Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A086SY57

Protein Details
Accession A0A086SY57    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-84PAAEAPAKKRKRDQDQQDDGAAGVTKKSKKDKKDKKDKKKDKKESRKEKKEKRKDLQNLPEEDBasic
110-142VDEEKEAKKREKRERKKEKKKEKKENEAKQAASBasic
266-310GGGGKTKQRQEKIREKNRKLDDNRSKRIEKEKNVKVEKKQEARSNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-33AKKRKR
46-75TKKSKKDKKDKKDKKKDKKESRKEKKEKRK
114-138KEAKKREKRERKKEKKKEKKENEAK
269-304GKTKQRQEKIREKNRKLDDNRSKRIEKEKNVKVEKK
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MKSKRAREAAEADDKPINGAAPAAEAPAKKRKRDQDQQDDGAAGVTKKSKKDKKDKKDKKKDKKESRKEKKEKRKDLQNLPEEDESPEDQDEAATAAPESKTKDKAVNGVDEEKEAKKREKRERKKEKKKEKKENEAKQAASKEQSSNGEAKKGEANNDNNAPAGADAAIDLDETTATKTDRHIVFVGNLPFSATATSISAHFASLSPIAVRCLKNKNDDNPCRGIAFVEFGKVWHMRTCLDKFHHSMFDDGVSPPRRINVELTAGGGGKTKQRQEKIREKNRKLDDNRSKRIEKEKNVKVEKKQEARSNPMEGSMHPSRMARTPGLAH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.38
3 0.32
4 0.25
5 0.14
6 0.14
7 0.1
8 0.1
9 0.1
10 0.11
11 0.13
12 0.14
13 0.19
14 0.28
15 0.35
16 0.38
17 0.47
18 0.56
19 0.64
20 0.74
21 0.8
22 0.81
23 0.84
24 0.82
25 0.74
26 0.64
27 0.54
28 0.44
29 0.34
30 0.23
31 0.16
32 0.18
33 0.21
34 0.27
35 0.37
36 0.44
37 0.53
38 0.65
39 0.73
40 0.78
41 0.86
42 0.91
43 0.92
44 0.96
45 0.97
46 0.97
47 0.97
48 0.97
49 0.97
50 0.97
51 0.97
52 0.97
53 0.97
54 0.97
55 0.96
56 0.96
57 0.96
58 0.96
59 0.96
60 0.94
61 0.93
62 0.92
63 0.91
64 0.9
65 0.87
66 0.8
67 0.73
68 0.65
69 0.55
70 0.46
71 0.38
72 0.29
73 0.22
74 0.18
75 0.14
76 0.12
77 0.11
78 0.1
79 0.08
80 0.07
81 0.05
82 0.05
83 0.06
84 0.07
85 0.09
86 0.12
87 0.16
88 0.19
89 0.21
90 0.26
91 0.25
92 0.31
93 0.32
94 0.33
95 0.32
96 0.33
97 0.31
98 0.28
99 0.29
100 0.25
101 0.27
102 0.25
103 0.3
104 0.32
105 0.42
106 0.52
107 0.61
108 0.7
109 0.76
110 0.85
111 0.89
112 0.95
113 0.96
114 0.96
115 0.96
116 0.96
117 0.96
118 0.95
119 0.95
120 0.94
121 0.93
122 0.91
123 0.86
124 0.75
125 0.69
126 0.61
127 0.51
128 0.43
129 0.35
130 0.26
131 0.23
132 0.24
133 0.21
134 0.23
135 0.22
136 0.23
137 0.21
138 0.21
139 0.23
140 0.22
141 0.23
142 0.24
143 0.26
144 0.26
145 0.27
146 0.26
147 0.21
148 0.2
149 0.17
150 0.11
151 0.09
152 0.05
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.13
168 0.14
169 0.16
170 0.17
171 0.17
172 0.18
173 0.22
174 0.23
175 0.16
176 0.15
177 0.13
178 0.12
179 0.12
180 0.11
181 0.06
182 0.05
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.09
197 0.14
198 0.15
199 0.18
200 0.25
201 0.29
202 0.37
203 0.43
204 0.5
205 0.56
206 0.61
207 0.62
208 0.58
209 0.56
210 0.47
211 0.41
212 0.33
213 0.23
214 0.2
215 0.15
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.14
220 0.14
221 0.15
222 0.15
223 0.16
224 0.16
225 0.22
226 0.25
227 0.29
228 0.32
229 0.35
230 0.36
231 0.39
232 0.42
233 0.36
234 0.35
235 0.29
236 0.26
237 0.23
238 0.2
239 0.24
240 0.22
241 0.22
242 0.21
243 0.23
244 0.23
245 0.23
246 0.26
247 0.23
248 0.25
249 0.25
250 0.26
251 0.24
252 0.22
253 0.21
254 0.19
255 0.16
256 0.17
257 0.22
258 0.28
259 0.35
260 0.42
261 0.51
262 0.59
263 0.69
264 0.74
265 0.8
266 0.84
267 0.83
268 0.85
269 0.85
270 0.86
271 0.82
272 0.82
273 0.82
274 0.81
275 0.84
276 0.82
277 0.76
278 0.72
279 0.77
280 0.75
281 0.74
282 0.75
283 0.74
284 0.77
285 0.83
286 0.84
287 0.82
288 0.83
289 0.83
290 0.81
291 0.81
292 0.8
293 0.77
294 0.78
295 0.75
296 0.7
297 0.6
298 0.55
299 0.48
300 0.4
301 0.4
302 0.36
303 0.33
304 0.29
305 0.3
306 0.28
307 0.33
308 0.37
309 0.31