FuNGI

A0A086TDP0

Protein Details

Accession

A0A086TDP0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
15-45	ETSEPSSYSNKRPKQQQQQQSSKSRQHQNSG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MVSNKRDLSDLEEGETSEPSSYSNKRPKQQQQQQSSKSRQHQNSGIDPTWGQKYVFSSCHDATTIPAGEESDFEDDADAMAYLMSVRQEAYGIPHLLVAPKVQIGPQLPADAQNIVHAVDNDGEGENDDEHDVTSAQSPYVNGLGDSRGWYEDGAYMAAPNPEGSSYDQRADDVSDDADEASGKAIHDAYIASLLDQYTHLRATLHAPPPSDAYSRLPSSTPIDAAPFGRNSPTTSIWSQRLRNADPIPLQLALMSKDSVLRVIRVLLGGKLLQPGHSVAERTSRWLWALLARLPDRGELNHAEIGWIRDLGRRAVLLSRSLAEMAALREELATEGGLGMDEDVDGYSSNDDEPVVAADAEGGDGLSDQTQTDPTAPVSDNVDSAAESKPPPPDEDPDYEDGEIAEEEEKDEDIAMELESTSSVEEGEAADDGQDDLEDAKARLLAQLDASAAEERQRVAAEEARERSRMNMRATVNMILTVAGEFYGQRDLLEFREPFVGM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.28
3	0.21
4	0.14
5	0.12
6	0.12
7	0.17
8	0.22
9	0.31
10	0.41
11	0.48
12	0.56
13	0.67
14	0.76
15	0.81
16	0.86
17	0.86
18	0.87
19	0.89
20	0.91
21	0.9
22	0.89
23	0.86
24	0.85
25	0.85
26	0.81
27	0.78
28	0.76
29	0.73
30	0.72
31	0.7
32	0.62
33	0.54
34	0.48
35	0.43
36	0.4
37	0.35
38	0.27
39	0.21
40	0.24
41	0.27
42	0.3
43	0.3
44	0.33
45	0.32
46	0.34
47	0.32
48	0.28
49	0.24
50	0.27
51	0.24
52	0.18
53	0.17
54	0.16
55	0.15
56	0.16
57	0.16
58	0.13
59	0.12
60	0.12
61	0.12
62	0.11
63	0.11
64	0.1
65	0.08
66	0.05
67	0.04
68	0.04
69	0.04
70	0.05
71	0.05
72	0.05
73	0.05
74	0.06
75	0.06
76	0.07
77	0.11
78	0.16
79	0.17
80	0.17
81	0.17
82	0.17
83	0.18
84	0.19
85	0.15
86	0.1
87	0.11
88	0.11
89	0.11
90	0.14
91	0.15
92	0.17
93	0.18
94	0.19
95	0.17
96	0.2
97	0.2
98	0.17
99	0.16
100	0.14
101	0.13
102	0.12
103	0.13
104	0.1
105	0.1
106	0.1
107	0.1
108	0.09
109	0.09
110	0.08
111	0.08
112	0.09
113	0.08
114	0.08
115	0.08
116	0.07
117	0.07
118	0.07
119	0.07
120	0.07
121	0.1
122	0.1
123	0.09
124	0.1
125	0.1
126	0.11
127	0.12
128	0.11
129	0.08
130	0.09
131	0.1
132	0.1
133	0.11
134	0.11
135	0.1
136	0.1
137	0.1
138	0.1
139	0.1
140	0.1
141	0.09
142	0.08
143	0.07
144	0.08
145	0.09
146	0.08
147	0.07
148	0.06
149	0.06
150	0.08
151	0.11
152	0.16
153	0.18
154	0.21
155	0.21
156	0.21
157	0.21
158	0.2
159	0.17
160	0.12
161	0.1
162	0.08
163	0.08
164	0.08
165	0.07
166	0.06
167	0.05
168	0.05
169	0.06
170	0.05
171	0.06
172	0.06
173	0.06
174	0.07
175	0.06
176	0.06
177	0.07
178	0.07
179	0.06
180	0.07
181	0.07
182	0.07
183	0.08
184	0.08
185	0.07
186	0.08
187	0.08
188	0.08
189	0.08
190	0.12
191	0.19
192	0.24
193	0.24
194	0.25
195	0.26
196	0.28
197	0.29
198	0.26
199	0.2
200	0.19
201	0.21
202	0.21
203	0.21
204	0.19
205	0.18
206	0.21
207	0.2
208	0.17
209	0.13
210	0.13
211	0.13
212	0.14
213	0.14
214	0.12
215	0.11
216	0.11
217	0.12
218	0.12
219	0.14
220	0.15
221	0.16
222	0.18
223	0.21
224	0.25
225	0.3
226	0.3
227	0.31
228	0.34
229	0.32
230	0.36
231	0.33
232	0.32
233	0.28
234	0.27
235	0.24
236	0.2
237	0.18
238	0.12
239	0.12
240	0.1
241	0.09
242	0.08
243	0.07
244	0.08
245	0.08
246	0.1
247	0.09
248	0.08
249	0.08
250	0.09
251	0.09
252	0.09
253	0.09
254	0.07
255	0.07
256	0.07
257	0.07
258	0.09
259	0.09
260	0.09
261	0.09
262	0.09
263	0.1
264	0.11
265	0.11
266	0.09
267	0.15
268	0.15
269	0.19
270	0.19
271	0.18
272	0.18
273	0.18
274	0.18
275	0.14
276	0.17
277	0.15
278	0.19
279	0.19
280	0.2
281	0.19
282	0.2
283	0.18
284	0.16
285	0.17
286	0.14
287	0.16
288	0.16
289	0.15
290	0.14
291	0.14
292	0.15
293	0.12
294	0.11
295	0.09
296	0.11
297	0.12
298	0.12
299	0.12
300	0.11
301	0.12
302	0.15
303	0.15
304	0.14
305	0.14
306	0.14
307	0.13
308	0.13
309	0.12
310	0.09
311	0.09
312	0.08
313	0.08
314	0.07
315	0.07
316	0.06
317	0.07
318	0.07
319	0.06
320	0.05
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.03
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.03
331	0.03
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.06
342	0.06
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.03
350	0.03
351	0.03
352	0.03
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.05
357	0.06
358	0.07
359	0.08
360	0.09
361	0.09
362	0.12
363	0.13
364	0.14
365	0.16
366	0.16
367	0.15
368	0.14
369	0.14
370	0.11
371	0.12
372	0.12
373	0.11
374	0.11
375	0.14
376	0.18
377	0.19
378	0.23
379	0.25
380	0.28
381	0.32
382	0.36
383	0.38
384	0.36
385	0.37
386	0.33
387	0.29
388	0.25
389	0.2
390	0.15
391	0.11
392	0.09
393	0.07
394	0.07
395	0.08
396	0.08
397	0.07
398	0.07
399	0.07
400	0.06
401	0.07
402	0.06
403	0.06
404	0.06
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.04
412	0.05
413	0.05
414	0.06
415	0.06
416	0.05
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.06
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.07
425	0.08
426	0.08
427	0.09
428	0.1
429	0.11
430	0.13
431	0.14
432	0.13
433	0.12
434	0.14
435	0.13
436	0.12
437	0.14
438	0.13
439	0.11
440	0.14
441	0.14
442	0.13
443	0.14
444	0.14
445	0.15
446	0.18
447	0.22
448	0.24
449	0.31
450	0.36
451	0.38
452	0.39
453	0.38
454	0.4
455	0.43
456	0.45
457	0.43
458	0.45
459	0.44
460	0.48
461	0.51
462	0.49
463	0.4
464	0.34
465	0.29
466	0.21
467	0.19
468	0.13
469	0.1
470	0.07
471	0.06
472	0.06
473	0.07
474	0.1
475	0.1
476	0.1
477	0.12
478	0.14
479	0.16
480	0.24
481	0.23
482	0.21

A0A086TDP0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer