Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A086SWD4

Protein Details
Accession A0A086SWD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-62ARDATKNVSKPRPRGRPPTKLNNNKIAKPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-69SKPRPRGRPPTKLNNNKIAKPSQRGGRR
109-143PKPKRGRPKASAGSAVRGARNGDTQPKPGRGRPRK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR040349  Csm1/Pcs1  
IPR020981  Csm1/Pcs1_C  
IPR038608  Csm1/Pcs1_C_sf  
Gene Ontology GO:0033551  C:monopolin complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF12539  Csm1  
Amino Acid Sequences MPPRTKALVGLTSLIESDSEPDLDNIDSRQLQMARDATKNVSKPRPRGRPPTKLNNNKIAKPSQRGGRRSAVPLQERSANASWDAQVDPKMSKAIAVDADPLDDDTMPPKPKRGRPKASAGSAVRGARNGDTQPKPGRGRPRKTQVTHNEEIPETQHPEPMEVDEHEEEVEQEDDATEPMVGSDGDLGDAHIDIDTDETTLRRRLGELTKRYESLENRHKDLREVGVKEAERNYDRLKKQSEENTAAANKLISELRAQLSTQASLANRLERSEAKCDSLQSEVTELNTSLSAARAELKTLSTKLAAARNAEANIKVPGSALKTNAAGNRGPPAEVVQAAQAKEDLYGDLTGLIVRGMKHEDKEDVFDCIQTGRNGTLHFKLALDTADAGENYEAVEYTYRPQLDPNRDEELQMVLPDYLLGEITFPRTQASKFFKKVSKYLTEVLD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.16
3 0.11
4 0.12
5 0.11
6 0.11
7 0.12
8 0.12
9 0.13
10 0.14
11 0.15
12 0.13
13 0.16
14 0.16
15 0.16
16 0.22
17 0.22
18 0.22
19 0.27
20 0.31
21 0.31
22 0.33
23 0.35
24 0.33
25 0.39
26 0.44
27 0.47
28 0.52
29 0.56
30 0.63
31 0.71
32 0.77
33 0.79
34 0.85
35 0.86
36 0.86
37 0.87
38 0.89
39 0.89
40 0.89
41 0.88
42 0.87
43 0.84
44 0.79
45 0.76
46 0.74
47 0.7
48 0.66
49 0.65
50 0.64
51 0.67
52 0.65
53 0.64
54 0.63
55 0.6
56 0.58
57 0.59
58 0.59
59 0.56
60 0.55
61 0.52
62 0.49
63 0.45
64 0.46
65 0.4
66 0.33
67 0.28
68 0.26
69 0.24
70 0.2
71 0.21
72 0.16
73 0.16
74 0.17
75 0.16
76 0.16
77 0.17
78 0.15
79 0.15
80 0.14
81 0.15
82 0.14
83 0.14
84 0.16
85 0.15
86 0.15
87 0.14
88 0.14
89 0.11
90 0.1
91 0.09
92 0.08
93 0.14
94 0.19
95 0.2
96 0.27
97 0.34
98 0.42
99 0.54
100 0.62
101 0.66
102 0.67
103 0.77
104 0.78
105 0.74
106 0.74
107 0.65
108 0.57
109 0.53
110 0.49
111 0.38
112 0.32
113 0.29
114 0.21
115 0.23
116 0.22
117 0.25
118 0.25
119 0.31
120 0.35
121 0.42
122 0.44
123 0.47
124 0.56
125 0.58
126 0.64
127 0.67
128 0.73
129 0.75
130 0.74
131 0.79
132 0.77
133 0.76
134 0.7
135 0.63
136 0.55
137 0.45
138 0.43
139 0.34
140 0.27
141 0.22
142 0.2
143 0.2
144 0.17
145 0.18
146 0.18
147 0.17
148 0.16
149 0.12
150 0.15
151 0.13
152 0.14
153 0.12
154 0.12
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.04
165 0.03
166 0.03
167 0.04
168 0.04
169 0.03
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.03
179 0.04
180 0.03
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.05
186 0.07
187 0.09
188 0.1
189 0.09
190 0.1
191 0.14
192 0.23
193 0.31
194 0.36
195 0.4
196 0.42
197 0.42
198 0.43
199 0.43
200 0.37
201 0.37
202 0.4
203 0.36
204 0.37
205 0.4
206 0.38
207 0.35
208 0.35
209 0.32
210 0.28
211 0.27
212 0.25
213 0.27
214 0.27
215 0.27
216 0.27
217 0.24
218 0.19
219 0.2
220 0.23
221 0.27
222 0.28
223 0.32
224 0.34
225 0.33
226 0.38
227 0.43
228 0.45
229 0.42
230 0.41
231 0.39
232 0.36
233 0.34
234 0.28
235 0.2
236 0.14
237 0.11
238 0.1
239 0.07
240 0.07
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.12
246 0.13
247 0.13
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.15
252 0.16
253 0.16
254 0.15
255 0.15
256 0.18
257 0.19
258 0.22
259 0.24
260 0.25
261 0.24
262 0.25
263 0.25
264 0.24
265 0.23
266 0.2
267 0.15
268 0.16
269 0.13
270 0.13
271 0.13
272 0.11
273 0.1
274 0.09
275 0.09
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.06
280 0.09
281 0.08
282 0.09
283 0.1
284 0.11
285 0.13
286 0.14
287 0.15
288 0.12
289 0.14
290 0.17
291 0.21
292 0.21
293 0.21
294 0.22
295 0.23
296 0.24
297 0.24
298 0.21
299 0.17
300 0.17
301 0.15
302 0.13
303 0.11
304 0.12
305 0.15
306 0.16
307 0.16
308 0.16
309 0.17
310 0.2
311 0.22
312 0.22
313 0.19
314 0.18
315 0.22
316 0.2
317 0.19
318 0.17
319 0.17
320 0.16
321 0.16
322 0.16
323 0.15
324 0.17
325 0.17
326 0.17
327 0.15
328 0.14
329 0.14
330 0.13
331 0.09
332 0.08
333 0.08
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.08
343 0.13
344 0.16
345 0.18
346 0.2
347 0.24
348 0.24
349 0.29
350 0.28
351 0.28
352 0.25
353 0.24
354 0.22
355 0.19
356 0.21
357 0.17
358 0.18
359 0.16
360 0.17
361 0.19
362 0.22
363 0.24
364 0.23
365 0.23
366 0.21
367 0.2
368 0.19
369 0.18
370 0.16
371 0.13
372 0.12
373 0.13
374 0.12
375 0.13
376 0.11
377 0.1
378 0.09
379 0.09
380 0.08
381 0.06
382 0.08
383 0.08
384 0.11
385 0.17
386 0.17
387 0.17
388 0.24
389 0.33
390 0.41
391 0.44
392 0.47
393 0.48
394 0.48
395 0.48
396 0.42
397 0.37
398 0.29
399 0.25
400 0.21
401 0.14
402 0.13
403 0.13
404 0.12
405 0.08
406 0.07
407 0.06
408 0.06
409 0.07
410 0.13
411 0.13
412 0.13
413 0.15
414 0.17
415 0.19
416 0.27
417 0.35
418 0.4
419 0.45
420 0.54
421 0.58
422 0.63
423 0.69
424 0.68
425 0.67
426 0.62