Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A086TBM4

Protein Details
Accession A0A086TBM4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-44TPPRNGSRMPQQQQHHHQQPPHydrophilic
99-121LIEKKKMEYERIREQRRRFELEMHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR033133  PUM-HD  
IPR033712  Pumilio_RNA-bd  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00806  PUF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
PS50303  PUM_HD  
CDD cd07920  Pumilio  
Amino Acid Sequences MDDLRFRPQRSPPDASQATMSLVTPPRNGSRMPQQQQHHHQQPPASMSDSRSNLPRRFTTDSGRVPTLSSVGLISPPLRGPEPTQEFGNAQHSYHKVQLIEKKKMEYERIREQRRRFELEMQKLDQEYRREARELAQLEEEARLGGHQSEPTTPPEHHSSSGGFPSIFSRPSRYSMSSLASPPGFYNRPARSGSTLISPPSGMIQGQGRHAWDDVLPSRSTPVTRRNSDDEEKDEAFRHELASHRSSHGHRYSMPVARSRNGGYETNLDGANVTRFLFDDEDSTAPHHNPNDERFPTLVRGGDQMLSASSAALDLALSSSPIPEAPATSSWSSNINRHRTQQSLSAINGPSSSIHNDAGTLGHRPASLRHSLDLKYITENVSDAPGTSTPGQGNHIMTSPPIPQSSFSSNDVPTVKNTSGAGMANTGNANNHAQQHFHNHNASMGRIPAGAMPNRGHSRELSNDNSANPGRDQANAFQSLQSALQPSAAPFGPSTSASAPMSPPQIPAPSNPTAMNNFGGYYPPNTFVPSNGANANAAAPGNYGMNMLTSGMQQMSVNGVVNGNNMYPGQNFAGYGPQVPYNQAPPPRDSQARVIQHRRQMDNEAMSRYQNVSLDSFRGQVYDLCKDQHGCRYLQKKLEERNDEQVHMIWLETNQHVVELMTDPFGNYLCQKLLEFCNDDDRTVLIQNASQDMVRIALNTHGTRALQKMIEYVNTPQQVHLITEALRGRVVDLIQDLNGNHVIQKCLNKLSSAEAQFIFDAVGGNCVDVGTHRHGCCVLQRCIDHASGDQKLWLIQCITEQSRILVQDPFGNYVVQYIIDLNEPTFTEPIVRMFQGCISQLSRHKFSSNVIEKCLRCAQPPSKDMIVDEMLAPQEIERLIRDSYANYVVQTALEYATPQQKHRLIESIRPILPTIRNTPYGRRIQAKVSSYDSRGSVTSSGQVTPADNTQGQIPLRTSGHSRGMSGGGPMVGGNPLTNGGGLNNQGMMDQNRNHFQHAGAMSVPPGPAPGNGAQQQPQYNPGPQNNNFNNGPHPSAAANPPPQNNGAPWM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.58
3 0.52
4 0.43
5 0.37
6 0.3
7 0.27
8 0.23
9 0.26
10 0.27
11 0.27
12 0.3
13 0.32
14 0.34
15 0.35
16 0.35
17 0.41
18 0.49
19 0.54
20 0.58
21 0.61
22 0.69
23 0.77
24 0.82
25 0.8
26 0.75
27 0.72
28 0.68
29 0.66
30 0.6
31 0.54
32 0.47
33 0.4
34 0.39
35 0.43
36 0.41
37 0.38
38 0.41
39 0.47
40 0.47
41 0.51
42 0.51
43 0.5
44 0.55
45 0.56
46 0.57
47 0.58
48 0.61
49 0.61
50 0.58
51 0.51
52 0.45
53 0.42
54 0.35
55 0.26
56 0.19
57 0.13
58 0.12
59 0.12
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.13
64 0.16
65 0.16
66 0.18
67 0.21
68 0.3
69 0.36
70 0.36
71 0.37
72 0.36
73 0.36
74 0.37
75 0.4
76 0.31
77 0.24
78 0.29
79 0.3
80 0.31
81 0.35
82 0.35
83 0.3
84 0.36
85 0.45
86 0.47
87 0.54
88 0.54
89 0.54
90 0.56
91 0.6
92 0.63
93 0.63
94 0.61
95 0.63
96 0.7
97 0.76
98 0.78
99 0.81
100 0.82
101 0.8
102 0.8
103 0.73
104 0.73
105 0.73
106 0.74
107 0.74
108 0.66
109 0.62
110 0.55
111 0.55
112 0.5
113 0.44
114 0.41
115 0.39
116 0.4
117 0.38
118 0.38
119 0.38
120 0.41
121 0.39
122 0.34
123 0.31
124 0.28
125 0.27
126 0.27
127 0.23
128 0.14
129 0.12
130 0.09
131 0.08
132 0.09
133 0.1
134 0.11
135 0.12
136 0.16
137 0.18
138 0.22
139 0.24
140 0.24
141 0.26
142 0.31
143 0.32
144 0.3
145 0.3
146 0.29
147 0.29
148 0.31
149 0.28
150 0.22
151 0.19
152 0.21
153 0.22
154 0.22
155 0.2
156 0.24
157 0.25
158 0.29
159 0.34
160 0.34
161 0.35
162 0.36
163 0.38
164 0.36
165 0.34
166 0.34
167 0.29
168 0.27
169 0.24
170 0.27
171 0.24
172 0.23
173 0.31
174 0.29
175 0.33
176 0.35
177 0.37
178 0.35
179 0.36
180 0.35
181 0.31
182 0.31
183 0.27
184 0.26
185 0.23
186 0.19
187 0.18
188 0.17
189 0.11
190 0.11
191 0.15
192 0.16
193 0.19
194 0.21
195 0.2
196 0.2
197 0.21
198 0.2
199 0.15
200 0.19
201 0.19
202 0.21
203 0.2
204 0.19
205 0.21
206 0.22
207 0.24
208 0.23
209 0.3
210 0.35
211 0.4
212 0.45
213 0.49
214 0.55
215 0.58
216 0.58
217 0.52
218 0.5
219 0.47
220 0.43
221 0.38
222 0.32
223 0.29
224 0.24
225 0.21
226 0.17
227 0.2
228 0.24
229 0.25
230 0.26
231 0.26
232 0.3
233 0.31
234 0.38
235 0.38
236 0.35
237 0.34
238 0.38
239 0.42
240 0.44
241 0.44
242 0.42
243 0.41
244 0.39
245 0.41
246 0.36
247 0.34
248 0.31
249 0.3
250 0.26
251 0.27
252 0.27
253 0.25
254 0.24
255 0.19
256 0.16
257 0.15
258 0.14
259 0.11
260 0.09
261 0.08
262 0.08
263 0.1
264 0.11
265 0.1
266 0.11
267 0.12
268 0.12
269 0.13
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.17
274 0.17
275 0.19
276 0.22
277 0.26
278 0.33
279 0.33
280 0.34
281 0.32
282 0.32
283 0.31
284 0.29
285 0.25
286 0.17
287 0.18
288 0.17
289 0.17
290 0.15
291 0.12
292 0.1
293 0.1
294 0.09
295 0.07
296 0.05
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.06
310 0.05
311 0.06
312 0.08
313 0.1
314 0.13
315 0.14
316 0.15
317 0.15
318 0.2
319 0.21
320 0.25
321 0.32
322 0.36
323 0.38
324 0.44
325 0.47
326 0.44
327 0.45
328 0.45
329 0.42
330 0.38
331 0.35
332 0.35
333 0.31
334 0.29
335 0.26
336 0.2
337 0.16
338 0.14
339 0.15
340 0.12
341 0.12
342 0.12
343 0.12
344 0.12
345 0.12
346 0.11
347 0.11
348 0.09
349 0.1
350 0.1
351 0.1
352 0.13
353 0.16
354 0.2
355 0.19
356 0.21
357 0.23
358 0.24
359 0.26
360 0.26
361 0.23
362 0.2
363 0.2
364 0.19
365 0.15
366 0.15
367 0.12
368 0.11
369 0.1
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.1
374 0.1
375 0.12
376 0.11
377 0.12
378 0.14
379 0.14
380 0.15
381 0.14
382 0.14
383 0.12
384 0.12
385 0.13
386 0.13
387 0.13
388 0.12
389 0.12
390 0.12
391 0.16
392 0.2
393 0.21
394 0.22
395 0.24
396 0.23
397 0.26
398 0.27
399 0.23
400 0.21
401 0.22
402 0.19
403 0.18
404 0.18
405 0.15
406 0.15
407 0.14
408 0.13
409 0.1
410 0.1
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.07
415 0.09
416 0.1
417 0.1
418 0.13
419 0.13
420 0.14
421 0.15
422 0.23
423 0.24
424 0.26
425 0.26
426 0.22
427 0.25
428 0.24
429 0.24
430 0.17
431 0.14
432 0.11
433 0.1
434 0.1
435 0.09
436 0.11
437 0.12
438 0.13
439 0.14
440 0.19
441 0.21
442 0.22
443 0.2
444 0.18
445 0.21
446 0.24
447 0.28
448 0.26
449 0.27
450 0.27
451 0.26
452 0.29
453 0.26
454 0.22
455 0.17
456 0.17
457 0.14
458 0.15
459 0.16
460 0.15
461 0.18
462 0.18
463 0.19
464 0.16
465 0.16
466 0.15
467 0.13
468 0.11
469 0.09
470 0.07
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.07
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.1
482 0.09
483 0.11
484 0.11
485 0.11
486 0.11
487 0.12
488 0.14
489 0.12
490 0.13
491 0.12
492 0.14
493 0.14
494 0.14
495 0.18
496 0.18
497 0.19
498 0.19
499 0.19
500 0.18
501 0.19
502 0.19
503 0.13
504 0.11
505 0.1
506 0.1
507 0.09
508 0.09
509 0.09
510 0.1
511 0.1
512 0.11
513 0.11
514 0.11
515 0.15
516 0.14
517 0.14
518 0.13
519 0.13
520 0.12
521 0.12
522 0.11
523 0.08
524 0.06
525 0.05
526 0.04
527 0.05
528 0.05
529 0.05
530 0.04
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.04
535 0.04
536 0.04
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.05
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.06
548 0.06
549 0.07
550 0.06
551 0.06
552 0.06
553 0.06
554 0.06
555 0.07
556 0.07
557 0.07
558 0.07
559 0.07
560 0.1
561 0.09
562 0.1
563 0.09
564 0.11
565 0.11
566 0.12
567 0.12
568 0.13
569 0.16
570 0.2
571 0.21
572 0.22
573 0.25
574 0.28
575 0.3
576 0.29
577 0.31
578 0.35
579 0.4
580 0.45
581 0.49
582 0.5
583 0.53
584 0.57
585 0.53
586 0.46
587 0.43
588 0.4
589 0.37
590 0.34
591 0.31
592 0.26
593 0.25
594 0.24
595 0.21
596 0.19
597 0.15
598 0.13
599 0.12
600 0.12
601 0.14
602 0.14
603 0.14
604 0.12
605 0.12
606 0.11
607 0.12
608 0.14
609 0.16
610 0.16
611 0.15
612 0.17
613 0.18
614 0.2
615 0.24
616 0.24
617 0.22
618 0.28
619 0.34
620 0.38
621 0.43
622 0.46
623 0.47
624 0.53
625 0.6
626 0.59
627 0.56
628 0.61
629 0.56
630 0.51
631 0.45
632 0.37
633 0.29
634 0.22
635 0.19
636 0.09
637 0.08
638 0.1
639 0.09
640 0.09
641 0.08
642 0.08
643 0.08
644 0.08
645 0.08
646 0.07
647 0.07
648 0.07
649 0.07
650 0.07
651 0.07
652 0.08
653 0.07
654 0.06
655 0.08
656 0.07
657 0.08
658 0.09
659 0.11
660 0.13
661 0.16
662 0.18
663 0.17
664 0.26
665 0.26
666 0.26
667 0.23
668 0.22
669 0.2
670 0.18
671 0.18
672 0.09
673 0.1
674 0.11
675 0.11
676 0.11
677 0.09
678 0.09
679 0.08
680 0.09
681 0.08
682 0.07
683 0.06
684 0.09
685 0.13
686 0.12
687 0.13
688 0.13
689 0.14
690 0.15
691 0.17
692 0.17
693 0.14
694 0.14
695 0.16
696 0.15
697 0.16
698 0.16
699 0.17
700 0.2
701 0.23
702 0.23
703 0.2
704 0.21
705 0.2
706 0.19
707 0.18
708 0.13
709 0.1
710 0.15
711 0.16
712 0.15
713 0.14
714 0.14
715 0.13
716 0.14
717 0.13
718 0.09
719 0.09
720 0.1
721 0.09
722 0.11
723 0.1
724 0.1
725 0.12
726 0.11
727 0.12
728 0.12
729 0.14
730 0.16
731 0.2
732 0.21
733 0.24
734 0.24
735 0.23
736 0.22
737 0.25
738 0.29
739 0.27
740 0.27
741 0.23
742 0.24
743 0.23
744 0.22
745 0.17
746 0.1
747 0.1
748 0.07
749 0.09
750 0.07
751 0.07
752 0.07
753 0.07
754 0.06
755 0.06
756 0.1
757 0.14
758 0.2
759 0.2
760 0.21
761 0.22
762 0.23
763 0.3
764 0.33
765 0.32
766 0.31
767 0.32
768 0.34
769 0.36
770 0.36
771 0.3
772 0.25
773 0.26
774 0.22
775 0.22
776 0.2
777 0.17
778 0.19
779 0.18
780 0.17
781 0.12
782 0.1
783 0.12
784 0.17
785 0.19
786 0.2
787 0.2
788 0.19
789 0.21
790 0.22
791 0.21
792 0.17
793 0.16
794 0.18
795 0.19
796 0.21
797 0.19
798 0.18
799 0.16
800 0.16
801 0.15
802 0.1
803 0.09
804 0.07
805 0.07
806 0.08
807 0.09
808 0.08
809 0.09
810 0.1
811 0.11
812 0.1
813 0.1
814 0.1
815 0.11
816 0.14
817 0.15
818 0.15
819 0.14
820 0.14
821 0.16
822 0.17
823 0.17
824 0.17
825 0.17
826 0.22
827 0.28
828 0.34
829 0.36
830 0.35
831 0.36
832 0.34
833 0.35
834 0.41
835 0.44
836 0.4
837 0.41
838 0.46
839 0.45
840 0.49
841 0.54
842 0.44
843 0.38
844 0.44
845 0.48
846 0.5
847 0.52
848 0.53
849 0.47
850 0.46
851 0.44
852 0.39
853 0.32
854 0.24
855 0.21
856 0.17
857 0.15
858 0.14
859 0.13
860 0.09
861 0.09
862 0.09
863 0.09
864 0.09
865 0.11
866 0.12
867 0.13
868 0.14
869 0.13
870 0.17
871 0.2
872 0.19
873 0.17
874 0.17
875 0.16
876 0.15
877 0.15
878 0.12
879 0.08
880 0.08
881 0.08
882 0.11
883 0.19
884 0.21
885 0.22
886 0.3
887 0.34
888 0.36
889 0.39
890 0.44
891 0.4
892 0.46
893 0.53
894 0.52
895 0.49
896 0.48
897 0.46
898 0.42
899 0.43
900 0.4
901 0.37
902 0.35
903 0.4
904 0.42
905 0.48
906 0.52
907 0.56
908 0.57
909 0.57
910 0.55
911 0.55
912 0.61
913 0.57
914 0.53
915 0.51
916 0.5
917 0.46
918 0.46
919 0.39
920 0.33
921 0.3
922 0.28
923 0.22
924 0.19
925 0.21
926 0.2
927 0.19
928 0.18
929 0.19
930 0.18
931 0.18
932 0.19
933 0.19
934 0.17
935 0.18
936 0.19
937 0.23
938 0.22
939 0.23
940 0.23
941 0.23
942 0.24
943 0.25
944 0.27
945 0.28
946 0.35
947 0.34
948 0.33
949 0.31
950 0.32
951 0.3
952 0.27
953 0.22
954 0.14
955 0.13
956 0.12
957 0.1
958 0.09
959 0.08
960 0.07
961 0.07
962 0.08
963 0.08
964 0.08
965 0.08
966 0.08
967 0.1
968 0.12
969 0.12
970 0.11
971 0.11
972 0.11
973 0.14
974 0.17
975 0.2
976 0.24
977 0.28
978 0.36
979 0.37
980 0.4
981 0.38
982 0.35
983 0.37
984 0.33
985 0.3
986 0.23
987 0.22
988 0.21
989 0.21
990 0.21
991 0.12
992 0.13
993 0.11
994 0.11
995 0.15
996 0.17
997 0.23
998 0.26
999 0.3
1000 0.33
1001 0.37
1002 0.41
1003 0.38
1004 0.41
1005 0.38
1006 0.42
1007 0.45
1008 0.49
1009 0.54
1010 0.53
1011 0.62
1012 0.6
1013 0.62
1014 0.57
1015 0.52
1016 0.5
1017 0.45
1018 0.44
1019 0.34
1020 0.32
1021 0.27
1022 0.3
1023 0.34
1024 0.35
1025 0.39
1026 0.41
1027 0.44
1028 0.45
1029 0.47
1030 0.45