Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A086T5G3

Protein Details
Accession A0A086T5G3    Localization Confidence High Confidence Score 22.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
498-519TSTGPEPPKRRGRPPKNAAAPVHydrophilic
528-547EASQPAKRRGRPPKNAATAEHydrophilic
675-701ASTDEKKTTTRGRPKKAPEVKPEPAQTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
355-363KPRGRPRKS
400-408PRPRGRPRK
449-480KPRGRPPKNASEPTPKTTSAKRGRPARAATRN
503-517EPPKRRGRPPKNAAA
532-543PAKRRGRPPKNA
603-700APKGRGRPPKAAASATETKAPSKKRGRASLEEEPTAPGTEPKRRRTGRGTVEAEAILPAGKRRGRPAKKVEAASTDEKKTTTRGRPKKAPEVKPEPAQ
704-713TRGRGLPPKG
749-749R
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
Amino Acid Sequences MDVFNSGGGGGGGGGGGGDDEPHQQATESPFQAFFSGSWLPGSSSLGQDDTMSGALPTTSATTRQPTMSGALFNDGGSARQSAEDDNEQEEAGDIVVSGGESPPILGAVGSRSAVIETAGSKISTWTAVPAAHADTEPSEDSGLRTIDDSNPDVNGTSGINNVTNGHAGWEEYGHGEHGHDDDDDDERVRDEHDLNEPEYDHASDQCDVRAKKSREPSVVLGEEPPPVAVERSEGDIDESLPEEAAPRSPSPRNSRPRTPEQSRTVSPKVPRTVPAKTAATSAAMGSAAKRRRRTAADMLLASTREFMGDNLSGRGKRHATPRTKSAAATPAEPASIRKASSAATPTTLSTQTPKPRGRPRKSEAPPQTANAAAPTPAKSASTTKARKTATPKADMTQTPRPRGRPRKSNAQPQPSSAIKESTLKATPRSTATPKETSSADALATVTPKPRGRPPKNASEPTPKTTSAKRGRPARAATRNSPLNIRRVVRNTAAGEATSTGPEPPKRRGRPPKNAAAPVQPKADQETEASQPAKRRGRPPKNAATAEQTRAPRATEASGARTARATGRTRGAAAAKTEEAPVARATGRKANAAEATAAATADAPKGRGRPPKAAASATETKAPSKKRGRASLEEEPTAPGTEPKRRRTGRGTVEAEAILPAGKRRGRPAKKVEAASTDEKKTTTRGRPKKAPEVKPEPAQTATTRGRGLPPKGGKDEAAAPSRDSTRSSGQTVTAVRSGRVVKAKAAPRAAVRGAKASTTGATGRSLRSRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.03
2 0.03
3 0.03
4 0.03
5 0.04
6 0.05
7 0.07
8 0.09
9 0.1
10 0.11
11 0.11
12 0.14
13 0.2
14 0.28
15 0.27
16 0.27
17 0.27
18 0.28
19 0.28
20 0.26
21 0.19
22 0.17
23 0.17
24 0.15
25 0.16
26 0.16
27 0.16
28 0.17
29 0.2
30 0.17
31 0.17
32 0.18
33 0.18
34 0.17
35 0.16
36 0.15
37 0.13
38 0.12
39 0.1
40 0.08
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.08
46 0.09
47 0.12
48 0.15
49 0.19
50 0.22
51 0.23
52 0.24
53 0.23
54 0.25
55 0.25
56 0.24
57 0.2
58 0.21
59 0.2
60 0.19
61 0.19
62 0.15
63 0.14
64 0.13
65 0.13
66 0.11
67 0.12
68 0.13
69 0.12
70 0.17
71 0.2
72 0.2
73 0.22
74 0.22
75 0.2
76 0.19
77 0.18
78 0.13
79 0.09
80 0.07
81 0.05
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.05
92 0.05
93 0.04
94 0.05
95 0.07
96 0.09
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.08
104 0.07
105 0.09
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.12
115 0.12
116 0.13
117 0.13
118 0.14
119 0.14
120 0.14
121 0.13
122 0.11
123 0.14
124 0.14
125 0.13
126 0.12
127 0.11
128 0.12
129 0.14
130 0.14
131 0.11
132 0.11
133 0.12
134 0.15
135 0.18
136 0.19
137 0.17
138 0.17
139 0.17
140 0.17
141 0.15
142 0.13
143 0.1
144 0.09
145 0.09
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.1
153 0.11
154 0.1
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.1
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.1
175 0.11
176 0.11
177 0.12
178 0.12
179 0.14
180 0.2
181 0.22
182 0.22
183 0.24
184 0.23
185 0.22
186 0.22
187 0.2
188 0.14
189 0.12
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.15
194 0.21
195 0.21
196 0.26
197 0.35
198 0.36
199 0.41
200 0.5
201 0.55
202 0.52
203 0.57
204 0.55
205 0.52
206 0.5
207 0.43
208 0.36
209 0.29
210 0.25
211 0.21
212 0.17
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.12
223 0.11
224 0.12
225 0.1
226 0.1
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.09
233 0.11
234 0.11
235 0.16
236 0.2
237 0.27
238 0.35
239 0.45
240 0.53
241 0.58
242 0.66
243 0.69
244 0.75
245 0.78
246 0.76
247 0.76
248 0.72
249 0.72
250 0.66
251 0.66
252 0.6
253 0.56
254 0.53
255 0.51
256 0.49
257 0.45
258 0.46
259 0.44
260 0.44
261 0.42
262 0.43
263 0.37
264 0.33
265 0.32
266 0.27
267 0.23
268 0.19
269 0.16
270 0.1
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.14
275 0.19
276 0.24
277 0.28
278 0.3
279 0.36
280 0.41
281 0.46
282 0.49
283 0.5
284 0.49
285 0.46
286 0.44
287 0.4
288 0.36
289 0.28
290 0.2
291 0.12
292 0.07
293 0.07
294 0.06
295 0.08
296 0.09
297 0.1
298 0.11
299 0.14
300 0.14
301 0.15
302 0.19
303 0.19
304 0.21
305 0.29
306 0.36
307 0.42
308 0.45
309 0.51
310 0.53
311 0.51
312 0.48
313 0.42
314 0.41
315 0.33
316 0.3
317 0.25
318 0.2
319 0.19
320 0.19
321 0.16
322 0.13
323 0.14
324 0.13
325 0.12
326 0.12
327 0.12
328 0.15
329 0.17
330 0.13
331 0.14
332 0.14
333 0.14
334 0.16
335 0.16
336 0.13
337 0.13
338 0.19
339 0.24
340 0.31
341 0.35
342 0.41
343 0.51
344 0.61
345 0.66
346 0.7
347 0.69
348 0.72
349 0.73
350 0.75
351 0.72
352 0.69
353 0.63
354 0.54
355 0.49
356 0.39
357 0.34
358 0.25
359 0.17
360 0.1
361 0.1
362 0.1
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.1
367 0.12
368 0.15
369 0.24
370 0.27
371 0.28
372 0.35
373 0.36
374 0.39
375 0.44
376 0.49
377 0.45
378 0.47
379 0.46
380 0.4
381 0.44
382 0.41
383 0.4
384 0.41
385 0.4
386 0.41
387 0.43
388 0.47
389 0.53
390 0.62
391 0.64
392 0.64
393 0.64
394 0.69
395 0.73
396 0.78
397 0.76
398 0.76
399 0.68
400 0.6
401 0.61
402 0.5
403 0.46
404 0.36
405 0.29
406 0.2
407 0.22
408 0.21
409 0.19
410 0.22
411 0.2
412 0.21
413 0.22
414 0.22
415 0.22
416 0.25
417 0.26
418 0.28
419 0.32
420 0.33
421 0.33
422 0.33
423 0.31
424 0.28
425 0.25
426 0.2
427 0.15
428 0.11
429 0.11
430 0.09
431 0.1
432 0.09
433 0.09
434 0.13
435 0.15
436 0.17
437 0.25
438 0.35
439 0.41
440 0.51
441 0.54
442 0.61
443 0.69
444 0.71
445 0.68
446 0.67
447 0.65
448 0.59
449 0.57
450 0.47
451 0.41
452 0.41
453 0.46
454 0.44
455 0.47
456 0.5
457 0.56
458 0.6
459 0.64
460 0.66
461 0.66
462 0.66
463 0.64
464 0.61
465 0.59
466 0.57
467 0.51
468 0.52
469 0.44
470 0.4
471 0.4
472 0.38
473 0.37
474 0.37
475 0.4
476 0.35
477 0.38
478 0.33
479 0.3
480 0.28
481 0.22
482 0.19
483 0.16
484 0.15
485 0.1
486 0.09
487 0.08
488 0.11
489 0.16
490 0.19
491 0.27
492 0.37
493 0.42
494 0.52
495 0.63
496 0.7
497 0.77
498 0.81
499 0.82
500 0.8
501 0.8
502 0.72
503 0.7
504 0.65
505 0.57
506 0.52
507 0.44
508 0.36
509 0.35
510 0.34
511 0.25
512 0.21
513 0.21
514 0.2
515 0.23
516 0.23
517 0.21
518 0.25
519 0.33
520 0.39
521 0.41
522 0.48
523 0.56
524 0.66
525 0.74
526 0.78
527 0.79
528 0.8
529 0.78
530 0.7
531 0.67
532 0.61
533 0.54
534 0.51
535 0.42
536 0.35
537 0.33
538 0.31
539 0.25
540 0.22
541 0.2
542 0.2
543 0.2
544 0.22
545 0.26
546 0.26
547 0.25
548 0.24
549 0.23
550 0.21
551 0.26
552 0.26
553 0.25
554 0.29
555 0.3
556 0.3
557 0.32
558 0.31
559 0.27
560 0.25
561 0.25
562 0.21
563 0.21
564 0.2
565 0.18
566 0.16
567 0.14
568 0.13
569 0.12
570 0.12
571 0.13
572 0.16
573 0.21
574 0.23
575 0.25
576 0.25
577 0.27
578 0.27
579 0.26
580 0.24
581 0.17
582 0.17
583 0.14
584 0.13
585 0.09
586 0.08
587 0.07
588 0.09
589 0.09
590 0.09
591 0.11
592 0.15
593 0.22
594 0.31
595 0.35
596 0.42
597 0.46
598 0.53
599 0.55
600 0.53
601 0.48
602 0.47
603 0.49
604 0.42
605 0.42
606 0.35
607 0.35
608 0.39
609 0.41
610 0.43
611 0.46
612 0.53
613 0.56
614 0.65
615 0.69
616 0.71
617 0.76
618 0.76
619 0.71
620 0.65
621 0.57
622 0.49
623 0.42
624 0.35
625 0.27
626 0.22
627 0.22
628 0.3
629 0.38
630 0.43
631 0.52
632 0.54
633 0.61
634 0.64
635 0.69
636 0.69
637 0.71
638 0.69
639 0.61
640 0.59
641 0.52
642 0.45
643 0.34
644 0.24
645 0.15
646 0.11
647 0.1
648 0.15
649 0.18
650 0.21
651 0.31
652 0.42
653 0.49
654 0.59
655 0.67
656 0.71
657 0.76
658 0.78
659 0.72
660 0.67
661 0.64
662 0.62
663 0.58
664 0.5
665 0.44
666 0.4
667 0.37
668 0.38
669 0.41
670 0.44
671 0.49
672 0.56
673 0.65
674 0.74
675 0.82
676 0.87
677 0.87
678 0.86
679 0.86
680 0.85
681 0.82
682 0.8
683 0.75
684 0.68
685 0.6
686 0.54
687 0.45
688 0.45
689 0.42
690 0.38
691 0.36
692 0.33
693 0.38
694 0.43
695 0.46
696 0.47
697 0.5
698 0.53
699 0.57
700 0.58
701 0.51
702 0.46
703 0.49
704 0.46
705 0.43
706 0.37
707 0.34
708 0.35
709 0.38
710 0.36
711 0.31
712 0.29
713 0.32
714 0.35
715 0.37
716 0.35
717 0.33
718 0.37
719 0.37
720 0.36
721 0.33
722 0.29
723 0.27
724 0.3
725 0.31
726 0.32
727 0.37
728 0.35
729 0.35
730 0.43
731 0.5
732 0.52
733 0.54
734 0.52
735 0.48
736 0.53
737 0.53
738 0.5
739 0.45
740 0.44
741 0.4
742 0.37
743 0.35
744 0.3
745 0.25
746 0.23
747 0.23
748 0.18
749 0.21
750 0.23
751 0.26