Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A086THP8

Protein Details
Accession A0A086THP8    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
228-251YFSGTSGKKQREREKKVKQTVDFDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
93-115RGGPRGGAGARVRGGRGSRNPRD
238-242REREK
259-293RGSRGGRGGSRGGRGGGRGGERGGQRGNFRGGRGG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 15.5, nucl 15, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MDNQSMDGTRLTVFMFDPAGNDSDGEEKPVVPVKTVEKTTMRTSKRNAEPTPPTRGPTGSRRGGGPGGNEGAFRDSGAGSARNQARSTEESARGGPRGGAGARVRGGRGSRNPRDRDDRHSRTVGQGSEKQAAAGWGANDGEAELKDEQAAESIAKTEQKEALAEDAAGEEPAEPEDKSVSYADYLAQQAEKKLQLEAGLKLRSANEGSKLDKKWQSAKPLEKEEVDYFSGTSGKKQREREKKVKQTVDFDPRFVEPDRGSRGGRGGSRGGRGGGRGGERGGQRGNFRGGRGGRDNAAPASAPINTRDESAFPSLGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.13
3 0.11
4 0.12
5 0.13
6 0.15
7 0.13
8 0.13
9 0.13
10 0.15
11 0.15
12 0.18
13 0.16
14 0.15
15 0.17
16 0.24
17 0.23
18 0.2
19 0.23
20 0.26
21 0.32
22 0.34
23 0.37
24 0.34
25 0.38
26 0.45
27 0.51
28 0.51
29 0.51
30 0.55
31 0.6
32 0.65
33 0.7
34 0.64
35 0.64
36 0.69
37 0.66
38 0.7
39 0.62
40 0.55
41 0.48
42 0.48
43 0.44
44 0.43
45 0.47
46 0.42
47 0.42
48 0.41
49 0.42
50 0.42
51 0.39
52 0.32
53 0.27
54 0.24
55 0.23
56 0.22
57 0.19
58 0.18
59 0.16
60 0.14
61 0.11
62 0.08
63 0.09
64 0.11
65 0.12
66 0.1
67 0.18
68 0.22
69 0.23
70 0.24
71 0.24
72 0.26
73 0.28
74 0.33
75 0.32
76 0.31
77 0.3
78 0.32
79 0.33
80 0.29
81 0.26
82 0.21
83 0.15
84 0.14
85 0.12
86 0.16
87 0.15
88 0.17
89 0.18
90 0.19
91 0.19
92 0.19
93 0.2
94 0.21
95 0.29
96 0.36
97 0.43
98 0.52
99 0.55
100 0.58
101 0.66
102 0.64
103 0.64
104 0.65
105 0.62
106 0.59
107 0.58
108 0.54
109 0.49
110 0.5
111 0.43
112 0.37
113 0.35
114 0.32
115 0.32
116 0.31
117 0.26
118 0.22
119 0.2
120 0.16
121 0.12
122 0.09
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.04
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.04
139 0.04
140 0.05
141 0.06
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.1
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.11
150 0.09
151 0.08
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.13
178 0.14
179 0.12
180 0.12
181 0.12
182 0.14
183 0.16
184 0.19
185 0.22
186 0.21
187 0.2
188 0.21
189 0.21
190 0.19
191 0.19
192 0.17
193 0.16
194 0.19
195 0.22
196 0.28
197 0.29
198 0.35
199 0.37
200 0.39
201 0.43
202 0.45
203 0.51
204 0.53
205 0.6
206 0.6
207 0.62
208 0.61
209 0.54
210 0.53
211 0.45
212 0.4
213 0.33
214 0.26
215 0.2
216 0.18
217 0.2
218 0.15
219 0.2
220 0.23
221 0.3
222 0.36
223 0.45
224 0.55
225 0.63
226 0.73
227 0.78
228 0.82
229 0.85
230 0.88
231 0.88
232 0.82
233 0.78
234 0.77
235 0.77
236 0.67
237 0.57
238 0.49
239 0.41
240 0.4
241 0.35
242 0.31
243 0.22
244 0.27
245 0.33
246 0.34
247 0.34
248 0.32
249 0.34
250 0.34
251 0.35
252 0.32
253 0.31
254 0.32
255 0.34
256 0.34
257 0.32
258 0.28
259 0.27
260 0.26
261 0.24
262 0.23
263 0.21
264 0.21
265 0.24
266 0.24
267 0.27
268 0.28
269 0.28
270 0.28
271 0.32
272 0.38
273 0.36
274 0.35
275 0.4
276 0.38
277 0.42
278 0.44
279 0.43
280 0.38
281 0.38
282 0.4
283 0.32
284 0.31
285 0.24
286 0.19
287 0.18
288 0.18
289 0.17
290 0.17
291 0.2
292 0.19
293 0.21
294 0.22
295 0.21
296 0.23
297 0.26
298 0.24