Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A086TDP5

Protein Details
Accession A0A086TDP5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-128WEWVDERMDRRRRQREAREKAEREEYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-117RRQR
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 8.5, cyto_mito 8, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PF14559  TPR_19  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MTGRRDFLSQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPARDGPSEDQIKEALAKRAVQLGLAPDKKKGKEDDTADDDDRYQDPDNETGLFAGGVYDKDDEEADKIWEWVDERMDRRRRQREAREKAEREEYERNNPKIQQQFTDLKRALANVTDDEWANLPEVGDLTGKNRRSKQQLRQRFYAVPDSVLAAARDANEMTTTVADDGMASSADRADGTMTNFAQIGAARDKVLKSRLEQASQSGGGDSVSGSSTSVDPQGYITSLNKMQMSEGLAQVGDINRVRELLQSVVKTNPNNALGWIAAARLEELAGKIVSARKTIDQGCQRCPKSEDAWLENIRLNHDSHNAKVIARRAIEANNRSVRLWVEAMRLENLPANKKRVIRQALDYLPESEALWKEAVNLEEDPEDARLMLAKATELIPLSVDLWLALARLETPENAQKVLNKARKAVPTSYEVWIAAARLQEQLGQGNKVNVMKRAVQVLAKESAMPKREEWIAEAEKCEEEGATVTCGNIIRETLGWGLDEDDDRKDTWMEDARASINRGKYETARAIYAYALRVFVNSKTMWTAAADLERNHGTRESLWQVLEKAVEACPKSEDLWMMLAKEKWQAGEVDGARLVLKRAFNQNPNNEDIWLAAVKLESESGNEEQARKLLEIAREQAPTDRVWTKSVVFERVLGNTETALDLVLQALQLFPSAAKLWMLKGQIYVDLGKMGQARDAYATGVKAVPKSVPLWLLYSRLEEKAGLTVKARSVLDRARLAVPKNPELWCESVRLERRAGNMAQAKSMMAKALQEVPKSGLLWVEQIWHLEPRTQRKPRSLEAIKKVDSDPVLFVAVARIFWGDRKLDKAQSWFEKALVLDSDQGDSWAWYYRFLCQHGTEEKRADVVTKCVLNEPRHGEVWQTVAKDPKNARKGTEEILKLVAAELEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.3
3 0.26
4 0.23
5 0.18
6 0.15
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.29
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.28
37 0.3
38 0.3
39 0.36
40 0.35
41 0.29
42 0.27
43 0.27
44 0.33
45 0.38
46 0.37
47 0.38
48 0.45
49 0.47
50 0.51
51 0.52
52 0.47
53 0.5
54 0.55
55 0.56
56 0.56
57 0.59
58 0.54
59 0.49
60 0.44
61 0.38
62 0.33
63 0.28
64 0.24
65 0.22
66 0.23
67 0.24
68 0.25
69 0.23
70 0.23
71 0.19
72 0.17
73 0.13
74 0.1
75 0.09
76 0.08
77 0.07
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.11
83 0.11
84 0.12
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.13
89 0.13
90 0.14
91 0.14
92 0.15
93 0.19
94 0.23
95 0.27
96 0.37
97 0.46
98 0.52
99 0.62
100 0.69
101 0.73
102 0.78
103 0.85
104 0.86
105 0.87
106 0.9
107 0.9
108 0.85
109 0.8
110 0.79
111 0.7
112 0.66
113 0.65
114 0.59
115 0.59
116 0.64
117 0.63
118 0.59
119 0.59
120 0.61
121 0.6
122 0.58
123 0.51
124 0.48
125 0.53
126 0.5
127 0.58
128 0.5
129 0.44
130 0.41
131 0.39
132 0.33
133 0.27
134 0.27
135 0.18
136 0.2
137 0.19
138 0.18
139 0.18
140 0.17
141 0.15
142 0.13
143 0.12
144 0.1
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.12
151 0.19
152 0.24
153 0.3
154 0.36
155 0.42
156 0.52
157 0.61
158 0.68
159 0.72
160 0.78
161 0.79
162 0.78
163 0.77
164 0.71
165 0.65
166 0.63
167 0.52
168 0.43
169 0.36
170 0.32
171 0.27
172 0.24
173 0.2
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.1
179 0.09
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.08
200 0.1
201 0.14
202 0.14
203 0.14
204 0.14
205 0.14
206 0.13
207 0.12
208 0.14
209 0.12
210 0.13
211 0.13
212 0.15
213 0.16
214 0.19
215 0.23
216 0.22
217 0.22
218 0.31
219 0.35
220 0.36
221 0.36
222 0.35
223 0.35
224 0.33
225 0.31
226 0.21
227 0.17
228 0.13
229 0.12
230 0.09
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.07
237 0.08
238 0.09
239 0.09
240 0.08
241 0.09
242 0.1
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.12
247 0.14
248 0.16
249 0.16
250 0.15
251 0.15
252 0.16
253 0.18
254 0.16
255 0.14
256 0.13
257 0.12
258 0.11
259 0.12
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.12
266 0.12
267 0.12
268 0.14
269 0.14
270 0.16
271 0.17
272 0.18
273 0.22
274 0.26
275 0.24
276 0.25
277 0.27
278 0.25
279 0.24
280 0.22
281 0.19
282 0.15
283 0.15
284 0.13
285 0.08
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.07
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.11
298 0.12
299 0.13
300 0.14
301 0.14
302 0.19
303 0.21
304 0.27
305 0.32
306 0.35
307 0.41
308 0.49
309 0.49
310 0.48
311 0.49
312 0.46
313 0.4
314 0.43
315 0.4
316 0.35
317 0.4
318 0.38
319 0.37
320 0.35
321 0.33
322 0.28
323 0.24
324 0.22
325 0.17
326 0.22
327 0.22
328 0.2
329 0.25
330 0.23
331 0.22
332 0.25
333 0.27
334 0.25
335 0.24
336 0.24
337 0.21
338 0.25
339 0.31
340 0.31
341 0.34
342 0.33
343 0.34
344 0.33
345 0.32
346 0.28
347 0.23
348 0.22
349 0.17
350 0.16
351 0.16
352 0.17
353 0.18
354 0.17
355 0.15
356 0.16
357 0.16
358 0.2
359 0.22
360 0.25
361 0.28
362 0.31
363 0.35
364 0.42
365 0.45
366 0.41
367 0.42
368 0.46
369 0.44
370 0.43
371 0.39
372 0.31
373 0.26
374 0.23
375 0.19
376 0.13
377 0.12
378 0.1
379 0.1
380 0.08
381 0.09
382 0.1
383 0.1
384 0.1
385 0.1
386 0.1
387 0.1
388 0.1
389 0.09
390 0.08
391 0.08
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.05
398 0.04
399 0.05
400 0.06
401 0.07
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.05
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.03
415 0.03
416 0.04
417 0.05
418 0.05
419 0.07
420 0.11
421 0.11
422 0.12
423 0.13
424 0.14
425 0.19
426 0.28
427 0.31
428 0.28
429 0.31
430 0.35
431 0.39
432 0.41
433 0.38
434 0.31
435 0.3
436 0.31
437 0.29
438 0.25
439 0.2
440 0.17
441 0.15
442 0.13
443 0.11
444 0.08
445 0.08
446 0.07
447 0.07
448 0.08
449 0.08
450 0.11
451 0.11
452 0.12
453 0.12
454 0.12
455 0.13
456 0.15
457 0.16
458 0.15
459 0.16
460 0.17
461 0.17
462 0.19
463 0.18
464 0.17
465 0.16
466 0.17
467 0.16
468 0.14
469 0.13
470 0.13
471 0.16
472 0.17
473 0.18
474 0.16
475 0.17
476 0.18
477 0.18
478 0.17
479 0.19
480 0.2
481 0.2
482 0.2
483 0.19
484 0.17
485 0.17
486 0.15
487 0.09
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.07
495 0.08
496 0.08
497 0.07
498 0.07
499 0.06
500 0.06
501 0.07
502 0.07
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.07
507 0.07
508 0.08
509 0.07
510 0.08
511 0.09
512 0.09
513 0.1
514 0.09
515 0.09
516 0.11
517 0.16
518 0.16
519 0.16
520 0.17
521 0.18
522 0.19
523 0.21
524 0.22
525 0.19
526 0.18
527 0.19
528 0.19
529 0.19
530 0.23
531 0.24
532 0.22
533 0.2
534 0.19
535 0.18
536 0.17
537 0.17
538 0.14
539 0.1
540 0.1
541 0.09
542 0.1
543 0.1
544 0.1
545 0.12
546 0.11
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.11
551 0.1
552 0.11
553 0.09
554 0.12
555 0.12
556 0.11
557 0.14
558 0.16
559 0.16
560 0.15
561 0.15
562 0.13
563 0.12
564 0.17
565 0.17
566 0.17
567 0.17
568 0.18
569 0.18
570 0.18
571 0.17
572 0.13
573 0.11
574 0.1
575 0.13
576 0.13
577 0.13
578 0.13
579 0.14
580 0.14
581 0.14
582 0.13
583 0.11
584 0.14
585 0.13
586 0.13
587 0.15
588 0.14
589 0.14
590 0.17
591 0.16
592 0.13
593 0.14
594 0.13
595 0.12
596 0.18
597 0.17
598 0.16
599 0.16
600 0.15
601 0.15
602 0.15
603 0.15
604 0.11
605 0.12
606 0.14
607 0.22
608 0.28
609 0.35
610 0.43
611 0.49
612 0.49
613 0.51
614 0.49
615 0.4
616 0.35
617 0.28
618 0.22
619 0.15
620 0.11
621 0.08
622 0.07
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.05
627 0.06
628 0.1
629 0.1
630 0.13
631 0.14
632 0.15
633 0.15
634 0.16
635 0.17
636 0.13
637 0.15
638 0.16
639 0.18
640 0.2
641 0.23
642 0.25
643 0.25
644 0.25
645 0.26
646 0.24
647 0.2
648 0.22
649 0.23
650 0.2
651 0.22
652 0.23
653 0.22
654 0.27
655 0.29
656 0.28
657 0.25
658 0.26
659 0.25
660 0.25
661 0.26
662 0.2
663 0.17
664 0.13
665 0.13
666 0.11
667 0.09
668 0.08
669 0.05
670 0.05
671 0.05
672 0.05
673 0.04
674 0.04
675 0.04
676 0.04
677 0.04
678 0.04
679 0.04
680 0.06
681 0.07
682 0.07
683 0.09
684 0.09
685 0.11
686 0.15
687 0.16
688 0.15
689 0.16
690 0.16
691 0.16
692 0.17
693 0.17
694 0.13
695 0.12
696 0.11
697 0.12
698 0.13
699 0.12
700 0.13
701 0.12
702 0.13
703 0.13
704 0.14
705 0.13
706 0.12
707 0.12
708 0.11
709 0.13
710 0.14
711 0.13
712 0.14
713 0.13
714 0.14
715 0.15
716 0.16
717 0.16
718 0.16
719 0.19
720 0.19
721 0.22
722 0.21
723 0.24
724 0.24
725 0.23
726 0.22
727 0.19
728 0.18
729 0.22
730 0.23
731 0.2
732 0.19
733 0.2
734 0.21
735 0.26
736 0.25
737 0.2
738 0.23
739 0.27
740 0.31
741 0.31
742 0.32
743 0.33
744 0.36
745 0.37
746 0.38
747 0.39
748 0.38
749 0.4
750 0.38
751 0.35
752 0.34
753 0.36
754 0.32
755 0.29
756 0.27
757 0.31
758 0.36
759 0.37
760 0.37
761 0.35
762 0.37
763 0.39
764 0.37
765 0.37
766 0.38
767 0.36
768 0.35
769 0.32
770 0.29
771 0.25
772 0.25
773 0.18
774 0.12
775 0.11
776 0.12
777 0.2
778 0.24
779 0.23
780 0.24
781 0.26
782 0.28
783 0.28
784 0.26
785 0.19
786 0.16
787 0.17
788 0.16
789 0.16
790 0.14
791 0.16
792 0.17
793 0.19
794 0.19
795 0.22
796 0.28
797 0.34
798 0.44
799 0.51
800 0.56
801 0.62
802 0.68
803 0.69
804 0.73
805 0.73
806 0.73
807 0.73
808 0.76
809 0.69
810 0.65
811 0.6
812 0.54
813 0.46
814 0.38
815 0.3
816 0.23
817 0.22
818 0.18
819 0.17
820 0.16
821 0.15
822 0.13
823 0.12
824 0.11
825 0.11
826 0.13
827 0.17
828 0.17
829 0.19
830 0.26
831 0.31
832 0.36
833 0.4
834 0.44
835 0.49
836 0.52
837 0.56
838 0.51
839 0.46
840 0.43
841 0.38
842 0.35
843 0.28
844 0.22
845 0.2
846 0.19
847 0.2
848 0.17
849 0.18
850 0.15
851 0.14
852 0.13
853 0.17
854 0.16
855 0.19
856 0.2
857 0.26
858 0.31
859 0.33
860 0.37
861 0.32
862 0.39
863 0.45
864 0.51
865 0.49
866 0.48
867 0.46
868 0.44
869 0.41
870 0.38
871 0.31
872 0.3
873 0.31
874 0.3
875 0.3
876 0.35
877 0.42
878 0.41
879 0.46
880 0.48
881 0.46
882 0.46
883 0.45
884 0.4
885 0.35
886 0.38
887 0.34
888 0.3
889 0.29
890 0.34
891 0.36
892 0.41
893 0.47
894 0.52
895 0.57
896 0.57
897 0.57
898 0.56
899 0.59
900 0.58
901 0.59
902 0.51
903 0.44
904 0.44
905 0.4
906 0.33
907 0.29