FuNGI

A0A084FVC6

Protein Details

Accession

A0A084FVC6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
124-147	AEERRLRGRLRFRGRRGRGSRFNT	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
9-18	GRGRPRGRGR
102-103	RR
107-144	EREKLAQQEAKKDSERAAEERRLRGRLRFRGRRGRGSR

Subcellular Location(s)

mito 16, nucl 8, cyto_nucl 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
KEGG	sapo:SAPIO_CDS10413 -
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MVRGAPSGGRGRPRGRGRAAAASANTRASTSTPTAPDPTSASPSSSATPIPRPATTASATLPESSSSSSTIQTQPQASTSTNTRGASKTAGSSLRLRPKVVRRNEEEREKLAQQEAKKDSERAAEERRLRGRLRFRGRRGRGSRFNTTGPRISKAEPSALFAGQQGVPGSSRGGFGFGGGQAGFFPRGGGRGRGRGYNFESIERPWEMRINTDKLGSSTPSSQDQENAEEEEMTFMAVNSQPGPKPLGIARREVKEPETVVVTTAELEAQMKEEDDENLYVGDSPESPPAMPQADDKVWSAAPEDHVQVKTEDGELRSIIPPPGDIDFDSMRKVPLPQHSGDTGSEATGDESKPISMTDSDGAKPSRKTKKSGAPLTDEEEWRQESYQYVLRTLAAASLRDSDAEDGAEDEEAANALNDPQPFLCKFGPIMPPLRPKVRPGPQIKDEPTDTVMLDQPSVDLTGDTTKASDENANADADIDESNPFKYGGFVGKLIIRKSGKAELDYGGIKYRMSRGIKSSGVTSYMLIEEDEAKKVGQDQYAGRAIAMGTLLGKFNFGPIYEEQEEWVVDEEDLKAPAEDDA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.63
3	0.66
4	0.64
5	0.66
6	0.65
7	0.61
8	0.55
9	0.5
10	0.47
11	0.41
12	0.36
13	0.27
14	0.24
15	0.2
16	0.23
17	0.22
18	0.26
19	0.27
20	0.3
21	0.33
22	0.33
23	0.34
24	0.33
25	0.32
26	0.32
27	0.3
28	0.29
29	0.27
30	0.28
31	0.28
32	0.25
33	0.25
34	0.23
35	0.27
36	0.32
37	0.34
38	0.32
39	0.33
40	0.34
41	0.36
42	0.33
43	0.3
44	0.25
45	0.25
46	0.26
47	0.24
48	0.22
49	0.18
50	0.18
51	0.17
52	0.17
53	0.16
54	0.16
55	0.16
56	0.2
57	0.23
58	0.25
59	0.28
60	0.29
61	0.28
62	0.28
63	0.3
64	0.27
65	0.27
66	0.27
67	0.29
68	0.32
69	0.32
70	0.33
71	0.31
72	0.32
73	0.32
74	0.29
75	0.25
76	0.25
77	0.26
78	0.26
79	0.31
80	0.37
81	0.44
82	0.45
83	0.45
84	0.48
85	0.56
86	0.63
87	0.67
88	0.67
89	0.65
90	0.72
91	0.78
92	0.79
93	0.74
94	0.68
95	0.64
96	0.57
97	0.52
98	0.48
99	0.44
100	0.38
101	0.42
102	0.42
103	0.41
104	0.42
105	0.41
106	0.38
107	0.4
108	0.41
109	0.37
110	0.41
111	0.44
112	0.47
113	0.53
114	0.56
115	0.54
116	0.53
117	0.55
118	0.58
119	0.6
120	0.66
121	0.68
122	0.72
123	0.78
124	0.82
125	0.85
126	0.83
127	0.83
128	0.82
129	0.79
130	0.77
131	0.71
132	0.7
133	0.65
134	0.62
135	0.59
136	0.51
137	0.48
138	0.43
139	0.41
140	0.4
141	0.36
142	0.38
143	0.31
144	0.32
145	0.3
146	0.27
147	0.26
148	0.2
149	0.21
150	0.14
151	0.15
152	0.12
153	0.1
154	0.1
155	0.1
156	0.11
157	0.09
158	0.1
159	0.08
160	0.1
161	0.09
162	0.09
163	0.09
164	0.08
165	0.09
166	0.08
167	0.08
168	0.06
169	0.08
170	0.08
171	0.07
172	0.07
173	0.06
174	0.09
175	0.11
176	0.16
177	0.18
178	0.24
179	0.26
180	0.31
181	0.32
182	0.35
183	0.37
184	0.39
185	0.37
186	0.33
187	0.33
188	0.28
189	0.3
190	0.26
191	0.23
192	0.17
193	0.2
194	0.18
195	0.21
196	0.26
197	0.27
198	0.26
199	0.27
200	0.26
201	0.23
202	0.25
203	0.21
204	0.17
205	0.16
206	0.17
207	0.2
208	0.2
209	0.19
210	0.21
211	0.21
212	0.21
213	0.2
214	0.19
215	0.15
216	0.14
217	0.13
218	0.11
219	0.09
220	0.07
221	0.06
222	0.04
223	0.05
224	0.06
225	0.06
226	0.07
227	0.09
228	0.09
229	0.1
230	0.13
231	0.11
232	0.12
233	0.15
234	0.22
235	0.22
236	0.28
237	0.3
238	0.31
239	0.33
240	0.33
241	0.31
242	0.26
243	0.25
244	0.2
245	0.18
246	0.15
247	0.14
248	0.13
249	0.11
250	0.08
251	0.08
252	0.07
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.06
261	0.06
262	0.07
263	0.07
264	0.06
265	0.06
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.06
270	0.05
271	0.06
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.07
276	0.08
277	0.09
278	0.09
279	0.08
280	0.11
281	0.11
282	0.13
283	0.13
284	0.13
285	0.12
286	0.12
287	0.12
288	0.1
289	0.11
290	0.11
291	0.12
292	0.14
293	0.14
294	0.15
295	0.13
296	0.13
297	0.11
298	0.11
299	0.12
300	0.1
301	0.1
302	0.1
303	0.11
304	0.11
305	0.12
306	0.11
307	0.09
308	0.09
309	0.09
310	0.1
311	0.09
312	0.09
313	0.11
314	0.12
315	0.12
316	0.13
317	0.13
318	0.12
319	0.12
320	0.13
321	0.14
322	0.2
323	0.23
324	0.23
325	0.25
326	0.26
327	0.27
328	0.26
329	0.24
330	0.17
331	0.13
332	0.12
333	0.09
334	0.09
335	0.09
336	0.09
337	0.08
338	0.08
339	0.08
340	0.08
341	0.07
342	0.08
343	0.07
344	0.09
345	0.1
346	0.12
347	0.13
348	0.16
349	0.17
350	0.19
351	0.22
352	0.3
353	0.37
354	0.39
355	0.44
356	0.49
357	0.57
358	0.63
359	0.69
360	0.64
361	0.6
362	0.59
363	0.58
364	0.54
365	0.45
366	0.36
367	0.3
368	0.27
369	0.22
370	0.2
371	0.16
372	0.12
373	0.15
374	0.18
375	0.16
376	0.16
377	0.16
378	0.15
379	0.15
380	0.15
381	0.15
382	0.11
383	0.11
384	0.11
385	0.12
386	0.12
387	0.12
388	0.13
389	0.1
390	0.1
391	0.09
392	0.08
393	0.07
394	0.07
395	0.07
396	0.06
397	0.05
398	0.04
399	0.04
400	0.04
401	0.04
402	0.03
403	0.05
404	0.07
405	0.07
406	0.08
407	0.09
408	0.12
409	0.13
410	0.17
411	0.16
412	0.15
413	0.16
414	0.21
415	0.25
416	0.25
417	0.29
418	0.31
419	0.39
420	0.42
421	0.48
422	0.44
423	0.45
424	0.52
425	0.56
426	0.59
427	0.6
428	0.64
429	0.63
430	0.71
431	0.69
432	0.64
433	0.56
434	0.49
435	0.43
436	0.36
437	0.29
438	0.22
439	0.22
440	0.17
441	0.16
442	0.13
443	0.11
444	0.1
445	0.11
446	0.09
447	0.06
448	0.07
449	0.09
450	0.1
451	0.1
452	0.1
453	0.1
454	0.1
455	0.12
456	0.13
457	0.11
458	0.13
459	0.15
460	0.15
461	0.14
462	0.14
463	0.13
464	0.11
465	0.11
466	0.08
467	0.08
468	0.09
469	0.1
470	0.1
471	0.1
472	0.09
473	0.1
474	0.11
475	0.15
476	0.17
477	0.17
478	0.18
479	0.22
480	0.26
481	0.26
482	0.31
483	0.28
484	0.27
485	0.32
486	0.37
487	0.36
488	0.34
489	0.36
490	0.29
491	0.32
492	0.31
493	0.28
494	0.24
495	0.22
496	0.2
497	0.19
498	0.22
499	0.27
500	0.29
501	0.32
502	0.33
503	0.39
504	0.42
505	0.41
506	0.4
507	0.33
508	0.32
509	0.29
510	0.24
511	0.19
512	0.17
513	0.16
514	0.13
515	0.12
516	0.15
517	0.16
518	0.17
519	0.16
520	0.15
521	0.15
522	0.2
523	0.23
524	0.21
525	0.23
526	0.23
527	0.3
528	0.34
529	0.34
530	0.29
531	0.26
532	0.23
533	0.2
534	0.18
535	0.11
536	0.08
537	0.09
538	0.1
539	0.09
540	0.11
541	0.09
542	0.11
543	0.12
544	0.12
545	0.15
546	0.15
547	0.24
548	0.26
549	0.26
550	0.25
551	0.25
552	0.25
553	0.21
554	0.22
555	0.15
556	0.12
557	0.13
558	0.14
559	0.14
560	0.15
561	0.15
562	0.13

A0A084FVC6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer