Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7EF40

Protein Details
Accession A7EF40    Localization Confidence Low Confidence Score 6.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-64TKDLSSTKPIPRRRNFTGNTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 8.5, cyto_mito 7.5, cyto 5.5, nucl 5, plas 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
KEGG ssl:SS1G_03931  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01535  PPR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MVSSTVGLEAWFISSLAGAGHCHKHTPKPIRPVTFFTSHRPNVSTKDLSSTKPIPRRRNFTGNTQSEAEERRTTNEANQTREELMELVDQYHGTSYTHQLPIVESPNLYQPGNGPHLQVSDEEEDEWPPPLQAWPADGETKEKLKKLESALKHFYTEDAEDVYQIYRELPEPRAPYLEANLRHMLLRHLSIVERKDEHSMLRYFSVVDDMKSTAIPLTISEWTSAISFASKYVAKATEVEVESALKMWKEMEHIAGVRGNNATFNVLYDVACKAGKFTLGEMIYKEMIARGLEYNRFHYVSMIFTCGLKKDGDGARAAYKALVDAGEIVDTVVLNAMISALIKSYEPSAALNIYERMKTMHAERTGTQEWHRSFKNRREVKRGLLRMAMEFRHDPEGRAKVQERSIVCPDLQTYRLLVNHFAITEGELDKAAKFLEEMGLFNVPLHGALFLSLFKGFHLHGGTRYTKWTAARLESVWKAYLKALDKGVEDIYMSTWIVTNVLKAFATCSGQARATEVWRDIRERWQPDERQLNAIMPDLYRIGIPENG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.07
4 0.08
5 0.08
6 0.12
7 0.18
8 0.19
9 0.26
10 0.29
11 0.37
12 0.47
13 0.56
14 0.6
15 0.65
16 0.73
17 0.76
18 0.77
19 0.75
20 0.71
21 0.69
22 0.63
23 0.6
24 0.61
25 0.56
26 0.55
27 0.51
28 0.48
29 0.45
30 0.5
31 0.47
32 0.38
33 0.43
34 0.42
35 0.42
36 0.46
37 0.48
38 0.49
39 0.54
40 0.62
41 0.64
42 0.7
43 0.77
44 0.78
45 0.81
46 0.75
47 0.77
48 0.78
49 0.71
50 0.67
51 0.6
52 0.53
53 0.46
54 0.46
55 0.4
56 0.34
57 0.31
58 0.3
59 0.32
60 0.32
61 0.35
62 0.41
63 0.42
64 0.42
65 0.44
66 0.43
67 0.4
68 0.39
69 0.33
70 0.23
71 0.2
72 0.17
73 0.15
74 0.12
75 0.12
76 0.12
77 0.11
78 0.12
79 0.11
80 0.09
81 0.11
82 0.14
83 0.2
84 0.21
85 0.22
86 0.21
87 0.22
88 0.26
89 0.28
90 0.25
91 0.18
92 0.18
93 0.23
94 0.25
95 0.24
96 0.19
97 0.18
98 0.22
99 0.27
100 0.27
101 0.22
102 0.21
103 0.22
104 0.23
105 0.21
106 0.19
107 0.17
108 0.17
109 0.17
110 0.16
111 0.16
112 0.16
113 0.17
114 0.12
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.11
119 0.11
120 0.12
121 0.13
122 0.15
123 0.17
124 0.17
125 0.19
126 0.21
127 0.27
128 0.29
129 0.29
130 0.29
131 0.29
132 0.34
133 0.38
134 0.44
135 0.43
136 0.48
137 0.52
138 0.51
139 0.5
140 0.45
141 0.39
142 0.32
143 0.27
144 0.2
145 0.15
146 0.13
147 0.12
148 0.13
149 0.12
150 0.1
151 0.09
152 0.08
153 0.07
154 0.09
155 0.12
156 0.15
157 0.2
158 0.22
159 0.23
160 0.25
161 0.25
162 0.24
163 0.25
164 0.28
165 0.24
166 0.26
167 0.26
168 0.25
169 0.24
170 0.24
171 0.22
172 0.17
173 0.16
174 0.13
175 0.13
176 0.13
177 0.17
178 0.18
179 0.2
180 0.2
181 0.2
182 0.22
183 0.22
184 0.22
185 0.23
186 0.23
187 0.21
188 0.2
189 0.19
190 0.16
191 0.15
192 0.19
193 0.14
194 0.13
195 0.13
196 0.12
197 0.13
198 0.12
199 0.12
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.08
205 0.09
206 0.09
207 0.1
208 0.09
209 0.09
210 0.1
211 0.09
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.1
220 0.11
221 0.11
222 0.12
223 0.13
224 0.17
225 0.17
226 0.17
227 0.15
228 0.14
229 0.13
230 0.13
231 0.12
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.08
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.11
241 0.11
242 0.13
243 0.13
244 0.12
245 0.11
246 0.1
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.08
263 0.07
264 0.08
265 0.12
266 0.12
267 0.13
268 0.13
269 0.14
270 0.13
271 0.12
272 0.12
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.09
279 0.13
280 0.14
281 0.17
282 0.18
283 0.19
284 0.18
285 0.17
286 0.16
287 0.14
288 0.14
289 0.13
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.11
294 0.12
295 0.1
296 0.09
297 0.14
298 0.16
299 0.17
300 0.17
301 0.18
302 0.19
303 0.19
304 0.19
305 0.13
306 0.11
307 0.09
308 0.08
309 0.07
310 0.04
311 0.05
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.02
322 0.02
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.09
339 0.11
340 0.12
341 0.12
342 0.12
343 0.12
344 0.12
345 0.14
346 0.16
347 0.21
348 0.21
349 0.24
350 0.24
351 0.3
352 0.32
353 0.33
354 0.31
355 0.32
356 0.32
357 0.34
358 0.36
359 0.37
360 0.42
361 0.49
362 0.58
363 0.59
364 0.64
365 0.68
366 0.7
367 0.71
368 0.73
369 0.69
370 0.61
371 0.56
372 0.5
373 0.44
374 0.44
375 0.35
376 0.28
377 0.25
378 0.24
379 0.28
380 0.27
381 0.25
382 0.27
383 0.32
384 0.3
385 0.35
386 0.36
387 0.33
388 0.36
389 0.4
390 0.35
391 0.36
392 0.39
393 0.35
394 0.32
395 0.28
396 0.27
397 0.25
398 0.24
399 0.19
400 0.16
401 0.17
402 0.2
403 0.2
404 0.2
405 0.18
406 0.18
407 0.17
408 0.16
409 0.13
410 0.12
411 0.13
412 0.11
413 0.1
414 0.09
415 0.1
416 0.09
417 0.09
418 0.09
419 0.07
420 0.06
421 0.07
422 0.1
423 0.11
424 0.11
425 0.13
426 0.14
427 0.14
428 0.14
429 0.13
430 0.09
431 0.08
432 0.08
433 0.06
434 0.05
435 0.05
436 0.06
437 0.06
438 0.07
439 0.08
440 0.07
441 0.07
442 0.1
443 0.09
444 0.12
445 0.15
446 0.16
447 0.18
448 0.24
449 0.28
450 0.27
451 0.31
452 0.3
453 0.3
454 0.31
455 0.34
456 0.33
457 0.34
458 0.36
459 0.34
460 0.39
461 0.38
462 0.38
463 0.35
464 0.31
465 0.28
466 0.27
467 0.31
468 0.28
469 0.29
470 0.29
471 0.29
472 0.29
473 0.3
474 0.29
475 0.23
476 0.2
477 0.16
478 0.14
479 0.13
480 0.12
481 0.1
482 0.1
483 0.09
484 0.11
485 0.1
486 0.12
487 0.11
488 0.13
489 0.13
490 0.12
491 0.14
492 0.16
493 0.18
494 0.18
495 0.2
496 0.22
497 0.24
498 0.24
499 0.26
500 0.26
501 0.27
502 0.3
503 0.3
504 0.34
505 0.35
506 0.39
507 0.38
508 0.45
509 0.5
510 0.51
511 0.54
512 0.57
513 0.59
514 0.64
515 0.71
516 0.64
517 0.6
518 0.56
519 0.52
520 0.44
521 0.42
522 0.34
523 0.24
524 0.23
525 0.19
526 0.18
527 0.14
528 0.14