Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A086TFB1

Protein Details
Accession A0A086TFB1    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
114-140ALETTEPPKRERKRKRKDENEDLESKYBasic
514-544SNGPPKGLKLGKKSKGKKAAKPTNRGARRAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-130PKRERKRKRK
414-423RAKDPRKTAL
426-433EREREKLR
443-479KYKYKATPEERSLAGRAGRLLGRAGAAQERRKSSGKG
517-551PPKGLKLGKKSKGKKAAKPTNRGARRAAEWRKTKN
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 6.5, cyto_mito 6.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12394  RRM1_RBM34  
Amino Acid Sequences MGKKTTRLVAPSAAIDPTLDALFSASAGPVQAPPKSRYSATLGTRPQGAEEDGSDDDDEVLSEASQELDYEDDEDDEEGDSEGSDKISHEPESSDEAETSEDAEASEEADEPKALETTEPPKRERKRKRKDENEDLESKYLAKLAKDDEPEPAEKRQKSDAPKATKNGEDDSDDDDAIPQHESLTKDDKASELEKADRTVFIANASSEAISSKPAKKTLLNHLSSVLDKDAGEKIESIRFRSVAFSVGSMPKRAAYITKQLMEATTKSTNAYVVYSTAAGARKSVSALNGTEVLGRHIRVDSVSHPAPTAHRRCVFVGNLGFVDDESVLNDTEDGETIKKKRNKVPSDVEEGLWRVFGKQGRVENVRVVRDPKTRVGKGFAYVQFYDANSVESALLLDGKKFPPMLPRALRVTRAKDPRKTALAQEREREKLRDANGAVKSTKYKYKATPEERSLAGRAGRLLGRAGAAQERRKSSGKGGAAPNGGGESVLRMEDKGFKTPQQVVFEGTRATSSNGPPKGLKLGKKSKGKKAAKPTNRGARRAAEWRKTKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.21
3 0.18
4 0.15
5 0.12
6 0.09
7 0.07
8 0.08
9 0.08
10 0.08
11 0.08
12 0.06
13 0.06
14 0.07
15 0.08
16 0.11
17 0.14
18 0.18
19 0.22
20 0.26
21 0.31
22 0.34
23 0.35
24 0.35
25 0.39
26 0.44
27 0.45
28 0.5
29 0.49
30 0.47
31 0.5
32 0.46
33 0.4
34 0.34
35 0.29
36 0.22
37 0.19
38 0.21
39 0.18
40 0.19
41 0.17
42 0.15
43 0.14
44 0.12
45 0.11
46 0.08
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.07
56 0.07
57 0.08
58 0.09
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.06
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.08
73 0.11
74 0.14
75 0.15
76 0.15
77 0.16
78 0.18
79 0.23
80 0.24
81 0.22
82 0.19
83 0.18
84 0.18
85 0.17
86 0.16
87 0.11
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.08
94 0.07
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.11
104 0.19
105 0.27
106 0.31
107 0.33
108 0.43
109 0.53
110 0.63
111 0.71
112 0.74
113 0.77
114 0.85
115 0.93
116 0.94
117 0.95
118 0.95
119 0.93
120 0.89
121 0.83
122 0.74
123 0.64
124 0.53
125 0.43
126 0.32
127 0.25
128 0.19
129 0.14
130 0.15
131 0.17
132 0.22
133 0.25
134 0.25
135 0.26
136 0.28
137 0.31
138 0.31
139 0.35
140 0.38
141 0.36
142 0.39
143 0.41
144 0.44
145 0.48
146 0.56
147 0.57
148 0.58
149 0.62
150 0.63
151 0.61
152 0.58
153 0.53
154 0.45
155 0.38
156 0.31
157 0.27
158 0.26
159 0.24
160 0.2
161 0.17
162 0.15
163 0.13
164 0.12
165 0.11
166 0.07
167 0.07
168 0.1
169 0.12
170 0.14
171 0.2
172 0.2
173 0.2
174 0.21
175 0.21
176 0.21
177 0.21
178 0.2
179 0.16
180 0.19
181 0.19
182 0.21
183 0.21
184 0.18
185 0.17
186 0.16
187 0.14
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.12
199 0.16
200 0.19
201 0.21
202 0.23
203 0.27
204 0.31
205 0.4
206 0.46
207 0.42
208 0.4
209 0.4
210 0.39
211 0.35
212 0.31
213 0.21
214 0.12
215 0.1
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.1
221 0.11
222 0.15
223 0.16
224 0.17
225 0.16
226 0.16
227 0.16
228 0.17
229 0.16
230 0.14
231 0.13
232 0.11
233 0.13
234 0.17
235 0.18
236 0.16
237 0.16
238 0.14
239 0.14
240 0.14
241 0.14
242 0.12
243 0.19
244 0.22
245 0.23
246 0.23
247 0.23
248 0.23
249 0.23
250 0.2
251 0.16
252 0.14
253 0.13
254 0.13
255 0.13
256 0.13
257 0.12
258 0.12
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.11
279 0.1
280 0.11
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.09
285 0.09
286 0.08
287 0.1
288 0.09
289 0.14
290 0.15
291 0.14
292 0.15
293 0.15
294 0.18
295 0.25
296 0.28
297 0.28
298 0.3
299 0.32
300 0.33
301 0.37
302 0.34
303 0.31
304 0.28
305 0.22
306 0.2
307 0.18
308 0.16
309 0.12
310 0.12
311 0.07
312 0.06
313 0.05
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.1
324 0.13
325 0.22
326 0.26
327 0.32
328 0.4
329 0.5
330 0.54
331 0.59
332 0.66
333 0.63
334 0.66
335 0.62
336 0.55
337 0.46
338 0.41
339 0.32
340 0.23
341 0.18
342 0.1
343 0.12
344 0.14
345 0.15
346 0.19
347 0.22
348 0.28
349 0.31
350 0.32
351 0.34
352 0.37
353 0.36
354 0.34
355 0.33
356 0.33
357 0.36
358 0.38
359 0.4
360 0.44
361 0.44
362 0.44
363 0.46
364 0.42
365 0.38
366 0.43
367 0.37
368 0.34
369 0.31
370 0.31
371 0.27
372 0.25
373 0.25
374 0.17
375 0.16
376 0.11
377 0.12
378 0.1
379 0.08
380 0.09
381 0.06
382 0.08
383 0.07
384 0.08
385 0.11
386 0.11
387 0.13
388 0.13
389 0.14
390 0.2
391 0.24
392 0.31
393 0.32
394 0.36
395 0.42
396 0.44
397 0.5
398 0.48
399 0.5
400 0.51
401 0.57
402 0.61
403 0.61
404 0.65
405 0.65
406 0.65
407 0.6
408 0.6
409 0.6
410 0.61
411 0.59
412 0.6
413 0.59
414 0.59
415 0.61
416 0.54
417 0.48
418 0.45
419 0.42
420 0.42
421 0.38
422 0.41
423 0.41
424 0.42
425 0.39
426 0.35
427 0.37
428 0.33
429 0.39
430 0.36
431 0.38
432 0.42
433 0.52
434 0.6
435 0.64
436 0.69
437 0.67
438 0.67
439 0.63
440 0.58
441 0.49
442 0.42
443 0.36
444 0.28
445 0.24
446 0.23
447 0.22
448 0.2
449 0.19
450 0.16
451 0.15
452 0.14
453 0.15
454 0.18
455 0.23
456 0.29
457 0.34
458 0.37
459 0.41
460 0.44
461 0.45
462 0.44
463 0.47
464 0.45
465 0.47
466 0.47
467 0.49
468 0.47
469 0.44
470 0.38
471 0.3
472 0.25
473 0.18
474 0.13
475 0.09
476 0.08
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.11
481 0.19
482 0.21
483 0.26
484 0.28
485 0.3
486 0.36
487 0.43
488 0.49
489 0.46
490 0.45
491 0.43
492 0.42
493 0.41
494 0.36
495 0.29
496 0.23
497 0.19
498 0.21
499 0.21
500 0.25
501 0.32
502 0.34
503 0.37
504 0.36
505 0.38
506 0.45
507 0.47
508 0.49
509 0.5
510 0.58
511 0.64
512 0.74
513 0.8
514 0.8
515 0.84
516 0.86
517 0.86
518 0.86
519 0.88
520 0.88
521 0.88
522 0.88
523 0.88
524 0.87
525 0.82
526 0.76
527 0.71
528 0.68
529 0.7
530 0.7
531 0.68