Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A086TH82

Protein Details
Accession A0A086TH82    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
141-163IKPEMDKKEKEKRRQRWEQVVEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-112SKKKK
147-154KKEKEKRR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024974  Sde2_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF13019  Sde2_N_Ubi  
Amino Acid Sequences MDSDKLNVLITSFGGLGLPSTLALPVPSSTTITDLRQRIHQRVPGASSRLILTTISNKQLPESSDTPLSDYLATTRDDFLSLRLAVPLCGGKGGFGSQLRAAGGRMSSKKKKEDHGSSRNLDGRRLRTVNEAKALAEYLAIKPEMDKKEKEKRRQRWEQVVEAAERREAEIQSGSKGRLDGKWVEDREESNERTRDAVLAAMKAGNYTDNLLGTSHGSSSSSHTRDRSGSEGEEDASSKESTPPSEPAKPAKLDKGKGKAPVFLGFDEDDEFMSSDEEEGDEKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.07
3 0.07
4 0.07
5 0.07
6 0.05
7 0.06
8 0.06
9 0.06
10 0.06
11 0.07
12 0.07
13 0.1
14 0.11
15 0.12
16 0.12
17 0.16
18 0.18
19 0.21
20 0.28
21 0.28
22 0.3
23 0.37
24 0.43
25 0.46
26 0.5
27 0.51
28 0.48
29 0.49
30 0.52
31 0.49
32 0.47
33 0.42
34 0.36
35 0.32
36 0.28
37 0.24
38 0.19
39 0.16
40 0.18
41 0.21
42 0.24
43 0.25
44 0.24
45 0.25
46 0.28
47 0.28
48 0.27
49 0.25
50 0.24
51 0.26
52 0.26
53 0.27
54 0.25
55 0.24
56 0.18
57 0.16
58 0.14
59 0.12
60 0.13
61 0.12
62 0.13
63 0.12
64 0.13
65 0.13
66 0.12
67 0.14
68 0.14
69 0.13
70 0.13
71 0.13
72 0.12
73 0.13
74 0.13
75 0.09
76 0.09
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.1
82 0.09
83 0.11
84 0.11
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.11
89 0.09
90 0.1
91 0.13
92 0.17
93 0.24
94 0.31
95 0.36
96 0.44
97 0.46
98 0.53
99 0.58
100 0.64
101 0.66
102 0.68
103 0.7
104 0.65
105 0.65
106 0.63
107 0.54
108 0.48
109 0.43
110 0.37
111 0.36
112 0.35
113 0.31
114 0.34
115 0.39
116 0.37
117 0.35
118 0.32
119 0.25
120 0.25
121 0.24
122 0.15
123 0.11
124 0.09
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.07
130 0.14
131 0.17
132 0.2
133 0.22
134 0.28
135 0.38
136 0.47
137 0.57
138 0.61
139 0.67
140 0.74
141 0.82
142 0.84
143 0.84
144 0.8
145 0.74
146 0.68
147 0.6
148 0.52
149 0.43
150 0.35
151 0.25
152 0.2
153 0.16
154 0.14
155 0.11
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.14
160 0.16
161 0.15
162 0.14
163 0.15
164 0.15
165 0.13
166 0.17
167 0.17
168 0.2
169 0.27
170 0.27
171 0.29
172 0.29
173 0.29
174 0.31
175 0.34
176 0.31
177 0.3
178 0.32
179 0.29
180 0.29
181 0.28
182 0.23
183 0.18
184 0.19
185 0.14
186 0.12
187 0.12
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.14
207 0.22
208 0.24
209 0.27
210 0.28
211 0.31
212 0.32
213 0.35
214 0.33
215 0.29
216 0.27
217 0.26
218 0.26
219 0.24
220 0.23
221 0.2
222 0.17
223 0.16
224 0.15
225 0.13
226 0.15
227 0.16
228 0.18
229 0.21
230 0.26
231 0.3
232 0.36
233 0.39
234 0.42
235 0.47
236 0.49
237 0.5
238 0.55
239 0.57
240 0.57
241 0.62
242 0.63
243 0.62
244 0.67
245 0.64
246 0.59
247 0.53
248 0.53
249 0.47
250 0.39
251 0.38
252 0.29
253 0.28
254 0.25
255 0.22
256 0.16
257 0.15
258 0.14
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.09
263 0.09
264 0.09