Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A084GFP6

Protein Details
Accession A0A084GFP6    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-80AGKTTVQEKPSKKNKKKSKKSEEVANDSGHydrophilic
330-358AAEKVEKTEKKEKKQKKKPAEVEEAPKALBasic
369-395EEPEKKSATKTSKAKKAVKAKKGKSKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-71KVKSKGAALKNGKSKLAEAKKRKASEEEPASKSKKLKAVKAVEKENAGKTTVQEKPSKKNKKKSKK
147-152SKKERK
336-359KTEKKEKKQKKKPAEVEEAPKALP
370-395EPEKKSATKTSKAKKAVKAKKGKSKA
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG sapo:SAPIO_CDS1027  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAVEPKVKSKGAALKNGKSKLAEAKKRKASEEEPASKSKKLKAVKAVEKENAGKTTVQEKPSKKNKKKSKKSEEVANDSGNDEAAAESALVVRENASDAEEDDDNAGDNEAEALAAEIDSGDEQEELDQAMAQFEEGQDVGKIPKLSKKERKAIEAARNEKPGIVYVGRIPHGFYEHEMRQYFSQFGPINRLRLSRNKRTGASKHFAFIEFAEETTAEIVAKTMDNYLLFGHILKCKVVPLERVHKDLWIGANRRFKKVPWNKMIGNKLDKPATQSAWERRVTREQRRRTLKALKLKELGYKFDAPTLKAIPPPAAQDKPAEIEEAAEEAAEKVEKTEKKEKKQKKKPAEVEEAPKALPEPPAGPEIVEEPEKKSATKTSKAKKAVKAKKGKSKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.67
3 0.7
4 0.66
5 0.58
6 0.55
7 0.55
8 0.57
9 0.59
10 0.6
11 0.66
12 0.73
13 0.75
14 0.76
15 0.73
16 0.67
17 0.67
18 0.68
19 0.66
20 0.62
21 0.65
22 0.64
23 0.62
24 0.61
25 0.57
26 0.55
27 0.53
28 0.57
29 0.59
30 0.66
31 0.71
32 0.74
33 0.75
34 0.7
35 0.69
36 0.65
37 0.6
38 0.51
39 0.43
40 0.36
41 0.31
42 0.35
43 0.36
44 0.37
45 0.4
46 0.44
47 0.52
48 0.62
49 0.71
50 0.73
51 0.78
52 0.83
53 0.87
54 0.93
55 0.94
56 0.94
57 0.94
58 0.9
59 0.9
60 0.88
61 0.85
62 0.78
63 0.69
64 0.58
65 0.47
66 0.41
67 0.3
68 0.21
69 0.12
70 0.08
71 0.06
72 0.05
73 0.04
74 0.04
75 0.05
76 0.06
77 0.05
78 0.05
79 0.06
80 0.06
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.08
86 0.11
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.08
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.03
100 0.03
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.04
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.09
129 0.1
130 0.1
131 0.15
132 0.22
133 0.32
134 0.41
135 0.49
136 0.55
137 0.58
138 0.61
139 0.64
140 0.66
141 0.65
142 0.64
143 0.61
144 0.57
145 0.56
146 0.51
147 0.44
148 0.36
149 0.27
150 0.21
151 0.16
152 0.12
153 0.12
154 0.15
155 0.16
156 0.15
157 0.15
158 0.12
159 0.14
160 0.14
161 0.13
162 0.16
163 0.16
164 0.21
165 0.21
166 0.22
167 0.21
168 0.22
169 0.22
170 0.15
171 0.2
172 0.17
173 0.17
174 0.24
175 0.25
176 0.26
177 0.26
178 0.28
179 0.25
180 0.33
181 0.4
182 0.41
183 0.48
184 0.49
185 0.51
186 0.56
187 0.59
188 0.57
189 0.55
190 0.46
191 0.4
192 0.37
193 0.35
194 0.28
195 0.22
196 0.18
197 0.12
198 0.12
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.09
219 0.1
220 0.11
221 0.11
222 0.11
223 0.11
224 0.14
225 0.15
226 0.18
227 0.22
228 0.31
229 0.33
230 0.37
231 0.36
232 0.35
233 0.33
234 0.3
235 0.29
236 0.26
237 0.27
238 0.3
239 0.39
240 0.41
241 0.45
242 0.44
243 0.4
244 0.44
245 0.51
246 0.54
247 0.52
248 0.57
249 0.57
250 0.64
251 0.69
252 0.65
253 0.61
254 0.55
255 0.51
256 0.47
257 0.43
258 0.41
259 0.39
260 0.33
261 0.31
262 0.34
263 0.37
264 0.41
265 0.45
266 0.42
267 0.42
268 0.51
269 0.56
270 0.6
271 0.63
272 0.66
273 0.71
274 0.79
275 0.79
276 0.77
277 0.78
278 0.75
279 0.75
280 0.73
281 0.7
282 0.65
283 0.62
284 0.62
285 0.54
286 0.5
287 0.44
288 0.42
289 0.35
290 0.36
291 0.36
292 0.29
293 0.31
294 0.3
295 0.27
296 0.25
297 0.26
298 0.23
299 0.23
300 0.27
301 0.3
302 0.29
303 0.28
304 0.29
305 0.3
306 0.3
307 0.29
308 0.24
309 0.17
310 0.17
311 0.16
312 0.14
313 0.12
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.08
318 0.07
319 0.06
320 0.07
321 0.15
322 0.18
323 0.26
324 0.36
325 0.45
326 0.55
327 0.66
328 0.76
329 0.79
330 0.87
331 0.91
332 0.92
333 0.94
334 0.93
335 0.92
336 0.92
337 0.88
338 0.86
339 0.82
340 0.72
341 0.61
342 0.51
343 0.42
344 0.34
345 0.28
346 0.22
347 0.17
348 0.17
349 0.2
350 0.19
351 0.18
352 0.17
353 0.17
354 0.19
355 0.21
356 0.2
357 0.21
358 0.28
359 0.29
360 0.29
361 0.3
362 0.35
363 0.39
364 0.48
365 0.54
366 0.58
367 0.66
368 0.76
369 0.81
370 0.82
371 0.85
372 0.86
373 0.86
374 0.87
375 0.87