Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A086T1M0

Protein Details
Accession A0A086T1M0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
170-194EYDPEERRRRNKYRERDGDRRRSERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
176-198RRRRNKYRERDGDRRRSERHGRR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDLDIDMEEAVQEPLVEDTFRSNADDILQPDEQSEELGEVIDDGEAEPAGDESTILVPSKVHIRGVDTLNTDEIRTYVKSHYGPADRVEWIDDTSANLLFASESIARDALIALSSIDIVDPSALAPGETLVAKPFDGKPEISLRVRLAVQSDRKQPGAALRSRFYLLNPEYDPEERRRRNKYRERDGDRRRSERHGRRDSDGGGGGGGVRFEASMYDDVPRSARERRHSESPERLPSFAEQNRGKELFAGRRSRTRDRSASPAKDLDGDESMGDDRASSSGNRIKARSLKDRITTDSRNRSKELFPTKKSSGHGGQLDQLESAIGSAHLREEDRPKVVDVPSEPRDTGFNIRGVARQGGQGEGFSIRGAASAKELFPSKLGGSNAGKELLGGRAKRNPRQRAEDLFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.08
3 0.08
4 0.08
5 0.11
6 0.13
7 0.14
8 0.16
9 0.15
10 0.15
11 0.18
12 0.22
13 0.2
14 0.24
15 0.24
16 0.22
17 0.22
18 0.22
19 0.19
20 0.15
21 0.14
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.07
26 0.06
27 0.06
28 0.05
29 0.05
30 0.05
31 0.05
32 0.05
33 0.05
34 0.05
35 0.05
36 0.05
37 0.05
38 0.05
39 0.05
40 0.07
41 0.08
42 0.09
43 0.09
44 0.08
45 0.1
46 0.17
47 0.18
48 0.18
49 0.18
50 0.22
51 0.27
52 0.31
53 0.34
54 0.29
55 0.29
56 0.3
57 0.29
58 0.25
59 0.2
60 0.17
61 0.15
62 0.14
63 0.16
64 0.15
65 0.21
66 0.22
67 0.25
68 0.31
69 0.33
70 0.34
71 0.34
72 0.35
73 0.3
74 0.29
75 0.28
76 0.21
77 0.18
78 0.17
79 0.14
80 0.12
81 0.12
82 0.12
83 0.1
84 0.09
85 0.08
86 0.07
87 0.07
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.1
93 0.09
94 0.1
95 0.1
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.09
121 0.1
122 0.13
123 0.15
124 0.15
125 0.17
126 0.22
127 0.27
128 0.25
129 0.27
130 0.24
131 0.25
132 0.25
133 0.23
134 0.2
135 0.22
136 0.28
137 0.31
138 0.38
139 0.37
140 0.37
141 0.37
142 0.35
143 0.35
144 0.35
145 0.34
146 0.31
147 0.3
148 0.31
149 0.32
150 0.32
151 0.25
152 0.27
153 0.22
154 0.23
155 0.22
156 0.21
157 0.22
158 0.24
159 0.26
160 0.25
161 0.34
162 0.36
163 0.43
164 0.52
165 0.59
166 0.68
167 0.75
168 0.79
169 0.8
170 0.84
171 0.85
172 0.86
173 0.87
174 0.87
175 0.84
176 0.8
177 0.72
178 0.7
179 0.72
180 0.7
181 0.71
182 0.7
183 0.66
184 0.62
185 0.62
186 0.55
187 0.46
188 0.37
189 0.27
190 0.17
191 0.14
192 0.11
193 0.08
194 0.06
195 0.04
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.04
201 0.05
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.09
207 0.1
208 0.11
209 0.16
210 0.21
211 0.27
212 0.34
213 0.38
214 0.47
215 0.51
216 0.55
217 0.58
218 0.6
219 0.61
220 0.56
221 0.52
222 0.44
223 0.4
224 0.41
225 0.34
226 0.36
227 0.29
228 0.3
229 0.34
230 0.34
231 0.32
232 0.27
233 0.29
234 0.29
235 0.33
236 0.38
237 0.35
238 0.42
239 0.48
240 0.54
241 0.57
242 0.57
243 0.56
244 0.53
245 0.61
246 0.63
247 0.61
248 0.56
249 0.51
250 0.44
251 0.4
252 0.37
253 0.29
254 0.21
255 0.17
256 0.13
257 0.13
258 0.12
259 0.09
260 0.09
261 0.07
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.06
266 0.12
267 0.16
268 0.22
269 0.25
270 0.25
271 0.3
272 0.36
273 0.42
274 0.47
275 0.49
276 0.49
277 0.53
278 0.56
279 0.56
280 0.57
281 0.58
282 0.57
283 0.62
284 0.62
285 0.6
286 0.59
287 0.57
288 0.52
289 0.54
290 0.56
291 0.54
292 0.52
293 0.56
294 0.58
295 0.59
296 0.57
297 0.55
298 0.49
299 0.46
300 0.45
301 0.39
302 0.4
303 0.36
304 0.35
305 0.28
306 0.23
307 0.16
308 0.12
309 0.11
310 0.06
311 0.05
312 0.04
313 0.05
314 0.06
315 0.08
316 0.09
317 0.13
318 0.19
319 0.23
320 0.26
321 0.27
322 0.28
323 0.32
324 0.32
325 0.33
326 0.31
327 0.34
328 0.35
329 0.37
330 0.36
331 0.31
332 0.32
333 0.31
334 0.33
335 0.29
336 0.27
337 0.26
338 0.27
339 0.29
340 0.3
341 0.29
342 0.24
343 0.23
344 0.22
345 0.22
346 0.21
347 0.18
348 0.17
349 0.15
350 0.14
351 0.11
352 0.1
353 0.08
354 0.09
355 0.1
356 0.09
357 0.12
358 0.14
359 0.15
360 0.18
361 0.2
362 0.19
363 0.19
364 0.22
365 0.19
366 0.22
367 0.23
368 0.27
369 0.28
370 0.31
371 0.32
372 0.31
373 0.29
374 0.23
375 0.24
376 0.24
377 0.27
378 0.25
379 0.29
380 0.36
381 0.45
382 0.54
383 0.63
384 0.66
385 0.69
386 0.76
387 0.79