Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A084GC17

Protein Details
Accession A0A084GC17    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-65LGNDYPPPKHVRKHQKEKTKSQEPINSVHydrophilic
85-115LLDRKRMEQERQERLRKKRQQESPPPQTSRPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
98-103RLRKKR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11.5, cyto 7.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
IPR003903  UIM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG sapo:SAPIO_CDS3012  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
PF02809  UIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50330  UIM  
Amino Acid Sequences MERKSNRDHSPEIIDLSSSADEDENEDEDLQRAIALSLGNDYPPPKHVRKHQKEKTKSQEPINSVPADSSTEPVKSHMTTFGSLLLDRKRMEQERQERLRKKRQQESPPPQTSRPAQRPKISGASSSKNKHLETTSKDAITATSKTHHTESSTQTLPFAKGAVKRTWTQGCERRGDDIKIEEVFQKNELKLAVLASFQWDDDWLLSKIDPSRTKLICIAFARDEAHIVFLIDLPRQEAAIPFVPTTFSLELFRFLKALGLDEKLVRSLENYDFAETKRYGFVHTICGSHTGDEWQYTGYCGLSRIARSLGLASPDPVEIDFVCSSLGNLKREYLSALYSAFQGKFGGGPDGEALVWWIVEVEPHPQERYVSRQAGGIRPVSPPGETGSAWAYVGSANLSESAWGRLVKDKSTNRPRLTCRNWECGIIFSVPTARTTSKAASWPQDLATVFGGHLPVPMETPGAAYDLMDREAQPWFGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.28
3 0.28
4 0.23
5 0.16
6 0.14
7 0.11
8 0.11
9 0.13
10 0.15
11 0.13
12 0.13
13 0.14
14 0.13
15 0.14
16 0.14
17 0.11
18 0.09
19 0.08
20 0.07
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.1
25 0.11
26 0.11
27 0.13
28 0.14
29 0.14
30 0.19
31 0.27
32 0.29
33 0.36
34 0.46
35 0.56
36 0.66
37 0.76
38 0.8
39 0.84
40 0.88
41 0.92
42 0.92
43 0.9
44 0.86
45 0.84
46 0.82
47 0.77
48 0.74
49 0.69
50 0.59
51 0.49
52 0.43
53 0.34
54 0.31
55 0.25
56 0.21
57 0.17
58 0.17
59 0.18
60 0.19
61 0.22
62 0.18
63 0.19
64 0.23
65 0.23
66 0.22
67 0.23
68 0.24
69 0.22
70 0.21
71 0.24
72 0.23
73 0.25
74 0.24
75 0.27
76 0.32
77 0.36
78 0.42
79 0.48
80 0.54
81 0.6
82 0.69
83 0.76
84 0.76
85 0.81
86 0.85
87 0.85
88 0.85
89 0.84
90 0.84
91 0.85
92 0.88
93 0.89
94 0.89
95 0.89
96 0.84
97 0.75
98 0.72
99 0.68
100 0.67
101 0.67
102 0.66
103 0.64
104 0.65
105 0.67
106 0.66
107 0.67
108 0.58
109 0.53
110 0.49
111 0.5
112 0.52
113 0.52
114 0.53
115 0.5
116 0.49
117 0.46
118 0.44
119 0.43
120 0.42
121 0.46
122 0.44
123 0.39
124 0.39
125 0.35
126 0.32
127 0.28
128 0.23
129 0.17
130 0.17
131 0.18
132 0.21
133 0.22
134 0.22
135 0.22
136 0.26
137 0.29
138 0.31
139 0.32
140 0.3
141 0.3
142 0.3
143 0.27
144 0.22
145 0.18
146 0.16
147 0.18
148 0.23
149 0.25
150 0.26
151 0.27
152 0.33
153 0.37
154 0.36
155 0.39
156 0.42
157 0.44
158 0.46
159 0.45
160 0.44
161 0.43
162 0.42
163 0.36
164 0.3
165 0.28
166 0.23
167 0.23
168 0.21
169 0.2
170 0.19
171 0.19
172 0.2
173 0.18
174 0.19
175 0.18
176 0.14
177 0.13
178 0.13
179 0.11
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.07
187 0.06
188 0.07
189 0.1
190 0.08
191 0.09
192 0.09
193 0.11
194 0.13
195 0.19
196 0.21
197 0.22
198 0.29
199 0.29
200 0.31
201 0.33
202 0.31
203 0.3
204 0.29
205 0.28
206 0.21
207 0.22
208 0.21
209 0.17
210 0.17
211 0.11
212 0.11
213 0.08
214 0.07
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.08
226 0.1
227 0.11
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.13
233 0.11
234 0.09
235 0.1
236 0.11
237 0.14
238 0.14
239 0.14
240 0.11
241 0.1
242 0.11
243 0.1
244 0.11
245 0.1
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.11
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.08
254 0.1
255 0.11
256 0.14
257 0.14
258 0.15
259 0.16
260 0.16
261 0.2
262 0.17
263 0.16
264 0.15
265 0.15
266 0.15
267 0.16
268 0.17
269 0.19
270 0.2
271 0.2
272 0.18
273 0.21
274 0.2
275 0.18
276 0.17
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.12
293 0.12
294 0.12
295 0.13
296 0.12
297 0.13
298 0.12
299 0.12
300 0.12
301 0.12
302 0.11
303 0.1
304 0.09
305 0.07
306 0.1
307 0.1
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.14
313 0.19
314 0.17
315 0.18
316 0.19
317 0.19
318 0.2
319 0.22
320 0.17
321 0.13
322 0.12
323 0.12
324 0.12
325 0.12
326 0.15
327 0.13
328 0.12
329 0.11
330 0.1
331 0.11
332 0.11
333 0.12
334 0.09
335 0.1
336 0.1
337 0.1
338 0.1
339 0.08
340 0.08
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.04
346 0.05
347 0.05
348 0.09
349 0.12
350 0.14
351 0.15
352 0.16
353 0.18
354 0.2
355 0.27
356 0.3
357 0.3
358 0.29
359 0.32
360 0.34
361 0.37
362 0.38
363 0.33
364 0.27
365 0.25
366 0.27
367 0.24
368 0.21
369 0.18
370 0.17
371 0.18
372 0.16
373 0.17
374 0.16
375 0.15
376 0.15
377 0.14
378 0.11
379 0.08
380 0.09
381 0.08
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.08
388 0.1
389 0.12
390 0.12
391 0.13
392 0.21
393 0.23
394 0.26
395 0.35
396 0.4
397 0.49
398 0.6
399 0.68
400 0.67
401 0.73
402 0.77
403 0.79
404 0.79
405 0.79
406 0.75
407 0.73
408 0.68
409 0.63
410 0.57
411 0.48
412 0.44
413 0.34
414 0.27
415 0.2
416 0.23
417 0.19
418 0.2
419 0.21
420 0.19
421 0.2
422 0.23
423 0.26
424 0.25
425 0.31
426 0.35
427 0.37
428 0.39
429 0.39
430 0.37
431 0.38
432 0.34
433 0.3
434 0.26
435 0.21
436 0.18
437 0.17
438 0.17
439 0.12
440 0.13
441 0.12
442 0.1
443 0.11
444 0.12
445 0.11
446 0.1
447 0.11
448 0.11
449 0.11
450 0.11
451 0.09
452 0.13
453 0.14
454 0.15
455 0.16
456 0.15
457 0.15
458 0.18