Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A086T9V4

Protein Details
Accession A0A086T9V4    Localization Confidence High Confidence Score 21.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
121-145HTVSDKASKKKVKKTNNLKRKAPSDHydrophilic
163-182ESENEKPKAKKQKRAPSSSSHydrophilic
304-332SSDSDSKKKTKAKAKKAAKSNAKKDPKAKHydrophilic
364-390LPPDPVQLKNEKKKNERFSRIPKDVKVHydrophilic
412-438LIVTKGKGFTKEKNKKKKGAYRGGMIDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
127-141ASKKKVKKTNNLKRK
169-176PKAKKQKR
310-335KKKTKAKAKKAAKSNAKKDPKAKAEK
418-431KGFTKEKNKKKKGA
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSGVGNGPPAWLFSNNSSNPLTTTTPTDPMAKKQKSGDTVAKKPGKDAALPPPAVLGLVDSFLSQYSPAAHTALKKEREKKGWEMATPSKESTLTSLEKVLTPSAAAAPSDDVEMKDSSSHTVSDKASKKKVKKTNNLKRKAPSDSSSSDSDSSSDGDSSDSESENEKPKAKKQKRAPSSSSSSSSDSSSSSSSSSSDSSSDSSSDSSDSPSDSSSDSSSDSSSDFSSDSSSDSSSDSSSNSSSDSSSDSSSDSSSDSSSGSSSDSDSDSEAEEAAKVPLPQSDSDSDSDSDSSSSSSSSSSSSSDSDSKKKTKAKAKKAAKSNAKKDPKAKAEKAVNGGNSSSSSVTLDNNTTGAATVADPPLPPDPVQLKNEKKKNERFSRIPKDVKVDPRFASNAYVPVDYSQRAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKKGAYRGGMIDISHKGAVYFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.31
3 0.35
4 0.35
5 0.32
6 0.32
7 0.33
8 0.31
9 0.23
10 0.29
11 0.28
12 0.3
13 0.31
14 0.38
15 0.36
16 0.42
17 0.51
18 0.48
19 0.49
20 0.52
21 0.58
22 0.55
23 0.6
24 0.61
25 0.59
26 0.64
27 0.69
28 0.69
29 0.61
30 0.58
31 0.57
32 0.5
33 0.46
34 0.44
35 0.43
36 0.46
37 0.46
38 0.44
39 0.38
40 0.34
41 0.3
42 0.24
43 0.15
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.08
51 0.06
52 0.07
53 0.08
54 0.1
55 0.11
56 0.13
57 0.14
58 0.18
59 0.26
60 0.34
61 0.4
62 0.47
63 0.54
64 0.61
65 0.67
66 0.7
67 0.68
68 0.7
69 0.67
70 0.62
71 0.61
72 0.6
73 0.58
74 0.55
75 0.48
76 0.4
77 0.34
78 0.32
79 0.27
80 0.25
81 0.22
82 0.2
83 0.21
84 0.21
85 0.22
86 0.23
87 0.2
88 0.15
89 0.13
90 0.12
91 0.11
92 0.11
93 0.1
94 0.09
95 0.09
96 0.1
97 0.11
98 0.1
99 0.09
100 0.11
101 0.11
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.12
106 0.13
107 0.13
108 0.12
109 0.16
110 0.18
111 0.25
112 0.32
113 0.37
114 0.45
115 0.53
116 0.6
117 0.65
118 0.74
119 0.75
120 0.79
121 0.83
122 0.86
123 0.88
124 0.89
125 0.86
126 0.83
127 0.79
128 0.75
129 0.69
130 0.61
131 0.56
132 0.51
133 0.47
134 0.42
135 0.38
136 0.32
137 0.26
138 0.24
139 0.18
140 0.16
141 0.13
142 0.11
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.11
151 0.14
152 0.2
153 0.23
154 0.26
155 0.27
156 0.35
157 0.46
158 0.52
159 0.59
160 0.63
161 0.71
162 0.74
163 0.81
164 0.78
165 0.74
166 0.73
167 0.68
168 0.62
169 0.54
170 0.47
171 0.39
172 0.34
173 0.27
174 0.21
175 0.18
176 0.14
177 0.12
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.11
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.1
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.08
201 0.09
202 0.08
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.08
223 0.09
224 0.08
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.09
267 0.1
268 0.11
269 0.13
270 0.15
271 0.16
272 0.17
273 0.19
274 0.18
275 0.17
276 0.17
277 0.14
278 0.12
279 0.1
280 0.09
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.09
288 0.09
289 0.11
290 0.12
291 0.14
292 0.2
293 0.23
294 0.29
295 0.34
296 0.38
297 0.44
298 0.5
299 0.55
300 0.6
301 0.67
302 0.71
303 0.76
304 0.81
305 0.82
306 0.85
307 0.87
308 0.87
309 0.87
310 0.84
311 0.84
312 0.83
313 0.81
314 0.78
315 0.78
316 0.77
317 0.77
318 0.72
319 0.7
320 0.68
321 0.67
322 0.66
323 0.6
324 0.52
325 0.43
326 0.4
327 0.32
328 0.25
329 0.21
330 0.16
331 0.12
332 0.12
333 0.11
334 0.12
335 0.13
336 0.14
337 0.13
338 0.12
339 0.12
340 0.11
341 0.1
342 0.09
343 0.07
344 0.07
345 0.09
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.12
350 0.14
351 0.15
352 0.15
353 0.18
354 0.22
355 0.27
356 0.32
357 0.39
358 0.47
359 0.55
360 0.63
361 0.67
362 0.72
363 0.76
364 0.82
365 0.84
366 0.83
367 0.83
368 0.87
369 0.88
370 0.88
371 0.85
372 0.78
373 0.74
374 0.72
375 0.73
376 0.68
377 0.64
378 0.55
379 0.53
380 0.51
381 0.46
382 0.42
383 0.34
384 0.33
385 0.29
386 0.28
387 0.23
388 0.24
389 0.25
390 0.22
391 0.21
392 0.19
393 0.2
394 0.21
395 0.21
396 0.22
397 0.22
398 0.23
399 0.28
400 0.29
401 0.26
402 0.26
403 0.3
404 0.3
405 0.35
406 0.37
407 0.4
408 0.48
409 0.59
410 0.68
411 0.75
412 0.81
413 0.83
414 0.89
415 0.9
416 0.89
417 0.9
418 0.86
419 0.84
420 0.8
421 0.75
422 0.66
423 0.57
424 0.5
425 0.41
426 0.37
427 0.29
428 0.23
429 0.18