Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7EF02

Protein Details
Accession A7EF02    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-44ADEVAKVKKAKKSPKTTEVTKPKKAAHydrophilic
317-341VEEPVKAKKEKKVKKSKVVEETPAAHydrophilic
352-375TEVAPVEKPKKAKKEAKKAKKSKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-49AKVKKAKKSPKTTEVTKPKKAAKVVEK
116-124KKQKKAIKK
227-240RFKKVPWNKIEGRR
250-288WEKRISKAEKKREIAAEKSKKIGYEFEAPKIKSAKGVSK
322-333KAKKEKKVKKSK
359-375KPKKAKKEAKKAKKSKA
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 8.833, mito 8.5, mito_nucl 7.333, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG ssl:SS1G_03893  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAEITARKRKASTAAAVPADEVAKVKKAKKSPKTTEVTKPKKAAKVVEKKIVEKEVVEKEVAEEPVEESEEEEEEDDQTEALLKGFESDNEEEENAKEGGLEPGQEVPNALEKLSKKQKKAIKKAAEEAANDLPGVVYIGRIPHGFYEAEMKAYFSQFGDILKIRLSRNRRTGASKHYAWIQFESRGVAEIVAKTMDNYLLFNHILKVKLVPDEQLPEDLFKGANRRFKKVPWNKIEGRRLEQGAGEEQWEKRISKAEKKREIAAEKSKKIGYEFEAPKIKSAKGVSKKPVPEIESGEDELAGDVDAVMAIEAAPAVEEPVKAKKEKKVKKSKVVEETPAATITTEETTITTEVAPVEKPKKAKKEAKKAKKSKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.5
3 0.49
4 0.45
5 0.38
6 0.32
7 0.25
8 0.18
9 0.13
10 0.18
11 0.24
12 0.29
13 0.36
14 0.45
15 0.55
16 0.64
17 0.73
18 0.76
19 0.81
20 0.83
21 0.83
22 0.84
23 0.85
24 0.83
25 0.81
26 0.79
27 0.76
28 0.75
29 0.73
30 0.71
31 0.71
32 0.73
33 0.72
34 0.74
35 0.7
36 0.67
37 0.68
38 0.62
39 0.53
40 0.43
41 0.43
42 0.4
43 0.38
44 0.34
45 0.28
46 0.26
47 0.3
48 0.29
49 0.22
50 0.15
51 0.14
52 0.15
53 0.16
54 0.14
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.09
61 0.08
62 0.09
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.06
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.13
75 0.14
76 0.15
77 0.17
78 0.17
79 0.16
80 0.16
81 0.18
82 0.13
83 0.12
84 0.1
85 0.09
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.08
90 0.12
91 0.13
92 0.13
93 0.12
94 0.11
95 0.17
96 0.17
97 0.16
98 0.16
99 0.17
100 0.27
101 0.37
102 0.42
103 0.39
104 0.47
105 0.54
106 0.61
107 0.71
108 0.72
109 0.71
110 0.7
111 0.73
112 0.72
113 0.68
114 0.57
115 0.51
116 0.42
117 0.32
118 0.27
119 0.2
120 0.14
121 0.1
122 0.1
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.14
135 0.13
136 0.15
137 0.14
138 0.15
139 0.14
140 0.14
141 0.14
142 0.08
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.15
151 0.15
152 0.21
153 0.26
154 0.31
155 0.38
156 0.42
157 0.43
158 0.45
159 0.49
160 0.51
161 0.52
162 0.45
163 0.39
164 0.4
165 0.4
166 0.35
167 0.33
168 0.27
169 0.21
170 0.2
171 0.2
172 0.14
173 0.13
174 0.12
175 0.09
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.09
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.12
195 0.11
196 0.13
197 0.14
198 0.13
199 0.13
200 0.15
201 0.15
202 0.16
203 0.15
204 0.13
205 0.13
206 0.12
207 0.11
208 0.09
209 0.16
210 0.18
211 0.26
212 0.28
213 0.33
214 0.35
215 0.39
216 0.49
217 0.52
218 0.58
219 0.57
220 0.63
221 0.66
222 0.73
223 0.76
224 0.69
225 0.64
226 0.58
227 0.53
228 0.45
229 0.38
230 0.31
231 0.25
232 0.21
233 0.18
234 0.15
235 0.14
236 0.17
237 0.19
238 0.17
239 0.16
240 0.24
241 0.28
242 0.36
243 0.46
244 0.53
245 0.6
246 0.63
247 0.67
248 0.67
249 0.66
250 0.64
251 0.65
252 0.64
253 0.57
254 0.58
255 0.53
256 0.47
257 0.43
258 0.38
259 0.32
260 0.32
261 0.33
262 0.36
263 0.42
264 0.41
265 0.44
266 0.43
267 0.39
268 0.34
269 0.35
270 0.38
271 0.4
272 0.48
273 0.51
274 0.56
275 0.59
276 0.6
277 0.62
278 0.55
279 0.5
280 0.47
281 0.44
282 0.39
283 0.37
284 0.32
285 0.25
286 0.22
287 0.18
288 0.13
289 0.09
290 0.05
291 0.04
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.02
301 0.03
302 0.03
303 0.04
304 0.06
305 0.06
306 0.09
307 0.16
308 0.21
309 0.25
310 0.3
311 0.38
312 0.48
313 0.57
314 0.66
315 0.7
316 0.77
317 0.84
318 0.89
319 0.9
320 0.9
321 0.87
322 0.82
323 0.75
324 0.68
325 0.59
326 0.5
327 0.4
328 0.29
329 0.22
330 0.18
331 0.15
332 0.12
333 0.1
334 0.1
335 0.12
336 0.12
337 0.13
338 0.11
339 0.1
340 0.11
341 0.12
342 0.14
343 0.19
344 0.24
345 0.28
346 0.36
347 0.44
348 0.53
349 0.62
350 0.71
351 0.75
352 0.81
353 0.87
354 0.91
355 0.93