Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A084GCX1

Protein Details
Accession A0A084GCX1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
450-472DLSGLVRKKQKEQKDESKPSTPTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
134-158AGGDKQQKKAPAEKKAAKPKEDRKG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.833, cyto 13, nucl 12.5, mito_nucl 7.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
KEGG sapo:SAPIO_CDS2636  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MSDATEPKAVPVEEVSATATEPTTSEPAPPLTGANVDDAQTPAADATKDGDEEEEDEEERKSRKVTLADLCAKGTALYVKKKYEESAECYAKAAERQAELNGEMDPENAEILFLYGRSLFKVGQAKSDVLGGKAGGDKQQKKAPAEKKAAKPKEDRKGEPSGSVTVEEGKKDVKEEDKKAEVAVPSTKKPLFQFTGDENFEDSDEEEEEGGDEEEEEEEEDDLAVAFEILDLARVLYSKKLENLESREKTEEEKEGDEDPLLRHVKERLADTHDLLAEISLENERYPNAITDSRASLKYKQQLYPKESEIIAEAHFKLSLALEFASITTDEGGNKTDSVDQEQRDEAVKELELAIESTKLKLQAKEVDLATMASPEDNELTRQEIADVKDIIADMEQRLVDLRGPPIDLNETLYGEQGLGKLGGILGAAVGGSSAEKQAAIQEAKKTATDLSGLVRKKQKEQKDESKPSTPTAETNGKRKAEDDAESEESKKAKVEEATA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.14
4 0.15
5 0.14
6 0.13
7 0.1
8 0.09
9 0.12
10 0.14
11 0.14
12 0.16
13 0.18
14 0.19
15 0.21
16 0.21
17 0.18
18 0.16
19 0.18
20 0.17
21 0.18
22 0.17
23 0.17
24 0.17
25 0.17
26 0.16
27 0.14
28 0.13
29 0.09
30 0.1
31 0.09
32 0.08
33 0.11
34 0.12
35 0.12
36 0.12
37 0.13
38 0.12
39 0.14
40 0.16
41 0.14
42 0.13
43 0.14
44 0.15
45 0.17
46 0.18
47 0.19
48 0.18
49 0.21
50 0.26
51 0.29
52 0.35
53 0.39
54 0.47
55 0.52
56 0.52
57 0.49
58 0.43
59 0.39
60 0.32
61 0.25
62 0.23
63 0.22
64 0.28
65 0.33
66 0.36
67 0.39
68 0.41
69 0.42
70 0.44
71 0.43
72 0.41
73 0.46
74 0.46
75 0.43
76 0.42
77 0.41
78 0.34
79 0.3
80 0.28
81 0.22
82 0.19
83 0.2
84 0.21
85 0.22
86 0.21
87 0.2
88 0.16
89 0.14
90 0.12
91 0.11
92 0.1
93 0.08
94 0.08
95 0.07
96 0.06
97 0.05
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.07
103 0.08
104 0.09
105 0.1
106 0.1
107 0.15
108 0.23
109 0.23
110 0.26
111 0.28
112 0.28
113 0.27
114 0.31
115 0.26
116 0.19
117 0.19
118 0.14
119 0.13
120 0.14
121 0.14
122 0.16
123 0.24
124 0.27
125 0.31
126 0.36
127 0.4
128 0.42
129 0.51
130 0.53
131 0.54
132 0.6
133 0.64
134 0.69
135 0.75
136 0.78
137 0.74
138 0.76
139 0.76
140 0.76
141 0.76
142 0.7
143 0.65
144 0.67
145 0.62
146 0.55
147 0.48
148 0.4
149 0.33
150 0.29
151 0.24
152 0.2
153 0.2
154 0.17
155 0.16
156 0.15
157 0.14
158 0.15
159 0.17
160 0.21
161 0.27
162 0.32
163 0.37
164 0.38
165 0.38
166 0.37
167 0.38
168 0.3
169 0.25
170 0.27
171 0.24
172 0.23
173 0.28
174 0.28
175 0.27
176 0.28
177 0.32
178 0.27
179 0.26
180 0.28
181 0.27
182 0.34
183 0.31
184 0.3
185 0.25
186 0.22
187 0.2
188 0.17
189 0.14
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.02
214 0.02
215 0.02
216 0.02
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.06
224 0.08
225 0.08
226 0.11
227 0.13
228 0.16
229 0.2
230 0.26
231 0.33
232 0.34
233 0.35
234 0.34
235 0.33
236 0.32
237 0.3
238 0.27
239 0.19
240 0.19
241 0.18
242 0.17
243 0.17
244 0.15
245 0.14
246 0.11
247 0.15
248 0.15
249 0.13
250 0.14
251 0.15
252 0.17
253 0.19
254 0.21
255 0.18
256 0.22
257 0.23
258 0.23
259 0.23
260 0.2
261 0.18
262 0.16
263 0.13
264 0.08
265 0.06
266 0.06
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.09
276 0.11
277 0.12
278 0.13
279 0.16
280 0.18
281 0.2
282 0.21
283 0.22
284 0.27
285 0.33
286 0.36
287 0.38
288 0.44
289 0.49
290 0.52
291 0.53
292 0.49
293 0.44
294 0.39
295 0.34
296 0.28
297 0.22
298 0.17
299 0.15
300 0.14
301 0.12
302 0.12
303 0.11
304 0.1
305 0.09
306 0.08
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.07
319 0.09
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.11
324 0.12
325 0.18
326 0.22
327 0.21
328 0.23
329 0.23
330 0.24
331 0.23
332 0.23
333 0.17
334 0.14
335 0.13
336 0.11
337 0.11
338 0.1
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.11
346 0.15
347 0.17
348 0.19
349 0.22
350 0.27
351 0.29
352 0.33
353 0.32
354 0.28
355 0.26
356 0.25
357 0.2
358 0.14
359 0.12
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.09
367 0.12
368 0.12
369 0.12
370 0.13
371 0.15
372 0.17
373 0.2
374 0.2
375 0.17
376 0.17
377 0.17
378 0.16
379 0.13
380 0.12
381 0.08
382 0.1
383 0.1
384 0.09
385 0.1
386 0.11
387 0.12
388 0.13
389 0.15
390 0.14
391 0.16
392 0.16
393 0.17
394 0.19
395 0.18
396 0.19
397 0.18
398 0.18
399 0.17
400 0.18
401 0.16
402 0.13
403 0.13
404 0.09
405 0.09
406 0.07
407 0.07
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.05
412 0.05
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.03
418 0.02
419 0.03
420 0.04
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.06
425 0.08
426 0.15
427 0.18
428 0.21
429 0.25
430 0.28
431 0.3
432 0.3
433 0.29
434 0.24
435 0.22
436 0.2
437 0.17
438 0.19
439 0.25
440 0.26
441 0.33
442 0.39
443 0.41
444 0.5
445 0.58
446 0.62
447 0.65
448 0.73
449 0.77
450 0.81
451 0.88
452 0.85
453 0.84
454 0.76
455 0.7
456 0.65
457 0.56
458 0.47
459 0.45
460 0.48
461 0.44
462 0.5
463 0.55
464 0.52
465 0.52
466 0.5
467 0.5
468 0.45
469 0.45
470 0.41
471 0.39
472 0.42
473 0.43
474 0.43
475 0.39
476 0.35
477 0.31
478 0.3
479 0.24
480 0.25