FuNGI

A0A086SY87

Protein Details

Accession

A0A086SY87

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
22-43	LRPNRPKPSIFAPRKRQPAPGQ	Hydrophilic
177-205	APVAKDSNPKPKKKHKEEKTQFHRTHKTE	Basic
645-665	AMVKRTCDYGPDKRLRRKNTP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-46	GGRPNGAPRPRGGGPLRPNRPKPSIFAPRKRQPAPGQVKG
181-196	KDSNPKPKKKHKEEKT
466-504	DGKDSKDKDKAKSTGHKGSTPQGKKKGKGVKRAGSPAVS
508-519	GNESTRKKKPKS
565-586	PKKKIKLKSGTGKGTPSASRAG

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPPPGGRPNGAPRPRGGGPLRPNRPKPSIFAPRKRQPAPGQVKGPNAAKGNAQIQQKTIEQRRRENGGWSEPAPEGAKDIPIMTTKKALLDGLRLHMMKLSTPKLDGKPIDPTDDDEFARPVTLQRRDPRQPAAAREIKVEEPERPPMDEQEAERLEKIKAEKEAQKAIDQAKIAPVAKDSNPKPKKKHKEEKTQFHRTHKTEAARKEAELRYEEALPWHLEDADGKNVWVGEYIASLSGNQVAFRIDGSSFRMVPLEKFYKFTSKPAFKPLSIDEAEDFMGKKMDVGRWVMKGEEKKAEQAELEATRRLLGASGRMVKTESSTFKAASRAEKMEHDDLDVSGDEFQDDDEATTFERNNDEDEKDSKERIRREQLGANLFGEGDEKEVERELNEELKEELERRKYGKSTKKALIKRDREDVYESDDSEDNPWSSSSDDDSSEDEDEEDDESKGEGKGGQGETKDGKDSKDKDKAKSTGHKGSTPQGKKKGKGVKRAGSPAVSESSGNESTRKKKPKSSTPAVGSRAGTPSLQHAAVKRKAQTGAGPSSDAEVTVGEMSDGAGPKKKIKLKSGTGKGTPSASRAGSPNPPRGSPPPGSPTGTVTPAEILEKIPPEGIVIGDLIKFFHGRLGEGPGRMPRADWIAMVKRTCDYGPDKRLRRKNTP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.54
3	0.53
4	0.56
5	0.5
6	0.49
7	0.52
8	0.61
9	0.68
10	0.71
11	0.77
12	0.76
13	0.8
14	0.73
15	0.69
16	0.68
17	0.69
18	0.7
19	0.73
20	0.76
21	0.77
22	0.84
23	0.82
24	0.8
25	0.77
26	0.78
27	0.77
28	0.75
29	0.74
30	0.7
31	0.71
32	0.69
33	0.64
34	0.58
35	0.52
36	0.44
37	0.38
38	0.37
39	0.37
40	0.37
41	0.39
42	0.34
43	0.33
44	0.36
45	0.38
46	0.43
47	0.48
48	0.51
49	0.53
50	0.6
51	0.66
52	0.69
53	0.67
54	0.65
55	0.63
56	0.61
57	0.59
58	0.5
59	0.47
60	0.39
61	0.4
62	0.33
63	0.26
64	0.21
65	0.18
66	0.18
67	0.15
68	0.15
69	0.14
70	0.18
71	0.2
72	0.19
73	0.23
74	0.22
75	0.23
76	0.24
77	0.24
78	0.2
79	0.25
80	0.26
81	0.25
82	0.3
83	0.29
84	0.27
85	0.28
86	0.27
87	0.24
88	0.27
89	0.27
90	0.23
91	0.26
92	0.32
93	0.32
94	0.4
95	0.38
96	0.35
97	0.4
98	0.4
99	0.42
100	0.36
101	0.38
102	0.35
103	0.36
104	0.34
105	0.26
106	0.25
107	0.2
108	0.2
109	0.16
110	0.16
111	0.22
112	0.28
113	0.34
114	0.41
115	0.5
116	0.57
117	0.62
118	0.63
119	0.64
120	0.62
121	0.6
122	0.62
123	0.59
124	0.53
125	0.51
126	0.48
127	0.41
128	0.41
129	0.37
130	0.32
131	0.29
132	0.35
133	0.34
134	0.33
135	0.33
136	0.31
137	0.33
138	0.31
139	0.29
140	0.3
141	0.31
142	0.29
143	0.29
144	0.28
145	0.23
146	0.24
147	0.25
148	0.21
149	0.24
150	0.29
151	0.34
152	0.38
153	0.44
154	0.42
155	0.42
156	0.42
157	0.4
158	0.37
159	0.31
160	0.27
161	0.23
162	0.25
163	0.24
164	0.2
165	0.19
166	0.19
167	0.22
168	0.3
169	0.3
170	0.37
171	0.45
172	0.52
173	0.6
174	0.67
175	0.76
176	0.78
177	0.86
178	0.85
179	0.88
180	0.91
181	0.93
182	0.92
183	0.92
184	0.87
185	0.85
186	0.84
187	0.75
188	0.72
189	0.68
190	0.66
191	0.63
192	0.61
193	0.6
194	0.52
195	0.5
196	0.51
197	0.46
198	0.41
199	0.36
200	0.33
201	0.26
202	0.26
203	0.25
204	0.18
205	0.18
206	0.15
207	0.14
208	0.12
209	0.1
210	0.09
211	0.11
212	0.12
213	0.14
214	0.13
215	0.12
216	0.12
217	0.13
218	0.12
219	0.11
220	0.09
221	0.05
222	0.05
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.05
228	0.08
229	0.08
230	0.07
231	0.07
232	0.08
233	0.08
234	0.08
235	0.09
236	0.06
237	0.08
238	0.11
239	0.13
240	0.13
241	0.13
242	0.14
243	0.13
244	0.14
245	0.19
246	0.21
247	0.19
248	0.21
249	0.23
250	0.29
251	0.3
252	0.35
253	0.38
254	0.39
255	0.41
256	0.47
257	0.49
258	0.41
259	0.44
260	0.4
261	0.36
262	0.31
263	0.29
264	0.21
265	0.19
266	0.19
267	0.16
268	0.14
269	0.08
270	0.08
271	0.07
272	0.08
273	0.09
274	0.1
275	0.11
276	0.14
277	0.16
278	0.17
279	0.18
280	0.18
281	0.2
282	0.21
283	0.22
284	0.24
285	0.22
286	0.24
287	0.24
288	0.24
289	0.2
290	0.18
291	0.19
292	0.16
293	0.17
294	0.14
295	0.13
296	0.13
297	0.13
298	0.12
299	0.09
300	0.07
301	0.08
302	0.1
303	0.15
304	0.15
305	0.15
306	0.16
307	0.15
308	0.16
309	0.18
310	0.17
311	0.15
312	0.16
313	0.17
314	0.18
315	0.21
316	0.21
317	0.2
318	0.22
319	0.2
320	0.2
321	0.21
322	0.24
323	0.23
324	0.22
325	0.19
326	0.16
327	0.14
328	0.14
329	0.12
330	0.08
331	0.06
332	0.06
333	0.05
334	0.05
335	0.05
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.05
342	0.06
343	0.06
344	0.07
345	0.08
346	0.08
347	0.1
348	0.13
349	0.13
350	0.15
351	0.17
352	0.21
353	0.22
354	0.24
355	0.25
356	0.28
357	0.32
358	0.37
359	0.43
360	0.42
361	0.44
362	0.47
363	0.48
364	0.46
365	0.42
366	0.35
367	0.27
368	0.22
369	0.18
370	0.15
371	0.09
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.07
377	0.07
378	0.06
379	0.07
380	0.08
381	0.11
382	0.11
383	0.11
384	0.11
385	0.12
386	0.13
387	0.14
388	0.17
389	0.18
390	0.21
391	0.22
392	0.26
393	0.29
394	0.38
395	0.46
396	0.49
397	0.53
398	0.58
399	0.65
400	0.66
401	0.72
402	0.73
403	0.72
404	0.68
405	0.68
406	0.63
407	0.56
408	0.54
409	0.45
410	0.41
411	0.34
412	0.3
413	0.24
414	0.23
415	0.21
416	0.19
417	0.19
418	0.12
419	0.11
420	0.11
421	0.09
422	0.1
423	0.1
424	0.11
425	0.11
426	0.12
427	0.13
428	0.14
429	0.15
430	0.15
431	0.15
432	0.12
433	0.1
434	0.1
435	0.1
436	0.09
437	0.07
438	0.07
439	0.07
440	0.08
441	0.08
442	0.08
443	0.08
444	0.07
445	0.13
446	0.14
447	0.16
448	0.16
449	0.19
450	0.21
451	0.21
452	0.25
453	0.2
454	0.21
455	0.27
456	0.31
457	0.37
458	0.45
459	0.49
460	0.51
461	0.59
462	0.62
463	0.62
464	0.67
465	0.66
466	0.65
467	0.63
468	0.61
469	0.55
470	0.58
471	0.6
472	0.58
473	0.59
474	0.6
475	0.64
476	0.63
477	0.69
478	0.72
479	0.69
480	0.71
481	0.73
482	0.7
483	0.71
484	0.74
485	0.69
486	0.6
487	0.54
488	0.45
489	0.38
490	0.31
491	0.23
492	0.18
493	0.2
494	0.21
495	0.21
496	0.22
497	0.25
498	0.32
499	0.42
500	0.5
501	0.5
502	0.56
503	0.65
504	0.72
505	0.77
506	0.79
507	0.79
508	0.77
509	0.8
510	0.74
511	0.69
512	0.59
513	0.51
514	0.44
515	0.35
516	0.28
517	0.2
518	0.21
519	0.2
520	0.2
521	0.19
522	0.22
523	0.3
524	0.36
525	0.4
526	0.4
527	0.41
528	0.42
529	0.42
530	0.42
531	0.4
532	0.4
533	0.36
534	0.34
535	0.29
536	0.29
537	0.27
538	0.22
539	0.15
540	0.09
541	0.09
542	0.08
543	0.08
544	0.05
545	0.05
546	0.06
547	0.08
548	0.1
549	0.1
550	0.15
551	0.17
552	0.23
553	0.31
554	0.38
555	0.42
556	0.5
557	0.58
558	0.63
559	0.72
560	0.76
561	0.76
562	0.73
563	0.69
564	0.62
565	0.58
566	0.49
567	0.41
568	0.35
569	0.28
570	0.27
571	0.27
572	0.29
573	0.34
574	0.39
575	0.46
576	0.45
577	0.45
578	0.48
579	0.51
580	0.53
581	0.48
582	0.48
583	0.46
584	0.47
585	0.49
586	0.44
587	0.45
588	0.41
589	0.4
590	0.33
591	0.27
592	0.24
593	0.21
594	0.22
595	0.17
596	0.14
597	0.15
598	0.17
599	0.17
600	0.16
601	0.15
602	0.14
603	0.14
604	0.13
605	0.1
606	0.09
607	0.09
608	0.09
609	0.1
610	0.09
611	0.1
612	0.1
613	0.09
614	0.12
615	0.12
616	0.13
617	0.15
618	0.23
619	0.26
620	0.26
621	0.3
622	0.32
623	0.34
624	0.33
625	0.32
626	0.26
627	0.28
628	0.28
629	0.26
630	0.29
631	0.33
632	0.39
633	0.39
634	0.38
635	0.33
636	0.35
637	0.34
638	0.33
639	0.33
640	0.37
641	0.47
642	0.55
643	0.64
644	0.71
645	0.81

A0A086SY87

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer