
673 0.14
674 0.13
675 0.15
676 0.13
677 0.13
678 0.11
679 0.12
680 0.2
681 0.25
682 0.31
683 0.31
684 0.39
685 0.46
686 0.53
687 0.6
688 0.64
689 0.7
690 0.74
691 0.83
692 0.86
693 0.88
694 0.86
695 0.82
696 0.8
697 0.71
698 0.64
699 0.56
700 0.49
701 0.43
702 0.38
703 0.33
704 0.25
705 0.27
706 0.24
707 0.22
708 0.2
709 0.21
710 0.26
711 0.28
712 0.3
713 0.33
714 0.4
715 0.42
716 0.51
717 0.56
718 0.61
719 0.68
720 0.72
721 0.75
722 0.76
723 0.82
724 0.79
725 0.78
726 0.69
727 0.63
728 0.62
729 0.56
730 0.54
731 0.51
732 0.51
733 0.49
734 0.54
735 0.53
736 0.51
737 0.55
738 0.53
739 0.51
740 0.46
741 0.38
742 0.38
743 0.42
744 0.43
745 0.4
746 0.38
747 0.45
748 0.48
749 0.54
750 0.6
751 0.63
752 0.68
753 0.74
754 0.8
755 0.81
756 0.83
757 0.87
758 0.85
759 0.84
760 0.76
761 0.68
762 0.63
763 0.53
764 0.46
765 0.38
766 0.3
767 0.25
768 0.24
769 0.22
770 0.22
771 0.29
772 0.28
773 0.28
774 0.26
775 0.21
776 0.21
777 0.26
778 0.28
779 0.28
780 0.34
781 0.36
782 0.4
783 0.42
784 0.42
785 0.42
786 0.42
787 0.43
788 0.47
789 0.53
790 0.53
791 0.59
792 0.64
793 0.69
794 0.73
795 0.7
796 0.61
797 0.6
798 0.61
799 0.55
800 0.49
801 0.4
802 0.31
803 0.26
804 0.26
805 0.19
806 0.13
807 0.12
808 0.1
809 0.1
810 0.09
811 0.09
812 0.09
813 0.09
814 0.09
815 0.1
816 0.12
817 0.13
818 0.15
819 0.16
820 0.23
821 0.23
822 0.27
823 0.3
824 0.28
825 0.29
826 0.31
827 0.36
828 0.28
829 0.29
830 0.27
831 0.25
832 0.23
833 0.23
834 0.23
835 0.17
836 0.18
837 0.17
838 0.14
839 0.14
840 0.13
841 0.12
842 0.08
843 0.06
844 0.06
845 0.07
846 0.07
847 0.08
848 0.1
849 0.1
850 0.11
851 0.13
852 0.14
853 0.14
854 0.14
855 0.16
856 0.19
857 0.19
858 0.18
859 0.17
860 0.17
861 0.17
862 0.16
863 0.13
864 0.12
865 0.14
866 0.17
867 0.15
868 0.16
869 0.16
870 0.19
871 0.21
872 0.26
873 0.28
874 0.3
875 0.35
876 0.36
877 0.4
878 0.4
879 0.39
880 0.34
881 0.3
882 0.29
883 0.26
884 0.27
885 0.23
886 0.23
887 0.21
888 0.21
889 0.21
890 0.16
891 0.13
892 0.11
893 0.11
894 0.08
895 0.08
896 0.07
897 0.07
898 0.08
899 0.08
900 0.09
901 0.09
902 0.11
903 0.13
904 0.13
905 0.13
906 0.14
907 0.13
908 0.16
909 0.16
910 0.19
911 0.18
912 0.18
913 0.2
914 0.2
915 0.22
916 0.22
917 0.25
918 0.27
919 0.34
920 0.35
921 0.41
922 0.44
923 0.51
924 0.57
925 0.62
926 0.58
927 0.56
928 0.58
929 0.55
930 0.61
931 0.59
932 0.59
933 0.59
934 0.66
935 0.71