Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A086SZM0

Protein Details
Accession A0A086SZM0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-36GSPGYTPRVSPKRPRDPDELKRTLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
539-570VQRGGPQRGGRGGGQQRGGNQQRGRGGPPRAS
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 9.5, nucl 7.5, pero 5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MTSIDALLQEEGSPGYTPRVSPKRPRDPDELKRTLEQQLLSPSPEFSTEWLNRLQQRWDFEADYSSLFRLAPTQTRTVTRFLRQGLEGRVTGYRNVTVPAASATAKNSTSLLRKPANRAEFVRGAAGFFPFAPGGLEGVEATAALEDQIHSGPVGDEQANAGKGKLDRVIQIGTEGGLLEIAPGLDRGIDFSKRKASHDQADANAVKEVLEEEPEDVGDEGQDKERSPTSTPDDEAAVDDEEGDDIDDILPIEFPSLEPHGVLAASSARKAGREWAHMVDIKHDMPNFRELVPDMAREWPFELDTFQKEAVYHLESGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAARHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRQTFDEVGILTGDVQINPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDFERGVVWEEVIIMLPEHVSLILLSATVPNTYEFASWVGRTKQKDIYVISTPKRPVPLEHYLWAGKNIHKIVDSDKKFIEKGWKDAHHAIQGKDKELQAQSAVATRGGNPRGNQRGGVQRGGPQRGGRGGGQQRGGNQQRGRGGPPRASHTPGHMGRAGRPGGFTSAAQDKTLWVHLVQFLRKQNLLPACIFVFSKKRCEENADALSNQDFCTASEKSHIHMIIERSVARLKPEDRQLPQIIRLRELLSRGIAVHHGGLLPIVKEMVEILFAQTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGFRKHDGHSFRNLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGSVIIVPPGGDDAPPVAELRHMILGEPSKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSEHATQQLLPEHEKDVKLAQADLAKVKRDSCKICDQHMDECHQAAQDFKQATFELYKGILKIPIGRRMFAQHRLVVFNWEGIRTPGILLADGMSLRGSPEDPSVHVCAIKPLRERRDATDLLPFIPSFRKYLHKLPQGKKRIQIKTLHVPLSDIECLTKWVTKDILPHVFQSGEARINADRQLQELCAAWDDRWDEMDFGKVKSLQLQELMEKRVSLAKTVKESPVTKCPAFLKHFAMCHDQWLIEQHISQLKQSLSDQNLQLLPDYEQRVQVLKELGFIDDATRIQLKGKVACEIHSGDELVLTELILDNVLADFEPPEIAALLSAFVFQEKTTVEPVLTGNLERGKQTIIALSEKVNDVQTRLQVIQSADDSNDFVSRPRFGLMEVVYEWARGMSFKNITGLTDVLEGTIVRTITRLDETCREVKNAARIVGDPELYQKMQTAQEMIKRDITAVASLYM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.13
3 0.15
4 0.16
5 0.26
6 0.35
7 0.42
8 0.52
9 0.62
10 0.69
11 0.77
12 0.82
13 0.82
14 0.83
15 0.86
16 0.86
17 0.82
18 0.75
19 0.7
20 0.66
21 0.62
22 0.56
23 0.46
24 0.4
25 0.41
26 0.4
27 0.38
28 0.36
29 0.31
30 0.27
31 0.28
32 0.24
33 0.18
34 0.25
35 0.24
36 0.27
37 0.3
38 0.36
39 0.39
40 0.42
41 0.48
42 0.43
43 0.46
44 0.48
45 0.48
46 0.43
47 0.39
48 0.39
49 0.33
50 0.3
51 0.26
52 0.22
53 0.18
54 0.16
55 0.15
56 0.16
57 0.18
58 0.23
59 0.26
60 0.31
61 0.34
62 0.4
63 0.42
64 0.45
65 0.47
66 0.46
67 0.48
68 0.46
69 0.47
70 0.44
71 0.47
72 0.46
73 0.44
74 0.39
75 0.35
76 0.36
77 0.32
78 0.32
79 0.29
80 0.25
81 0.22
82 0.23
83 0.21
84 0.17
85 0.17
86 0.16
87 0.15
88 0.14
89 0.14
90 0.15
91 0.18
92 0.19
93 0.18
94 0.18
95 0.21
96 0.26
97 0.29
98 0.35
99 0.39
100 0.44
101 0.51
102 0.59
103 0.6
104 0.6
105 0.59
106 0.59
107 0.54
108 0.51
109 0.47
110 0.37
111 0.32
112 0.28
113 0.25
114 0.18
115 0.14
116 0.15
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.05
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.11
142 0.1
143 0.1
144 0.11
145 0.15
146 0.16
147 0.16
148 0.15
149 0.16
150 0.17
151 0.2
152 0.22
153 0.21
154 0.21
155 0.24
156 0.26
157 0.22
158 0.22
159 0.19
160 0.15
161 0.13
162 0.11
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.05
174 0.08
175 0.12
176 0.18
177 0.2
178 0.24
179 0.33
180 0.35
181 0.39
182 0.45
183 0.49
184 0.5
185 0.57
186 0.58
187 0.5
188 0.57
189 0.53
190 0.46
191 0.39
192 0.31
193 0.22
194 0.17
195 0.17
196 0.09
197 0.1
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.08
205 0.07
206 0.08
207 0.09
208 0.12
209 0.14
210 0.14
211 0.17
212 0.2
213 0.22
214 0.24
215 0.29
216 0.32
217 0.35
218 0.35
219 0.33
220 0.31
221 0.29
222 0.27
223 0.23
224 0.17
225 0.12
226 0.11
227 0.09
228 0.08
229 0.08
230 0.07
231 0.05
232 0.04
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.09
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.08
251 0.1
252 0.1
253 0.11
254 0.13
255 0.13
256 0.14
257 0.15
258 0.22
259 0.23
260 0.27
261 0.31
262 0.32
263 0.36
264 0.39
265 0.38
266 0.33
267 0.31
268 0.28
269 0.27
270 0.26
271 0.23
272 0.21
273 0.26
274 0.24
275 0.21
276 0.21
277 0.19
278 0.23
279 0.23
280 0.22
281 0.19
282 0.23
283 0.24
284 0.23
285 0.23
286 0.19
287 0.18
288 0.17
289 0.18
290 0.15
291 0.17
292 0.19
293 0.18
294 0.18
295 0.17
296 0.18
297 0.19
298 0.18
299 0.15
300 0.13
301 0.13
302 0.12
303 0.13
304 0.12
305 0.08
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.05
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.1
335 0.11
336 0.15
337 0.16
338 0.18
339 0.21
340 0.24
341 0.24
342 0.27
343 0.36
344 0.38
345 0.47
346 0.47
347 0.52
348 0.54
349 0.55
350 0.61
351 0.53
352 0.46
353 0.43
354 0.44
355 0.37
356 0.33
357 0.32
358 0.2
359 0.2
360 0.17
361 0.1
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.06
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.06
372 0.05
373 0.06
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.09
385 0.11
386 0.1
387 0.09
388 0.1
389 0.11
390 0.11
391 0.11
392 0.11
393 0.09
394 0.09
395 0.1
396 0.08
397 0.07
398 0.08
399 0.09
400 0.07
401 0.06
402 0.09
403 0.08
404 0.09
405 0.09
406 0.09
407 0.08
408 0.1
409 0.1
410 0.07
411 0.08
412 0.09
413 0.12
414 0.11
415 0.11
416 0.09
417 0.09
418 0.09
419 0.08
420 0.07
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.04
430 0.03
431 0.03
432 0.04
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.06
437 0.06
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.09
443 0.1
444 0.1
445 0.14
446 0.17
447 0.21
448 0.23
449 0.27
450 0.3
451 0.32
452 0.35
453 0.33
454 0.34
455 0.36
456 0.4
457 0.39
458 0.39
459 0.37
460 0.35
461 0.37
462 0.33
463 0.29
464 0.3
465 0.35
466 0.33
467 0.33
468 0.34
469 0.32
470 0.32
471 0.32
472 0.27
473 0.21
474 0.23
475 0.22
476 0.2
477 0.19
478 0.2
479 0.24
480 0.31
481 0.31
482 0.29
483 0.3
484 0.31
485 0.3
486 0.31
487 0.35
488 0.27
489 0.31
490 0.36
491 0.37
492 0.4
493 0.44
494 0.45
495 0.42
496 0.43
497 0.38
498 0.37
499 0.36
500 0.34
501 0.32
502 0.3
503 0.27
504 0.24
505 0.23
506 0.16
507 0.16
508 0.14
509 0.14
510 0.14
511 0.11
512 0.1
513 0.11
514 0.16
515 0.18
516 0.21
517 0.19
518 0.26
519 0.31
520 0.32
521 0.31
522 0.29
523 0.35
524 0.35
525 0.36
526 0.29
527 0.29
528 0.34
529 0.35
530 0.34
531 0.26
532 0.25
533 0.24
534 0.25
535 0.2
536 0.23
537 0.25
538 0.26
539 0.28
540 0.27
541 0.28
542 0.35
543 0.37
544 0.35
545 0.32
546 0.32
547 0.34
548 0.35
549 0.36
550 0.34
551 0.34
552 0.32
553 0.34
554 0.36
555 0.34
556 0.37
557 0.34
558 0.31
559 0.36
560 0.32
561 0.33
562 0.29
563 0.27
564 0.26
565 0.31
566 0.28
567 0.2
568 0.19
569 0.17
570 0.16
571 0.16
572 0.13
573 0.11
574 0.15
575 0.15
576 0.15
577 0.15
578 0.14
579 0.14
580 0.15
581 0.12
582 0.07
583 0.08
584 0.12
585 0.15
586 0.16
587 0.19
588 0.21
589 0.23
590 0.24
591 0.23
592 0.24
593 0.24
594 0.24
595 0.2
596 0.18
597 0.16
598 0.16
599 0.16
600 0.13
601 0.18
602 0.17
603 0.24
604 0.24
605 0.26
606 0.27
607 0.33
608 0.34
609 0.34
610 0.38
611 0.33
612 0.31
613 0.29
614 0.28
615 0.23
616 0.19
617 0.13
618 0.08
619 0.06
620 0.11
621 0.11
622 0.1
623 0.15
624 0.15
625 0.15
626 0.18
627 0.18
628 0.14
629 0.17
630 0.18
631 0.16
632 0.17
633 0.16
634 0.14
635 0.16
636 0.15
637 0.14
638 0.16
639 0.15
640 0.19
641 0.25
642 0.29
643 0.3
644 0.35
645 0.37
646 0.35
647 0.4
648 0.4
649 0.34
650 0.3
651 0.3
652 0.25
653 0.24
654 0.23
655 0.18
656 0.13
657 0.12
658 0.11
659 0.1
660 0.09
661 0.08
662 0.07
663 0.06
664 0.06
665 0.05
666 0.05
667 0.05
668 0.05
669 0.04
670 0.04
671 0.04
672 0.04
673 0.04
674 0.04
675 0.04
676 0.04
677 0.04
678 0.05
679 0.05
680 0.05
681 0.05
682 0.05
683 0.04
684 0.05
685 0.04
686 0.04
687 0.04
688 0.04
689 0.06
690 0.05
691 0.06
692 0.06
693 0.06
694 0.06
695 0.06
696 0.07
697 0.07
698 0.07
699 0.06
700 0.06
701 0.07
702 0.07
703 0.07
704 0.08
705 0.09
706 0.12
707 0.18
708 0.19
709 0.22
710 0.23
711 0.24
712 0.29
713 0.32
714 0.33
715 0.34
716 0.36
717 0.33
718 0.38
719 0.37
720 0.31
721 0.26
722 0.23
723 0.19
724 0.15
725 0.15
726 0.09
727 0.1
728 0.1
729 0.1
730 0.1
731 0.11
732 0.11
733 0.11
734 0.12
735 0.12
736 0.12
737 0.12
738 0.11
739 0.09
740 0.09
741 0.08
742 0.07
743 0.06
744 0.06
745 0.04
746 0.04
747 0.03
748 0.04
749 0.04
750 0.04
751 0.04
752 0.04
753 0.05
754 0.05
755 0.06
756 0.05
757 0.05
758 0.06
759 0.07
760 0.08
761 0.08
762 0.07
763 0.1
764 0.11
765 0.13
766 0.14
767 0.14
768 0.15
769 0.18
770 0.19
771 0.2
772 0.24
773 0.29
774 0.31
775 0.37
776 0.35
777 0.38
778 0.38
779 0.36
780 0.32
781 0.25
782 0.22
783 0.15
784 0.13
785 0.09
786 0.07
787 0.06
788 0.05
789 0.06
790 0.06
791 0.07
792 0.09
793 0.11
794 0.13
795 0.14
796 0.14
797 0.14
798 0.15
799 0.17
800 0.17
801 0.19
802 0.19
803 0.23
804 0.25
805 0.25
806 0.24
807 0.26
808 0.25
809 0.23
810 0.22
811 0.2
812 0.19
813 0.19
814 0.19
815 0.17
816 0.17
817 0.16
818 0.15
819 0.14
820 0.14
821 0.15
822 0.19
823 0.19
824 0.2
825 0.2
826 0.23
827 0.26
828 0.3
829 0.33
830 0.33
831 0.42
832 0.43
833 0.46
834 0.5
835 0.47
836 0.48
837 0.47
838 0.46
839 0.36
840 0.34
841 0.3
842 0.24
843 0.21
844 0.16
845 0.14
846 0.15
847 0.15
848 0.15
849 0.16
850 0.16
851 0.18
852 0.18
853 0.16
854 0.12
855 0.13
856 0.14
857 0.12
858 0.13
859 0.13
860 0.12
861 0.19
862 0.22
863 0.29
864 0.29
865 0.29
866 0.3
867 0.35
868 0.4
869 0.39
870 0.39
871 0.34
872 0.35
873 0.37
874 0.36
875 0.33
876 0.29
877 0.25
878 0.21
879 0.18
880 0.16
881 0.15
882 0.15
883 0.12
884 0.11
885 0.1
886 0.09
887 0.09
888 0.08
889 0.08
890 0.08
891 0.07
892 0.07
893 0.05
894 0.05
895 0.05
896 0.06
897 0.06
898 0.06
899 0.09
900 0.1
901 0.11
902 0.15
903 0.17
904 0.17
905 0.17
906 0.16
907 0.21
908 0.23
909 0.28
910 0.31
911 0.38
912 0.43
913 0.5
914 0.52
915 0.5
916 0.55
917 0.52
918 0.46
919 0.45
920 0.39
921 0.33
922 0.32
923 0.26
924 0.19
925 0.22
926 0.22
927 0.16
928 0.18
929 0.24
930 0.27
931 0.37
932 0.45
933 0.5
934 0.59
935 0.66
936 0.73
937 0.76
938 0.76
939 0.76
940 0.76
941 0.74
942 0.7
943 0.69
944 0.66
945 0.68
946 0.7
947 0.64
948 0.54
949 0.48
950 0.42
951 0.39
952 0.32
953 0.22
954 0.15
955 0.13
956 0.15
957 0.15
958 0.17
959 0.13
960 0.15
961 0.17
962 0.18
963 0.23
964 0.28
965 0.33
966 0.32
967 0.33
968 0.32
969 0.3
970 0.28
971 0.26
972 0.22
973 0.18
974 0.17
975 0.18
976 0.17
977 0.19
978 0.21
979 0.22
980 0.19
981 0.18
982 0.2
983 0.18
984 0.18
985 0.17
986 0.16
987 0.13
988 0.14
989 0.12
990 0.14
991 0.15
992 0.15
993 0.16
994 0.16
995 0.14
996 0.14
997 0.2
998 0.18
999 0.18
1000 0.21
1001 0.2
1002 0.19
1003 0.25
1004 0.27
1005 0.22
1006 0.23
1007 0.25
1008 0.27
1009 0.3
1010 0.33
1011 0.27
1012 0.25
1013 0.24
1014 0.27
1015 0.25
1016 0.24
1017 0.25
1018 0.27
1019 0.32
1020 0.36
1021 0.39
1022 0.4
1023 0.42
1024 0.43
1025 0.47
1026 0.48
1027 0.42
1028 0.43
1029 0.43
1030 0.45
1031 0.47
1032 0.46
1033 0.43
1034 0.41
1035 0.44
1036 0.42
1037 0.46
1038 0.38
1039 0.36
1040 0.33
1041 0.27
1042 0.23
1043 0.25
1044 0.25
1045 0.19
1046 0.19
1047 0.19
1048 0.24
1049 0.24
1050 0.24
1051 0.25
1052 0.22
1053 0.23
1054 0.26
1055 0.29
1056 0.27
1057 0.32
1058 0.32
1059 0.31
1060 0.33
1061 0.3
1062 0.29
1063 0.23
1064 0.22
1065 0.22
1066 0.26
1067 0.23
1068 0.23
1069 0.24
1070 0.26
1071 0.25
1072 0.26
1073 0.24
1074 0.2
1075 0.23
1076 0.21
1077 0.21
1078 0.19
1079 0.18
1080 0.15
1081 0.13
1082 0.13
1083 0.13
1084 0.13
1085 0.13
1086 0.15
1087 0.18
1088 0.21
1089 0.24
1090 0.26
1091 0.3
1092 0.3
1093 0.31
1094 0.33
1095 0.31
1096 0.29
1097 0.25
1098 0.24
1099 0.17
1100 0.17
1101 0.16
1102 0.13
1103 0.11
1104 0.08
1105 0.07
1106 0.07
1107 0.07
1108 0.06
1109 0.05
1110 0.04
1111 0.04
1112 0.05
1113 0.04
1114 0.04
1115 0.05
1116 0.05
1117 0.06
1118 0.05
1119 0.06
1120 0.06
1121 0.06
1122 0.06
1123 0.06
1124 0.06
1125 0.06
1126 0.06
1127 0.05
1128 0.06
1129 0.06
1130 0.06
1131 0.08
1132 0.09
1133 0.11
1134 0.13
1135 0.14
1136 0.13
1137 0.14
1138 0.15
1139 0.17
1140 0.17
1141 0.15
1142 0.17
1143 0.21
1144 0.22
1145 0.21
1146 0.21
1147 0.19
1148 0.19
1149 0.2
1150 0.2
1151 0.19
1152 0.21
1153 0.21
1154 0.22
1155 0.23
1156 0.23
1157 0.23
1158 0.23
1159 0.21
1160 0.2
1161 0.23
1162 0.25
1163 0.27
1164 0.26
1165 0.26
1166 0.26
1167 0.26
1168 0.27
1169 0.25
1170 0.23
1171 0.19
1172 0.19
1173 0.19
1174 0.16
1175 0.17
1176 0.14
1177 0.14
1178 0.16
1179 0.18
1180 0.18
1181 0.19
1182 0.18
1183 0.17
1184 0.23
1185 0.22
1186 0.23
1187 0.21
1188 0.23
1189 0.21
1190 0.21
1191 0.2
1192 0.14
1193 0.13
1194 0.1
1195 0.12
1196 0.16
1197 0.18
1198 0.2
1199 0.24
1200 0.24
1201 0.25
1202 0.26
1203 0.24
1204 0.18
1205 0.17
1206 0.16
1207 0.12
1208 0.12
1209 0.11
1210 0.09
1211 0.12
1212 0.11
1213 0.09
1214 0.1
1215 0.11
1216 0.13
1217 0.19
1218 0.2
1219 0.22
1220 0.28
1221 0.34
1222 0.4
1223 0.42
1224 0.42
1225 0.39
1226 0.41
1227 0.45
1228 0.45
1229 0.42
1230 0.37
1231 0.36
1232 0.38
1233 0.4
1234 0.36
1235 0.27
1236 0.26
1237 0.28
1238 0.27
1239 0.26
1240 0.23
1241 0.23
1242 0.25
1243 0.26
1244 0.26
1245 0.26
1246 0.32
1247 0.37
1248 0.38
1249 0.38
1250 0.36
1251 0.35
1252 0.33
1253 0.3
1254 0.25