Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7EPU6

Protein Details
Accession A7EPU6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
228-247AGTGGKTKRERQRAQKQVVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-113HPRAGGRGRGGARGGAK
258-303RGGRGGFRGGRGRGDGQPRGDRGGFRGRGEGQRGRARGDRGPPRQS
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ssl:SS1G_07345  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSGIASKNLYELLGNDHEYDSDKEPEPPVKVVDKTPARTTKRNATGEAPAAKAPVADGRGARRGGFTGNEGAFRDRNAGSANNHGKPIDDSVRTDRHPRAGGRGRGGARGGAKFDRHSRGVVGDSEKQVAHGWGATEGGAELADEQAGEAIAKNDAKEDGEAPADAAAEEPEPEDNSVSYADYLAQLEEKRAALNAATPEARKPDSKVDKKWASAKAITKEDEEDFVAGTGGKTKRERQRAQKQVVEIDQRYVEPAERGGRGGFRGGRGRGDGQPRGDRGGFRGRGEGQRGRARGDRGPPRQSAPRTGGASAPIQIEDQSAFPSLGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.2
4 0.2
5 0.23
6 0.26
7 0.23
8 0.24
9 0.24
10 0.26
11 0.29
12 0.34
13 0.34
14 0.33
15 0.33
16 0.34
17 0.35
18 0.35
19 0.41
20 0.43
21 0.44
22 0.51
23 0.57
24 0.58
25 0.63
26 0.67
27 0.67
28 0.7
29 0.69
30 0.63
31 0.58
32 0.57
33 0.56
34 0.53
35 0.44
36 0.34
37 0.31
38 0.27
39 0.23
40 0.18
41 0.15
42 0.13
43 0.14
44 0.15
45 0.19
46 0.25
47 0.26
48 0.26
49 0.23
50 0.22
51 0.22
52 0.21
53 0.19
54 0.2
55 0.2
56 0.22
57 0.22
58 0.24
59 0.22
60 0.21
61 0.23
62 0.16
63 0.17
64 0.17
65 0.19
66 0.18
67 0.28
68 0.34
69 0.32
70 0.33
71 0.32
72 0.3
73 0.28
74 0.32
75 0.28
76 0.23
77 0.24
78 0.29
79 0.34
80 0.35
81 0.39
82 0.36
83 0.37
84 0.4
85 0.37
86 0.42
87 0.46
88 0.48
89 0.46
90 0.5
91 0.46
92 0.43
93 0.42
94 0.35
95 0.29
96 0.25
97 0.24
98 0.2
99 0.21
100 0.22
101 0.27
102 0.29
103 0.27
104 0.27
105 0.25
106 0.24
107 0.24
108 0.24
109 0.23
110 0.21
111 0.21
112 0.22
113 0.21
114 0.2
115 0.18
116 0.16
117 0.12
118 0.09
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.02
133 0.02
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.06
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.15
188 0.17
189 0.15
190 0.17
191 0.25
192 0.35
193 0.42
194 0.46
195 0.53
196 0.56
197 0.59
198 0.63
199 0.58
200 0.52
201 0.51
202 0.51
203 0.48
204 0.48
205 0.46
206 0.39
207 0.37
208 0.33
209 0.29
210 0.23
211 0.17
212 0.12
213 0.11
214 0.1
215 0.07
216 0.07
217 0.12
218 0.12
219 0.17
220 0.2
221 0.29
222 0.37
223 0.48
224 0.56
225 0.61
226 0.71
227 0.76
228 0.81
229 0.77
230 0.72
231 0.67
232 0.65
233 0.61
234 0.51
235 0.43
236 0.37
237 0.32
238 0.3
239 0.25
240 0.2
241 0.14
242 0.16
243 0.17
244 0.17
245 0.18
246 0.17
247 0.18
248 0.18
249 0.22
250 0.21
251 0.22
252 0.28
253 0.28
254 0.3
255 0.31
256 0.34
257 0.36
258 0.41
259 0.42
260 0.41
261 0.46
262 0.45
263 0.47
264 0.45
265 0.4
266 0.37
267 0.42
268 0.4
269 0.35
270 0.39
271 0.38
272 0.42
273 0.49
274 0.49
275 0.47
276 0.52
277 0.52
278 0.51
279 0.52
280 0.5
281 0.49
282 0.54
283 0.56
284 0.57
285 0.62
286 0.61
287 0.62
288 0.67
289 0.65
290 0.63
291 0.58
292 0.57
293 0.54
294 0.51
295 0.47
296 0.41
297 0.38
298 0.32
299 0.28
300 0.21
301 0.18
302 0.17
303 0.17
304 0.15
305 0.13
306 0.13
307 0.13