Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A084GHV7

Protein Details
Accession A0A084GHV7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-124DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
424-425KR
Subcellular Location(s) nucl 9.5, cyto_nucl 8.5, mito 8, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
KEGG sapo:SAPIO_CDS0261  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGIPAAFRWLSKKYPKIISPVIEDLPKKLDDGSVIPVDTTQPNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPAPKDEEEMMLEIFKYTDRVVNMVRPRKVLVIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAKEKEVAKEELRALIKRQGGDLAPSSPEEALKKAFDSNSITPGTPFMDILAASLRYWCAYKLNTDPAWANLKIIISDATVPGEGEHKVMDFVRSQRASPDYDPNTRHVIYGLDADLIMLALATHEPHFRVLREDVFFQEARTRLCKLCGQKGHDAYHCKGQEKEKEGEFDEKDNAAPLKPFIWLHISVLREYLAVELYVPNLPFQFDLERAIDDWIFLCCFVGNDFLPHLPALEIRENGIQTLTAIWRDNLPYMGGYVTRDGHIDLSRAQLIMDGLAKQEDAIFRRRKQQEDRREANSKRRRLQDSAASGNGSQEPKWKRHNVDTAASGLSTLQPISDFSKARPVTHDSVITRKIASDANLANRSAANVLKNRMSSESDLTRDGSLASPAVSGSNLELPDSGASSSALGKRKASTLEDSTPGASTSGMSTPSAADDGPVDTVRLWEEGYADRYYEQKFHADPKDIKFRNQVAKAYVEGLAWVLLYYFQGCPSWDWYYPYHYAPFAKDFVGLSEMKIIFEKGRISRPFEQLMSVLPAASRHALPDVFHDLMTNEDSEIIDFYPEEFEIDLNGKKMAWQGVALLPFIDMARLLQAVEKKYPLLSPEDADRNEIGKVVLLLSDANSDLYSDITNRFYTKKQSIPSYSLDPRISGGLAGEVEKIQEYLPHGPLDYPLQRKAMPCLEYDRSLIVRYEIPTAAHSHKSMLLRGVRLPKPALDRGDIETLKRMLESAGRSYGGVPLGRNSYDARGRRDHINFAPRGSPHYSNNEVNRGPAYARNGSGDSQHWDRRQQQQPRTGFGGPSYRSQASRVPPPGHQSFGMGMPAPAPPPPLQYDSRWWNNGGAPPSSRGPGPGSGPERSHAPPRQSWQPPPPGVARPYSNAPGHPGGNSWRGGFDGTRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.62
3 0.66
4 0.68
5 0.65
6 0.62
7 0.59
8 0.55
9 0.52
10 0.48
11 0.42
12 0.39
13 0.35
14 0.29
15 0.24
16 0.22
17 0.19
18 0.21
19 0.24
20 0.23
21 0.22
22 0.22
23 0.21
24 0.23
25 0.22
26 0.24
27 0.23
28 0.24
29 0.26
30 0.28
31 0.29
32 0.31
33 0.29
34 0.3
35 0.27
36 0.26
37 0.25
38 0.23
39 0.23
40 0.18
41 0.17
42 0.13
43 0.1
44 0.08
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.1
49 0.13
50 0.18
51 0.21
52 0.23
53 0.29
54 0.38
55 0.46
56 0.51
57 0.53
58 0.53
59 0.51
60 0.52
61 0.47
62 0.41
63 0.35
64 0.31
65 0.26
66 0.21
67 0.19
68 0.16
69 0.14
70 0.11
71 0.1
72 0.1
73 0.13
74 0.13
75 0.17
76 0.2
77 0.28
78 0.37
79 0.44
80 0.46
81 0.45
82 0.46
83 0.45
84 0.44
85 0.39
86 0.32
87 0.29
88 0.26
89 0.25
90 0.24
91 0.21
92 0.2
93 0.18
94 0.15
95 0.1
96 0.13
97 0.19
98 0.26
99 0.36
100 0.45
101 0.55
102 0.66
103 0.74
104 0.8
105 0.82
106 0.79
107 0.76
108 0.77
109 0.77
110 0.75
111 0.77
112 0.72
113 0.67
114 0.7
115 0.64
116 0.54
117 0.5
118 0.45
119 0.36
120 0.37
121 0.34
122 0.34
123 0.36
124 0.37
125 0.34
126 0.36
127 0.38
128 0.33
129 0.33
130 0.3
131 0.27
132 0.28
133 0.27
134 0.23
135 0.2
136 0.2
137 0.2
138 0.17
139 0.19
140 0.17
141 0.17
142 0.17
143 0.17
144 0.18
145 0.21
146 0.21
147 0.22
148 0.28
149 0.28
150 0.3
151 0.31
152 0.3
153 0.26
154 0.27
155 0.25
156 0.18
157 0.16
158 0.11
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.12
163 0.11
164 0.1
165 0.11
166 0.11
167 0.1
168 0.11
169 0.12
170 0.13
171 0.14
172 0.19
173 0.24
174 0.31
175 0.31
176 0.33
177 0.33
178 0.33
179 0.37
180 0.33
181 0.27
182 0.21
183 0.21
184 0.18
185 0.18
186 0.15
187 0.1
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.09
200 0.1
201 0.11
202 0.13
203 0.16
204 0.24
205 0.25
206 0.25
207 0.28
208 0.3
209 0.33
210 0.33
211 0.4
212 0.36
213 0.42
214 0.44
215 0.43
216 0.46
217 0.42
218 0.38
219 0.29
220 0.25
221 0.19
222 0.2
223 0.17
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.09
228 0.08
229 0.06
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.05
236 0.07
237 0.08
238 0.11
239 0.13
240 0.14
241 0.18
242 0.2
243 0.24
244 0.25
245 0.26
246 0.24
247 0.27
248 0.26
249 0.23
250 0.25
251 0.22
252 0.23
253 0.24
254 0.26
255 0.23
256 0.26
257 0.31
258 0.32
259 0.4
260 0.44
261 0.47
262 0.52
263 0.57
264 0.58
265 0.58
266 0.58
267 0.5
268 0.52
269 0.5
270 0.43
271 0.41
272 0.44
273 0.46
274 0.46
275 0.49
276 0.42
277 0.42
278 0.43
279 0.45
280 0.39
281 0.34
282 0.31
283 0.26
284 0.24
285 0.23
286 0.21
287 0.15
288 0.15
289 0.13
290 0.11
291 0.13
292 0.13
293 0.12
294 0.16
295 0.15
296 0.17
297 0.2
298 0.21
299 0.19
300 0.19
301 0.18
302 0.13
303 0.13
304 0.11
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.07
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.09
315 0.08
316 0.1
317 0.1
318 0.09
319 0.12
320 0.13
321 0.13
322 0.13
323 0.14
324 0.13
325 0.11
326 0.1
327 0.08
328 0.08
329 0.07
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.08
335 0.07
336 0.08
337 0.1
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.07
343 0.08
344 0.11
345 0.13
346 0.13
347 0.14
348 0.16
349 0.15
350 0.15
351 0.14
352 0.1
353 0.08
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.11
361 0.12
362 0.11
363 0.1
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.08
368 0.08
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.11
375 0.11
376 0.11
377 0.1
378 0.12
379 0.12
380 0.12
381 0.11
382 0.1
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.07
387 0.06
388 0.07
389 0.06
390 0.06
391 0.07
392 0.08
393 0.1
394 0.18
395 0.24
396 0.26
397 0.36
398 0.41
399 0.46
400 0.55
401 0.63
402 0.66
403 0.7
404 0.73
405 0.7
406 0.74
407 0.71
408 0.72
409 0.7
410 0.68
411 0.65
412 0.67
413 0.66
414 0.61
415 0.62
416 0.59
417 0.56
418 0.52
419 0.45
420 0.38
421 0.33
422 0.29
423 0.28
424 0.2
425 0.14
426 0.18
427 0.2
428 0.25
429 0.32
430 0.37
431 0.38
432 0.44
433 0.52
434 0.49
435 0.49
436 0.46
437 0.4
438 0.34
439 0.3
440 0.23
441 0.14
442 0.11
443 0.08
444 0.06
445 0.04
446 0.04
447 0.05
448 0.08
449 0.12
450 0.12
451 0.12
452 0.21
453 0.22
454 0.22
455 0.24
456 0.27
457 0.27
458 0.28
459 0.32
460 0.24
461 0.28
462 0.29
463 0.26
464 0.21
465 0.18
466 0.17
467 0.14
468 0.15
469 0.14
470 0.14
471 0.19
472 0.21
473 0.2
474 0.19
475 0.18
476 0.17
477 0.14
478 0.14
479 0.11
480 0.12
481 0.14
482 0.16
483 0.17
484 0.17
485 0.18
486 0.19
487 0.17
488 0.18
489 0.19
490 0.18
491 0.19
492 0.19
493 0.17
494 0.15
495 0.14
496 0.1
497 0.08
498 0.07
499 0.06
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.07
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.07
512 0.07
513 0.07
514 0.04
515 0.04
516 0.05
517 0.07
518 0.11
519 0.14
520 0.15
521 0.16
522 0.16
523 0.18
524 0.2
525 0.2
526 0.2
527 0.21
528 0.23
529 0.23
530 0.23
531 0.22
532 0.2
533 0.18
534 0.14
535 0.09
536 0.07
537 0.06
538 0.07
539 0.07
540 0.07
541 0.07
542 0.07
543 0.07
544 0.07
545 0.06
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.06
550 0.06
551 0.06
552 0.06
553 0.06
554 0.07
555 0.07
556 0.06
557 0.05
558 0.07
559 0.08
560 0.11
561 0.11
562 0.1
563 0.1
564 0.13
565 0.14
566 0.14
567 0.14
568 0.14
569 0.15
570 0.22
571 0.25
572 0.29
573 0.32
574 0.35
575 0.45
576 0.43
577 0.44
578 0.44
579 0.46
580 0.48
581 0.48
582 0.45
583 0.36
584 0.37
585 0.35
586 0.3
587 0.25
588 0.16
589 0.13
590 0.1
591 0.08
592 0.06
593 0.05
594 0.04
595 0.03
596 0.04
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.06
601 0.07
602 0.08
603 0.12
604 0.15
605 0.15
606 0.18
607 0.19
608 0.23
609 0.25
610 0.25
611 0.23
612 0.21
613 0.21
614 0.2
615 0.22
616 0.18
617 0.16
618 0.15
619 0.14
620 0.13
621 0.15
622 0.13
623 0.11
624 0.15
625 0.15
626 0.14
627 0.14
628 0.14
629 0.11
630 0.13
631 0.17
632 0.14
633 0.22
634 0.24
635 0.31
636 0.36
637 0.4
638 0.41
639 0.37
640 0.36
641 0.28
642 0.27
643 0.23
644 0.17
645 0.13
646 0.1
647 0.1
648 0.1
649 0.11
650 0.1
651 0.07
652 0.09
653 0.1
654 0.1
655 0.13
656 0.17
657 0.17
658 0.16
659 0.16
660 0.15
661 0.16
662 0.16
663 0.13
664 0.07
665 0.07
666 0.07
667 0.07
668 0.08
669 0.06
670 0.05
671 0.05
672 0.06
673 0.06
674 0.06
675 0.06
676 0.06
677 0.06
678 0.07
679 0.09
680 0.1
681 0.09
682 0.1
683 0.09
684 0.1
685 0.12
686 0.13
687 0.11
688 0.1
689 0.12
690 0.14
691 0.15
692 0.14
693 0.12
694 0.1
695 0.1
696 0.1
697 0.08
698 0.05
699 0.04
700 0.05
701 0.05
702 0.05
703 0.07
704 0.11
705 0.14
706 0.16
707 0.16
708 0.16
709 0.17
710 0.18
711 0.17
712 0.18
713 0.17
714 0.17
715 0.22
716 0.27
717 0.27
718 0.28
719 0.27
720 0.23
721 0.22
722 0.21
723 0.15
724 0.1
725 0.1
726 0.08
727 0.07
728 0.06
729 0.06
730 0.06
731 0.07
732 0.07
733 0.07
734 0.06
735 0.06
736 0.06
737 0.07
738 0.07
739 0.07
740 0.09
741 0.11
742 0.12
743 0.13
744 0.16
745 0.18
746 0.26
747 0.3
748 0.34
749 0.37
750 0.44
751 0.47
752 0.49
753 0.5
754 0.5
755 0.48
756 0.48
757 0.44
758 0.36
759 0.32
760 0.29
761 0.25
762 0.17
763 0.14
764 0.09
765 0.09
766 0.09
767 0.09
768 0.08
769 0.08
770 0.08
771 0.08
772 0.07
773 0.08
774 0.11
775 0.15
776 0.17
777 0.17
778 0.17
779 0.17
780 0.19
781 0.23
782 0.27
783 0.26
784 0.27
785 0.29
786 0.31
787 0.32
788 0.37
789 0.37
790 0.32
791 0.3
792 0.34
793 0.35
794 0.34
795 0.34
796 0.31
797 0.26
798 0.26
799 0.24
800 0.19
801 0.19
802 0.18
803 0.21
804 0.19
805 0.18
806 0.18
807 0.22
808 0.24
809 0.24
810 0.23
811 0.21
812 0.25
813 0.27
814 0.27
815 0.29
816 0.29
817 0.28
818 0.34
819 0.41
820 0.39
821 0.4
822 0.4
823 0.38
824 0.41
825 0.44
826 0.42
827 0.36
828 0.35
829 0.36
830 0.43
831 0.39
832 0.33
833 0.33
834 0.3
835 0.28
836 0.25
837 0.21
838 0.14
839 0.18
840 0.2
841 0.19
842 0.21
843 0.21
844 0.22
845 0.22
846 0.24
847 0.22
848 0.2
849 0.17
850 0.17
851 0.2
852 0.2
853 0.21
854 0.2
855 0.23
856 0.3
857 0.35
858 0.38
859 0.4
860 0.43
861 0.5
862 0.52
863 0.53
864 0.53
865 0.57
866 0.53
867 0.49
868 0.52
869 0.43
870 0.45
871 0.43
872 0.4
873 0.36
874 0.42
875 0.45
876 0.46
877 0.51
878 0.53
879 0.48
880 0.45
881 0.42
882 0.35
883 0.31
884 0.29
885 0.3
886 0.26
887 0.27
888 0.28
889 0.29
890 0.28
891 0.29
892 0.28
893 0.27
894 0.3
895 0.36
896 0.36
897 0.42
898 0.48
899 0.55
900 0.63
901 0.67
902 0.69
903 0.71
904 0.72
905 0.71
906 0.7
907 0.62
908 0.53
909 0.47
910 0.47
911 0.39
912 0.4
913 0.4
914 0.37
915 0.36
916 0.38
917 0.4
918 0.37
919 0.45
920 0.48
921 0.46
922 0.47
923 0.54
924 0.55
925 0.51
926 0.46
927 0.39
928 0.33
929 0.31
930 0.29
931 0.22
932 0.18
933 0.16
934 0.16
935 0.15
936 0.14
937 0.15
938 0.14
939 0.17
940 0.22
941 0.26
942 0.28
943 0.32
944 0.4
945 0.45
946 0.52
947 0.51
948 0.48
949 0.47
950 0.48
951 0.49
952 0.44
953 0.39
954 0.34
955 0.35
956 0.36
957 0.35
958 0.3
959 0.27
960 0.27
961 0.26
962 0.28
963 0.33
964 0.35
965 0.37
966 0.39
967 0.38
968 0.39
969 0.39
970 0.44
971 0.43
972 0.45
973 0.47
974 0.53
975 0.61
976 0.64
977 0.7
978 0.7
979 0.73
980 0.69
981 0.67
982 0.66
983 0.63
984 0.58
985 0.56
986 0.5
987 0.45
988 0.48
989 0.5
990 0.47
991 0.41
992 0.44
993 0.42
994 0.39
995 0.35
996 0.32
997 0.31
998 0.33
999 0.34
1000 0.29
1001 0.25
1002 0.24
1003 0.26
1004 0.25