Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7ETT6

Protein Details
Accession A7ETT6    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-79DDKNDRGDRRDDRNRNHDRNRRDRSRSPRDSRDHRRSSYRDRDRDRERERBasic
202-225DIDGGNKKKKSQPKKKIEEEVEEEAcidic
261-281VSAVRKEKKTEYRQYMNRVGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-91EKRGPARDRDDKNDRGDRRDDRNRNHDRNRRDRSRSPRDSRDHRRSSYRDRDRDRERERDRGGRRDDRDGR
208-217KKKKSQPKKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG ssl:SS1G_08743  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MAEPPRRRQRPDSTKMWEESEKRGPARDRDDKNDRGDRRDDRNRNHDRNRRDRSRSPRDSRDHRRSSYRDRDRDRERERDRGGRRDDRDGRDNDRNRDYRERNNERSGRKDGHRTDVPDRTRGEFMPDALSQTMFALRGTPNIGKEDIRQSREKDEDRNGRKGKDETSRRSECTDDRITPQPVSFSIGAGHTTTGQDHDRMDIDGGNKKKKSQPKKKIEEEVEEEDDDIVVEDDGMAAMQAMMGFGGFATTQNKQVPGNNVSAVRKEKKTEYRQYMNRVGGFNRPLSPSRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.74
3 0.71
4 0.67
5 0.6
6 0.59
7 0.58
8 0.56
9 0.5
10 0.55
11 0.55
12 0.55
13 0.62
14 0.64
15 0.62
16 0.64
17 0.72
18 0.71
19 0.73
20 0.75
21 0.69
22 0.65
23 0.66
24 0.64
25 0.66
26 0.7
27 0.71
28 0.71
29 0.77
30 0.82
31 0.84
32 0.87
33 0.86
34 0.85
35 0.87
36 0.88
37 0.88
38 0.86
39 0.85
40 0.85
41 0.87
42 0.88
43 0.86
44 0.85
45 0.85
46 0.87
47 0.88
48 0.88
49 0.85
50 0.8
51 0.8
52 0.78
53 0.79
54 0.79
55 0.79
56 0.78
57 0.77
58 0.81
59 0.8
60 0.84
61 0.8
62 0.79
63 0.74
64 0.74
65 0.72
66 0.72
67 0.7
68 0.68
69 0.7
70 0.68
71 0.67
72 0.67
73 0.7
74 0.66
75 0.67
76 0.63
77 0.61
78 0.62
79 0.65
80 0.6
81 0.61
82 0.59
83 0.57
84 0.63
85 0.61
86 0.6
87 0.65
88 0.68
89 0.66
90 0.71
91 0.72
92 0.67
93 0.67
94 0.64
95 0.59
96 0.54
97 0.57
98 0.5
99 0.51
100 0.51
101 0.49
102 0.49
103 0.52
104 0.5
105 0.45
106 0.44
107 0.39
108 0.37
109 0.32
110 0.31
111 0.23
112 0.22
113 0.21
114 0.19
115 0.17
116 0.16
117 0.16
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.06
125 0.07
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.12
130 0.14
131 0.12
132 0.14
133 0.22
134 0.25
135 0.27
136 0.29
137 0.3
138 0.34
139 0.39
140 0.39
141 0.35
142 0.39
143 0.46
144 0.48
145 0.55
146 0.53
147 0.48
148 0.5
149 0.47
150 0.44
151 0.44
152 0.48
153 0.45
154 0.51
155 0.53
156 0.51
157 0.51
158 0.49
159 0.4
160 0.39
161 0.37
162 0.3
163 0.3
164 0.34
165 0.34
166 0.32
167 0.31
168 0.25
169 0.21
170 0.22
171 0.18
172 0.13
173 0.12
174 0.11
175 0.12
176 0.11
177 0.11
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.1
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.13
189 0.12
190 0.13
191 0.19
192 0.23
193 0.3
194 0.3
195 0.33
196 0.4
197 0.48
198 0.57
199 0.62
200 0.68
201 0.72
202 0.81
203 0.86
204 0.89
205 0.85
206 0.81
207 0.76
208 0.71
209 0.63
210 0.53
211 0.44
212 0.34
213 0.28
214 0.2
215 0.14
216 0.08
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.03
223 0.03
224 0.02
225 0.02
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.02
233 0.03
234 0.03
235 0.05
236 0.08
237 0.1
238 0.15
239 0.18
240 0.2
241 0.21
242 0.26
243 0.32
244 0.32
245 0.35
246 0.34
247 0.36
248 0.36
249 0.41
250 0.44
251 0.44
252 0.44
253 0.46
254 0.52
255 0.58
256 0.65
257 0.7
258 0.72
259 0.76
260 0.79
261 0.83
262 0.82
263 0.78
264 0.72
265 0.65
266 0.57
267 0.54
268 0.5
269 0.45
270 0.41
271 0.39