FuNGI

A0A086TER6

Protein Details

Accession

A0A086TER6

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
32-51	LNSRKKLGLVTKNRGKFRKR	Basic
366-388	IEEYGSPRRHKRNKAAQEAEKKP	Basic
590-609	TASSKEPERQQQQQQPTKRG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
35-51	RKKLGLVTKNRGKFRKR
372-403	PRRHKRNKAAQEAEKKPEKELPSSKKIAKLRE

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR026258 SRP68 IPR034652 SRP68-RBD IPR038253 SRP68_N_sf
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0030942 F:endoplasmic reticulum signal peptide binding GO:0005047 F:signal recognition particle binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
Pfam	View protein in Pfam PF16969 SRP68
CDD	cd15481 SRP68-RBD

Amino Acid Sequences

MDITSFIVQGRDKALLYGDYATYHSQLSKRLLNSRKKLGLVTKNRGKFRKREHVTAEDIAENREHVYLALLTSERAWAQAMSFKASHTADQKGIVGRARSHIISRLHKAAISADQLVEALSQSNVSSASTTDILEAKAYASMIHGAELFEKQNWEHCLQNYATCRIIYTALSTTAKSDIFKDLLSETIDPSIRYAAYRLKTPRTIPIPIIARKAFPQSDSALVGEVSKLDPSILKQDEKDSTQETSDEVPNTLTWRNREVKIEDAQIAQAWAAVGSAREGLTQKLATLDESHLFEVAAAYDDILAASQDAVDATKQAIDELRAEGVRQGDARMQSLQITRTAVNYEMLSWRIGRNRVLTGLQDGAIEEYGSPRRHKRNKAAQEAEKKPEKELPSSKKIAKLREKAALYDGNLQNLQSIKELPGVAADQELAAKLDASVKYFQALSSLSIARSHAIIGNVTNALALINHCLSLSKEAASQLPNIGDKPSGPLHVDISRDNIQFLTNLLTGELQRHRAIVHINNLRKEGKEDAPAVGKAPLIEQLSEYPVGGVDLGNIVEFPPKLALIPVKPIFLDVAWNYIDYPGKAPQATASSKEPERQQQQQQPTKRGWFGFGRS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.17
3	0.19
4	0.19
5	0.17
6	0.15
7	0.18
8	0.18
9	0.17
10	0.18
11	0.2
12	0.2
13	0.25
14	0.29
15	0.34
16	0.38
17	0.46
18	0.54
19	0.61
20	0.67
21	0.71
22	0.71
23	0.67
24	0.67
25	0.68
26	0.69
27	0.69
28	0.71
29	0.71
30	0.72
31	0.79
32	0.81
33	0.79
34	0.78
35	0.78
36	0.79
37	0.76
38	0.78
39	0.77
40	0.76
41	0.75
42	0.69
43	0.61
44	0.54
45	0.48
46	0.4
47	0.32
48	0.26
49	0.2
50	0.17
51	0.14
52	0.09
53	0.11
54	0.1
55	0.1
56	0.12
57	0.11
58	0.11
59	0.11
60	0.13
61	0.1
62	0.1
63	0.11
64	0.09
65	0.1
66	0.15
67	0.15
68	0.18
69	0.18
70	0.18
71	0.22
72	0.23
73	0.26
74	0.25
75	0.28
76	0.25
77	0.27
78	0.3
79	0.27
80	0.29
81	0.29
82	0.28
83	0.25
84	0.28
85	0.29
86	0.28
87	0.27
88	0.31
89	0.35
90	0.39
91	0.42
92	0.43
93	0.41
94	0.4
95	0.39
96	0.35
97	0.31
98	0.27
99	0.23
100	0.18
101	0.17
102	0.17
103	0.16
104	0.13
105	0.09
106	0.07
107	0.05
108	0.06
109	0.06
110	0.06
111	0.06
112	0.06
113	0.07
114	0.06
115	0.09
116	0.1
117	0.1
118	0.11
119	0.12
120	0.12
121	0.11
122	0.11
123	0.09
124	0.09
125	0.09
126	0.07
127	0.07
128	0.09
129	0.09
130	0.09
131	0.09
132	0.09
133	0.1
134	0.12
135	0.12
136	0.11
137	0.12
138	0.11
139	0.17
140	0.2
141	0.21
142	0.24
143	0.23
144	0.27
145	0.27
146	0.33
147	0.31
148	0.3
149	0.3
150	0.25
151	0.25
152	0.21
153	0.22
154	0.16
155	0.15
156	0.14
157	0.16
158	0.17
159	0.17
160	0.17
161	0.18
162	0.18
163	0.16
164	0.16
165	0.15
166	0.15
167	0.15
168	0.15
169	0.14
170	0.15
171	0.16
172	0.15
173	0.12
174	0.14
175	0.15
176	0.14
177	0.14
178	0.13
179	0.12
180	0.11
181	0.13
182	0.16
183	0.17
184	0.24
185	0.27
186	0.32
187	0.36
188	0.37
189	0.43
190	0.41
191	0.43
192	0.37
193	0.39
194	0.41
195	0.39
196	0.43
197	0.36
198	0.32
199	0.31
200	0.35
201	0.29
202	0.23
203	0.23
204	0.19
205	0.2
206	0.2
207	0.19
208	0.14
209	0.13
210	0.12
211	0.09
212	0.08
213	0.06
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.06
219	0.14
220	0.16
221	0.17
222	0.18
223	0.22
224	0.25
225	0.26
226	0.27
227	0.21
228	0.2
229	0.19
230	0.19
231	0.16
232	0.16
233	0.17
234	0.15
235	0.13
236	0.13
237	0.12
238	0.14
239	0.16
240	0.16
241	0.15
242	0.21
243	0.25
244	0.27
245	0.3
246	0.3
247	0.31
248	0.32
249	0.33
250	0.28
251	0.24
252	0.22
253	0.18
254	0.16
255	0.11
256	0.08
257	0.05
258	0.04
259	0.04
260	0.03
261	0.03
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.05
266	0.06
267	0.06
268	0.08
269	0.08
270	0.08
271	0.08
272	0.09
273	0.08
274	0.09
275	0.1
276	0.1
277	0.11
278	0.11
279	0.1
280	0.1
281	0.09
282	0.08
283	0.06
284	0.05
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.03
291	0.03
292	0.02
293	0.02
294	0.02
295	0.02
296	0.02
297	0.03
298	0.03
299	0.03
300	0.03
301	0.04
302	0.04
303	0.05
304	0.05
305	0.06
306	0.07
307	0.08
308	0.09
309	0.08
310	0.08
311	0.09
312	0.09
313	0.09
314	0.08
315	0.08
316	0.1
317	0.11
318	0.12
319	0.11
320	0.11
321	0.12
322	0.14
323	0.14
324	0.13
325	0.14
326	0.13
327	0.13
328	0.14
329	0.12
330	0.11
331	0.11
332	0.1
333	0.1
334	0.1
335	0.1
336	0.1
337	0.12
338	0.14
339	0.17
340	0.18
341	0.19
342	0.19
343	0.21
344	0.21
345	0.19
346	0.17
347	0.16
348	0.14
349	0.12
350	0.11
351	0.09
352	0.08
353	0.07
354	0.05
355	0.07
356	0.11
357	0.13
358	0.16
359	0.23
360	0.33
361	0.42
362	0.51
363	0.59
364	0.65
365	0.73
366	0.81
367	0.83
368	0.81
369	0.82
370	0.79
371	0.75
372	0.71
373	0.61
374	0.53
375	0.5
376	0.44
377	0.42
378	0.46
379	0.47
380	0.47
381	0.52
382	0.53
383	0.55
384	0.57
385	0.59
386	0.59
387	0.59
388	0.56
389	0.58
390	0.57
391	0.5
392	0.5
393	0.43
394	0.35
395	0.37
396	0.33
397	0.28
398	0.27
399	0.25
400	0.23
401	0.21
402	0.2
403	0.12
404	0.12
405	0.11
406	0.13
407	0.14
408	0.12
409	0.12
410	0.11
411	0.1
412	0.1
413	0.09
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.1
422	0.1
423	0.13
424	0.14
425	0.13
426	0.15
427	0.15
428	0.14
429	0.12
430	0.12
431	0.11
432	0.13
433	0.14
434	0.13
435	0.14
436	0.15
437	0.13
438	0.13
439	0.12
440	0.11
441	0.1
442	0.11
443	0.1
444	0.12
445	0.11
446	0.11
447	0.1
448	0.08
449	0.07
450	0.06
451	0.06
452	0.07
453	0.07
454	0.08
455	0.08
456	0.09
457	0.1
458	0.13
459	0.14
460	0.12
461	0.13
462	0.14
463	0.17
464	0.18
465	0.18
466	0.16
467	0.18
468	0.18
469	0.17
470	0.17
471	0.15
472	0.14
473	0.17
474	0.17
475	0.17
476	0.17
477	0.18
478	0.2
479	0.23
480	0.25
481	0.21
482	0.25
483	0.29
484	0.28
485	0.27
486	0.24
487	0.21
488	0.19
489	0.19
490	0.18
491	0.12
492	0.12
493	0.12
494	0.13
495	0.13
496	0.18
497	0.21
498	0.2
499	0.2
500	0.2
501	0.2
502	0.21
503	0.27
504	0.27
505	0.33
506	0.39
507	0.44
508	0.46
509	0.5
510	0.5
511	0.45
512	0.43
513	0.39
514	0.35
515	0.35
516	0.34
517	0.33
518	0.36
519	0.35
520	0.33
521	0.28
522	0.24
523	0.18
524	0.17
525	0.19
526	0.16
527	0.15
528	0.16
529	0.16
530	0.19
531	0.19
532	0.18
533	0.13
534	0.12
535	0.11
536	0.1
537	0.08
538	0.06
539	0.06
540	0.06
541	0.06
542	0.06
543	0.06
544	0.09
545	0.09
546	0.1
547	0.1
548	0.1
549	0.11
550	0.14
551	0.19
552	0.18
553	0.28
554	0.29
555	0.29
556	0.28
557	0.29
558	0.27
559	0.22
560	0.25
561	0.17
562	0.19
563	0.18
564	0.18
565	0.18
566	0.19
567	0.22
568	0.17
569	0.2
570	0.21
571	0.25
572	0.25
573	0.25
574	0.26
575	0.3
576	0.32
577	0.33
578	0.33
579	0.36
580	0.39
581	0.44
582	0.47
583	0.5
584	0.54
585	0.59
586	0.64
587	0.67
588	0.75
589	0.79
590	0.82
591	0.79
592	0.79
593	0.78
594	0.74
595	0.66
596	0.61

A0A086TER6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer