Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A084FXW5

Protein Details
Accession A0A084FXW5    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
292-312TTTTNGGRRKKRKGALTNASSHydrophilic
374-397FLAGYSKGRRPSKKSKGGQSGLDQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
299-304RRKKRK
380-390KGRRPSKKSKG
411-413PGR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG sapo:SAPIO_CDS8894  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MAKGKWIDKKTATHFTLVHRPQNDPLIHDESAPQMVLNPTQTKGSKSKALGDLASELGSEVESIRDNEGEAANYGVYFDDTEYDYMQHLRDLNSGGPGEVVFVEANSSGNKNKGKNKMSLEDALRQMDLENKADDLLDEVVLPSKNLQHVSYQAQQDIPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEEFVDNEDDDLFQELAKDGREIDDYEFEETAFNEEYPNDDDDGWESDHTAKPTREYKDEEADEVPELVSAGANGAQGQNWMEDFKKFKQDQKSGRPTGGITGSVLESTWTTTTNGGRRKKRKGALTNASSYSMTSSSLVRTEQLTILDARYEKLEQRYQNDLDDLGSVSEISTASSVQGPLRSDFDNVMDDFLAGYSKGRRPSKKSKGGQSGLDQLDEIRKGLGPARIPGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.55
3 0.6
4 0.58
5 0.58
6 0.5
7 0.51
8 0.5
9 0.55
10 0.5
11 0.42
12 0.42
13 0.4
14 0.38
15 0.35
16 0.32
17 0.26
18 0.27
19 0.24
20 0.17
21 0.14
22 0.15
23 0.17
24 0.2
25 0.2
26 0.2
27 0.26
28 0.28
29 0.31
30 0.35
31 0.38
32 0.4
33 0.4
34 0.47
35 0.47
36 0.49
37 0.44
38 0.4
39 0.37
40 0.3
41 0.28
42 0.19
43 0.14
44 0.1
45 0.1
46 0.08
47 0.06
48 0.06
49 0.08
50 0.09
51 0.1
52 0.1
53 0.11
54 0.12
55 0.13
56 0.13
57 0.12
58 0.11
59 0.1
60 0.09
61 0.09
62 0.07
63 0.07
64 0.06
65 0.06
66 0.07
67 0.08
68 0.09
69 0.1
70 0.11
71 0.11
72 0.12
73 0.12
74 0.13
75 0.14
76 0.14
77 0.16
78 0.17
79 0.17
80 0.19
81 0.18
82 0.16
83 0.14
84 0.13
85 0.11
86 0.09
87 0.09
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.07
94 0.09
95 0.1
96 0.16
97 0.21
98 0.26
99 0.34
100 0.43
101 0.47
102 0.52
103 0.57
104 0.56
105 0.56
106 0.56
107 0.51
108 0.47
109 0.45
110 0.39
111 0.33
112 0.28
113 0.24
114 0.23
115 0.22
116 0.18
117 0.16
118 0.15
119 0.15
120 0.15
121 0.14
122 0.1
123 0.09
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.1
132 0.12
133 0.13
134 0.14
135 0.13
136 0.17
137 0.22
138 0.27
139 0.26
140 0.25
141 0.24
142 0.24
143 0.23
144 0.2
145 0.15
146 0.09
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.13
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.11
164 0.12
165 0.11
166 0.11
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.07
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.05
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.06
189 0.07
190 0.08
191 0.09
192 0.11
193 0.11
194 0.13
195 0.12
196 0.11
197 0.11
198 0.1
199 0.1
200 0.08
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.08
205 0.1
206 0.11
207 0.1
208 0.09
209 0.09
210 0.1
211 0.12
212 0.11
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.12
217 0.14
218 0.17
219 0.15
220 0.19
221 0.26
222 0.29
223 0.3
224 0.34
225 0.36
226 0.4
227 0.4
228 0.38
229 0.32
230 0.29
231 0.26
232 0.2
233 0.16
234 0.08
235 0.08
236 0.06
237 0.05
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.1
252 0.14
253 0.17
254 0.26
255 0.28
256 0.34
257 0.43
258 0.52
259 0.59
260 0.65
261 0.72
262 0.65
263 0.65
264 0.59
265 0.49
266 0.44
267 0.36
268 0.26
269 0.16
270 0.14
271 0.13
272 0.12
273 0.11
274 0.08
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.11
281 0.15
282 0.22
283 0.3
284 0.38
285 0.48
286 0.55
287 0.65
288 0.72
289 0.74
290 0.78
291 0.79
292 0.81
293 0.81
294 0.79
295 0.74
296 0.66
297 0.61
298 0.51
299 0.41
300 0.32
301 0.23
302 0.17
303 0.13
304 0.12
305 0.11
306 0.13
307 0.13
308 0.12
309 0.13
310 0.14
311 0.15
312 0.15
313 0.15
314 0.14
315 0.14
316 0.16
317 0.15
318 0.14
319 0.15
320 0.16
321 0.18
322 0.24
323 0.3
324 0.32
325 0.37
326 0.43
327 0.43
328 0.43
329 0.4
330 0.34
331 0.28
332 0.24
333 0.2
334 0.12
335 0.11
336 0.08
337 0.07
338 0.08
339 0.07
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.07
344 0.09
345 0.1
346 0.11
347 0.15
348 0.16
349 0.18
350 0.21
351 0.21
352 0.21
353 0.21
354 0.22
355 0.22
356 0.2
357 0.19
358 0.16
359 0.15
360 0.14
361 0.13
362 0.11
363 0.07
364 0.1
365 0.14
366 0.19
367 0.28
368 0.37
369 0.45
370 0.54
371 0.65
372 0.74
373 0.79
374 0.83
375 0.85
376 0.87
377 0.84
378 0.81
379 0.76
380 0.74
381 0.65
382 0.56
383 0.46
384 0.36
385 0.37
386 0.31
387 0.26
388 0.17
389 0.16
390 0.17
391 0.22
392 0.26
393 0.23
394 0.29