FuNGI

A0A086SYN2

Protein Details

Accession

A0A086SYN2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
405-436	PDVVLVKKHFQRHRKNRRRNWRLKRMAKEEGD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
412-431	KHFQRHRKNRRRNWRLKRMA

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 13, cyto 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3

Amino Acid Sequences

MSMDIDDAPVSIASGSAQTGATILCCNCGAPIDGTTATGALCYDCVKLTVDISQGVQREATIHFCKDCDRWLLPPATWITALPESRELLALCLKKLKGLSRVRIVDASFVWTEPHSRRIKVKITIQDSVQDGVLLQQSFEVVYLVHTQQCRDCAKSYTPAHWRSCVQVRQKVHHKRTFLFLEQLILKHGAHRDAINIKEAPNGVDFFFSSRSQGEGFVDFLNSVVPVTVKYSQELISHDEHTATATIKHSASADIVPVCRDDLVAIPIKLARKYGNVSPLLLCYKIGSSVYLMDPQTLQTADISSAIYWRAPFHSLADSQQLVEFIIMDIELTGKQKGKWRLAEATVAKASDLGHNDTTYFVRTHLGGLLHAGDSAMGYLLSGTNFNNAEFEAIEASNQYSSTIPDVVLVKKHFQRHRKNRRRNWRLKRMAKEEGDLLPKAADQERMDREYEQFLRDVEEDEELRATLELYKAQKRQQEEMSVAETDEEEDDAPQVNMEELLDDFDELKVDDAQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.07
2	0.07
3	0.07
4	0.08
5	0.07
6	0.08
7	0.08
8	0.08
9	0.11
10	0.11
11	0.12
12	0.12
13	0.12
14	0.12
15	0.13
16	0.15
17	0.13
18	0.14
19	0.16
20	0.16
21	0.17
22	0.17
23	0.15
24	0.13
25	0.11
26	0.1
27	0.06
28	0.07
29	0.08
30	0.08
31	0.08
32	0.1
33	0.12
34	0.13
35	0.14
36	0.16
37	0.16
38	0.17
39	0.18
40	0.21
41	0.2
42	0.2
43	0.19
44	0.15
45	0.16
46	0.16
47	0.22
48	0.21
49	0.23
50	0.23
51	0.24
52	0.28
53	0.28
54	0.31
55	0.3
56	0.29
57	0.29
58	0.35
59	0.38
60	0.34
61	0.38
62	0.35
63	0.31
64	0.29
65	0.25
66	0.23
67	0.26
68	0.26
69	0.23
70	0.23
71	0.22
72	0.22
73	0.24
74	0.19
75	0.15
76	0.21
77	0.21
78	0.2
79	0.24
80	0.24
81	0.25
82	0.28
83	0.32
84	0.35
85	0.42
86	0.48
87	0.52
88	0.55
89	0.54
90	0.54
91	0.49
92	0.42
93	0.33
94	0.3
95	0.21
96	0.18
97	0.17
98	0.14
99	0.19
100	0.18
101	0.27
102	0.27
103	0.3
104	0.36
105	0.42
106	0.49
107	0.51
108	0.57
109	0.57
110	0.59
111	0.58
112	0.53
113	0.5
114	0.44
115	0.37
116	0.29
117	0.2
118	0.14
119	0.13
120	0.16
121	0.12
122	0.1
123	0.09
124	0.09
125	0.09
126	0.09
127	0.07
128	0.04
129	0.06
130	0.09
131	0.1
132	0.13
133	0.14
134	0.15
135	0.17
136	0.22
137	0.24
138	0.23
139	0.25
140	0.26
141	0.29
142	0.37
143	0.38
144	0.4
145	0.46
146	0.5
147	0.51
148	0.5
149	0.47
150	0.44
151	0.5
152	0.49
153	0.48
154	0.48
155	0.49
156	0.54
157	0.64
158	0.69
159	0.7
160	0.69
161	0.65
162	0.6
163	0.63
164	0.6
165	0.52
166	0.45
167	0.35
168	0.33
169	0.3
170	0.28
171	0.22
172	0.19
173	0.16
174	0.15
175	0.17
176	0.15
177	0.14
178	0.14
179	0.17
180	0.2
181	0.21
182	0.21
183	0.2
184	0.19
185	0.21
186	0.2
187	0.18
188	0.15
189	0.15
190	0.11
191	0.11
192	0.11
193	0.1
194	0.12
195	0.11
196	0.11
197	0.1
198	0.11
199	0.11
200	0.12
201	0.12
202	0.1
203	0.11
204	0.1
205	0.1
206	0.08
207	0.08
208	0.07
209	0.06
210	0.05
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.06
215	0.1
216	0.1
217	0.11
218	0.13
219	0.14
220	0.15
221	0.17
222	0.17
223	0.16
224	0.17
225	0.17
226	0.15
227	0.14
228	0.13
229	0.12
230	0.09
231	0.08
232	0.08
233	0.1
234	0.09
235	0.1
236	0.1
237	0.09
238	0.1
239	0.09
240	0.09
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.08
246	0.07
247	0.06
248	0.05
249	0.05
250	0.07
251	0.1
252	0.09
253	0.1
254	0.12
255	0.13
256	0.13
257	0.13
258	0.12
259	0.12
260	0.15
261	0.18
262	0.22
263	0.22
264	0.22
265	0.22
266	0.23
267	0.22
268	0.19
269	0.16
270	0.1
271	0.1
272	0.1
273	0.09
274	0.07
275	0.07
276	0.08
277	0.09
278	0.12
279	0.12
280	0.11
281	0.11
282	0.11
283	0.12
284	0.1
285	0.1
286	0.06
287	0.07
288	0.07
289	0.07
290	0.07
291	0.06
292	0.06
293	0.07
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.08
298	0.1
299	0.1
300	0.12
301	0.14
302	0.15
303	0.16
304	0.19
305	0.17
306	0.16
307	0.16
308	0.14
309	0.11
310	0.1
311	0.09
312	0.05
313	0.05
314	0.04
315	0.03
316	0.03
317	0.04
318	0.05
319	0.05
320	0.07
321	0.09
322	0.11
323	0.19
324	0.27
325	0.33
326	0.37
327	0.4
328	0.43
329	0.44
330	0.49
331	0.43
332	0.41
333	0.35
334	0.3
335	0.25
336	0.21
337	0.2
338	0.16
339	0.17
340	0.16
341	0.16
342	0.16
343	0.16
344	0.17
345	0.17
346	0.16
347	0.13
348	0.11
349	0.11
350	0.11
351	0.12
352	0.13
353	0.13
354	0.11
355	0.11
356	0.12
357	0.11
358	0.1
359	0.09
360	0.06
361	0.05
362	0.05
363	0.04
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.04
368	0.04
369	0.06
370	0.06
371	0.09
372	0.1
373	0.1
374	0.1
375	0.1
376	0.1
377	0.1
378	0.1
379	0.08
380	0.08
381	0.08
382	0.08
383	0.09
384	0.08
385	0.08
386	0.09
387	0.07
388	0.08
389	0.11
390	0.11
391	0.1
392	0.12
393	0.15
394	0.16
395	0.21
396	0.22
397	0.26
398	0.31
399	0.4
400	0.45
401	0.53
402	0.63
403	0.69
404	0.78
405	0.83
406	0.89
407	0.91
408	0.95
409	0.96
410	0.96
411	0.96
412	0.96
413	0.95
414	0.94
415	0.93
416	0.9
417	0.88
418	0.8
419	0.71
420	0.64
421	0.58
422	0.53
423	0.43
424	0.35
425	0.26
426	0.23
427	0.23
428	0.21
429	0.21
430	0.19
431	0.26
432	0.31
433	0.34
434	0.35
435	0.34
436	0.34
437	0.37
438	0.37
439	0.31
440	0.27
441	0.24
442	0.26
443	0.25
444	0.26
445	0.19
446	0.2
447	0.18
448	0.18
449	0.18
450	0.15
451	0.15
452	0.12
453	0.12
454	0.1
455	0.11
456	0.16
457	0.21
458	0.29
459	0.34
460	0.39
461	0.44
462	0.47
463	0.53
464	0.54
465	0.55
466	0.5
467	0.49
468	0.46
469	0.42
470	0.36
471	0.3
472	0.23
473	0.17
474	0.15
475	0.12
476	0.09
477	0.09
478	0.09
479	0.1
480	0.1
481	0.09
482	0.09
483	0.09
484	0.08
485	0.08
486	0.08
487	0.07
488	0.09
489	0.09
490	0.09
491	0.1
492	0.1
493	0.1
494	0.1

A0A086SYN2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer