Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A086SYC4

Protein Details
Accession A0A086SYC4    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-74ATLHSEATNPKRRSRRIKDRYTTIMHDHydrophilic
244-263YPLEHPKQPEHPTKNRPDKSBasic
560-585ESREAAKKARPKRKKSTKGAAGKKGVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
39-42KRKK
58-63KRRSRR
564-584AAKKARPKRKKSTKGAAGKKG
Subcellular Location(s) mito 17.5, cyto_mito 10, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015353  Rubisco_LSMT_subst-bd  
IPR036464  Rubisco_LSMT_subst-bd_sf  
IPR001214  SET_dom  
IPR046341  SET_dom_sf  
IPR044430  SETD6_SET  
IPR004601  UvdE  
IPR036237  Xyl_isomerase-like_sf  
Gene Ontology GO:0004519  F:endonuclease activity  
GO:0016279  F:protein-lysine N-methyltransferase activity  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0018022  P:peptidyl-lysine methylation  
GO:0009411  P:response to UV  
Pfam View protein in Pfam  
PF09273  Rubis-subs-bind  
PF00856  SET  
PF03851  UvdE  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50280  SET  
CDD cd19178  SET_SETD6  
Amino Acid Sequences MPIRLTAVIELSTLSHAPRIIATRVRTQTVRAASAMPGKRKKDKTGDATLHSEATNPKRRSRRIKDRYTTIMHDNVPTGTQAILDRRPTSPSQSSRETWKPKADMQYAMRHLKEMESELQSVVKRQQLAVETSSLDCATESTTEGERLPRDPDHYVLDEDEHKDPDPLQQAPLDRHDAELAQGDVVVLRDGDADAAERGARRAPPVNTELTPIQACLNTYLRASNPPVFSSRTCRLSSIIDHRYPLEHPKQPEHPTKNRPDKSQEPDKELGLKFVRDLGLANARDTVKMLRWNDKYGIKFMRLSSDMFPFASHEEHGYKLEPFAAKLLAQVGKVAAELGHRLTTHPGQFTQLGSPRKEVISAAIRDLEYHAEMLSLLRLPDQMDRDAVMILHMGGTYGDKAATLDRFRETYKTLSAGVKRRLVLENDDVSWCVHDLLPICEELNIPLVLDFHHHNIIFDPSIREGTLDIIDLFERILSTWSRKGIRPKMHYSEQTPSAITPRERRKHSARVRTLPPCPPDMDLMIEAKDKEQAVFELMRTFKLPGWDLFNDIVPYERDDESREAAKKARPKRKKSTKGAAGKKGVAKDQDNDDDEIEVPERIVSEEDFGMGGPERRVFWPEGMEEWLRPRKREIQKVATEDIAPDTTLFTIPRKAIINVLTSDLPKKLPSVFTPEGGRVDGGDDDEPRQNSWSYLILVMVYEFLRGEGSSWKPYFDVLPQAFDTPMFWSKDELTELQASPLLGKVGKEEAEGMFRANILPVIRQNPELFAASAEKTDGELVELAHRMGSTIMAYAFDLENEDEQNNEDDEEWVEDREGESMLGMVPMADILNADAEFNAHVNHGDDALTVTALRTIRAGEEILNYYGPLPNSELLRRYGYVTPKHSRYDVVELPWEIVEASLTSELAVPAETLGKIRAGIEESDVLEDSFILERETPEPNPDGTFAAGSPTFTAPLDESLVAQLKDFCKAIKKVNPDLIPDKRKRDGVIEAVLAKSLQALEARYPTDVVEDERLLREGGLGQRRRMAIEVRLGEKKLLREARNFLRGQQDEGSEPSKRAKTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.12
4 0.13
5 0.16
6 0.2
7 0.23
8 0.29
9 0.32
10 0.4
11 0.44
12 0.48
13 0.46
14 0.45
15 0.47
16 0.46
17 0.45
18 0.36
19 0.34
20 0.32
21 0.41
22 0.44
23 0.46
24 0.49
25 0.53
26 0.62
27 0.67
28 0.73
29 0.74
30 0.77
31 0.76
32 0.79
33 0.79
34 0.74
35 0.73
36 0.65
37 0.56
38 0.46
39 0.41
40 0.37
41 0.4
42 0.45
43 0.43
44 0.5
45 0.58
46 0.68
47 0.76
48 0.8
49 0.82
50 0.83
51 0.9
52 0.91
53 0.89
54 0.88
55 0.83
56 0.77
57 0.71
58 0.67
59 0.58
60 0.5
61 0.43
62 0.35
63 0.29
64 0.25
65 0.2
66 0.13
67 0.13
68 0.14
69 0.18
70 0.23
71 0.27
72 0.29
73 0.29
74 0.34
75 0.35
76 0.4
77 0.43
78 0.45
79 0.47
80 0.51
81 0.53
82 0.56
83 0.64
84 0.65
85 0.62
86 0.63
87 0.61
88 0.61
89 0.68
90 0.64
91 0.62
92 0.59
93 0.62
94 0.61
95 0.63
96 0.56
97 0.48
98 0.45
99 0.38
100 0.36
101 0.3
102 0.28
103 0.25
104 0.26
105 0.25
106 0.28
107 0.27
108 0.27
109 0.28
110 0.26
111 0.24
112 0.23
113 0.27
114 0.28
115 0.31
116 0.3
117 0.27
118 0.25
119 0.24
120 0.25
121 0.2
122 0.16
123 0.12
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.1
128 0.12
129 0.13
130 0.15
131 0.16
132 0.2
133 0.2
134 0.21
135 0.24
136 0.24
137 0.27
138 0.28
139 0.29
140 0.3
141 0.31
142 0.3
143 0.27
144 0.27
145 0.27
146 0.28
147 0.27
148 0.24
149 0.22
150 0.22
151 0.21
152 0.24
153 0.26
154 0.24
155 0.23
156 0.25
157 0.28
158 0.3
159 0.34
160 0.33
161 0.28
162 0.28
163 0.28
164 0.24
165 0.22
166 0.21
167 0.17
168 0.11
169 0.11
170 0.1
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.08
184 0.08
185 0.09
186 0.12
187 0.13
188 0.16
189 0.23
190 0.24
191 0.29
192 0.32
193 0.35
194 0.32
195 0.35
196 0.32
197 0.29
198 0.27
199 0.22
200 0.2
201 0.17
202 0.17
203 0.17
204 0.19
205 0.16
206 0.17
207 0.18
208 0.18
209 0.22
210 0.26
211 0.27
212 0.26
213 0.27
214 0.29
215 0.31
216 0.32
217 0.35
218 0.37
219 0.36
220 0.36
221 0.35
222 0.35
223 0.35
224 0.39
225 0.41
226 0.42
227 0.39
228 0.39
229 0.38
230 0.38
231 0.37
232 0.39
233 0.37
234 0.35
235 0.37
236 0.43
237 0.5
238 0.56
239 0.64
240 0.64
241 0.66
242 0.69
243 0.76
244 0.81
245 0.78
246 0.77
247 0.74
248 0.75
249 0.73
250 0.75
251 0.69
252 0.65
253 0.62
254 0.57
255 0.57
256 0.48
257 0.46
258 0.37
259 0.32
260 0.25
261 0.26
262 0.25
263 0.17
264 0.18
265 0.15
266 0.21
267 0.21
268 0.21
269 0.22
270 0.22
271 0.22
272 0.22
273 0.21
274 0.17
275 0.23
276 0.26
277 0.31
278 0.34
279 0.38
280 0.41
281 0.45
282 0.43
283 0.43
284 0.43
285 0.37
286 0.37
287 0.34
288 0.35
289 0.31
290 0.31
291 0.27
292 0.27
293 0.25
294 0.22
295 0.21
296 0.16
297 0.16
298 0.15
299 0.13
300 0.13
301 0.13
302 0.14
303 0.15
304 0.15
305 0.14
306 0.13
307 0.16
308 0.14
309 0.13
310 0.13
311 0.13
312 0.11
313 0.12
314 0.15
315 0.13
316 0.13
317 0.13
318 0.12
319 0.11
320 0.11
321 0.1
322 0.07
323 0.06
324 0.07
325 0.08
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.14
330 0.17
331 0.19
332 0.2
333 0.19
334 0.2
335 0.21
336 0.21
337 0.23
338 0.26
339 0.28
340 0.28
341 0.29
342 0.28
343 0.27
344 0.27
345 0.22
346 0.2
347 0.22
348 0.22
349 0.21
350 0.21
351 0.21
352 0.21
353 0.21
354 0.18
355 0.11
356 0.1
357 0.09
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.05
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.11
368 0.13
369 0.13
370 0.13
371 0.13
372 0.13
373 0.13
374 0.12
375 0.09
376 0.06
377 0.05
378 0.05
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.05
388 0.06
389 0.1
390 0.1
391 0.12
392 0.13
393 0.15
394 0.16
395 0.18
396 0.18
397 0.18
398 0.18
399 0.18
400 0.19
401 0.22
402 0.27
403 0.32
404 0.36
405 0.37
406 0.36
407 0.37
408 0.37
409 0.35
410 0.33
411 0.3
412 0.27
413 0.24
414 0.24
415 0.22
416 0.19
417 0.17
418 0.13
419 0.09
420 0.07
421 0.07
422 0.08
423 0.09
424 0.1
425 0.1
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.08
430 0.09
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.06
436 0.08
437 0.08
438 0.08
439 0.11
440 0.11
441 0.11
442 0.12
443 0.14
444 0.13
445 0.13
446 0.12
447 0.1
448 0.11
449 0.1
450 0.1
451 0.08
452 0.09
453 0.08
454 0.07
455 0.07
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.04
461 0.04
462 0.04
463 0.05
464 0.06
465 0.09
466 0.11
467 0.16
468 0.18
469 0.22
470 0.31
471 0.38
472 0.46
473 0.49
474 0.54
475 0.57
476 0.6
477 0.6
478 0.55
479 0.51
480 0.45
481 0.39
482 0.32
483 0.26
484 0.23
485 0.23
486 0.21
487 0.24
488 0.31
489 0.38
490 0.41
491 0.47
492 0.51
493 0.59
494 0.66
495 0.68
496 0.66
497 0.66
498 0.7
499 0.7
500 0.67
501 0.62
502 0.54
503 0.46
504 0.39
505 0.33
506 0.27
507 0.22
508 0.19
509 0.14
510 0.13
511 0.11
512 0.11
513 0.1
514 0.09
515 0.1
516 0.09
517 0.08
518 0.08
519 0.07
520 0.09
521 0.09
522 0.09
523 0.11
524 0.11
525 0.12
526 0.12
527 0.13
528 0.12
529 0.14
530 0.15
531 0.12
532 0.17
533 0.17
534 0.18
535 0.18
536 0.17
537 0.15
538 0.14
539 0.14
540 0.09
541 0.1
542 0.1
543 0.1
544 0.1
545 0.12
546 0.14
547 0.15
548 0.19
549 0.19
550 0.18
551 0.21
552 0.24
553 0.29
554 0.38
555 0.47
556 0.52
557 0.6
558 0.7
559 0.78
560 0.85
561 0.86
562 0.87
563 0.86
564 0.86
565 0.86
566 0.83
567 0.75
568 0.68
569 0.61
570 0.53
571 0.45
572 0.39
573 0.32
574 0.27
575 0.28
576 0.28
577 0.27
578 0.26
579 0.23
580 0.2
581 0.19
582 0.17
583 0.13
584 0.08
585 0.07
586 0.06
587 0.06
588 0.05
589 0.06
590 0.05
591 0.06
592 0.06
593 0.06
594 0.06
595 0.06
596 0.06
597 0.06
598 0.07
599 0.06
600 0.07
601 0.08
602 0.09
603 0.12
604 0.12
605 0.13
606 0.14
607 0.14
608 0.14
609 0.16
610 0.16
611 0.14
612 0.19
613 0.26
614 0.25
615 0.25
616 0.28
617 0.35
618 0.43
619 0.52
620 0.55
621 0.56
622 0.61
623 0.65
624 0.63
625 0.54
626 0.45
627 0.36
628 0.29
629 0.2
630 0.13
631 0.09
632 0.08
633 0.07
634 0.08
635 0.08
636 0.08
637 0.1
638 0.11
639 0.14
640 0.15
641 0.15
642 0.17
643 0.19
644 0.2
645 0.18
646 0.2
647 0.18
648 0.17
649 0.18
650 0.16
651 0.14
652 0.12
653 0.13
654 0.13
655 0.14
656 0.15
657 0.23
658 0.23
659 0.25
660 0.26
661 0.27
662 0.26
663 0.24
664 0.22
665 0.13
666 0.12
667 0.1
668 0.1
669 0.09
670 0.09
671 0.1
672 0.14
673 0.14
674 0.14
675 0.15
676 0.14
677 0.14
678 0.15
679 0.14
680 0.12
681 0.12
682 0.11
683 0.1
684 0.09
685 0.09
686 0.08
687 0.06
688 0.05
689 0.05
690 0.05
691 0.05
692 0.05
693 0.06
694 0.1
695 0.13
696 0.19
697 0.2
698 0.2
699 0.2
700 0.21
701 0.21
702 0.18
703 0.24
704 0.18
705 0.21
706 0.21
707 0.22
708 0.22
709 0.2
710 0.19
711 0.14
712 0.18
713 0.16
714 0.15
715 0.16
716 0.17
717 0.19
718 0.21
719 0.18
720 0.16
721 0.18
722 0.18
723 0.16
724 0.17
725 0.14
726 0.12
727 0.12
728 0.1
729 0.08
730 0.08
731 0.09
732 0.11
733 0.11
734 0.11
735 0.12
736 0.12
737 0.13
738 0.14
739 0.13
740 0.1
741 0.1
742 0.1
743 0.09
744 0.1
745 0.08
746 0.1
747 0.12
748 0.16
749 0.17
750 0.19
751 0.19
752 0.19
753 0.2
754 0.2
755 0.17
756 0.14
757 0.15
758 0.14
759 0.13
760 0.12
761 0.1
762 0.09
763 0.1
764 0.08
765 0.07
766 0.07
767 0.07
768 0.09
769 0.1
770 0.09
771 0.09
772 0.09
773 0.08
774 0.08
775 0.08
776 0.06
777 0.06
778 0.06
779 0.06
780 0.06
781 0.08
782 0.07
783 0.07
784 0.08
785 0.08
786 0.08
787 0.09
788 0.1
789 0.08
790 0.1
791 0.11
792 0.1
793 0.1
794 0.1
795 0.09
796 0.1
797 0.12
798 0.12
799 0.11
800 0.11
801 0.1
802 0.1
803 0.1
804 0.1
805 0.07
806 0.06
807 0.06
808 0.06
809 0.05
810 0.05
811 0.04
812 0.03
813 0.04
814 0.04
815 0.03
816 0.03
817 0.03
818 0.05
819 0.05
820 0.05
821 0.05
822 0.05
823 0.06
824 0.06
825 0.07
826 0.06
827 0.06
828 0.08
829 0.08
830 0.08
831 0.08
832 0.08
833 0.08
834 0.08
835 0.08
836 0.06
837 0.06
838 0.09
839 0.09
840 0.09
841 0.09
842 0.09
843 0.1
844 0.11
845 0.12
846 0.1
847 0.13
848 0.15
849 0.16
850 0.15
851 0.14
852 0.14
853 0.16
854 0.15
855 0.13
856 0.13
857 0.14
858 0.17
859 0.2
860 0.22
861 0.22
862 0.25
863 0.25
864 0.26
865 0.3
866 0.34
867 0.38
868 0.44
869 0.49
870 0.5
871 0.53
872 0.51
873 0.48
874 0.45
875 0.46
876 0.42
877 0.37
878 0.37
879 0.34
880 0.34
881 0.31
882 0.26
883 0.18
884 0.14
885 0.11
886 0.06
887 0.08
888 0.07
889 0.07
890 0.07
891 0.08
892 0.08
893 0.08
894 0.07
895 0.06
896 0.06
897 0.08
898 0.08
899 0.08
900 0.09
901 0.09
902 0.09
903 0.1
904 0.11
905 0.12
906 0.12
907 0.14
908 0.15
909 0.15
910 0.16
911 0.16
912 0.14
913 0.12
914 0.11
915 0.1
916 0.09
917 0.09
918 0.08
919 0.09
920 0.11
921 0.14
922 0.18
923 0.17
924 0.2
925 0.22
926 0.22
927 0.23
928 0.22
929 0.21
930 0.18
931 0.18
932 0.14
933 0.16
934 0.15
935 0.14
936 0.15
937 0.14
938 0.14
939 0.14
940 0.15
941 0.12
942 0.14
943 0.16
944 0.14
945 0.14
946 0.16
947 0.2
948 0.18
949 0.18
950 0.21
951 0.19
952 0.22
953 0.22
954 0.2
955 0.25
956 0.3
957 0.38
958 0.41
959 0.48
960 0.53
961 0.62
962 0.63
963 0.62
964 0.66
965 0.67
966 0.7
967 0.69
968 0.69
969 0.65
970 0.66
971 0.61
972 0.58
973 0.55
974 0.51
975 0.49
976 0.45
977 0.41
978 0.37
979 0.35
980 0.29
981 0.22
982 0.17
983 0.12
984 0.1
985 0.1
986 0.11
987 0.14
988 0.19
989 0.2
990 0.2
991 0.2
992 0.19
993 0.2
994 0.19
995 0.19
996 0.2
997 0.2
998 0.22
999 0.23
1000 0.24
1001 0.21
1002 0.2
1003 0.17
1004 0.18
1005 0.24
1006 0.31
1007 0.34
1008 0.35
1009 0.41
1010 0.42
1011 0.43
1012 0.41
1013 0.38
1014 0.34
1015 0.39
1016 0.42
1017 0.42
1018 0.47
1019 0.46
1020 0.47
1021 0.46
1022 0.43
1023 0.44
1024 0.47
1025 0.46
1026 0.48
1027 0.56
1028 0.61
1029 0.66
1030 0.63
1031 0.57
1032 0.59
1033 0.56
1034 0.53
1035 0.49
1036 0.43
1037 0.36
1038 0.4
1039 0.4
1040 0.31
1041 0.32
1042 0.35