Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A086T1W5

Protein Details
Accession A0A086T1W5    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
346-365RRYPTKPPEKTKPVKPARKVBasic
493-519IEDGRGRSPRRESPRSKHEPRETSTERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
346-373RRYPTKPPEKTKPVKPARKVGTIGGRKQ
431-433KKG
479-486KRKEAKAS
493-546IEDGRGRSPRRESPRSKHEPRETSTERADRRREELKRELEKKAAAGPVKKRRKF
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MTVQSTWRPLPLPESSGVPVLLASIDTDTAAYTVRVTDMANMWVESLDRKAICMRGWGENTSIDPSDTPENMSKLLSTIRSALDLSDPAHQDTSMSLAPASPSDAGEGGLTLRLTCRLPGLQPLKWPVHLRKAAPSSIATALVLPLIQAHHSRIREIESLAALLAQKDGVITKLLDKLEATGTGLEHVFNTLSGKKKVNRSVAEDRVRGLAPFHRKQWQTDMGHEEGPDSAASLVRDVFSAGGLRHHGSLEVEDSPKLDRWWLDLKGTLQISQRSLDTDAHQGNKGQTPPANDTEEDDDFQVQETPPHLAPTTAHKPSSKALPIDDASTASETDDSNVSPSRSGNRRYPTKPPEKTKPVKPARKVGTIGGRKQSSPRRCTSPRTLRETQERGGIQVTKSDAASDVADKDNDTDSTADPSPPSSSPKRTVAKKGRLGRIGGQRGATQGAQQDNEQNVEEASGKKSETATSHTPRLGMVGKRKEAKASTPPADGIEDGRGRSPRRESPRSKHEPRETSTERADRRREELKRELEKKAAAGPVKKRRKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.3
3 0.3
4 0.28
5 0.22
6 0.18
7 0.14
8 0.13
9 0.09
10 0.08
11 0.06
12 0.07
13 0.07
14 0.07
15 0.07
16 0.07
17 0.08
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.08
22 0.09
23 0.09
24 0.12
25 0.13
26 0.15
27 0.16
28 0.16
29 0.15
30 0.15
31 0.15
32 0.13
33 0.13
34 0.16
35 0.14
36 0.16
37 0.19
38 0.22
39 0.23
40 0.28
41 0.29
42 0.32
43 0.35
44 0.36
45 0.34
46 0.32
47 0.33
48 0.3
49 0.28
50 0.2
51 0.17
52 0.19
53 0.22
54 0.2
55 0.22
56 0.22
57 0.23
58 0.24
59 0.24
60 0.21
61 0.18
62 0.21
63 0.19
64 0.16
65 0.17
66 0.17
67 0.18
68 0.18
69 0.17
70 0.16
71 0.16
72 0.16
73 0.19
74 0.2
75 0.2
76 0.2
77 0.19
78 0.17
79 0.15
80 0.18
81 0.13
82 0.12
83 0.1
84 0.1
85 0.11
86 0.11
87 0.13
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.07
96 0.08
97 0.08
98 0.07
99 0.07
100 0.09
101 0.1
102 0.1
103 0.13
104 0.13
105 0.14
106 0.24
107 0.29
108 0.29
109 0.33
110 0.39
111 0.38
112 0.41
113 0.46
114 0.42
115 0.47
116 0.49
117 0.47
118 0.49
119 0.51
120 0.48
121 0.44
122 0.39
123 0.33
124 0.29
125 0.27
126 0.19
127 0.14
128 0.13
129 0.11
130 0.1
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.07
135 0.08
136 0.11
137 0.17
138 0.18
139 0.19
140 0.2
141 0.23
142 0.24
143 0.23
144 0.22
145 0.16
146 0.16
147 0.14
148 0.14
149 0.1
150 0.08
151 0.08
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.08
160 0.13
161 0.14
162 0.14
163 0.14
164 0.15
165 0.14
166 0.14
167 0.13
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.1
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.08
178 0.11
179 0.15
180 0.18
181 0.24
182 0.28
183 0.36
184 0.43
185 0.49
186 0.5
187 0.53
188 0.59
189 0.63
190 0.64
191 0.57
192 0.5
193 0.44
194 0.41
195 0.33
196 0.25
197 0.22
198 0.25
199 0.27
200 0.3
201 0.35
202 0.36
203 0.38
204 0.44
205 0.47
206 0.4
207 0.42
208 0.43
209 0.37
210 0.37
211 0.35
212 0.28
213 0.19
214 0.17
215 0.12
216 0.08
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.08
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.09
247 0.12
248 0.17
249 0.18
250 0.18
251 0.19
252 0.19
253 0.22
254 0.22
255 0.21
256 0.18
257 0.19
258 0.19
259 0.18
260 0.17
261 0.14
262 0.16
263 0.14
264 0.13
265 0.17
266 0.18
267 0.18
268 0.19
269 0.19
270 0.19
271 0.21
272 0.2
273 0.16
274 0.16
275 0.18
276 0.22
277 0.24
278 0.24
279 0.21
280 0.22
281 0.24
282 0.23
283 0.2
284 0.16
285 0.13
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.1
293 0.1
294 0.11
295 0.11
296 0.1
297 0.1
298 0.17
299 0.24
300 0.24
301 0.25
302 0.25
303 0.27
304 0.28
305 0.34
306 0.3
307 0.24
308 0.22
309 0.24
310 0.24
311 0.24
312 0.22
313 0.16
314 0.13
315 0.13
316 0.12
317 0.08
318 0.09
319 0.07
320 0.08
321 0.08
322 0.07
323 0.08
324 0.1
325 0.1
326 0.1
327 0.11
328 0.17
329 0.22
330 0.27
331 0.32
332 0.38
333 0.47
334 0.5
335 0.59
336 0.62
337 0.67
338 0.71
339 0.72
340 0.75
341 0.77
342 0.8
343 0.78
344 0.79
345 0.79
346 0.8
347 0.78
348 0.77
349 0.73
350 0.72
351 0.65
352 0.59
353 0.58
354 0.56
355 0.55
356 0.53
357 0.48
358 0.42
359 0.48
360 0.53
361 0.52
362 0.51
363 0.52
364 0.53
365 0.57
366 0.64
367 0.67
368 0.68
369 0.68
370 0.7
371 0.71
372 0.68
373 0.72
374 0.7
375 0.6
376 0.56
377 0.48
378 0.4
379 0.38
380 0.35
381 0.25
382 0.23
383 0.23
384 0.17
385 0.17
386 0.16
387 0.14
388 0.13
389 0.13
390 0.11
391 0.12
392 0.13
393 0.13
394 0.13
395 0.13
396 0.14
397 0.13
398 0.13
399 0.12
400 0.12
401 0.16
402 0.17
403 0.16
404 0.15
405 0.16
406 0.18
407 0.18
408 0.23
409 0.25
410 0.3
411 0.35
412 0.44
413 0.5
414 0.54
415 0.63
416 0.68
417 0.72
418 0.75
419 0.78
420 0.78
421 0.74
422 0.71
423 0.68
424 0.68
425 0.64
426 0.57
427 0.49
428 0.42
429 0.39
430 0.38
431 0.3
432 0.22
433 0.2
434 0.21
435 0.21
436 0.21
437 0.25
438 0.24
439 0.26
440 0.24
441 0.2
442 0.16
443 0.16
444 0.18
445 0.14
446 0.15
447 0.15
448 0.14
449 0.15
450 0.17
451 0.19
452 0.19
453 0.24
454 0.31
455 0.35
456 0.4
457 0.4
458 0.39
459 0.35
460 0.37
461 0.36
462 0.34
463 0.38
464 0.42
465 0.48
466 0.53
467 0.55
468 0.57
469 0.53
470 0.54
471 0.54
472 0.54
473 0.51
474 0.48
475 0.48
476 0.43
477 0.42
478 0.35
479 0.28
480 0.26
481 0.24
482 0.22
483 0.26
484 0.29
485 0.31
486 0.36
487 0.42
488 0.44
489 0.52
490 0.62
491 0.67
492 0.72
493 0.8
494 0.84
495 0.86
496 0.87
497 0.88
498 0.86
499 0.81
500 0.81
501 0.75
502 0.71
503 0.71
504 0.69
505 0.66
506 0.67
507 0.7
508 0.64
509 0.66
510 0.69
511 0.67
512 0.67
513 0.69
514 0.71
515 0.74
516 0.75
517 0.74
518 0.7
519 0.65
520 0.59
521 0.56
522 0.52
523 0.48
524 0.5
525 0.55
526 0.6