Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A084GGJ5

Protein Details
Accession A0A084GGJ5    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
173-201ANKRWISTPPKPRDQKRPKKVKAVGKELEHydrophilic
271-292DSPSKDSKAKNSKKKLTKPASPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
73-78APGKRK
175-198KRWISTPPKPRDQKRPKKVKAVGK
278-292KAKNSKKKLTKPASP
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
KEGG sapo:SAPIO_CDS0785  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MSAYTWNQRRVGMSKNARPPQLLKSLNRPETTSRENLHSKPAIREPDDIEAPPISSDEEEAEYAEKDKASKAAPGKRKGANHSWSSDPEEEDSPPRGDIRPTTFSKPAKERTFSKQPARYGGVRSFREGLERKKENSSTKSSAKATSGADVSFQSGVLETSLLRDSEKTYKGANKRWISTPPKPRDQKRPKKVKAVGKELELPKLKLPDDLFDSFDAGTPKARVTSLQIPNRTADSPSPTEATASTRTLRSLSASPPKPTAPVKLDTKYLDSPSKDSKAKNSKKKLTKPASPDEKPRLRNVGDSVNSGARLDGLSDSDDSPLSDIDLSFDEIEENAAAVQCPYCKKPVDPDLLQTFSKGKRMPIRMQRLFCTEHKKVEARDLWRSRGYPDIDWKALDTRISDHYNYLERILKGGRSHFGDLLARDIKEGINRNLMKADFNCSPGYYGTRGFRVMQESIFGRFSSLLRKRAVEDSLVSSRGYSLYVQAVLVPELAVRLVMEDMDVEAKEARQILEESAWIGELLCEDVGDVVDEDDDNLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.65
3 0.7
4 0.68
5 0.68
6 0.63
7 0.6
8 0.6
9 0.59
10 0.53
11 0.57
12 0.65
13 0.68
14 0.66
15 0.62
16 0.58
17 0.58
18 0.59
19 0.56
20 0.49
21 0.49
22 0.54
23 0.52
24 0.55
25 0.54
26 0.51
27 0.5
28 0.55
29 0.55
30 0.52
31 0.54
32 0.49
33 0.5
34 0.49
35 0.42
36 0.37
37 0.3
38 0.27
39 0.23
40 0.19
41 0.14
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.13
49 0.12
50 0.14
51 0.15
52 0.13
53 0.12
54 0.14
55 0.16
56 0.17
57 0.23
58 0.3
59 0.38
60 0.46
61 0.53
62 0.59
63 0.62
64 0.67
65 0.68
66 0.69
67 0.67
68 0.63
69 0.6
70 0.57
71 0.54
72 0.54
73 0.48
74 0.4
75 0.35
76 0.32
77 0.3
78 0.29
79 0.29
80 0.24
81 0.23
82 0.23
83 0.21
84 0.22
85 0.25
86 0.29
87 0.32
88 0.36
89 0.41
90 0.46
91 0.49
92 0.54
93 0.57
94 0.59
95 0.59
96 0.61
97 0.6
98 0.61
99 0.68
100 0.68
101 0.7
102 0.67
103 0.63
104 0.65
105 0.65
106 0.59
107 0.54
108 0.54
109 0.53
110 0.47
111 0.47
112 0.43
113 0.38
114 0.43
115 0.43
116 0.43
117 0.44
118 0.47
119 0.47
120 0.52
121 0.58
122 0.57
123 0.58
124 0.58
125 0.55
126 0.54
127 0.57
128 0.52
129 0.49
130 0.43
131 0.4
132 0.33
133 0.29
134 0.26
135 0.2
136 0.19
137 0.17
138 0.16
139 0.13
140 0.12
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.07
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.09
152 0.12
153 0.19
154 0.21
155 0.21
156 0.23
157 0.31
158 0.37
159 0.45
160 0.51
161 0.49
162 0.5
163 0.53
164 0.58
165 0.59
166 0.62
167 0.64
168 0.62
169 0.67
170 0.73
171 0.75
172 0.78
173 0.81
174 0.83
175 0.83
176 0.87
177 0.83
178 0.86
179 0.87
180 0.85
181 0.83
182 0.81
183 0.73
184 0.65
185 0.65
186 0.56
187 0.55
188 0.47
189 0.4
190 0.32
191 0.33
192 0.3
193 0.26
194 0.25
195 0.2
196 0.23
197 0.23
198 0.23
199 0.19
200 0.2
201 0.16
202 0.18
203 0.16
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.13
212 0.23
213 0.3
214 0.35
215 0.38
216 0.38
217 0.39
218 0.4
219 0.35
220 0.27
221 0.2
222 0.19
223 0.19
224 0.19
225 0.19
226 0.17
227 0.17
228 0.16
229 0.18
230 0.15
231 0.15
232 0.15
233 0.14
234 0.15
235 0.15
236 0.15
237 0.14
238 0.14
239 0.17
240 0.25
241 0.27
242 0.28
243 0.3
244 0.3
245 0.3
246 0.29
247 0.3
248 0.24
249 0.27
250 0.3
251 0.29
252 0.32
253 0.3
254 0.32
255 0.29
256 0.28
257 0.27
258 0.23
259 0.24
260 0.26
261 0.3
262 0.3
263 0.29
264 0.35
265 0.42
266 0.51
267 0.57
268 0.63
269 0.67
270 0.74
271 0.82
272 0.83
273 0.8
274 0.78
275 0.75
276 0.75
277 0.75
278 0.68
279 0.67
280 0.65
281 0.65
282 0.6
283 0.56
284 0.52
285 0.44
286 0.43
287 0.38
288 0.37
289 0.3
290 0.29
291 0.28
292 0.23
293 0.22
294 0.2
295 0.17
296 0.09
297 0.08
298 0.07
299 0.06
300 0.05
301 0.06
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.07
307 0.08
308 0.07
309 0.06
310 0.06
311 0.05
312 0.06
313 0.06
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.07
320 0.06
321 0.05
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.05
327 0.07
328 0.09
329 0.11
330 0.14
331 0.16
332 0.17
333 0.25
334 0.32
335 0.38
336 0.37
337 0.42
338 0.43
339 0.45
340 0.43
341 0.37
342 0.33
343 0.27
344 0.31
345 0.26
346 0.27
347 0.32
348 0.39
349 0.46
350 0.52
351 0.62
352 0.63
353 0.65
354 0.62
355 0.59
356 0.57
357 0.53
358 0.52
359 0.44
360 0.42
361 0.44
362 0.45
363 0.41
364 0.46
365 0.47
366 0.43
367 0.51
368 0.5
369 0.49
370 0.49
371 0.49
372 0.41
373 0.42
374 0.4
375 0.34
376 0.38
377 0.39
378 0.36
379 0.36
380 0.35
381 0.31
382 0.29
383 0.26
384 0.19
385 0.16
386 0.2
387 0.24
388 0.23
389 0.21
390 0.23
391 0.26
392 0.26
393 0.26
394 0.26
395 0.23
396 0.25
397 0.25
398 0.25
399 0.24
400 0.27
401 0.28
402 0.27
403 0.29
404 0.27
405 0.28
406 0.28
407 0.26
408 0.29
409 0.27
410 0.23
411 0.21
412 0.21
413 0.19
414 0.22
415 0.27
416 0.24
417 0.31
418 0.31
419 0.32
420 0.35
421 0.35
422 0.34
423 0.29
424 0.32
425 0.24
426 0.27
427 0.27
428 0.23
429 0.24
430 0.21
431 0.23
432 0.2
433 0.22
434 0.23
435 0.24
436 0.26
437 0.26
438 0.27
439 0.29
440 0.28
441 0.23
442 0.24
443 0.23
444 0.24
445 0.24
446 0.21
447 0.17
448 0.17
449 0.18
450 0.25
451 0.3
452 0.33
453 0.34
454 0.37
455 0.39
456 0.42
457 0.44
458 0.36
459 0.32
460 0.33
461 0.34
462 0.33
463 0.3
464 0.25
465 0.23
466 0.21
467 0.19
468 0.13
469 0.12
470 0.13
471 0.14
472 0.14
473 0.14
474 0.15
475 0.14
476 0.13
477 0.11
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.06
482 0.05
483 0.06
484 0.06
485 0.05
486 0.06
487 0.05
488 0.07
489 0.08
490 0.08
491 0.09
492 0.09
493 0.1
494 0.12
495 0.13
496 0.13
497 0.14
498 0.15
499 0.16
500 0.17
501 0.17
502 0.16
503 0.15
504 0.15
505 0.12
506 0.11
507 0.09
508 0.07
509 0.09
510 0.07
511 0.07
512 0.06
513 0.07
514 0.07
515 0.08
516 0.07
517 0.06
518 0.07
519 0.07